Apublication of the Locus Or Genbank Accession Number If Unpublished

Table S1.Characteristics of microsatellite loci applied in the study. All were run in the same panel; i.e. run in the same capillary.

Locus information / Amplification details / Genetic diversity
Referencea / Locusb / Labelc / MPd / Primer(µM)e / PCRf / Nag / Allele-rangeh / Uhei
GenBank: AF151370 / BFRO13 / FAM / MP1 / 0.09 / 58 / 5 / 235-251 / 0.66
(Junge et al., 2010) / 213 / FAM / single / 0.38 / 60 / 11 / 283-327 / 0.78
(Junge et al., 2010) / 414 / FAM / MP2 / 0.20 / 60 / 7 / 389-413 / 0.71
(Junge et al., 2010) / 309 / FAM / MP4 / 0.57 / 59 / 2 / 447-451 / 0.47
(Sušnik et al., 2000) / BFRO10 / VIC / MP1 / 0.08 / 58 / 5 / 96-128 / 0.33
(Sušnik et al., 1999b) / BFRO15 / VIC / MP1 / 0.04 / 58 / 2 / 144-154 / 0.50
(Sušnik et al., 1999b) / BFRO18 / VIC / MP1 / 0.04 / 58 / 5 / 181-195 / 0.59
(Junge et al., 2010) / 207 / VIC / MP1 / 0.10 / 58 / 2 / 216-224 / 0.47
(Sušnik et al., 1999a) / BFRO9 / VIC / MP1 / 0.05 / 58 / 2 / 243-247 / 0.16
(Junge et al., 2010) / 438 / VIC / single / 0.34 / 60 / 10 / 261-297 / 0.79
(Sušnik et al., 2000) / BFRO11 / NED / MP3 / 0.30 / 59 / 2 / 86-102 / 0.43
(Junge et al., 2010) / 313 / NED / MP2 / 0.18 / 60 / 6 / 180-200 / 0.75
(Olsen et al., 1998) / Ogo2 / NED / MP1 / 0.07 / 58 / 4 / 233-245 / 0.63
(Junge et al., 2010) / 433b / NED / MP3 / 0.18 / 59 / 8 / 291-319 / 0.69
(Junge et al., 2010) / 445 / NED / MP4 / 0.13 / 59 / 13 / 374-422 / 0.85
(Junge et al., 2010) / 419a / PET / single / 0.24 / 58 / 2 / 106-110 / 0.29
(Junge et al., 2010) / 415 / PET / MP3 / 0.33 / 59 / 10 / 189-225 / 0.76
(Junge et al., 2010) / 211 / PET / MP2 / 0.25 / 60 / 5 / 232-240 / 0.08
(Junge et al., 2010) / 214 / PET / MP1 / 0.14 / 58 / 3 / 292-313 / 0.53

aPublication of the locus or GenBank accession number if unpublished.

bCommon name of the locus

cLabel, Fluorescent dye used

dMP, Multiplex group or single locus PCR amplification

ePrimer concentration in the PCR-mix

fAnnealing temperature profile of the PCR program used

gNa, Number of alleles found in the locus

hA-range, Range of the length (bp) of alleles

iHE, Unbiased expected heterozygosity in the locus

Marker information and methodological details are described in detail in Junge et al. (2010) and Koskinen and Primmer (2001).
TableS2.Microsatellite loci with alleles and allele frequencies. Given are the populations and their respective sampling year, e.g. RAU04.

a) populations from basin 1

Locus / Allele/n / RAU04 / MYR04 / NSKO01 / SSKO01 / SSKO04 / SSKO06 / SSKO07 / SSKO08 / STE01 / STE04 / STE05 / STE06 / STE07 / STE08 / BRA01 / BRA06 / ROT06 / BRY01
BFRO13 / N / 19 / 36 / 43 / 69 / 42 / 43 / 38 / 59 / 40 / 40 / 31 / 42 / 41 / 44 / 45 / 21 / 26 / 30
235 / 0.342 / 0.403 / 0.314 / 0.312 / 0.310 / 0.349 / 0.329 / 0.373 / 0.275 / 0.325 / 0.371 / 0.333 / 0.305 / 0.420 / 0.422 / 0.476 / 0.173 / 0.333
239 / 0.447 / 0.444 / 0.512 / 0.435 / 0.464 / 0.442 / 0.474 / 0.441 / 0.500 / 0.513 / 0.532 / 0.476 / 0.439 / 0.420 / 0.444 / 0.333 / 0.519 / 0.500
243 / 0.132 / 0.069 / 0.116 / 0.138 / 0.119 / 0.116 / 0.118 / 0.085 / 0.113 / 0.125 / 0.065 / 0.131 / 0.195 / 0.057 / 0.056 / 0.119 / 0.212 / 0.033
247 / 0.079 / 0.083 / 0.058 / 0.116 / 0.095 / 0.093 / 0.066 / 0.102 / 0.113 / 0.038 / 0.032 / 0.036 / 0.049 / 0.102 / 0.078 / 0.071 / 0.096 / 0.133
251 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.012 / 0.000 / 0.013 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.024 / 0.012 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000
Tth-213 / N / 18 / 35 / 38 / 63 / 35 / 43 / 37 / 59 / 41 / 32 / 28 / 41 / 42 / 44 / 41 / 22 / 26 / 30
283 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.018 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000
291 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.008 / 0.014 / 0.012 / 0.000 / 0.025 / 0.000 / 0.016 / 0.000 / 0.000 / 0.012 / 0.011 / 0.012 / 0.000 / 0.019 / 0.017
295 / 0.389 / 0.400 / 0.342 / 0.333 / 0.357 / 0.453 / 0.459 / 0.364 / 0.268 / 0.438 / 0.446 / 0.402 / 0.310 / 0.295 / 0.366 / 0.523 / 0.538 / 0.433
299 / 0.083 / 0.143 / 0.237 / 0.151 / 0.129 / 0.093 / 0.095 / 0.136 / 0.171 / 0.141 / 0.089 / 0.049 / 0.048 / 0.148 / 0.159 / 0.182 / 0.096 / 0.067
303 / 0.056 / 0.114 / 0.132 / 0.095 / 0.057 / 0.128 / 0.108 / 0.102 / 0.195 / 0.109 / 0.179 / 0.159 / 0.214 / 0.170 / 0.061 / 0.114 / 0.173 / 0.200
307 / 0.000 / 0.000 / 0.026 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.014 / 0.000 / 0.012 / 0.016 / 0.000 / 0.012 / 0.012 / 0.011 / 0.012 / 0.023 / 0.000 / 0.017
311 / 0.167 / 0.186 / 0.092 / 0.222 / 0.229 / 0.151 / 0.189 / 0.169 / 0.183 / 0.156 / 0.125 / 0.110 / 0.155 / 0.227 / 0.195 / 0.068 / 0.058 / 0.083
315 / 0.028 / 0.014 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.041 / 0.025 / 0.024 / 0.000 / 0.000 / 0.024 / 0.048 / 0.023 / 0.012 / 0.023 / 0.000 / 0.017
319 / 0.028 / 0.000 / 0.039 / 0.008 / 0.029 / 0.012 / 0.014 / 0.017 / 0.000 / 0.000 / 0.036 / 0.037 / 0.036 / 0.011 / 0.000 / 0.023 / 0.019 / 0.017
323 / 0.250 / 0.143 / 0.132 / 0.183 / 0.186 / 0.151 / 0.081 / 0.161 / 0.134 / 0.109 / 0.089 / 0.207 / 0.167 / 0.102 / 0.183 / 0.045 / 0.058 / 0.150
327 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.012 / 0.016 / 0.018 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.038 / 0.000
Tth-414 / N / 18 / 36 / 43 / 65 / 38 / 43 / 38 / 59 / 41 / 37 / 27 / 42 / 44 / 43 / 43 / 22 / 26 / 31
389 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000
393 / 0.056 / 0.056 / 0.047 / 0.038 / 0.013 / 0.000 / 0.066 / 0.051 / 0.012 / 0.041 / 0.037 / 0.036 / 0.034 / 0.047 / 0.000 / 0.045 / 0.000 / 0.016
397 / 0.083 / 0.125 / 0.047 / 0.108 / 0.066 / 0.105 / 0.118 / 0.093 / 0.085 / 0.095 / 0.093 / 0.071 / 0.114 / 0.081 / 0.105 / 0.227 / 0.250 / 0.194
401 / 0.556 / 0.458 / 0.465 / 0.515 / 0.421 / 0.453 / 0.355 / 0.398 / 0.488 / 0.432 / 0.389 / 0.571 / 0.545 / 0.407 / 0.547 / 0.477 / 0.385 / 0.452
405 / 0.139 / 0.250 / 0.198 / 0.146 / 0.316 / 0.198 / 0.184 / 0.237 / 0.220 / 0.311 / 0.352 / 0.202 / 0.148 / 0.279 / 0.174 / 0.159 / 0.269 / 0.258
409 / 0.139 / 0.097 / 0.244 / 0.192 / 0.184 / 0.244 / 0.276 / 0.220 / 0.183 / 0.122 / 0.130 / 0.119 / 0.148 / 0.174 / 0.174 / 0.091 / 0.096 / 0.081
413 / 0.028 / 0.014 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.012 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.011 / 0.012 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000
Tth-309 / N / 19 / 35 / 40 / 65 / 38 / 43 / 38 / 59 / 41 / 35 / 31 / 42 / 44 / 44 / 41 / 22 / 26 / 28
447 / 0.447 / 0.629 / 0.700 / 0.708 / 0.592 / 0.698 / 0.724 / 0.712 / 0.622 / 0.686 / 0.597 / 0.667 / 0.648 / 0.716 / 0.610 / 0.614 / 0.654 / 0.589
451 / 0.553 / 0.371 / 0.300 / 0.292 / 0.408 / 0.302 / 0.276 / 0.288 / 0.378 / 0.314 / 0.403 / 0.333 / 0.352 / 0.284 / 0.390 / 0.386 / 0.346 / 0.411
BFRO10 / N / 19 / 36 / 42 / 69 / 43 / 43 / 38 / 59 / 40 / 40 / 32 / 42 / 44 / 43 / 45 / 22 / 26 / 32
96 / 0.132 / 0.236 / 0.286 / 0.188 / 0.221 / 0.174 / 0.224 / 0.237 / 0.263 / 0.250 / 0.406 / 0.214 / 0.205 / 0.233 / 0.211 / 0.182 / 0.154 / 0.188
122 / 0.868 / 0.764 / 0.714 / 0.812 / 0.779 / 0.826 / 0.776 / 0.763 / 0.713 / 0.750 / 0.594 / 0.786 / 0.795 / 0.767 / 0.789 / 0.818 / 0.846 / 0.813
124 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000
126 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.025 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000
128 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000
BFRO15 / N / 19 / 36 / 43 / 68 / 43 / 43 / 38 / 59 / 41 / 40 / 32 / 42 / 44 / 44 / 44 / 22 / 26 / 32
144 / 0.474 / 0.417 / 0.547 / 0.419 / 0.465 / 0.442 / 0.592 / 0.466 / 0.537 / 0.500 / 0.609 / 0.476 / 0.534 / 0.432 / 0.545 / 0.614 / 0.500 / 0.531
154 / 0.526 / 0.583 / 0.453 / 0.581 / 0.535 / 0.558 / 0.408 / 0.534 / 0.463 / 0.500 / 0.391 / 0.524 / 0.466 / 0.568 / 0.455 / 0.386 / 0.500 / 0.469
BFRO18 / N / 19 / 36 / 43 / 69 / 41 / 43 / 38 / 58 / 41 / 39 / 32 / 42 / 43 / 44 / 45 / 21 / 26 / 31
181 / 0.474 / 0.528 / 0.407 / 0.377 / 0.341 / 0.384 / 0.500 / 0.336 / 0.415 / 0.538 / 0.453 / 0.381 / 0.512 / 0.364 / 0.467 / 0.595 / 0.404 / 0.452
183 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000
191 / 0.316 / 0.403 / 0.477 / 0.580 / 0.561 / 0.512 / 0.447 / 0.534 / 0.500 / 0.385 / 0.469 / 0.524 / 0.407 / 0.545 / 0.478 / 0.333 / 0.462 / 0.452
193 / 0.000 / 0.014 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.013 / 0.000 / 0.000 / 0.012 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.019 / 0.000
195 / 0.211 / 0.056 / 0.116 / 0.043 / 0.098 / 0.105 / 0.053 / 0.129 / 0.085 / 0.064 / 0.078 / 0.095 / 0.070 / 0.091 / 0.056 / 0.071 / 0.115 / 0.097

