Tables14 Uniquein Silico Restriction Endonuclease Digestion Pattern (5ʹ-3ʹ) of Acee Gene

TableS14 Uniquein silico Restriction Endonuclease digestion pattern (5ʹ-3ʹ) of aceE gene of Vibrio genomes

Vibrio genome / Restriction Endonucleases
AluI / BfaI / CviAII
AE003852 / 610•134•972•368•61•44•100•372 / 1156•111•879•515 / 9•7•131•120•48•732•135•61•135•347•105•201•171•123•84252
BA000031 / 205•275•130•134•160•20•9•168•58•138•137•282•432•36•835•165•272 / 106•12•15•165•6•99•78•102•96•66•42•114•135•120•111168•21•261•156•276•420•95 / 16•251•48•38•289•405•135•551•97•114•66•21•174•123•84252
BA000037 / 127•78•98•441•160•20•495•13•284•142•287•36•8•472 / 106•12•15•165•6•177•102•162•42•114•135•120•111•189•261429•515 / 16•251•48•327•540•551•97•5•109•258•123•84•252
CP000020 / 55•72•210•321•246•20•9•97•129•144•131•136•288•140•15044•100•372 / 31•273•375•66•42•249•120•111•189•543•665 / 9•7•251•48•867•54•594•5•109•66•195•123•84•33•219
FM954972 / 55•150•129•146•264•160•20•106•129•33•116•31•95•136•174114•140•150•44•152•320 / 106•12•180•105•78•102•96•66•42•114•135•120•111•168•282282•665 / 9•7•251•48•327•405•189•121•376•97•114•66•21•174•12384•33•219
CP002284 / 190•554•180•373•419•437•51•472 / 49•69•15•546•108•1695•99•95 / 9•7•299•38•829•54•497•97•5•175•21•186•107•16•84252
FO203526 / 480•130•134•84•96•9•501•424•290•36•480 / 106•12•15•93•78•177•282•24•42•606•1229 / 16•251•48•732•40•95•54•599•109•66•21•174•123•84•33219
CP009354 / 205•98•177•264•84•96•9•97•71•58•149•126•282•142•29036•108•100•180•39•53 / 106•12•15•171•99•78•102•45•51•66•18•66•207•120•111168•282•156•696•95 / 16•251•48•867•54•594•114•66•21•174•123•84•33•219
HpyCH4V / RsaI / TaqI / Tru9I
AE003852 / 28•255•497•150•100•245•81•21•55•266•315•318•118•102•51•59 / 100•16•902•87•210•184•76•119•199•65•77•210•109•25•5340•181•8 / 227•59•664•1671•6•34
BA000031 / 28•162•150•693•471•509•301•126•224 / 71•29•525•370•23•229•68•30•154•76•318•60•40•42•16417•32•109•25•93•189 / 950•809•766•99•6•34 / 620•453•96•54•285•12•1141•3
BA000037 / 94•243•693•81•12•575•49•132•510•48•114•51•59 / 100•525•366•4•23•87•394•4•11•61•119•199•60•5•23849•109•25•282 / 950•26•360•423•405•358•99•6•34 / 1073•96•54•297•1092•46•3
CP000020 / 28•306•6•108•285•300•9•69•12•72•684•134•301•350 / 71•554•370•23•229•256•72•318•306•49•109•5•73•8•257•189 / 286•664•117•1458•105•34 / 161•459•24•198•24•105•144•54•54•284•13•665•100•246•133
FM954972 / 94•354•585•9•69•12•72•546•6•132•6•128•379•48•9618•110 / 71•554•370•23•229•98•154•4•72•318•65•77•164•49•1095•73•33•7•189 / 244•706•117•1458•105•34 / 359•261•222•24•303•54•285•12•665•460•19
CP002284 / 28•255•315•182•70•401•310•137•49•255•11•663 / 71•1034•142•328•119•199•318•49•109•111•7•189 / 286•13•651•386•423•778•105•34 / 359•483•24•105•198•1028•51•379•46•3
FO203526 / 337•321•237•147•209•105•523•38•96•385•138•128 / 995•23•87•142•98•82•76•72•181•137•60•82•164•183•867•189 / - / 620•147•75•24•105•102•96•54•78•120•87•12•381•714•49
CP009354 / 28•162•93•57•108•447•138•9•960•11•355•186•110 / 71•554•370•23•87•142•68•112•76•72•119•199•65•77•16417•32•109•25•93•189 / - / 620•147•99•105•102•96•54•78•207•12•1011•130•3
Symbol (•) indicates RE site in the gene sequences (-): No digestion
Additional unique patterns:
(i)BfuCI-110•675•531•45•417•883 (AE003852); 210•1151•1036•267 (FO203526)

TableS15 Uniquein silico Restriction Endonuclease digestion pattern (5ʹ-3ʹ) of asnB gene of Vibrio genomes

Vibrio genome / Restriction Endonucleases
AluI / BfuCI / CviAII
AE003852 / 207•127•202•116•747•177•89 / 198•138•216•263•22•545•33•7•243 / 142•306•340•199•30•167•153•328
BA000031 / 81•58•212•194•56•778•152•134 / 230•106•1086•243 / 327•461•358•38•481
BA000037 / 536•9•256•864 / 110•45•181•57•444•170•375•40•243 / 142•744•131•129•519
CP000020 / 154•95•85•405•444•147•49•197•92 / 36•300•501•545•235•51 / 142•315•331•98•225•35•191•331
FM954972 / 81•49•24•382•97•19•135•651•74•159 / 512•495•415•161•88 / 886•260•38•153•334
CP002284 / 490•55•88•168•214•364•133•52•69•32 / 1058•364•77•166 / 142•185•121•340•877
FO203526 / 490•357•390•142•32•101•64•89 / 123•8•738•138•415•243 / 788•98•131•129•38•153•328
CP009354 / 81•58•55•119•339•149•330•248•133•52•12•89 / 230•75•19•12•501•32•138•375•40•77•118•48 / 788•98•225•35•191•274•54
HpyCH4V / RsaI / TaqI / Tru9I
AE003852 / 40•822•474•329 / 695•181•5•243•368•52•121 / 65•8•271•377•226•383•55•280 / 29•137•468•208•823
BA000031 / 40•516•42•657•279•99•5•27 / 274•100•5•21•97•121•65•12•181•202•127•242•97•121 / 29•192•620•824
BA000037 / 506•50•326•355•297•113•18 / 400•205•293•93•43•90•541 / 73•874•282•156•120•124•36 / 29•138•54•131•1252•58•3
CP000020 / 601•203•58•189•129•351•137 / 695•181•158•634 / 90•254•628•413•109•174 / 29•137•55•131•51•202•29•36•324•147•105•419•3
FM954972 / 217•339•177•18•99•126•189•15•491 / 695•181•5•110•43•44•46•81•339•93•34 / 23•741•183•32•214•36•357•85 / 29•137•55•132•306•587•422•3
CP002284 / 40•282•153•31•731•297•113•18 / 400•283•198•153•626•5 / 547•32•393•358•175•160 / 29•137•493•183•405•357•61
FO203526 / 40•294•33•288•96•81•18•201•480•107•27 / 190•184•221•10•429•171•268•71•121 / 126•853•221•465 / 49•172•438•182•153•253•418
CP009354 / 40•294•222•45•231•504•329 / 497•198•181•248•81•460 / 7•66•691•215•221•29•81•75•244•36 / 353•306•366•640
Symbol (•) indicates RE site in the gene sequences
Additional unique patterns:
(i)Hin1I-982•359•314•16 (FM954972)
(ii)Bfal-151•252•243•177•699•149 (FM954972); 22•288•1212•143(FO203526); 136•174•33•303•66•423•78•452 (CP009354)

TableS16Uniquein silico Restriction Endonuclease digestion pattern (5ʹ-3ʹ) of carB gene of Vibrio genomes