Cont.

Locus / Allele/n / RAU04 / MYR04 / NSKO01 / SSKO01 / SSKO04 / SSKO06 / SSKO07 / SSKO08 / STE01 / STE04 / STE05 / STE06 / STE07 / STE08 / BRA01 / BRA06 / ROT06 / BRY01
Tth-207 / N / 19 / 36 / 43 / 68 / 42 / 43 / 38 / 59 / 41 / 39 / 26 / 42 / 44 / 44 / 45 / 22 / 26 / 32
216 / 0.342 / 0.306 / 0.337 / 0.368 / 0.440 / 0.326 / 0.421 / 0.415 / 0.402 / 0.487 / 0.423 / 0.345 / 0.432 / 0.375 / 0.433 / 0.364 / 0.538 / 0.344
224 / 0.658 / 0.694 / 0.663 / 0.632 / 0.560 / 0.674 / 0.579 / 0.585 / 0.598 / 0.513 / 0.577 / 0.655 / 0.568 / 0.625 / 0.567 / 0.636 / 0.462 / 0.656
BFRO9 / N / 19 / 36 / 43 / 69 / 43 / 43 / 38 / 59 / 41 / 40 / 32 / 42 / 44 / 44 / 45 / 22 / 26 / 32
243 / 0.026 / 0.167 / 0.116 / 0.109 / 0.116 / 0.081 / 0.105 / 0.102 / 0.061 / 0.088 / 0.156 / 0.071 / 0.091 / 0.057 / 0.089 / 0.045 / 0.096 / 0.047
247 / 0.974 / 0.833 / 0.884 / 0.891 / 0.884 / 0.919 / 0.895 / 0.898 / 0.939 / 0.913 / 0.844 / 0.929 / 0.909 / 0.943 / 0.911 / 0.955 / 0.904 / 0.953
Tth-438 / N / 19 / 36 / 43 / 67 / 36 / 43 / 38 / 59 / 41 / 38 / 24 / 41 / 43 / 44 / 43 / 22 / 26 / 30
261 / 0.000 / 0.000 / 0.023 / 0.015 / 0.000 / 0.000 / 0.013 / 0.000 / 0.000 / 0.013 / 0.000 / 0.012 / 0.012 / 0.011 / 0.012 / 0.000 / 0.000 / 0.000
265 / 0.158 / 0.194 / 0.256 / 0.261 / 0.153 / 0.209 / 0.197 / 0.237 / 0.122 / 0.197 / 0.146 / 0.220 / 0.186 / 0.261 / 0.186 / 0.136 / 0.154 / 0.200
269 / 0.289 / 0.278 / 0.314 / 0.209 / 0.222 / 0.244 / 0.237 / 0.263 / 0.280 / 0.250 / 0.229 / 0.317 / 0.291 / 0.170 / 0.326 / 0.250 / 0.269 / 0.350
273 / 0.342 / 0.194 / 0.233 / 0.254 / 0.333 / 0.326 / 0.211 / 0.212 / 0.317 / 0.276 / 0.250 / 0.220 / 0.279 / 0.330 / 0.256 / 0.227 / 0.250 / 0.083
277 / 0.000 / 0.014 / 0.000 / 0.045 / 0.014 / 0.047 / 0.039 / 0.017 / 0.049 / 0.026 / 0.042 / 0.012 / 0.023 / 0.034 / 0.012 / 0.000 / 0.019 / 0.000
281 / 0.053 / 0.125 / 0.035 / 0.030 / 0.069 / 0.023 / 0.026 / 0.042 / 0.073 / 0.039 / 0.042 / 0.024 / 0.081 / 0.011 / 0.047 / 0.068 / 0.135 / 0.117
285 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.014 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.012 / 0.013 / 0.000 / 0.012 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.038 / 0.000
289 / 0.053 / 0.056 / 0.012 / 0.037 / 0.042 / 0.035 / 0.053 / 0.059 / 0.037 / 0.039 / 0.042 / 0.012 / 0.012 / 0.023 / 0.047 / 0.091 / 0.019 / 0.133
293 / 0.105 / 0.125 / 0.128 / 0.149 / 0.153 / 0.093 / 0.211 / 0.161 / 0.110 / 0.145 / 0.250 / 0.171 / 0.116 / 0.136 / 0.105 / 0.205 / 0.096 / 0.117
297 / 0.000 / 0.014 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.023 / 0.013 / 0.008 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.023 / 0.012 / 0.023 / 0.019 / 0.000
BFRO11 / N / 19 / 36 / 43 / 67 / 42 / 43 / 38 / 59 / 41 / 40 / 32 / 42 / 43 / 43 / 44 / 22 / 26 / 32
86 / 0.737 / 0.597 / 0.651 / 0.821 / 0.690 / 0.709 / 0.711 / 0.686 / 0.634 / 0.713 / 0.656 / 0.690 / 0.581 / 0.663 / 0.761 / 0.591 / 0.615 / 0.656
102 / 0.263 / 0.403 / 0.349 / 0.179 / 0.310 / 0.291 / 0.289 / 0.314 / 0.366 / 0.288 / 0.344 / 0.310 / 0.419 / 0.337 / 0.239 / 0.409 / 0.385 / 0.344
Tth-313 / N / 18 / 36 / 43 / 69 / 43 / 43 / 38 / 59 / 41 / 36 / 28 / 42 / 44 / 43 / 45 / 22 / 26 / 32
180 / 0.111 / 0.167 / 0.081 / 0.123 / 0.198 / 0.128 / 0.145 / 0.093 / 0.085 / 0.194 / 0.071 / 0.119 / 0.102 / 0.070 / 0.156 / 0.205 / 0.058 / 0.094
184 / 0.333 / 0.333 / 0.395 / 0.239 / 0.314 / 0.349 / 0.382 / 0.364 / 0.329 / 0.306 / 0.339 / 0.357 / 0.341 / 0.384 / 0.367 / 0.318 / 0.327 / 0.484
188 / 0.222 / 0.083 / 0.163 / 0.254 / 0.151 / 0.186 / 0.211 / 0.178 / 0.159 / 0.153 / 0.125 / 0.190 / 0.182 / 0.140 / 0.156 / 0.091 / 0.192 / 0.219
192 / 0.056 / 0.042 / 0.128 / 0.029 / 0.035 / 0.035 / 0.026 / 0.000 / 0.061 / 0.056 / 0.107 / 0.071 / 0.034 / 0.035 / 0.033 / 0.068 / 0.038 / 0.031
196 / 0.278 / 0.375 / 0.233 / 0.319 / 0.291 / 0.291 / 0.237 / 0.314 / 0.341 / 0.278 / 0.339 / 0.250 / 0.307 / 0.349 / 0.278 / 0.295 / 0.327 / 0.156
200 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.036 / 0.012 / 0.012 / 0.000 / 0.051 / 0.024 / 0.014 / 0.018 / 0.012 / 0.034 / 0.023 / 0.011 / 0.023 / 0.058 / 0.016
Ogo2 / N / 18 / 35 / 43 / 68 / 43 / 43 / 38 / 59 / 41 / 40 / 32 / 42 / 44 / 43 / 45 / 22 / 26 / 30
233 / 0.556 / 0.486 / 0.430 / 0.515 / 0.442 / 0.407 / 0.355 / 0.449 / 0.305 / 0.413 / 0.453 / 0.488 / 0.443 / 0.430 / 0.411 / 0.409 / 0.462 / 0.550
237 / 0.306 / 0.314 / 0.407 / 0.360 / 0.372 / 0.360 / 0.408 / 0.331 / 0.463 / 0.338 / 0.344 / 0.357 / 0.386 / 0.419 / 0.389 / 0.364 / 0.404 / 0.267
241 / 0.139 / 0.200 / 0.163 / 0.125 / 0.186 / 0.233 / 0.237 / 0.220 / 0.232 / 0.250 / 0.203 / 0.155 / 0.170 / 0.151 / 0.200 / 0.227 / 0.135 / 0.183
245 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000
Tth-433b / N / 19 / 34 / 42 / 69 / 39 / 42 / 38 / 59 / 41 / 38 / 30 / 42 / 44 / 43 / 43 / 19 / 26 / 31
291 / 0.026 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.008 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000
295 / 0.105 / 0.132 / 0.083 / 0.152 / 0.064 / 0.083 / 0.118 / 0.093 / 0.122 / 0.132 / 0.050 / 0.143 / 0.136 / 0.116 / 0.116 / 0.132 / 0.212 / 0.065
299 / 0.447 / 0.456 / 0.452 / 0.399 / 0.513 / 0.417 / 0.474 / 0.466 / 0.341 / 0.513 / 0.433 / 0.429 / 0.409 / 0.581 / 0.465 / 0.526 / 0.442 / 0.629
303 / 0.395 / 0.309 / 0.310 / 0.304 / 0.333 / 0.321 / 0.276 / 0.339 / 0.354 / 0.250 / 0.433 / 0.321 / 0.273 / 0.151 / 0.326 / 0.263 / 0.192 / 0.194
307 / 0.026 / 0.059 / 0.036 / 0.065 / 0.051 / 0.060 / 0.079 / 0.059 / 0.085 / 0.053 / 0.067 / 0.048 / 0.114 / 0.081 / 0.047 / 0.053 / 0.077 / 0.065
311 / 0.000 / 0.000 / 0.024 / 0.029 / 0.013 / 0.024 / 0.013 / 0.000 / 0.012 / 0.013 / 0.000 / 0.012 / 0.034 / 0.012 / 0.000 / 0.000 / 0.019 / 0.000
315 / 0.000 / 0.044 / 0.095 / 0.051 / 0.026 / 0.095 / 0.039 / 0.034 / 0.085 / 0.039 / 0.017 / 0.048 / 0.034 / 0.058 / 0.047 / 0.026 / 0.058 / 0.048
319 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000