Vibrio genome / Restriction Endonucleases
AluI / BfaI / BfuCI / CviAII
AE003852 / 1281•132•1473•312•28•5 / 421•966•477•1023•344 / 227•117•244•26•126•147•186•166•135•305•157•74•283•60•389•229•132•228 / 162•105•46•140•41•25•270•93•744•57•105•543•649•222•29
BA000031 / 106•357•323•216•289•113•559•479•334•17•93•175•137•36 / 136•162•6•501•189•210•39•144•18•9•342•201•294•12•315•309•210•137 / 227•73•288•525•261•305•1555 / 68•94•318•39•819•288•57•64•584•44•605•254
BA000037 / 283•474•245•279•132•1029•465•327 / 37•99•186•99•384•123•48•228•552•108•93•31•275•633•69•269 / 344•285•610•135•305•231•343•680•301 / 98•64•105•186•41•25•1107•57•105•300•243•44•859
CP000020 / 358•105•146•199•194•964•89•203•184•12•127•207•312•54•44•19•14 / 37•438•330•399•183•477•12•579•162•348•132•46•88 / 1073•40•261•305•6•742•215•589 / 68•30•64•15•276•41•782•282•68•57•105•543•44•605•177•74
FM954972 / 97•366•294•168•77•289•122•51•9•127•363•295•184•346•98•9•12•142•149•19•9•5 / 37•261•6•501•123•66•210•39•144•27•102•174•66•120•112•62•213•180•174•258•33•57•258•8 / - / 68•94•15•303•1146•57•64•41•543•44•856
CP002284 / 424•39•288•530•682•411•68•334•54•77•324 / 37•768•420•763•629•614 / 381•207•152•45•102•226•261•462•180•27•150•60•389•589 / 98•64•105•46•476•93•394•350•57•64•41•543•649•251
FO203526 / 786•216•279•37•86•28•189•597•224•351•93•9•205•126•5 / 1204•201•9•102•240•232•62•213•315•216•303•126•8 / 300•44•37•248•610•440•963•589 / 162•291•66•1107•57•105•543•44•856
CP009354 / 463•146•393•411•12•48•785•184•181•153•17•93•9•12•238•53•33 / 37•261•6•171•111•219•123•276•39•144•18•111•240•232•62•213•180•174•177•81•33•30•27•132•134 / 227•594•858•1552 / 68•30•64•15•276•1173•57•105•543•44•856
HpyCH4V / RsaI / TaqI / Tru9I
AE003852 / 683•502•139•68•367•158•355•216•441•50•115•107•30 / 12•454•110•70•166•500•151•167•115•176•52•13•56•140•359•384•100•55•111•40 / 197•36•72•171•141•93•29•154•150•12•36•282•351•366•140•1001 / 140•1218•249•186•873•303•259•3
BA000031 / 187•66•546•206•22•222•75•426•216•72•234•102•396•279•93•27•65 / 12•516•19•99•205•779•58•57•241•476•79•5•266•113•53•256 / 197•198•222•84•9•183•150•12•36•25•608•6•86•34•380•58•162•107•516•161 / 140•147•798•176•97•51•531•1014•280
BA000037 / 352•500•115•218•73•60•6•593•619•36•189•218•121•42•50•9•12•21 / 12•209•245•62•19•99•166•500•318•115•176•65•167•356•32•302•391 / 145•52•36•135•27•81•87•54•84•9•183•162•36•282•24•162•444•227•52•6•54•174•41•516•161 / 1358•1040•289•441•106
CP000020 / 91•96•165•12•333•102•126•33•9•291•204•549•63•498•18•240•84•132•48•39•98 / 12•181•335•118•166•39•461•318•115•129•47•65•152•108•189•106•219•165•53•47•206 / 145•88•506•105•49•41•157•306•189•138•141•245•154•18•6•54•539•350 / 20•266•342•235•222•176•97•69•23•25•318•147•458•72•22•30•144•225•63•84•144•46•3
FM954972 / 187•66•30•69•331•284•135•495•153•261•378•144•297•216•90•27•68 / 12•516•118•166•39•461•318•115•101•28•47•52•13•167•93•263•32•137•247•53•47•6•200 / 77•68•52•171•27•222•93•183•150•12•36•282•24•453•153•339•108•66•715 / 20•1065•198•126•18•48•318•147•552•30•690•16•3
CP002284 / 283•12•202•186•248•96•158•73•659•37•107•211•489•21•197•115•48•50•39 / 12•112•522•166•39•540•239•356•152•108•263•32•5•297•82•306 / 233•330•54•276•162•36•759•153•39•300•108•66•41•674 / 20•120•863•82•35•330•343•417•188•94•30•165•267•57•27•193
FO203526 / 283•12•57•93•522•69•149•73•66•120•153•320•82•537•36•21•168•381•21•38•30 / 12•461•55•118•166•39•779•115•101•28•47•65•152•108•216•79•5•379•53•253 / 197•171•27•81•87•138•9•183•41•109•12•36•306•327•6•120•438•54•108•66•41•516•158 / 863•222•198•126•1083•519•27•190•3
CP009354 / 43•111•33•165•573•42•69•297•159•519•261•117•147•225•381•33•56 / 12•308•208•118•135•31•39•461•246•72•115•101•28•47•65•152•15•388•5•379•53•47•206 / 197•36•330•54•93•183•150•12•36•282•24•333•120•42•111•39•188•58•54•108•66•41•674 / 19•268•798•197•76•51•18•48•318•699•30•447•69•193
Symbol (•) indicates RE site in the gene sequences (-): No digestion
Additional unique patterns:
(i)Hin1I-1030•1848•306•50(BA000037); 1907•971•176•177(CP002284)

TableS17 Uniquein silico Restriction Endonuclease digestion pattern (5ʹ-3ʹ) of cpxA gene of Vibrio genomes

Vibrio genome / Restriction Endonucleases
AluI / BfuCI / CviAII
AE003852 / 225•473•302•395 / 168•279•89•318•180•72•21•127•141 / 66•474•106•155•114•480
BA000031 / 38•663•208•495 / 117•44•49•441•239•87•60•99•121•147 / 259•284•261•114•18•468
BA000037 / 516•173•148•60•162•330 / 44•58•30•9•26•28•39•132•135•138•239•49•38•108•48124•144 / 60•159•22•458•61•146•483
CP000020 / 38•107•553•208•483 / 50•183•37•384•216•384•135 / 408•34•98•229•620
FM954972 / 23•536•124•76•94•29•65•38•68•141•138•48 / 132•501•130•109•147•121•99•141 / 60•333•393•114•480
CP002284 / 402•263•42•141•553 / 74•28•354•407•33•505 / 193•62•210•119•817
FO203526 / 195•470•687•4 / 90•30•9•561•8•658 / 48•459•35•194•146•16•458
CP009354 / 23•133•63•467•76•94•29•501 / 14•88•39•8•97•473•469•198 / 60•87•249•96•71•194•395•234
HpyCH4V / RsaI / TaqI / Tru9I
AE003852 / 345•300•273•30•63•70•314 / - / 158•69•630•318•68•14•138 / 205•130•366•86•147•458•3
BA000031 / 348•466•107•213•270 / - / 236•276•138•66•423•39•226 / 32•275•166•510•305•116
BA000037 / 840•69•70•35•375 / 442•101•644•202 / 170•182•352•372•66•60•25•162 / 1063•213•110•3
CP000020 / 142•453•246•548 / 196•356•467•370 / 324•528•405•132 / 5•65•277•8•228•118•20•75•127•86•27•36•37•33•81166
FM954972 / 903•70•149•196•62 / 83•454•644•199 / 140•9•146•51•286•12•54•210•35•172•12•253 / 320•366•21•257•416
CP002284 / 510•310•107•474 / 561•507•213•51•41•28 / 518•96•42•175•35•291•244 / 157•25•156•6•366•86•570•32•3
FO203526 / 309•127•53•396•449•22 / 16•1003•144•193 / 89•127•112•496•299•80•72•81 / 241•9•504•193•182•227
CP009354 / 523•39•39•305•385•95 / - / 101•51•18•51•132•6•421•30•308•81•117•36•34 / 215•102•372•21•635•41
Symbol (•) indicates RE site in the gene sequences (-): No digestion
Additional unique patterns:
(i)BfaI-20•257•70•792•247 (CP009354)

TableS18 Uniquein silico Restriction Endonuclease digestion pattern (5ʹ-3ʹ) of dnaE gene of Vibrio genomes

Vibrio genome / Restriction Endonucleases
AluI / BfaI / BfuCI / CviAII
AE003852 / 255•267•32•205•240•465•30•351•24•1062•245•280•39 / 517•1527•369•1082 / 504•189•249•98•112•15•81•12•123•27•86•282•261•51•160•345•27•38•322•135•149•25•177•27 / 15•105•220•45•824•111•633•28•42•110•300•273•516•244•29
BA000031 / 99•150•209•286•705•381•24•484•305•518•319 / 502•267•141•501•1137•300•632 / 6•185•367•120•107•240•106•6•108•41•109•381•80•123•52•576•360•135•108•62•7•201 / 114•58•402•84•221•315•744•28•152•228•72•410•217•435
BA000037 / 249•120•89•166•120•574•131•10•20•351•24•789•518•319 / - / 383•106•20•67•102•107•142•98•112•15•134•82•27•152•15•201•13•80•1111•29•61•57•191•175 / 172•153•333•536•111•183•357•93•28•42•110•228•72•627•162•273
CP000020 / 240•299•26•849•35•28•429•780•315•160•304•15 / 769•642•240•453•567•177•157•116•189•167•3 / 705•320•112•15•81•162•86•295•75•233•303•258•322•94•41•378 / 172•153•312•21•647•183•450•28•34•818•115•547
FM954972 / 310•197•436•41•271•128•96•351•600•503•228•280•39 / 115•441•429•426•90•210•318•819•157•363•56•56 / 6•672•107•90•150•106•6•149•109•293•55•33•80•228•144•379•454•41•378 / 172•153•45•267•35•330•192•210•534•285•123•394•272•195•273
CP002284 / 240•9•290•205•240•399•66•30•283•881•100•374•44•280•39 / 259•102•195•837•108•204•195•189•1391 / 50•249•190•87•102•249•160•50•108•41•109•152•304•5•123•96•435•97•57•303•90•248•148•27 / 213•112•312•21•14•330•529•314•121•42•362•321•321•33•162•273
FO203526 / 249•290•205•696•39•351•594•737•280•39 / 1345•66•678•1391 / 383•106•69•63•57•197•150•112•15•81•12•41•109•86•375•372•352•84•303•243•270 / 48•57•67•153•312•365•192•111•633•70•338•72•348•62•379•273
CP009354 / 240•9•120•157•35•183•705•30•304•47•24•1307•319 / 148•525•471•267•315•303•1281•170 / 191•108•379•249•39•59•112•15•93•41•82•27•86•375•219•153•436•303•90•45•108•51•219 / 48•57•469•63•21•344•192•157•53•534•28•152•1225•137
HpyCH4V / RsaI / TaqI / Tru9I
AE003852 / 14•217•245•290•224•142•321•5•357•69•60•144•58•591•279•111•368 / 589•238•490•41•169•168•407•1248•145 / 380•417•129•75•177•42•6•156•45•72•10•128•150•60•123•252•27•240•327•300•149•6•211•13 / 200•810•864•408•180•21•45•464•66•142•248•40•7
BA000031 / 202•14•58•272•73•1310•144•100•480•6•129•309•383 / 257•56•203•25•174•549•38•210•168•361•989•305•145 / 46•511•72•153•198•6•65•112•42•6•167•106•210•63•5•193•75•150•54•303•69•30•46•255•132•53•345•13 / 185•197•49•993•48•183•60•552•54•255•45•96•180•11•277•194•42•12•40•7
BA000037 / 112•104•184•400•175•619•206•129•144•616•99•324•368 / 516•827•169•575•345•29•98•367•104•450 / 347•105•105•72•282•69•6•65•112•42•6•273•273•5•10•183•252•27•315•388•319•211•13 / 185•810•429•231•29•31•302•430•245•205•44•244•194•54•40•7
CP000020 / 112•150•218•112•471•33•21•342•537•77•7•51•558•297•494 / 20•51•186•259•296•126•364•210•663•1060•245 / 522•165•264•35•219•6•167•106•31•207•30•20•67•132•250•13•372•316•39•144•264•92•19 / 25•127•57•36•5•48•67•17•48•22•56•370•777•20•40•75•69•158•163•87•53•105•22•21•45•179•87•102•16•12•134•142
FM954972 / 216•46•68•70•54•92•892•138•353•144•214•312•387•494 / 32•133•360•190•111•241•197•38•210•168•495•855•450 / 46•467•174•293•183•42•6•283•128•135•5•193•447•147•39•48•397•68•21•128•10•207•13 / 83•102•113•676•21•660•135•227•163•87•201•45•63•141•164•28•68•208•90•104•54•40•7
CP002284 / 202•14•114•216•46•179•204•536•289•97•32•144•1039•368 / 165•1137•151•227•376•405•465•464•90 / 53•399•12•24•157•341•177•48•156•45•282•189•72•236•30•13•240•463•313•217•13 / 431•564•429•260•31•302•250•53•106•21•21•108•128•205•276•288•7
FO203526 / 216•330•46•504•21•309•168•206•273•7•33•546•453•368 / 370•591•106•197•38•86•124•168•781•465•104•450 / 53•294•282•58•95•381•42•6•33•94•146•210•138•123•225•357•51•13•5•30•301•164•220•146•13 / 995•689•31•75•531•105•42•45•99•329•244•156•92•40•7
CP009354 / 216•727•312•545•273•214•402•24•399•126•129•113 / 723•427•152•41•110•59•168•817•429•464•90 / 27•26•399•235•449•69•6•167•106•138•333•279•168•72•75•39•18•243•88•123•45•155•207•13 / 83•795•96•146•55•297•183•60•753•108•45•96•224•244•248•40•7
Symbol (•) indicates RE site in the gene sequences (-): No digestion
Additional unique patterns:
(i)Hin1I-215•1008•996•453•823 (AE003852); 1208•1490•667•115 (BA000031); 1208•1490•250•417•115(BA000037) ; 2698•250•441•91(FO203526)

TableS19Uniquein silico Restriction Endonuclease digestion pattern (5ʹ-3ʹ) of gyrB gene of Vibrio genomes