Cont.

Locus / Allele/n / RAU04 / MYR04 / NSKO01 / SSKO01 / SSKO04 / SSKO06 / SSKO07 / SSKO08 / STE01 / STE04 / STE05 / STE06 / STE07 / STE08 / BRA01 / BRA06 / ROT06 / BRY01
Tth-445 / N / 18 / 34 / 41 / 65 / 34 / 43 / 38 / 59 / 41 / 30 / 24 / 42 / 44 / 42 / 42 / 22 / 26 / 23
374 / 0.139 / 0.265 / 0.232 / 0.292 / 0.221 / 0.198 / 0.171 / 0.229 / 0.220 / 0.383 / 0.292 / 0.226 / 0.193 / 0.214 / 0.190 / 0.159 / 0.212 / 0.152
378 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.012 / 0.017 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000
382 / 0.111 / 0.059 / 0.146 / 0.138 / 0.176 / 0.221 / 0.158 / 0.203 / 0.171 / 0.100 / 0.208 / 0.131 / 0.114 / 0.190 / 0.226 / 0.136 / 0.212 / 0.261
386 / 0.028 / 0.015 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.012 / 0.000 / 0.008 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.012 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.043
390 / 0.056 / 0.074 / 0.195 / 0.092 / 0.118 / 0.140 / 0.184 / 0.136 / 0.159 / 0.117 / 0.167 / 0.202 / 0.148 / 0.143 / 0.190 / 0.182 / 0.173 / 0.087
394 / 0.028 / 0.147 / 0.073 / 0.077 / 0.044 / 0.105 / 0.066 / 0.076 / 0.122 / 0.117 / 0.063 / 0.107 / 0.080 / 0.071 / 0.095 / 0.091 / 0.135 / 0.065
398 / 0.000 / 0.044 / 0.012 / 0.015 / 0.044 / 0.000 / 0.039 / 0.017 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.036 / 0.034 / 0.024 / 0.024 / 0.091 / 0.019 / 0.065
402 / 0.222 / 0.132 / 0.073 / 0.062 / 0.074 / 0.047 / 0.092 / 0.093 / 0.085 / 0.100 / 0.125 / 0.095 / 0.136 / 0.095 / 0.071 / 0.136 / 0.077 / 0.087
406 / 0.111 / 0.000 / 0.024 / 0.031 / 0.015 / 0.012 / 0.039 / 0.025 / 0.024 / 0.000 / 0.000 / 0.012 / 0.023 / 0.024 / 0.012 / 0.023 / 0.019 / 0.022
410 / 0.000 / 0.015 / 0.012 / 0.038 / 0.029 / 0.000 / 0.039 / 0.008 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.011 / 0.012 / 0.000 / 0.000 / 0.019 / 0.043
414 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.012 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000
418 / 0.278 / 0.206 / 0.232 / 0.254 / 0.235 / 0.256 / 0.211 / 0.195 / 0.207 / 0.167 / 0.146 / 0.179 / 0.250 / 0.202 / 0.190 / 0.182 / 0.135 / 0.152
422 / 0.028 / 0.044 / 0.000 / 0.000 / 0.044 / 0.012 / 0.000 / 0.008 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.011 / 0.012 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.022
Tth-415 / N / 19 / 35 / 42 / 67 / 38 / 43 / 38 / 59 / 41 / 39 / 31 / 41 / 44 / 43 / 44 / 20 / 26 / 31
189 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.013 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000
193 / 0.026 / 0.043 / 0.083 / 0.052 / 0.066 / 0.081 / 0.039 / 0.059 / 0.061 / 0.064 / 0.065 / 0.085 / 0.068 / 0.047 / 0.057 / 0.075 / 0.115 / 0.048
197 / 0.026 / 0.057 / 0.000 / 0.060 / 0.026 / 0.035 / 0.000 / 0.025 / 0.049 / 0.000 / 0.081 / 0.037 / 0.068 / 0.047 / 0.057 / 0.050 / 0.038 / 0.081
201 / 0.026 / 0.014 / 0.048 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000
205 / 0.105 / 0.129 / 0.036 / 0.164 / 0.158 / 0.116 / 0.211 / 0.110 / 0.098 / 0.077 / 0.210 / 0.171 / 0.114 / 0.105 / 0.136 / 0.225 / 0.154 / 0.161
209 / 0.237 / 0.257 / 0.310 / 0.299 / 0.408 / 0.186 / 0.237 / 0.305 / 0.256 / 0.218 / 0.306 / 0.220 / 0.307 / 0.267 / 0.250 / 0.325 / 0.173 / 0.194
213 / 0.421 / 0.400 / 0.321 / 0.261 / 0.276 / 0.372 / 0.342 / 0.331 / 0.378 / 0.423 / 0.258 / 0.280 / 0.295 / 0.384 / 0.341 / 0.200 / 0.308 / 0.323
217 / 0.158 / 0.071 / 0.202 / 0.149 / 0.066 / 0.186 / 0.171 / 0.153 / 0.146 / 0.192 / 0.065 / 0.195 / 0.136 / 0.151 / 0.159 / 0.100 / 0.212 / 0.177
221 / 0.000 / 0.014 / 0.000 / 0.015 / 0.000 / 0.023 / 0.000 / 0.017 / 0.012 / 0.013 / 0.016 / 0.000 / 0.011 / 0.000 / 0.000 / 0.025 / 0.000 / 0.016
225 / 0.000 / 0.014 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.012 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000
Tth-419a / N / 19 / 36 / 43 / 63 / 43 / 43 / 38 / 57 / 41 / 39 / 32 / 42 / 44 / 43 / 45 / 21 / 26 / 32
106 / 0.211 / 0.250 / 0.174 / 0.143 / 0.163 / 0.198 / 0.158 / 0.184 / 0.195 / 0.244 / 0.203 / 0.190 / 0.170 / 0.151 / 0.211 / 0.238 / 0.135 / 0.172
110 / 0.789 / 0.750 / 0.826 / 0.857 / 0.837 / 0.802 / 0.842 / 0.816 / 0.805 / 0.756 / 0.797 / 0.810 / 0.830 / 0.849 / 0.789 / 0.762 / 0.865 / 0.828
Tth-211 / N / 19 / 36 / 43 / 68 / 42 / 42 / 38 / 59 / 41 / 40 / 32 / 42 / 44 / 44 / 45 / 22 / 26 / 32
232 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.011 / 0.000 / 0.038 / 0.000
234 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.008 / 0.000 / 0.013 / 0.016 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000
236 / 0.079 / 0.028 / 0.023 / 0.059 / 0.012 / 0.071 / 0.026 / 0.025 / 0.024 / 0.025 / 0.031 / 0.024 / 0.045 / 0.023 / 0.022 / 0.045 / 0.000 / 0.031
238 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000
240 / 0.921 / 0.972 / 0.977 / 0.941 / 0.988 / 0.929 / 0.974 / 0.966 / 0.976 / 0.963 / 0.953 / 0.976 / 0.955 / 0.977 / 0.967 / 0.955 / 0.962 / 0.969
Tth-214 / N / 19 / 34 / 41 / 66 / 35 / 43 / 38 / 59 / 41 / 37 / 29 / 42 / 44 / 43 / 43 / 22 / 26 / 30
292 / 0.132 / 0.221 / 0.159 / 0.227 / 0.300 / 0.209 / 0.224 / 0.186 / 0.268 / 0.284 / 0.207 / 0.167 / 0.273 / 0.279 / 0.198 / 0.250 / 0.192 / 0.233
310 / 0.158 / 0.250 / 0.122 / 0.167 / 0.157 / 0.128 / 0.132 / 0.102 / 0.159 / 0.149 / 0.069 / 0.214 / 0.148 / 0.140 / 0.198 / 0.114 / 0.135 / 0.100
313 / 0.711 / 0.529 / 0.720 / 0.606 / 0.543 / 0.663 / 0.645 / 0.712 / 0.573 / 0.568 / 0.724 / 0.619 / 0.580 / 0.581 / 0.605 / 0.636 / 0.673 / 0.667