Vibrio genome / Restriction Endonucleases
AluI / BfaI / BfuCI / CviAII
AE003852 / 576•33•411•51•627•51•30•48•30•28•86•185•94•168 / - / 416•186•385•210•575•268•5•31•71•33•64•24•81•69 / 114•168•157•209•61•182•168•429•303•31•198•323•75
BA000031 / 576•33•278•410•266•154•6•6•50•48•58•61•13•12•99•86•94•168 / 460•96•639•6•525•15•351•12•123•180•11 / 987•255•107•436•206•253•174 / 114•76•92•157•209•840•334•42•162•260•132
BA000037 / 576•311•266•410•216•291•9•171•78•90 / 556•472•395•318•666•11 / 602•37•348•255•170•373•81•174•5•57•142•24•81•69 / 114•76•92•157•209•61•182•168•429•303•31•64•379•21•132
CP000020 / 151•408•17•33•28•327•56•85•33•159•72•194•216•304•73•262 / 46•1176•201•681•49•265 / 639•348•137•118•504•39•255•228•150 / 114•76•92•157•209•840•398•134•154•244
FM954972 / 157•43•359•17•33•278•133•51•94•60•72•266•186•30•106•14•12•60•99•86•11•83•151•17 / 154•306•762•678•72•99•82•74•180•11 / 639•348•255•49•494•255•36•168•24•54•96 / 114•76•92•609•597•376•144•12•398
CP002284 / 559•17•155•832•216•120•72•99•348 / - / 704•283•210•45•575•37•390•24•81•69 / 114•181•414•182•597•214•89•31•186•410
FO203526 / 576•444•118•231•194•160•56•120•12•71•88•180•78•90 / 1021•174•546•159•171•99•248 / 704•283•425•585•43•36•26•142•105•69 / 114•76•92•366•243•597•285•18•31•186•12•6•239•153
CP009354 / 559•17•33•448•48•33•66•359•160•26•30•106•14•12•35•124•86•94•78•73•17 / 556•639•6•483•42•15•231•99•156•180•11 / 602•37•39•309•210•45•543•255•204•24•54•96 / 114•76•458•243•597•214•89•31•42•144•12•266•132
HpyCH4V / RsaI / TaqI / Tru9I
AE003852 / 108•138•48•51•172•254•649•273•8•120•471•79•47 / 35•21•20•214•196•6•8•340•36•574•74•112•30•172•143•23•58•79•277 / 4•18•514•65•309•210•385•399•149•250•75•30•10 / 29•339•360•230•1460
BA000031 / 246•48•223•254•364•9•81•180•296•67•53•49•63•29•330•109•17 / 35•21•20•214•35•67•100•348•36•574•74•61•51•368•115•20•279 / 22•100•189•399•18•182•90•88•32•10•246•129•63•623•187•40 / 29•656•1498•235
BA000037 / 108•138•48•160•317•385•93•156•296•67•45•153•53•142•257 / 35•21•20•214•202•8•340•610•74•82•30•30•338•22•113•279 / 4•18•514•65•309•220•246•129•450•98•52•273•40 / 29•699•249•663•135•408•235
CP000020 / 271•138•362•364•57•228•234•21•42•12•189•15•45•189•125•19•78•29 / 35•21•43•191•202•185•163•36•531•117•480•26•32•356 / 22•109•12•168•809•385•279•634 / 29•365•192•282•12•157•303•300•206•66•267•124•115
FM954972 / 108•138•99•421•5•94•270•18•96•156•288•8•67•165•359•126 / 35•21•20•23•226•167•384•648•112•368•135•279 / 22•289•225•111•263•220•246•129•548•325•40 / 29•339•237•81•654•15•623•70•75•270•25
CP002284 / 108•186•51•426•478•452•172•338•81•126 / 35•41•800•388•260•112•426•356 / 4•18•888•466•129•548•97•228•30•10 / 29•636•20•183•90•397•351•48•21•137•120•147•4•209•26
FO203526 / 108•138•525•79•12•195•17•61•561•125•31•440•28•98 / 35•21•20•416•348•36•574•74•61•51•202•104•197•279 / 22•888•220•246•64•665•57•256 / 29•1611•66•712
CP009354 / 108•138•99•426•91•84•755•120•208•263•28•69•29 / 35•41•136•78•202•348•36•243•331•74•61•51•126•242•414 / 22•289•290•109•200•220•246•129•399•45•104•325•40 / 29•699•249•378•351•69•138•66•53•147•214•25
Symbol (•) indicates RE site in the gene sequences (-): No digestion
Additional unique patterns:
(i)Hin1I-1133•369•807•109 (BA000037)

Table S20 Unique in silico Restriction Endonuclease digestion pattern (5ʹ-3ʹ) of ileS gene of Vibrio genomes

Vibrio genome / Restriction Endonucleases
AluI / BfaI / BfuCI / CviAII
AE003852 / 419•335•92•276•98•95•560•383•32•75•80•144•21•240 / 505•1104•87•504•390•260 / 57•62•183•495•67•51•63•272•235•57•293•111•124•41•77•19•321•208•114 / 694•336•505•523•187•71•534
BA000031 / 130•289•239•266•198•98•77•191•21•46•540•160•169•103•5•45•127•125 / 919•150•249•288•396•63•27•105•93•117•150•21•251 / 105•675•84•51•53•10•401•729•225•382•114 / 438•592•505•778•516
BA000037 / 419•68•171•266•296•77•191•91•676•98•242•127•125 / 1069•537•757•212•272 / 57•455•268•84•51•53•10•272•486•96•372•643 / 438•30•736•331•254•21•1037
CP000020 / 419•167•72•571•268•72•421•30•15•222•261•341 / 430•552•345•165•27•204•180•129•827 / 347•433•59•34•426•89•325•21•32•331•41•295•104•322 / 1039•108•66•331•799•418•98
FM954972 / 419•173•57•180•104•198•98•77•189•23•25•359•223•160•32•137•54•99•12•64•51•125 / 505•162•15•174•222•249•291•285•129•36•159•93•267•21•251 / 119•661•17•76•426•89•325•384•41•721 / 160•278•302•407•1125•71•516
CP002284 / 419•335•377•193•735•208•107•121•62•50•252 / 928•189•210•1532 / 57•48•585•90•93•461•234•127•21•363•80•64•98•424•114 / 438•30•402•169•108•66•474•114•21•330•102•71•466•68
FO203526 / 419•173•54•215•78•43•183•70•268•21•51•695•32•137•271•134 / 505•993•714•632 / 105•414•261•99•51•63•312•200•577•41•103•395•109•114 / 694•182•674•254•524•516
CP009354 / 419•427•78•198•28•70•247•21•21•25•338•247•136•155•14•103•50•12•240 / 430•354•63•222•249•192•36•18•42•87•180•219•105•36•174•75•75•21•251 / 119•661•17•67•104•10•564•492•74•225•496 / 438•256•1619•516
HpyCH4V / RsaI / TaqI / Tru9I
AE003852 / 87•415•276•419•241•11•21•187•435•50•106•296•130•102•74 / 112•452•40•190•135•73•11•50•274•82•274•279•181•681•16 / 241•64•294•26•90•655•177•281•6•346•510•160 / 221•15•186•123•96•504•1705
BA000031 / 159•421•6•168•443•112•372•198•81•129•74•103•231•21•96•215 / 97•467•71•367•61•356•166•10•71•456•99•592•16 / 305•324•249•492•12•216•21•558•213•279•160 / 221•15•299•106•1983•8•197
BA000037 / 159•19•402•81•93•443•273•82•297•30•210•74•306•244•134 / 564•40•186•212•61•356•29•242•432•9•90•51•575 / 878•492•177•278•6•346•231•279•15•104•41 / 221•15•186•219•504•803•166•730•3
CP000020 / 178•402•174•9•117•59•37•230•67•45•273•120•168•30•51•117•42•6•68•328•204•129•5 / 97•383•84•71•165•211•161•47•209•29•354•608•153•206•81 / 241•19•627•504•816•576•76 / 86•135•15•74•634•1097•10•186•350•67•205
FM954972 / 159•106•933•8•67•45•810•65•163•141•56•31•275 / 97•58•116•114•80•99•447•417•169•10•71•483•90•379•229 / 305•324•258•492•12•240•576•213•398•7•34 / 86•135•315•647•796•165•93•417•205
CP002284 / 159•229•413•58•63•108•176•67•185•235•198•24•141•119•76•6•113•111•220•158 / 564•71•376•161•9•165•82•11•168•95•928•229 / 241•64•320•90•618•46•177•54•21•183•104•900•41 / 85•136•201•522•210•879•93•93•218•162•257•3
FO203526 / 159•19•741•144•30•119•273•409•81•138•53•12•355•36•275 / 97•15•452•71•382•417•352•360•90•51•328•229 / 629•671•208•126•558•213•235•204 / 86•135•15•924•804•804•73•3
CP009354 / 265•237•402•144•111•150•570•81•129•74•163•197•31•45•230 / 271•114•179•40•31•155•212•417•166•10•71•303•162•90•608 / 629•188•61•492•228•21•206•352•492•160 / 86•135•15•405•1380•93•44•49•417•202•3
Symbol (•) indicates RE site in the gene sequences
Additional unique patterns:
(i)Hin1I- 227•1009•1072•542 (AE003852); 1236•1069•303•221 (BA000031)