b)populations from basin 2

Locus / Allele/n / NHYR01 / SHYR03 / SHYR06 / SHYR08 / VAL01 / VAL03 / VAL04 / VAL05 / VAL06 / VAL07 / VAL08 / SPR05 / BRE05 / SAN05 / SAN07 / SAN08 / LAG01
BFRO13 / N / 28 / 17 / 30 / 41 / 53 / 41 / 19 / 21 / 35 / 43 / 42 / 25 / 20 / 20 / 37 / 44 / 17
235 / 0.357 / 0.471 / 0.267 / 0.415 / 0.236 / 0.293 / 0.342 / 0.310 / 0.286 / 0.337 / 0.417 / 0.300 / 0.350 / 0.275 / 0.500 / 0.466 / 0.324
239 / 0.339 / 0.382 / 0.467 / 0.402 / 0.509 / 0.439 / 0.395 / 0.548 / 0.500 / 0.430 / 0.417 / 0.480 / 0.375 / 0.525 / 0.338 / 0.409 / 0.235
243 / 0.232 / 0.029 / 0.150 / 0.122 / 0.170 / 0.146 / 0.105 / 0.071 / 0.157 / 0.140 / 0.071 / 0.180 / 0.150 / 0.150 / 0.135 / 0.091 / 0.382
247 / 0.071 / 0.118 / 0.117 / 0.061 / 0.085 / 0.122 / 0.158 / 0.071 / 0.057 / 0.093 / 0.095 / 0.040 / 0.125 / 0.050 / 0.027 / 0.034 / 0.059
251 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000
Tth-213 / N / 24 / 19 / 30 / 42 / 51 / 41 / 19 / 15 / 37 / 43 / 43 / 23 / 19 / 16 / 38 / 44 / 14
283 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.020 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000
291 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.020 / 0.000 / 0.053 / 0.033 / 0.014 / 0.012 / 0.000 / 0.022 / 0.000 / 0.000 / 0.013 / 0.000 / 0.036
295 / 0.313 / 0.263 / 0.400 / 0.393 / 0.333 / 0.366 / 0.342 / 0.333 / 0.324 / 0.291 / 0.302 / 0.370 / 0.289 / 0.563 / 0.329 / 0.500 / 0.393
299 / 0.042 / 0.079 / 0.067 / 0.119 / 0.069 / 0.134 / 0.158 / 0.100 / 0.081 / 0.081 / 0.174 / 0.065 / 0.026 / 0.156 / 0.079 / 0.045 / 0.107
303 / 0.313 / 0.237 / 0.133 / 0.190 / 0.225 / 0.195 / 0.079 / 0.233 / 0.257 / 0.244 / 0.163 / 0.304 / 0.263 / 0.063 / 0.289 / 0.250 / 0.143
307 / 0.000 / 0.000 / 0.033 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.012 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000
311 / 0.167 / 0.263 / 0.133 / 0.167 / 0.186 / 0.110 / 0.158 / 0.133 / 0.149 / 0.209 / 0.163 / 0.087 / 0.158 / 0.031 / 0.132 / 0.057 / 0.286
315 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.012 / 0.000 / 0.000 / 0.026 / 0.000 / 0.026 / 0.011 / 0.000
319 / 0.021 / 0.026 / 0.033 / 0.000 / 0.039 / 0.024 / 0.000 / 0.000 / 0.027 / 0.023 / 0.035 / 0.043 / 0.026 / 0.000 / 0.013 / 0.045 / 0.000
323 / 0.146 / 0.132 / 0.200 / 0.131 / 0.108 / 0.171 / 0.211 / 0.167 / 0.149 / 0.116 / 0.163 / 0.109 / 0.211 / 0.156 / 0.118 / 0.091 / 0.036
327 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.031 / 0.000 / 0.000 / 0.000
Tth-414 / N / 27 / 19 / 29 / 42 / 53 / 41 / 18 / 19 / 37 / 43 / 43 / 24 / 20 / 17 / 37 / 44 / 14
389 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.014 / 0.000 / 0.000
393 / 0.037 / 0.026 / 0.017 / 0.036 / 0.038 / 0.037 / 0.028 / 0.026 / 0.095 / 0.023 / 0.058 / 0.063 / 0.000 / 0.029 / 0.014 / 0.023 / 0.036
397 / 0.241 / 0.184 / 0.293 / 0.250 / 0.160 / 0.183 / 0.083 / 0.000 / 0.216 / 0.186 / 0.174 / 0.146 / 0.200 / 0.294 / 0.230 / 0.091 / 0.214
401 / 0.426 / 0.368 / 0.362 / 0.369 / 0.425 / 0.390 / 0.417 / 0.368 / 0.486 / 0.419 / 0.570 / 0.417 / 0.325 / 0.471 / 0.378 / 0.455 / 0.393
405 / 0.222 / 0.263 / 0.172 / 0.179 / 0.208 / 0.268 / 0.194 / 0.447 / 0.095 / 0.244 / 0.105 / 0.146 / 0.275 / 0.147 / 0.135 / 0.114 / 0.250
409 / 0.074 / 0.158 / 0.155 / 0.155 / 0.170 / 0.122 / 0.250 / 0.158 / 0.081 / 0.116 / 0.081 / 0.208 / 0.175 / 0.059 / 0.230 / 0.295 / 0.107
413 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.012 / 0.000 / 0.000 / 0.028 / 0.000 / 0.027 / 0.012 / 0.012 / 0.021 / 0.025 / 0.000 / 0.000 / 0.023 / 0.000
Tth-309 / N / 22 / 19 / 30 / 42 / 51 / 41 / 18 / 20 / 37 / 42 / 43 / 24 / 21 / 20 / 38 / 44 / 17
447 / 0.750 / 0.447 / 0.550 / 0.536 / 0.578 / 0.659 / 0.556 / 0.450 / 0.649 / 0.583 / 0.593 / 0.688 / 0.524 / 0.600 / 0.658 / 0.682 / 0.441
451 / 0.250 / 0.553 / 0.450 / 0.464 / 0.422 / 0.341 / 0.444 / 0.550 / 0.351 / 0.417 / 0.407 / 0.313 / 0.476 / 0.400 / 0.342 / 0.318 / 0.559
BFRO10 / N / 28 / 19 / 30 / 41 / 52 / 41 / 19 / 20 / 37 / 43 / 43 / 25 / 21 / 20 / 38 / 43 / 17
96 / 0.143 / 0.158 / 0.100 / 0.207 / 0.183 / 0.317 / 0.079 / 0.100 / 0.135 / 0.221 / 0.209 / 0.260 / 0.310 / 0.250 / 0.066 / 0.140 / 0.147
122 / 0.857 / 0.842 / 0.900 / 0.793 / 0.817 / 0.683 / 0.921 / 0.900 / 0.865 / 0.779 / 0.791 / 0.720 / 0.690 / 0.700 / 0.921 / 0.837 / 0.853
124 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.020 / 0.000 / 0.050 / 0.013 / 0.012 / 0.000
126 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000
128 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.012 / 0.000
BFRO15 / N / 27 / 19 / 30 / 42 / 53 / 41 / 19 / 21 / 37 / 43 / 43 / 25 / 21 / 20 / 38 / 44 / 17
144 / 0.537 / 0.474 / 0.567 / 0.369 / 0.443 / 0.427 / 0.368 / 0.548 / 0.459 / 0.523 / 0.453 / 0.600 / 0.429 / 0.550 / 0.513 / 0.636 / 0.324
154 / 0.463 / 0.526 / 0.433 / 0.631 / 0.557 / 0.573 / 0.632 / 0.452 / 0.541 / 0.477 / 0.547 / 0.400 / 0.571 / 0.450 / 0.487 / 0.364 / 0.676
BFRO18 / N / 28 / 15 / 30 / 42 / 53 / 38 / 19 / 21 / 37 / 43 / 43 / 25 / 20 / 19 / 38 / 44 / 17
181 / 0.321 / 0.533 / 0.450 / 0.405 / 0.443 / 0.487 / 0.658 / 0.476 / 0.392 / 0.453 / 0.547 / 0.520 / 0.600 / 0.526 / 0.526 / 0.432 / 0.529
183 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.012 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000
191 / 0.554 / 0.400 / 0.433 / 0.393 / 0.462 / 0.355 / 0.263 / 0.452 / 0.514 / 0.465 / 0.337 / 0.380 / 0.350 / 0.368 / 0.263 / 0.318 / 0.441
193 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.012 / 0.000 / 0.013 / 0.000 / 0.000 / 0.014 / 0.012 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.013 / 0.011 / 0.000
195 / 0.125 / 0.067 / 0.117 / 0.190 / 0.094 / 0.145 / 0.079 / 0.071 / 0.081 / 0.070 / 0.105 / 0.100 / 0.050 / 0.105 / 0.197 / 0.239 / 0.029

Cont.

Locus / Allele/n / NHYR01 / SHYR03 / SHYR06 / SHYR08 / VAL01 / VAL03 / VAL04 / VAL05 / VAL06 / VAL07 / VAL08 / SPR05 / BRE05 / SAN05 / SAN07 / SAN08 / LAG01
Tth-207 / N / 28 / 18 / 30 / 42 / 52 / 41 / 19 / 18 / 37 / 43 / 43 / 25 / 21 / 16 / 38 / 44 / 17
216 / 0.357 / 0.444 / 0.383 / 0.417 / 0.375 / 0.427 / 0.474 / 0.444 / 0.432 / 0.360 / 0.349 / 0.540 / 0.548 / 0.281 / 0.211 / 0.307 / 0.206
224 / 0.643 / 0.556 / 0.617 / 0.583 / 0.625 / 0.573 / 0.526 / 0.556 / 0.568 / 0.640 / 0.651 / 0.460 / 0.452 / 0.719 / 0.789 / 0.693 / 0.794
BFRO9 / N / 28 / 19 / 30 / 42 / 53 / 41 / 19 / 21 / 37 / 43 / 43 / 25 / 21 / 20 / 38 / 44 / 17
243 / 0.071 / 0.026 / 0.067 / 0.060 / 0.123 / 0.061 / 0.158 / 0.095 / 0.122 / 0.023 / 0.058 / 0.080 / 0.095 / 0.125 / 0.053 / 0.045 / 0.029
247 / 0.929 / 0.974 / 0.933 / 0.940 / 0.877 / 0.939 / 0.842 / 0.905 / 0.878 / 0.977 / 0.942 / 0.920 / 0.905 / 0.875 / 0.947 / 0.955 / 0.971
Tth-438 / N / 24 / 18 / 30 / 42 / 53 / 41 / 18 / 18 / 35 / 42 / 43 / 25 / 19 / 19 / 38 / 44 / 16
261 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.019 / 0.000 / 0.000 / 0.028 / 0.000 / 0.024 / 0.012 / 0.020 / 0.000 / 0.053 / 0.000 / 0.000 / 0.000
265 / 0.229 / 0.167 / 0.183 / 0.190 / 0.179 / 0.146 / 0.139 / 0.111 / 0.200 / 0.119 / 0.186 / 0.080 / 0.211 / 0.237 / 0.197 / 0.148 / 0.094
269 / 0.188 / 0.361 / 0.283 / 0.333 / 0.292 / 0.244 / 0.361 / 0.417 / 0.300 / 0.357 / 0.267 / 0.420 / 0.342 / 0.368 / 0.408 / 0.307 / 0.375
273 / 0.250 / 0.250 / 0.300 / 0.262 / 0.283 / 0.329 / 0.222 / 0.333 / 0.286 / 0.226 / 0.314 / 0.280 / 0.289 / 0.211 / 0.132 / 0.318 / 0.406
277 / 0.021 / 0.000 / 0.017 / 0.048 / 0.019 / 0.061 / 0.028 / 0.056 / 0.029 / 0.000 / 0.035 / 0.000 / 0.000 / 0.053 / 0.000 / 0.011 / 0.031
281 / 0.042 / 0.028 / 0.050 / 0.036 / 0.047 / 0.073 / 0.083 / 0.056 / 0.043 / 0.060 / 0.093 / 0.060 / 0.053 / 0.000 / 0.013 / 0.057 / 0.000
285 / 0.021 / 0.028 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.028 / 0.000 / 0.000 / 0.024 / 0.000 / 0.000 / 0.026 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000
289 / 0.042 / 0.028 / 0.050 / 0.012 / 0.047 / 0.012 / 0.000 / 0.000 / 0.086 / 0.048 / 0.047 / 0.000 / 0.026 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.031
293 / 0.208 / 0.111 / 0.117 / 0.119 / 0.085 / 0.110 / 0.139 / 0.000 / 0.057 / 0.107 / 0.047 / 0.100 / 0.053 / 0.079 / 0.250 / 0.114 / 0.063
297 / 0.000 / 0.028 / 0.000 / 0.000 / 0.028 / 0.024 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.036 / 0.000 / 0.040 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.045 / 0.000
BFRO11 / N / 28 / 19 / 30 / 42 / 53 / 40 / 19 / 21 / 35 / 43 / 43 / 25 / 20 / 20 / 38 / 44 / 17
86 / 0.750 / 0.632 / 0.817 / 0.702 / 0.557 / 0.763 / 0.579 / 0.643 / 0.686 / 0.616 / 0.709 / 0.600 / 0.600 / 0.725 / 0.763 / 0.750 / 0.706
102 / 0.250 / 0.368 / 0.183 / 0.298 / 0.443 / 0.238 / 0.421 / 0.357 / 0.314 / 0.384 / 0.291 / 0.400 / 0.400 / 0.275 / 0.237 / 0.250 / 0.294
Tth-313 / N / 28 / 18 / 30 / 42 / 51 / 41 / 18 / 20 / 37 / 43 / 43 / 25 / 21 / 18 / 37 / 44 / 17
180 / 0.143 / 0.278 / 0.083 / 0.143 / 0.167 / 0.146 / 0.028 / 0.075 / 0.149 / 0.116 / 0.093 / 0.100 / 0.119 / 0.167 / 0.284 / 0.182 / 0.206
184 / 0.339 / 0.306 / 0.433 / 0.298 / 0.422 / 0.341 / 0.500 / 0.250 / 0.419 / 0.360 / 0.314 / 0.320 / 0.238 / 0.417 / 0.216 / 0.330 / 0.265
188 / 0.179 / 0.139 / 0.183 / 0.131 / 0.098 / 0.159 / 0.083 / 0.125 / 0.081 / 0.093 / 0.198 / 0.240 / 0.119 / 0.056 / 0.095 / 0.102 / 0.235
192 / 0.107 / 0.028 / 0.050 / 0.024 / 0.039 / 0.073 / 0.139 / 0.025 / 0.027 / 0.070 / 0.023 / 0.100 / 0.143 / 0.083 / 0.027 / 0.091 / 0.029
196 / 0.214 / 0.250 / 0.250 / 0.405 / 0.265 / 0.268 / 0.222 / 0.525 / 0.324 / 0.349 / 0.337 / 0.240 / 0.357 / 0.250 / 0.378 / 0.295 / 0.265
200 / 0.018 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.010 / 0.012 / 0.028 / 0.000 / 0.000 / 0.012 / 0.035 / 0.000 / 0.024 / 0.028 / 0.000 / 0.000 / 0.000
Ogo2 / N / 28 / 16 / 30 / 41 / 53 / 41 / 19 / 20 / 37 / 43 / 43 / 25 / 21 / 16 / 38 / 44 / 17
233 / 0.625 / 0.594 / 0.467 / 0.329 / 0.453 / 0.500 / 0.553 / 0.500 / 0.432 / 0.500 / 0.442 / 0.400 / 0.381 / 0.594 / 0.592 / 0.398 / 0.559
237 / 0.161 / 0.219 / 0.400 / 0.463 / 0.387 / 0.268 / 0.289 / 0.375 / 0.419 / 0.326 / 0.419 / 0.320 / 0.476 / 0.281 / 0.250 / 0.432 / 0.176
241 / 0.214 / 0.188 / 0.133 / 0.207 / 0.160 / 0.232 / 0.158 / 0.125 / 0.149 / 0.163 / 0.140 / 0.280 / 0.143 / 0.125 / 0.158 / 0.170 / 0.265
245 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.012 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000
Tth-433b / N / 28 / 18 / 30 / 42 / 52 / 41 / 18 / 18 / 35 / 43 / 43 / 24 / 19 / 16 / 38 / 44 / 15
291 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.012 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.012 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000
295 / 0.161 / 0.056 / 0.083 / 0.060 / 0.087 / 0.073 / 0.111 / 0.139 / 0.057 / 0.070 / 0.116 / 0.146 / 0.105 / 0.094 / 0.237 / 0.182 / 0.067
299 / 0.482 / 0.500 / 0.483 / 0.500 / 0.413 / 0.366 / 0.389 / 0.472 / 0.386 / 0.430 / 0.337 / 0.417 / 0.526 / 0.719 / 0.434 / 0.420 / 0.567
303 / 0.196 / 0.361 / 0.233 / 0.310 / 0.327 / 0.354 / 0.361 / 0.306 / 0.357 / 0.314 / 0.349 / 0.333 / 0.237 / 0.125 / 0.250 / 0.261 / 0.133
307 / 0.107 / 0.056 / 0.083 / 0.083 / 0.096 / 0.122 / 0.028 / 0.056 / 0.114 / 0.105 / 0.163 / 0.083 / 0.053 / 0.000 / 0.066 / 0.125 / 0.067
311 / 0.018 / 0.028 / 0.033 / 0.000 / 0.019 / 0.024 / 0.028 / 0.000 / 0.029 / 0.012 / 0.000 / 0.000 / 0.026 / 0.000 / 0.013 / 0.000 / 0.033
315 / 0.036 / 0.000 / 0.083 / 0.048 / 0.038 / 0.049 / 0.083 / 0.028 / 0.057 / 0.070 / 0.023 / 0.021 / 0.026 / 0.063 / 0.000 / 0.011 / 0.133
319 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.019 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.026 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000

Cont.