Table S21 Unique insilicorestriction endonuclease digestion pattern (5ʹ-3ʹ) of ligA gene of Vibrio genomes

Vibrio genome / Restriction Endonucleases
AluI / BfaI / BfuCI / CviAII
AE003852 / 123•38•117•524•158•340•143•421•77•69•77•69 / 911•818•60•153•68 / 105•192•5•825•588•295 / 46•6•171•1121•401•265
BA000031 / 142•139•67•129•22•62•104•638•128•157•128•157•33•93•230•69 / 25•105•219•1197•39•207•221 / 108•758•66•78•109•273•27•306•288•288 / -
BA000037 / 273•75•13•259•10•399•357•381•243•243 / - / 230•70•341•909•460 / 226•302•715•387•380
CP000020 / 84•183•292•181•173•285•182•190•273•9•273•9•72•83 / 170•26•72•1739 / 102•110•12•921•862 / 49•171•1238•549
FM954972 / 361•100•159•10•75•33•7•35•172•77•172•77•139•99•119•202•33•67••28•20•70•12•146 / 202•699•436•269•407 / 89•19•26•96•861•88•213•66•318•213•318•213•24 / 55•171•68•528•808•383
CP002284 / 126•53•94•75•272•10•19•251•367•36•367•36•83•60•377•46•143•4 / 778•324•736•125•53 / 108•347•1275•237•49 / 55•171•302•1102•386
FO203526 / 126•83•456•235•367•119•402•35•10•16•10•16•6•75•18•6•62 / 1102•261•24•142•487 / 1419•540•41•16 / -
CP009354 / 24•102•9•138•8•67•52•77•188•40•188•40•33•67•224•357•124•18•17•195•22•89•66 / 274•75•552•13•116•318•15•429•78•140•78•140 / 300•576•5•270•28•213•338•280 / 55•62•993•520•380
HpyCH4V / RsaI / TaqI / Tru9I
AE003852 / 45•52•125•255•127•218•66•307•345•129•345•129•249•92 / 314•103•29•4•549•408•603 / 245•384•643•368•336•18•16 / 22•9•81•343•96•15•300•563•168•213•168•213•180•20
BA000031 / 48•52•507•86•132•13•239•547•113•28•113•28•98•13•57•80 / 14•406•861•540•21•171 / 260•15•507•403•71•19•104•12•119•44•119•44•416•43 / 323•135•989•46•23•82•412•3
BA000037 / 48•280•152•127•128•103•231•369•186•98•186•98•127•161 / 453•1001•357•199 / 275•133•98•131•191•26•240•40•215•6•215•6•288•117•250 / 34•93•160•306•146•43•18•23•46•578•46•578•151•41•306•65
CP000020 / 52•42•20•472•18•63•240•39•125•7•125•7•57•438•117•317 / 399•15•582•779•40•192 / 105•720•44•474•205•459 / 466•81•15•171•61•164•463•75•182•76•182•76•74•159•12•5•3
FM954972 / 48•72•615•178•6•150•8•166•381•132•381•132•107•13•137 / 106•289•58•239•310•173•106•732 / 10•91•10•26•326•82•810•51•148•167•148•167•12•237•43 / 34•439•396•453•105•75•96•147•268•268
CP002284 / 6•42•249•310•128•156•344•263•518•518 / 62•333•413•194•220•59•735 / 632•505•65•531•27•68•142•46 / 25•298•270•146•84•46•452•172•228•281•228•281•14
FO203526 / 199•57•105•119•127•128•217•528•243•140•243•140•70•83 / 676•132•473•735 / 74•63•30•378•438•111•40•215•205•140•205•140•145•131•46 / 115•454•1029•41•10•367
CP009354 / 421•516•132•555•225•14•13•134 / 67•322•64•394•155•452•526•30 / 74•638•79•33•30•129•660•90•27•250•27•250 / 26•528•39•276•558•171•18•197•189•8•189•8
Symbol (•) indicates RE site in the gene sequences (-): No digestion
Additional unique patterns: Hin1I - 192•665•325•828 (AE003852); 797•183•205•831 (FO203526)

Table S22 Unique in silicorestriction endonuclease digestion pattern (5ʹ-3ʹ) of nusA gene of Vibrio genomes

Vibrio genome / Restriction Endonucleases
AluI / BfaI / BfuCI / CviAII
AE003852 / 242•415•9•447•60•42•225•48 / - / 125•22•74•61•5•51•111•7•39•33•39•33•156•20•180•66•76•122•52•96•75•117 / 861•216•114•138•159
BA000031 / 76•159•29•97•420•14•85•110•15•108•15•108•60•30•12•133•30•62•48 / 91•138•36•675•147•54•36•105•21•15•21•15•57•113 / 221•184•239•40•20•322•270•75•117•117 / -
BA000037 / 76•159•29•402•129•46•108•266•43•230•43•230 / 409•51•519•108•54•36•132•57•9•113•9•113 / 287•169•228•51•291•174•5•42•49•75•49•75•71•46 / -
CP000020 / 19•30•312•47•249•124•14•136•123•59•123•59•145•33•38•19•140 / 940•201•36•78•233 / 143•4•227•82•39•189•20•322•462•462 / -
FM954972 / 31•159•45•93•33•47•160•14•34•41•34•41•124•150•18•224•118•50•37•62•48 / 121•288•45•6•153•327•39•51•57•105•57•105•57•6•87•33•24•89 / 249•8•199•570•462 / -
CP002284 / 238•21•102•140•120•36•138•46•332•315•332•315 / 940•252•63•27•27•179 / 282•402•51•149•142•270•75•71•46•46 / 115•776•186•369•42
FO203526 / 31•69•135•126•117•143•45•283•266•133•266•133•92•48 / - / 143•4•258•51•228•342•462 / 907•170•369•42
CP009354 / 94•164•103•47•174•39•58•102•14•154•14•154•111•13•100•175•92•13•35 / 79•12•138•36•144•45•6•153•327•147•327•147•54•51•12•105•9•48•122 / 656•28•342•174•180•108 / -
HpyCH4V / RsaI / TaqI / Tru9I
AE003852 / 370•399•135•387•15•182 / 53•291•206•226•198•186•328 / 122•6•18•132•12•102•63•279•149•184•149•184•21•186•214 / -
BA000031 / 370•534•120•228•39•141•56 / 53•62•229•192•14•226•198•110•404•404 / 37•85•6•162•102•270•150•255•27•90•27•90•225•79 / -
BA000037 / 370•189•120•201•24•128•205•123•72•56•72•56 / 53•291•192•438•514 / 37•63•22•6•18•84•60•308•469•27•469•27•114•66•117•18•79 / -
CP000020 / 94•96•180•75•108•306•213•27•54•192•54•192•33•110 / 134•210•9•285•138•198•186•61•267•267 / 146•21•93•30•1198 / 425•132•110•46•293•25•48•161•201•47•201•47
FM954972 / 94•144•441•180•447•117•9•56 / 244•100•9•423•198•514 / 128•39•93•30•522•282•180•135•79•79 / 425•9•123•111•45•775
CP002284 / 235•318•156•150•21•552•56 / 53•81•210•213•417•110•137•267 / 37•91•18•234•407•96•171•34•6•114•6•114•192•88 / 187•238•912•151
FO203526 / 238•183•228•51•69•135•6•33•81•84•81•84•129•15•201•35 / 344•9•183•285•667 / 122•6•18•21•93•18•12•444•78•255•78•255•27•273•121 / 425•233•508•251•71
CP009354 / 472•204•93•213•81•174•21•102•128•128 / 53•291•9•99•186•138•198•186•328•328 / 37•208•45•102•270•72•78•255•27•114•27•114•66•117•9•88 / 425•9•234•45•624•151
Symbol (•) indicates RE site in the gene sequences (-): No digestion