Locus / Allele/n / NHYR01 / SHYR03 / SHYR06 / SHYR08 / VAL01 / VAL03 / VAL04 / VAL05 / VAL06 / VAL07 / VAL08 / SPR05 / BRE05 / SAN05 / SAN07 / SAN08 / LAG01
Tth-445 / N / 25 / 19 / 30 / 42 / 50 / 41 / 18 / 17 / 37 / 41 / 43 / 23 / 16 / 16 / 38 / 44 / 14
374 / 0.240 / 0.211 / 0.267 / 0.226 / 0.210 / 0.146 / 0.194 / 0.265 / 0.203 / 0.232 / 0.267 / 0.087 / 0.156 / 0.250 / 0.224 / 0.136 / 0.214
378 / 0.020 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.010 / 0.012 / 0.000 / 0.000 / 0.014 / 0.000 / 0.012 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.013 / 0.000 / 0.000
382 / 0.220 / 0.105 / 0.167 / 0.190 / 0.120 / 0.134 / 0.167 / 0.059 / 0.068 / 0.195 / 0.116 / 0.130 / 0.219 / 0.000 / 0.211 / 0.148 / 0.071
386 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.010 / 0.000 / 0.000 / 0.029 / 0.014 / 0.000 / 0.012 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.036
390 / 0.120 / 0.184 / 0.117 / 0.107 / 0.180 / 0.256 / 0.194 / 0.324 / 0.189 / 0.159 / 0.140 / 0.217 / 0.281 / 0.281 / 0.237 / 0.273 / 0.179
394 / 0.140 / 0.079 / 0.133 / 0.155 / 0.100 / 0.146 / 0.083 / 0.029 / 0.081 / 0.122 / 0.140 / 0.087 / 0.031 / 0.156 / 0.039 / 0.091 / 0.286
398 / 0.020 / 0.026 / 0.000 / 0.060 / 0.050 / 0.024 / 0.056 / 0.000 / 0.014 / 0.024 / 0.035 / 0.087 / 0.063 / 0.031 / 0.053 / 0.034 / 0.036
402 / 0.040 / 0.105 / 0.083 / 0.083 / 0.080 / 0.049 / 0.083 / 0.176 / 0.108 / 0.073 / 0.081 / 0.152 / 0.156 / 0.063 / 0.039 / 0.080 / 0.000
406 / 0.020 / 0.026 / 0.050 / 0.012 / 0.000 / 0.012 / 0.000 / 0.000 / 0.054 / 0.024 / 0.035 / 0.022 / 0.031 / 0.094 / 0.013 / 0.057 / 0.000
410 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.027 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.013 / 0.000 / 0.036
414 / 0.000 / 0.000 / 0.017 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000
418 / 0.180 / 0.211 / 0.167 / 0.167 / 0.210 / 0.195 / 0.222 / 0.118 / 0.216 / 0.159 / 0.151 / 0.152 / 0.063 / 0.063 / 0.158 / 0.182 / 0.143
422 / 0.000 / 0.053 / 0.000 / 0.000 / 0.030 / 0.024 / 0.000 / 0.000 / 0.014 / 0.012 / 0.012 / 0.065 / 0.000 / 0.063 / 0.000 / 0.000 / 0.000
Tth-415 / N / 28 / 19 / 30 / 42 / 53 / 41 / 18 / 19 / 35 / 43 / 43 / 25 / 20 / 17 / 38 / 44 / 17
189 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000
193 / 0.107 / 0.105 / 0.067 / 0.012 / 0.066 / 0.037 / 0.000 / 0.105 / 0.071 / 0.012 / 0.023 / 0.100 / 0.075 / 0.029 / 0.053 / 0.023 / 0.029
197 / 0.036 / 0.026 / 0.033 / 0.024 / 0.019 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.029 / 0.035 / 0.023 / 0.000 / 0.025 / 0.000 / 0.000 / 0.011 / 0.029
201 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.012 / 0.000 / 0.012 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000
205 / 0.179 / 0.158 / 0.117 / 0.179 / 0.094 / 0.110 / 0.111 / 0.079 / 0.071 / 0.140 / 0.140 / 0.080 / 0.225 / 0.147 / 0.105 / 0.182 / 0.118
209 / 0.268 / 0.158 / 0.283 / 0.238 / 0.226 / 0.317 / 0.250 / 0.263 / 0.286 / 0.256 / 0.314 / 0.260 / 0.275 / 0.294 / 0.197 / 0.261 / 0.353
213 / 0.250 / 0.395 / 0.417 / 0.381 / 0.396 / 0.378 / 0.472 / 0.342 / 0.371 / 0.512 / 0.337 / 0.460 / 0.225 / 0.382 / 0.539 / 0.398 / 0.294
217 / 0.161 / 0.158 / 0.083 / 0.155 / 0.189 / 0.134 / 0.139 / 0.211 / 0.171 / 0.047 / 0.151 / 0.080 / 0.150 / 0.147 / 0.105 / 0.114 / 0.176
221 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.009 / 0.012 / 0.028 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.012 / 0.020 / 0.025 / 0.000 / 0.000 / 0.011 / 0.000
225 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000
Tth-419a / N / 28 / 19 / 30 / 42 / 53 / 41 / 19 / 21 / 36 / 43 / 43 / 25 / 21 / 20 / 38 / 44 / 17
106 / 0.214 / 0.184 / 0.200 / 0.179 / 0.198 / 0.183 / 0.184 / 0.286 / 0.236 / 0.174 / 0.186 / 0.140 / 0.071 / 0.125 / 0.118 / 0.080 / 0.147
110 / 0.786 / 0.816 / 0.800 / 0.821 / 0.802 / 0.817 / 0.816 / 0.714 / 0.764 / 0.826 / 0.814 / 0.860 / 0.929 / 0.875 / 0.882 / 0.920 / 0.853
Tth-211 / N / 28 / 19 / 29 / 42 / 52 / 41 / 18 / 20 / 37 / 41 / 43 / 25 / 21 / 20 / 37 / 44 / 17
232 / 0.000 / 0.000 / 0.017 / 0.000 / 0.010 / 0.012 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.037 / 0.012 / 0.000 / 0.000 / 0.025 / 0.000 / 0.000 / 0.000
234 / 0.000 / 0.053 / 0.000 / 0.012 / 0.010 / 0.012 / 0.000 / 0.000 / 0.027 / 0.000 / 0.012 / 0.040 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.029
236 / 0.036 / 0.026 / 0.069 / 0.000 / 0.048 / 0.037 / 0.056 / 0.050 / 0.027 / 0.049 / 0.012 / 0.000 / 0.048 / 0.025 / 0.000 / 0.011 / 0.000
238 / 0.000 / 0.000 / 0.017 / 0.000 / 0.000 / 0.037 / 0.000 / 0.000 / 0.027 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.000
240 / 0.964 / 0.921 / 0.897 / 0.988 / 0.933 / 0.902 / 0.944 / 0.950 / 0.919 / 0.915 / 0.965 / 0.960 / 0.952 / 0.950 / 1.000 / 0.989 / 0.971
Tth-214 / N / 27 / 18 / 30 / 41 / 51 / 41 / 19 / 19 / 37 / 43 / 43 / 24 / 20 / 16 / 38 / 44 / 17
292 / 0.259 / 0.194 / 0.150 / 0.134 / 0.157 / 0.159 / 0.237 / 0.316 / 0.203 / 0.174 / 0.128 / 0.083 / 0.325 / 0.219 / 0.263 / 0.295 / 0.324
310 / 0.148 / 0.250 / 0.150 / 0.317 / 0.167 / 0.134 / 0.158 / 0.079 / 0.162 / 0.209 / 0.128 / 0.146 / 0.175 / 0.000 / 0.039 / 0.125 / 0.147
313 / 0.593 / 0.556 / 0.700 / 0.549 / 0.676 / 0.707 / 0.605 / 0.605 / 0.635 / 0.616 / 0.744 / 0.771 / 0.500 / 0.781 / 0.697 / 0.580 / 0.529

Table S3.Pairwise geographic distances in km.

pop / RAU / MYR / NSKO / SSKO / STE / BRA / ROT / BRY / NHYR / SHYR / VAL / SPR / BRE / SAN / LAG
RAU / 0,00
MYR / 0,39 / 0,00
NSKO / 0,54 / 0,46 / 0,00
SSKO / 2,00 / 2,02 / 1,52 / 0,00
STE / 2,32 / 2,35 / 1,84 / 0,61 / 0,00
BRA / 2,47 / 2,42 / 1,95 / 0,77 / 0,66 / 0,00
ROT / 1,52 / 1,51 / 1,09 / 0,53 / 0,82 / 0,94 / 0,00
BRY / 4,07 / 4,09 / 3,68 / 2,55 / 2,56 / 2,03 / 2,59 / 0,00
NHYR / 5,10 / 5,15 / 4,65 / 3,62 / 3,59 / 3,04 / 3,54 / 1,13 / 0,00
SHYR / 6,30 / 6,34 / 5,87 / 4,82 / 4,81 / 4,25 / 4,76 / 2,31 / 1,35 / 0,00
VAL / 8,22 / 8,27 / 7,79 / 6,74 / 6,73 / 6,17 / 6,68 / 4,23 / 3,28 / 1,84 / 0,00
SPR / 8,55 / 8,60 / 8,12 / 7,07 / 7,06 / 6,50 / 7,01 / 4,57 / 3,44 / 2,29 / 0,49 / 0,00
BRE / 9,24 / 9,29 / 8,81 / 7,76 / 7,75 / 7,19 / 7,70 / 5,25 / 4,30 / 2,93 / 1,26 / 1,02 / 0,00
SAN / 9,99 / 10,04 / 9,56 / 8,51 / 8,50 / 7,94 / 8,45 / 6,00 / 5,08 / 3,66 / 1,83 / 1,62 / 0,68 / 0,00
LAG / 9,87 / 9,93 / 9,45 / 8,40 / 8,39 / 7,83 / 8,34 / 5,89 / 4,92 / 3,61 / 1,94 / 1,67 / 0,70 / 0,37 / 0,00

Table S4.Pairwise FST values and exact G tests (significant pairwise comparisons indicated).

pop / RAU04 / MYR04 / NSKO01 / SSKO01 / SSKO04 / SSKO06 / SSKO07 / SSKO08 / STE01 / STE04 / STE05 / STE06 / STE07 / STE08 / BRA01 / BRA06 / ROT06
MYR04 / 0,0029
NSKO01 / 0,0063 / 0.0056*
SSKO01 / 0.008* / 0.009** / 0.0069**
SSKO04 / 0,0056 / 0,0033 / 0,0042 / 0,0025
SSKO06 / 0,0011 / 0,0029 / -0,0012 / 0,0006 / 0,0013
SSKO07 / 0,0081 / 0,006 / -0,0014 / 0,0061 / 0,0024 / -0,0022
SSKO08 / 0,0056 / 0,0037 / -0,0024 / 0,0019 / -0,0014 / -0,0037 / -0,002
STE01 / 0,0052 / 0,0025 / -0,0014 / 0.0072* / 0,0000 / -0,0011 / 0,0002 / 0,0008
STE04 / 0,007 / -0,0005 / 0,0031 / 0.0084* / 0,0021 / 0,0015 / -0,0018 / 0,0019 / 0,0006
STE05 / 0.0129* / 0,0065 / 0,0023 / 0.0162** / 0,0038 / 0.0087* / 0,0017 / 0,0024 / 0,0022 / 0,0039
STE06 / -0,0009 / 0,0005 / -0,0028 / 0,0004 / 0,0012 / -0,0039 / -0,0004 / -0,0018 / -0,0004 / 0,0014 / 0,0044
STE07 / 0,0009 / 0,0004 / 0,0009 / 0.0063* / 0,0017 / 0,0014 / -0,0002 / 0,0024 / -0,0039 / 0,001 / 0,0058 / -0,0029
STE08 / 0,0127 / 0,0041 / 0,0026 / 0,0047 / 0,0003 / -0,0006 / 0,0022 / -0,0014 / 0,0015 / 0,0028 / 0.0111* / 0,0025 / 0,0032
BRA01 / -0,0011 / 0,002 / -0,0001 / 0,003 / -0,0007 / -0,0024 / -0,0026 / -0,0012 / -0,0022 / -0,001 / 0,0046 / -0,0039 / -0,0005 / 0,0027
BRA06 / 0,0039 / -0,0001 / 0.0057* / 0.0164* / 0,0073 / 0,0058 / -0,0024 / 0,0066 / 0,0053 / 0,0024 / 0,0026 / 0,0026 / -0,0019 / 0,0095 / -0,0001
ROT06 / 0.0111* / 0.0098* / 0.0066* / 0.012** / 0,0072 / 0,0033 / 0,001 / 0.0042* / 0,0034 / 0,0013 / 0.0085* / 0,0018 / 0,0005 / 0.0078* / 0.0061* / 0,004
BRY01 / 0,0042 / 0,0065 / 0.0062* / 0.0159** / 0,0098 / 0,0054 / 0,0039 / 0,0045 / 0.0112* / 0.0073* / 0,0097 / 0,0011 / 0,0056 / 0,0077 / 0,0036 / 0,0018 / 0,0035
NHYR01 / 0,0127 / 0.0105* / 0.0102* / 0,0042 / 0,0076 / 0,0035 / 0,0064 / 0,004 / 0,0118 / 0,008 / 0.0145* / -0,0001 / 0,005 / 0,005 / 0.0077* / 0,007 / 0,0062
SHYR03 / -0,0052 / -0,0009 / 0.0122* / 0.0139* / 0,0037 / 0,0063 / 0,0074 / 0,0071 / 0,0049 / 0,003 / 0,0111 / 0,0028 / 0,0017 / 0,0081 / -0,0002 / 0,0019 / 0,0101
SHYR06 / -0,0045 / 0.0087* / 0.0056* / 0,0073 / 0,0059 / 0,0006 / 0,0013 / 0.0043* / 0,0052 / 0,0043 / 0.0114* / 0,0024 / 0,0041 / 0,0083 / -0,0005 / 0,0049 / 0,0011
SHYR08 / 0,0036 / 0,0022 / 0.0117** / 0.0121** / 0,0056 / 0.0038* / 0.0077* / 0.0063* / 0,0037 / 0.006* / 0.0144** / 0,0047 / 0.0067* / 0,006 / 0,0024 / 0,007 / 0.0066*
VAL01 / 0,0013 / 0,0004 / 0,0013 / 0.0118** / 0,0041 / -0,0001 / 0,0038 / 0,0029 / -0,0008 / 0,0041 / 0,0083 / -0,0003 / -0,0021 / 0,0054 / 0,0036 / 0,0061 / 0,0007
VAL03 / 0,0019 / 0,0051 / 0,003 / 0.0085** / 0,0046 / 0,0008 / 0,0034 / 0,0015 / 0,0021 / 0,0016 / 0,0036 / 0,0019 / 0,0033 / 0,0077 / 0,0025 / 0,0065 / 0,0045
VAL04 / -0,0032 / -0,0004 / 0,0077 / 0.017* / 0,0097 / 0,0059 / 0,0073 / 0.0077* / 0,0068 / 0,0053 / 0.017* / 0,0065 / 0,0009 / 0,0124 / 0,0038 / 0,0059 / 0,0071
VAL05 / 0,0062 / 0.0093* / 0.0139* / 0.0226** / 0,0083 / 0.0133* / 0.0158* / 0.0134* / 0,0048 / 0,0061 / 0,0105 / 0,01 / 0,0065 / 0.0141* / 0,0086 / 0.0129* / 0,0076
VAL06 / 0,0005 / 0,002 / 0.0021* / 0.0053* / 0,0035 / -0,0008 / 0,0033 / 0,0016 / -0,0016 / 0,0032 / 0.0106* / -0,0023 / -0,0035 / 0,0047 / -0,0001 / 0,0054 / 0,0015
VAL07 / 0,0018 / -0,0006 / 0.0053* / 0.0126** / 0,0049 / 0,003 / 0.0053* / 0.0039* / -0,0014 / 0,0044 / 0,0058 / 0,0015 / -0,0003 / 0,0042 / 0,0014 / 0,004 / 0,0053
VAL08 / -0,0038 / 0,0026 / 0.0048* / 0.0067* / 0.0098* / 0,0035 / 0.008* / 0,0053 / 0,0016 / 0,0069 / 0.0103* / 0,0016 / 0,0003 / 0,0092 / 0,0001 / 0,0026 / 0.01*
SPR05 / 0,008 / 0.0126* / 0,0032 / 0,0222** / 0.0137* / 0.0085* / 0,0001 / 0.0064* / 0,002 / 0,0055 / 0,0053 / 0,0057 / -0,0009 / 0.0156* / 0.0057* / 0,0048 / 0,0007
BRE05 / 0,0155 / 0,0103 / 0.0151* / 0.0199** / 0,0063 / 0.0154* / 0,0087 / 0.0132* / 0,0047 / 0,0076 / 0,0092 / 0,0107 / 0,0011 / 0,0089 / 0,0081 / 0,0061 / 0,0042
SAN05 / 0.0103* / 0.0104* / 0.0064* / 0.0208** / 0.0178* / 0.0133** / 0.0086* / 0.0131** / 0.0193** / 0,0078 / 0.0126* / 0.0071* / 0.0123* / 0.0164* / 0.0103* / 0,0032 / 0,0086
SAN07 / 0.0152** / 0,0186** / 0,024** / 0,0259** / 0,031** / 0.0176** / 0.019** / 0,0214** / 0,0274** / 0.0229** / 0,0332** / 0.0187** / 0.0205** / 0,0241** / 0,02** / 0.0144* / 0.0278**
SAN08 / 0.0107* / 0,0167** / 0.0102** / 0,0197** / 0.0162** / 0.007** / 0.003* / 0,0135** / 0.0101** / 0.0139** / 0.0176** / 0.0082* / 0.0076* / 0.0134** / 0.0074** / 0,0031 / 0.014**
LAG01 / 0.013* / 0.0133* / 0.0282** / 0.0209* / 0.0166* / 0.0163* / 0.0259* / 0.0252** / 0.0225* / 0.0197* / 0.0362** / 0.0175* / 0.0169* / 0.0203* / 0.021* / 0,0157 / 0.024*

Cont.

pop / BRY01 / NHYR01 / SHYR03 / SHYR06 / SHYR08 / VAL01 / VAL03 / VAL04 / VAL05 / VAL06 / VAL07 / VAL08 / SPR05 / BRE05 / SAN05 / SAN07 / SAN08
NHYR01 / 0,0036
SHYR03 / 0,0023 / 0,0066
SHYR06 / 0,0014 / 0,0038 / 0,0033
SHYR08 / 0.0123* / 0.0149* / -0,0011 / 0,0037
VAL01 / 0,005 / 0,0098 / -0,002 / 0,0023 / 0,0039
VAL03 / 0.0094* / 0,0059 / 0,0028 / 0,0022 / 0,0054 / 0,0023
VAL04 / 0,0075 / 0.0184* / -0,0045 / 0,005 / 0.0074* / -0,0012 / 0,0035
VAL05 / 0.0163* / 0.0231** / 0,0012 / 0.0103* / 0.0136** / 0,0057 / 0.0134* / 0,0079
VAL06 / 0.0076* / 0,0048 / 0,0017 / -0,0019 / 0,0028 / -0,0051 / 0,0013 / 0,0032 / 0,0064
VAL07 / 0,0033 / 0,0062 / -0,0057 / 0,0001 / 0,0019 / -0,0025 / 0,0015 / 0,0018 / 0.0062* / -0,0004
VAL08 / 0,0113 / 0.0134* / 0,0042 / 0,0023 / 0,0037 / 0,0033 / 0,0004 / 0,0046 / 0.0131* / -0,0003 / 0,0026
SPR05 / 0.0105* / 0.015* / 0,0058 / 0.0077* / 0.0119* / 0,0025 / 0,0004 / 0,006 / 0.0142* / 0,0035 / 0,0017 / 0,0077
BRE05 / 0,0142 / 0.0201* / -0,0001 / 0,0141 / 0,0026 / 0,0073 / 0,0072 / 0,005 / 0,0064 / 0,0101 / 0,0063 / 0,0117 / 0,0067
SAN05 / 0.0019* / 0.0149* / 0.0162* / 0,0032 / 0.0181** / 0.0105* / 0.0076* / 0.0157* / 0.0207* / 0.0108* / 0.0108* / 0.0114* / 0.0137* / 0.019*
SAN07 / 0.0202** / 0.0146* / 0.0105* / 0.0162** / 0,0212** / 0,0217** / 0,0197** / 0.0179** / 0.0278** / 0,0218** / 0.0131** / 0,0179** / 0.0229** / 0.0312** / 0.0177**
SAN08 / 0.016** / 0.0145* / 0.0148* / 0.0091* / 0.0137** / 0.0149** / 0.0122** / 0.0179** / 0.0206** / 0.0121** / 0.0111** / 0.0117** / 0,0091 / 0.0175* / 0.0142** / 0,0082
LAG01 / 0.02* / 0,0126 / 0,0063 / 0.0155* / 0.0134* / 0,0152 / 0.0148* / 0,0173 / 0.0232* / 0.0196* / 0,0132 / 0.0177* / 0.0333** / 0.0198* / 0,017 / 0.0241** / 0.0301**

*p0.05; **p0.001

Table S5. Candidate models for the whole dataset with and without putative outlier populations. Populations are sequentially excluded from the full model according to regression residual examinations (see main text, and Fig. 3), i.e., the first population to exclude is SAN07, and without SAN07 the next population to exclude is LAG01 and so on until no population exhibited the mean residuals significantly larger or smaller than zero.