Table S23 Unique in silicorestriction endonuclease digestion pattern (5ʹ-3ʹ) of pheT gene of Vibrio genomes

Vibrio genome / Restriction Endonucleases
AluI / BfaI / BfuCI / CviAII
AE003852 / 115•104•103•50•674•131•59•305•99•264•99•264•41•231•23•65•124 / 904•384•9•1091 / 738•63•344•232•120•32•63•51•141•73•141•73•116•75•15•15•310 / 17•334•51•853•47•47•103•303•633•633
BA000031 / 60•159•189•118•156•176•55•133•88•181•88•181•226•25•370•9•77•145•68•47•5•105•14 / 88•135•150•36•42•6•66•126•123•33•123•33•63•270•99•12•39•9•270•24•183•87•12•327•206 / 738•63•11•333•328•24•503•96•310•310 / 17•334•51•947•271•113•22•651
BA000037 / 60•159•153•674•146•349•337•26•100•384•100•384 / 88•285•78•321•33•444•39•717•177•206•177•206 / 738•63•11•123•348•175•39•32•63•253•63•253•203•30•310 / 351•51•947•384•22•595•38
CP000020 / 60•4•155•153•154•156•126•326•31•27•31•27•148•201•74•336•53•85•110•130•59 / 61•312•54•378•126•207•159•708•177•25•177•25•98•83 / 801•11•208•263•175•39•71•87•190•287•190•287•256 / 993•356•103•303•285•348
FM954972 / 60•4•155•153•36•39•9•124•278•25•278•25•251•58•44•88•217•203•134•26•11•147•126•159•41 / 61•312•54•345•66•30•63•207•99•12•99•12•48•564•144•261•122 / 801•11•208•174•413•238•543 / 351•1269•135•633
CP002284 / 372•36•47•428•91•72•386•109•356•7•356•7•100•85•110•18•171 / - / 738•63•114•614•114•202•543 / 17•334•442•278•381•70•296•359•211•211
FO203526 / 219•153•36•450•25•45•118•88•102•202•102•202•103•25•312•144•93•120•171 / 403•735•99•51•735•383 / 600•138•63•11•661•24•599•310 / 351•284•714•113•733•211
CP009354 / 408•184•90•176•25•5•158•146•44•305•44•305•337•7•12•72•146•172•119 / 88•135•33•117•36•42•417•36•333•12•333•12•39•348•225•339•84•122 / 801•344•138•246•328•239•310 / 351•51•233•714•384•462•211
HpyCH4V / RsaI / TaqI / Tru9I
AE003852 / 241•36•425•90•247•65•22•54•125•156•125•156•471•16•338•60•42 / 104•1389•81•415•399 / 125•75•180•11•82•264•501•72•60•474•60•474•201•6•90•247 / 35•26•253•575•1499
BA000031 / 175•527•90•142•72•33•17•70•51•278•51•278•160•129•336•93•159•57•17 / 432•110•688•344•21•199•106•107•312•87•312•87 / 380•216•18•123•63•15•264•279•12•339•12•339•111•243•6•171•166 / 134•411•117•786•402•339•33•184
BA000037 / 175•66•461•90•121•102•89•22•138•191•138•191•160•270•27•150•33•18•156•78•41 / 542•1252•195•399 / 200•180•36•321•63•15•264•279•351•111•351•111•231•337 / 125•9•180•357•813•366•321•33•184•184
CP000020 / 106•135•30•162•120•51•98•90•121•93•121•93•33•6•261•30•30•78•648•21•27•129•81•38 / 293•127•897•477•195•5•40•267•87•87 / 380•93•264•78•555•339•342•171•166•166 / 35•12•87•180•144•26•61•75•269•559•269•559•36•107•45•214•57•116•180•185
FM954972 / 43•198•345•116•90•334•696•63•228•201•228•201•74 / 293•127•20•102•450•582•220•195•399•399 / 380•93•264•78•264•291•339•135•201•6•201•6•171•166 / 35•12•87•324•204•786•36•366•174•364•174•364
CP002284 / 241•171•290•90•223•89•61•156•120•477•120•477•14•160•84•147•48•17 / 293•139•444•116•802•507•87 / 95•384•336•54•27•948•117•210•119•48•119•48•50 / 35•227•52•357•813•173•222•509
FO203526 / 631•71•90•121•93•98•22•51•87•191•87•191•457•168•93•21•110•28•74 / 432•110•225•807•220•213•399 / 614•201•264•291•339•111•24•225•171•166•171•166 / 134•350•91•45•42•786•36•174•192•234•192•234•322
CP009354 / 631•71•90•334•51•87•191•322•189•114•189•114•111•141•74 / 104•328•560•802•213•45•59•208•87•87 / 49•331•216•18•123•63•291•279•339•111•339•111•243•177•166 / 134•441•87•786•955•3
Symbol (•) indicates RE site in the gene sequences (-): No digestion
Additional unique patterns: Hin1I - 487•481•306•1114 (AE003852)

TableS24 Uniquein silico Restriction Endonuclease digestion pattern (5ʹ-3ʹ) of ileS gene of Vibrio genomes

Vibrio genome / Restriction Endonucleases
AluI / BfaI / BfuCI / CviAII
AE003852 / 270•576•8•139•7•89•1038 / - / 128•82•176•10•9•177•380•322•39•11•210•298•15•251•19 / 418•60•587•44•28•195•183•163•77•372
BA000031 / 442•613•484•154•230•99•13•89 / 67•673•294•548•441•81•20 / 210•92•237•43•699•39•221•43•8•262•270 / 33•174•211•286•361•651•408
BA000037 / 1055•199•285•158•427 / 582•261•287•190•221•43•8•262•270 / 418•206•15•426•651•36•372
CP000020 / 220•25•26•258•51•825•150•563 / 582•201•261•344•457•57•216 / 557•75•556•507•48•375
FM954972 / 260•96•365•125•33•176•484•219•40•237•15•71 / 13•54•97•416•102•352•293•186•501•107 / 800•337•337•110•8•252•10•33•24•210 / 207•432•159•757•120•77•369
CP002284 / 631•48•23•159•176•721•259•5•108 / 13•144•490•215•393•72•489•198•116 / 210•92•237•43•699•39•221•43•8•262•270 / 400•18•206•931•120•438•4•13
FO203526 / 160•999•71•264•102•531 / 67•513•651•381•515 / 78•308•10•9•308•165•14•392•23•16•77•187•255•15•57•191•22 / 418•152•339•418•188•163•41•168•240
CP009354 / 66•636•291•44•10•8•199•237•48•219•137•229 / 67•153•309•153•882•168•392 / 71•139•176•10•9•915•340•179•15•110•160 / 418•221•426•457•33•120•77•132•240
HpyCH4V / RsaI / TaqI / Tru9I
AE003852 / 477•258•69•175•9•360•170•178•62•150•219 / 603•328•239•506•116•48•287 / 385•70•126•93•18•341•226•171•138•134•13•8•404 / 58•16•30•6•81•804•767•178•187
BA000031 / 634•177•205•149•240•149•112•15•74•54•16•80•219 / 92•81•118•28•284•345•580•145•56•233•162 / 378•203•201•1116•77•101•48 / 110•126•48•806•358•546•130
BA000037 / 76•401•490•180•387•225•365 / 92•227•91•193•197•217•538•118•164•287 / 692•159•182•223•443•21•346•58 / 110•747•137•91•435•120•203•93•188
CP000020 / 49•15•261•18•134•481•9•105•30•189•105•261•128•333 / 291•204•60•48•345•25•44•502•197•51•128•58•165 / 110•12•69•115•1523•15•274 / 104•132•48•44•325•81•18•95•147•91•114•179•60•100•296•93•94•97
FM954972 / 82•792•93•21•84•552•42•455 / 173•44•74•312•758•760 / - / 104•132•48•369•99•129•114•213•179•61•87•12•93•120•60•117•184
CP002284 / 93•310•26•268•96•11•862•143•16•80•211•4•10 / 422•73•108•345•497•517•168 / 118•144•16•72•35•4•192•93•350•174•109•12•246•288•277 / 110•135•749•91•5•117•180•148•218•166•17•58•136
FO203526 / 477•346•193•502•151•143•315 / 92•199•204•239•214•1179 / 163•222•70•402•453•258•147•8•133•45•226 / 59•269•7•24•72•564•216•240•192•284•105•95
CP009354 / 3•426•403•240•114•350•138•135•96•219 / 104•187•28•284•131•214•25•452•20•38•37•604 / 262•97•26•871•63•401•70•63•23•248 / 58•52•606•87•54•24•567•93•383•13•57•35•95
Symbol (•) indicates RE site in the gene sequences (-): No digestion
Additional unique patterns:
(i)Hin1I-22•319•1438•348 (AE003852); 643•226•441•466•348 (BA000037)

Table S25 Unique in silico Restriction Endonuclease digestion pattern (5ʹ-3ʹ) of rplQgene of Vibrio genomes

Vibrio genome / Restriction Endonucleases
AluI
AE003852 / 77•52•34•159•20•19•12•14
BA000031 / -
BA000037 / 41•36•44•8•34•71•64•24•20•16•12•14
CP000020 / 77•52•34•159•20•39
FM954972 / 77•86•159•20•16•12•11
CP002284 / 77•52•34•102•57•20•22•9•14
FO203526 / 77•52•34•135•24•20•34•11
Symbol (•) indicates RE site in the gene sequences (-): No digestion
Additional unique patterns:
(i)Bfal- 74•8•78•87•140 (FO203526)
(ii)Rsal-86•121•102•72 (CP002284)
(iii)Tru9I- 101•138•54•88 (FM954972)

TableS26 Uniquein silico Restriction Endonuclease digestion pattern (5ʹ-3ʹ) of rplWgene of Vibrio genomes

Vibrio genome / Restriction Endonucleases
BfucI / Tru9I
AE003852 / 2•123•57•91•30 / -
CP000020 / - / 107•21•36•139
FM954972 / - / 22•142•23•52•64
Symbol (•) indicates RE site in the gene sequences (-): No digestion

TableS27 Uniquein silico Restriction Endonuclease digestion pattern (5ʹ-3ʹ) of rpsU gene of Vibrio genomes

Vibrio genome / Restriction Endonucleases
AluI / RsaI
AE003852 / 43•108•26•4•35 / -
CP000020 / - / 17•114•80•5
Symbol (•) indicates RE site in the gene sequences(-): No digestion

Table S28 Unique in silico Restriction Endonuclease digestion pattern (5ʹ-3ʹ) of SecA gene of Vibrio genomes

Vibrio genome / Restriction Endonucleases
AluI / BfaI / BfuCI / CviAII
AE003852 / 12•114•73•21•41•591•62•247•395•22•40•95•474•337•18•170 / - / 180•408•111•26•279•90•30•189•325•165•17•139•65•97•21•14•190•90•29•247 / 240•43•170•27•90•300•79•504•65•504•538•103•49
BA000031 / 12•114•60•13•62•253•338•62•155•228•259•62•199•115•63•556•176 / 160•288•669•429•543•57•78•503 / 80•588•336•90•327•163•54•165•156•98•85•204•371•10 / 480•90•379•504•65•169•311•24•75•478•103•49
BA000037 / 12•683•7•690•226•11•303•51•204•337•18•27•15•11•129 / 160•288•1098•1178 / 42•221•325•50•6•360•252•382•165•47•109•65•79•243•378 / 480•90•379•320•249•291•24•264•478•149
CP000020 / 60•346•99•150•411•1158•114•204•26•27•28•101 / 793•1377•426•125•3 / 42•546•993•219•159•189•198•125•246•7 / 344•109•27•469•317•249•118•51•131•47•329•487•46
FM954972 / 12•97•237•168•141•197•217•9•387•18•73•62•270•44•51•20•184•337•12•6•53•4•12•116 / 403•333•486•324•33•567•165•132•153•131 / 180•944•189•156•132•9•193•318•21•204•381 / 240•33•180•27•90•222•133•528•65•169•410•478•97•6•49
CP002284 / 12•77•825•155•228•120•139•22•354•51•12•156•276•181•119 / 1360•219•591•165•392 / 80•183•325•80•456•189•288•9•193•47•109•162•225•270•101•10 / 453•117•379•504•65•480•300•429
FO203526 / 12•187•147•159•190•219•269•373•13•9•354•233•359•39•21•140 / 160•18•1182•210•1154 / 699•158•946•47•109•65•36•61•92•133•371•7 / 240•213•27•90•355•245•348•169•335•495•155•6•46
CP009354 / 12•114•135•244•190•7•150•540•164•22•40•95•104•166•559•53•135 / 178•225•108•849•219•69•441•222•24•395 / 747•110•237•238•471•221•118•71•15•502 / 240•139•101•90•948•118•881•58•106•32•17
HpyCH4V / RsaI / TaqI / Tru9I
AE003852 / 282•315•141•78•60•45•141•343•230•15•654•259•149 / 257•52•68•149•134•109•260•150•189•165•144•394•336•305 / 143•297•183•24•324•152•252•328•173•40•225•78•389•104 / 83•560•286•684•1092•7
BA000031 / 258•28•72•954•353•601•270•191 / 377•96•187•235•134•150•106•5•78•165•144•514•216•320 / 251•300•72•24•64•362•302•229•99•65•85•63•147•78•144•27•349•66 / 128•339•393•123•108•1633•3
BA000037 / 286•452•78•105•484•72•33•756•117•110•70•161 / 309•199•152•235•134•150•111•78•165•144•265•782 / 251•372•14•10•147•11•318•76•11•169•20•177•127•150•27•36•111•36•78•6•138•439 / 74•9•44•201•25•114•462•162•333•1300
CP000020 / 154•204•546•498•78•9•288•111•453•273•110 / 48•164•66•31•351•366•150•189•68•52•45•144•557•176•317 / 104•39•480•24•324•401•481•366•251•17•69•168 / 83•44•234•282•97•80•37•14•58•159•237•96•15•560•456•24•248
FM954972 / 258•40•623•25•531•188•79•374•445•15•149 / 212•97•199•152•109•260•150•111•78•165•113•31•265•106•191•34•134•43•189•88 / 92•131•400•348•152•76•180•225•99•213•225•144•442 / 83•560•24•49•2011
CP002284 / 378•307•53•927•934•128 / 257•216•123•110•662•165•144•514•48•168•85•206•29 / 251•300•72•14•436•50•76•11•165•229•99•65•85•23•25•578•248 / 62•65•201•139•249•375•348•669•344•275
FO203526 / 816•849•871•188 / 309•164•187•369•124•26•189•120•45•144•301•213•216•317 / 251•300•72•24•552•180•389•85•27•36•111•24•90•144•174•28•72•102•63 / 74•9•198•539•163•108•333•15•669•368•248
CP009354 / 298•36•44•360•183•13•471•72•33•155•913•21•131 / 278•31•164•58•65•64•109•184•76•150•111•78•68•52•45•144•301•93•336•85•238 / 251•189•111•72•14•10•476•76•180•225•99•65•85•27•36•111•114•78•66•445 / 83•270•114•624•333•15•174•1110•7
Symbol (•) indicates RE site in the gene sequences(-): No digestion