Population
excluded / na / r2 b / p-valuec / AICcd / ΔAICce
None / 35 / 0.082 / 0.0001 / –241.53 / 5.64
SAN07 / 34 / 0.075 / 0.0001 / –243.16 / 4.01
LAG01 / 33 / 0.066 / 0.0001 / –247.17 / 0.00
SAN08 / 32 / 0.064 / 0.0001 / –243.16 / 4.01
SAN05 / 31 / 0.055 / 0.0001 / –239.81 / 7.36
VAL05 / 30 / 0.054 / 0.0003 / –236.23 / 10.95
SSKO01 / 29 / 0.057 / 0.0002 / –232.80 / 14.38
NHYR01 / 28 / 0.071 / 0.0002 / –228.98 / 18.19
BRE05 / 27 / 0.050 / 0.0009 / –224.13 / 23.04
STE05 / 26 / 0.055 / 0.0008 / –219.25 / 27.92
BRY01 / 25 / 0.065 / 0.0004 / –212.74 / 34.43
STE08 / 24 / 0.060 / 0.0006 / –206.79 / 40.38
SHYR08 / 23 / 0.063 / 0.0009 / –199.39 / 47.78
ROT06 / 22 / 0.086 / 0.0002 / –192.73 / 54.44
SPR05 / 21 / 0.076 / 0.0018 / –186.70 / 60.47
SSKO04 / 20 / 0.069 / 0.0028 / –178.60 / 68.57
BRA06 / 19 / 0.074 / 0.0039 / –170.44 / 76.73
VAL06 / 18 / 0.091 / 0.0034 / –161.80 / 85.37
BRA01 / 17 / 0.066 / 0.0125 / –152.42 / 94.75
STE06 / 16 / 0.043 / 0.0318 / –143.23 / 103.94
VAL01 / 15 / 0.053 / 0.0251 / –134.00 / 113.18
STE07 / 14 / 0.045 / 0.0408 / –124.19 / 122.98

an refers to the number of populations left in the model

br2values for each model

cp-value obtained from a Mantel test with 10 000 permutations

dthe corrected Akaike Information Criteria (AICc)

ethe difference between each model and the optimal one (ΔAICc). The number of parameters for each model is always three.

Table S6.Scores of each population sampled in a given year in the X (PC1), Y (PC2)space obtained from the Principal Components Analysis (PCA) using rda function from ‘vegan 1.11-4’ package in R.

Population / Scores on X / Scores on Y
RAU04 / -0.149 / 0.286
MYR04 / 0.010 / 0.000
NSKO01 / 0.397 / -0.060
SSKO01 / 0.877 / 0.407
SSKO04 / 0.505 / -0.065
SSKO06 / 0.550 / 0.506
SSKO07 / 0.570 / -0.586
SSKO08 / 0.776 / 0.013
STE01 / 0.306 / 0.129
STE04 / 0.163 / 0.104
STE05 / 0.203 / -0.358
STE06 / 0.398 / -0.325
STE07 / 0.159 / -0.313
STE08 / 0.615 / 0.060
BRA01 / 0.536 / -0.079
BRA06 / -0.084 / -0.720
ROT06 / -0.109 / -0.139
BRY01 / 0.141 / -0.276
NHYR01 / 0.251 / 0.060
SHYR03 / -0.559 / 0.169
SHYR06 / 0.033 / 0.444
SHYR08 / -0.169 / 0.194
VAL01 / -0.349 / 0.279
VAL03 / -0.267 / 0.574
VAL04 / -0.239 / 0.234
VAL05 / -0.237 / 0.210
VAL06 / -0.166 / 0.616
VAL07 / -0.498 / 0.101
VAL08 / -0.116 / 0.315
SPR05 / -0.579 / -0.449
BRE05 / -0.344 / -0.324
SAN05 / -0.214 / -0.196
SAN07 / -0.270 / -0.336
SAN08 / -0.285 / -0.566
LAG01 / -0.190 / 0.375

Figure S1.Decomposed pairwise regression (DPR) analyses in year 2001. Average residuals and 95% CIs from the linear regression model obtained for 2001 shown in Fig. 5 in the main text.

Table S7. Candidate models for 2001with and without putative outlier population.

Population / na / r2 b / AICcc / ΔAICcd
excluded
None / 8 / 0.345 / -58.53 / 0
LAG01 / 7 / 0.005 / -52.90 / 5.63

an refers to the number of populations left in the model

br2values for each model

cthe corrected Akaike Information Criteria (AICc)

dthe difference between each model and the optimal one (ΔAICc). The number of parameters for each model is three.

FigureS2.Isolation by time (IBT) results. Relationship between genetic (FST/ (1-FST)) and spawning time distance (days) for all 35 population-year samples by year. The linear regression model and p-value of the Mantel test are also shown in each panel.

Supporting information

Spatial: The program STRUCTURE 2.3 (Pritchard et al., 2000) has been used to infer population structuring. This version of STRUCTURE introduces new models that make explicit use of sampling location information which can potentially help to detect weak structuring, as was expected here in this young system (see Hubisz et al., 2009). Those LOCPRIOR models use sampling locations as prior information to assist the clustering, and can often provide accurate inference of population structure and individual ancestry in data sets where the signal of structure is too weak to be found using the standard structure models.

Here,year-wise, five replicate runs for K values representingthe number of populations sampled that year, i.e. e.g. K=1 to K=8 for 2001, using the admixture model and assuming correlated allele frequencies (Pritchard et al., 2000, Falush et al., 2003) were performed with a Burnin of 500000 and 1000000 MCMC iterations. The analyses have been performed for 2001 (seven populations), 2005(five populations) and 2008 (four populations) in order to assess if any clustering is possible at all.

No population structuring could be found for either of the years when performing the cluster analyses in STRUCTURE as the best K was always K=1 (see Table below).

K / Ln P(D)
2001 / 2005 / 2008
1 / -12514.86 / -4314.92 / -9001.26
2 / -12562.36 / -4356.96 / -9004.66
3 / -12677.62 / -4395.48 / -9092.36
4 / -12765.52 / -4398.3 / -9113.18
5 / -12961.4 / -4395.54 / -9236.62
6 / -13297.94
7 / -13830.88
8 / -13906.46

References

Barson NJ, Haugen TO, Vøllestad LA, Primmer CR (2009) Contemporary isolation-by-distance, but not isolation-by-time, among demes of European grayling (Thymallus thymallus, Linnaeus) with recent common ancestors. Evolution63: 549-556.

Falush D, Stephens M, Pritchard JK(2003) Inference of population structure using

multilocus genotype data: Linked loci and correlated allele frequencies. Genetics

164: 1567-1587.

Hubisz MJ, Falush D, Stephens M, Pritchard JK (2009)Inferring weak population structure with the assistance ofsample group information. Mol Ecol Resour9: 1322–1332.

Junge C, Primmer CR, Vøllestad AV, Leder EH (2010). Isolation and characterization of 19 new microsatellites for European grayling, Thymallusthymallus (Linnaeus, 1758), and their cross-amplification in four other salmonid species. Conserv Genet Resour 2: 219–223.

Koskinen MT, Primmer CR (2001). High throughput analysis of 17 microsatellite loci in grayling (Thymallus spp. Salmonidae). Conserv Genet 2: 173–177.

Moran MD (2003)Arguments for rejecting the sequential Bonferroni in ecological

Studies.Oikos100: 403-405.

Olsen JB, Bentzen P, Seeb JE (1998). Characterization of sevenmicrosatellite loci derived from pink salmon. Mol Ecol7: 1083–1090.

Peakall R, SmousePE (2006) GENALEX 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research. Mol Ecol Notes6: 288-295.

Pritchard JK, Stephens M, Donnelly P (2000) Inference of population structure using multilocus genotype data. Genetics155: 945-959. html

Raymond M, Rousset F (1995) GENEPOP (version 1.2): population genetics software for exact tests and ecumenicism. J Hered86: 248-249.

Rice WR (1989) Analysing tables of statistical tests. Evolution43: 223-225.

Sušnik S, Snoj A, Dovc P (1999a). Microsatellites in grayling(Thymallus thymallus): Comparison of two geographicallyremote populations from the Danubian and Adriatic river basinin Slovenia. Mol Ecol8: 1756–1758.

Sušnik S, Snoj A, Dovc P (1999b). A new set of microsatellitemarkers for grayling: BFRO014, BFRO015, BFRO016,BFRO017 and BFRO018. Anim Genet30: 462–478.

Sušnik S, Snoj A, Jesenšek D, Dovc P (2000). Microsatellite DNAmarkers (BFRO010 and BFRO011) for grayling. J Anim Sci78: 488–489.