Table S29 Unique in silico Restriction Endonuclease digestion pattern (5ʹ-3ʹ) of rpoA gene of Vibrio genomes

Vibrio genome / Restriction Endonucleases
AluI / BfaI / BfuCI
AE003852 / 466•105•32•264•126 / - / 368•51•280•51•5•22•63•153
BA000031 / 59•218•189•105•32•61•12•191•126 / 37•480•78•39•39•171•111•38 / 368•223•108•51•5•22•63•153
BA000037 / 59•407•6•99•32•264•126 / 37•78•402•327•111•38 / 53•315•51•280•51•5•22•63•153
CP000020 / 469•177•15•12•249•68 / 115•147•657•33•38 / 633•63•51•5•22•63•153
FM954972 / 265•201•6•131•61•12•191•126 / 115•519•309•12•38 / 53•315•51•280•51•27•63•153
CP002284 / 466•6•131•264•126 / 634•210•111•38 / 239•129•51•280•51•27•63•153
FO203526 / 115•828•12•38 / 239•129•331•51•5•22•63•153
CP009354 / 265•338•61•12•191•126 / 634•39•282•38 / 368•51•280•51•5•22•63•68•85
HpyCH4V / RsaI / Tru9I
AE003852 / 3•121•213•588•68 / 202•386•42•83•6•129•145 / 26•374•472•39•79•3
BA000031 / 3•121•39•174•324•30•282•20 / 191•11•19•367•42•83•135•7•65•73 / 26•228•180•438•39•79•3
BA000037 / 3•121•213•636•20 / 202•67•361•83•6•129•7•65•73 / -
CP000020 / 3•67•249•15•189•135•30•158•144 / 202•256•127•42•83•280 / 254•15•36•564•29•10•79•3
FM954972 / 3•334•324•332 / 269•319•42•83•6•129•145 / 26•228•618•39•79•3
CP002284 / - / 191•11•386•42•83•6•129•145• / -
FO203526 / - / 202•19•367•42•218•7•65•73 / 26•222•21•165•438•118•3
CP009354 / - / 191•11•67•263•98•83•6•129•7•65•73 / 26•222•6•618•118•3
Symbol (•) indicates RE site in the gene sequences (-): No digestion
Additional unique patterns:
(i)CviAII- 67•282•74•567 (CP000020)
(ii)TaqI - 182•336•90•138•244 (CP000020); 182•360•69•138•244 (FM954972)

Table S30 Unique in silico Restriction Endonuclease digestion pattern (5ʹ-3ʹ) of recA gene of Vibrio genomes

Vibrio genome / Restriction Endonucleases
AluI / BfaI / BfuCI / CviAII
AE003852 / 336•536•127•66 / - / 185•109•485•39•4•179•64 / 75•411•297•210•72
BA000031 / 231•84•55•24•60•45•29•315•29•116•56 / 37•336•471•200 / - / 75•411•297•261
BA000037 / 231•84•184•344•29•178 / 37•45•744•224 / 233•61•284•12•96•60•304 / -
CP000020 / 241•129•84•45•270•103•91•84 / 148•78•66•660•95 / - / 75•188•23•200•297•80•58•126
FM954972 / 231•297•241•47•27•29•71•92•6 / 136•12•144•552•102•95 / - / -
CP002284 / 336•118•418•175 / - / 71•162•345•244•225 / 75•211•200•72•387•102
FO203526 / 231•84•124•89•241•74•29•169 / - / - / -
CP009354 / 315•55•84•74•241•47•27•29•68•23•25•26•24•6 / 37•279•57•18•435•18•171•29 / 294•593•63•94
HpyCH4V / RsaI / TaqI / Tru9I
AE003852 / 174•75•782•34 / - / 118•157•54•492•213•31 / 761•218•83•3
BA000031 / - / 304•374•190•176 / 227•48•54•81•51•492•91 / 641•96•24•39•241•3
BA000037 / 217•32•164•519•118 / 678•109•81•82•100 / 118•157•54•96•36•558•31 / 323•206•232•39•247•3
CP000020 / 249•147•570•81 / - / - / 232•91•119•87•43•69•96•24•39•17•16•211•3
FM954972 / 104•70•88•151•628 / - / 275•54•81•51•360•220 / 572•69•48•48•96•208
CP002284 / 174•43•749•81 / - / 70•205•54•718 / 220•309•112•48•39•9•24•39•194•53
FO203526 / 174•75•147•17•88•540 / - / 275•48•6•81•51•473•19•88 / 728•9•24•277•3
CP009354 / 104•292•17•553•78 / - / 275•150•36•360•132•91 / 442•130•69•96•24•39•33•211
Symbol (•) indicates RE site in the gene sequences (-): No digestion

Table S31Unique in silico Restriction Endonuclease digestion pattern (5ʹ-3ʹ) of rpoB gene of Vibrio genomes

Vibrio genome / Restriction Endonucleases
AluI / BfaI / BfuCI / CviAII
AE003852 / 93•89•19•14•229•165•387•224•73•146•91•336•466•173•27•60•264•162•12•381•9•166•27•171•227•15 / 637•10•317•33•762•252•1020•129•177•114•561•14 / 86•37•185•256•56•36•43•227•91•54•114•110•151•29•70•167•273•15•222•222•102•165•393•16•113•99•48•12•55•156•423 / 369•18•158•493•66•852•96•254•91•15•840•432•6•336
BA000031 / 93•58•31•19•14•229•165•202•171•156•82•73•237•336•30•10•177•137•16•143•153•150•18•156•73•101•30•7•530•27•160•227•18 / 304•333•24•168•135•33•24•321•60•39•570•210•159•213•54•318•27•12•120•36•252•39•147•156•18•57•165•18•17 / 86•37•441•56•109•117•77•94•168•116•174•237•186•546•102•234•196•128•16•23•90•99•48•67•65•471•46 / 369•18•158•493•66•438•414•96•236•18•91•15•840•432•6•249•12•78
BA000037 / 93•89•19•14•229•165•363•10•14•68•74•9•13•60•73•237•336•30•636•150•18•156•108•66•30•528•36•160•227•18 / 304•333•360•24•321•60•39•318•252•360•222•54•318•27•132•36•177•18•96•321•57•165•18•17 / 86•37•441•92•73•117•5•72•94•54•224•151•29•204•33•111•621•532•128•39•90•99•48•67•536•46 / 369•18•158•482•11•66•841•11•96•254•91•15•840•432•6•261•78
CP000020 / 93•89•19•14•229•325•24•144•16•185•82•278•32•460•75•18•63•90•143•199•122•156•10•51•150•521•36•160•245 / 202•1140•417•252•369•213•54•189•324•612•257 / 86•37•441•56•36•7•36•224•37•35•22•6•48•224•175•20•310•746•430•128•16•23•90•147•67•156•327•53•46 / 369•176•482•11•66•357•495•96•236•109•15•840•432•6•37•212•12•78
FM954972 / 93•58•31•19•14•229•165•529•82•310•366•10•159•18•153•147•149•22•146•156•10•63•30•5•66•30•564•160•227•18 / 304•357•294•42•24•381•357•252•84•285•213•54•345•12•120•36•177•417•75•165•18•17 / 86•37•192•249•92•7•66•194•148•105•503•262•503•102•328•246•260•67•48•17•91•426 / 369•176•482•1025•345•15•840•432•6•339
CP002284 / 93•89•19•14•229•509•267•28•282•292•74•10•426•47•153•150•18•156•73•35•54•21•21•7•344•213•160•227•18 / 304•525•258•672•252•369•213•54•267•78•12•120•36•141•297•156•75•165•18•17 / 86•37•185•256•56•36•7•354•6•48•224•151•11•18•204•219•546•102•328•62•36•4•144•113•99•48•67•536•46 / 369•18•158•482•77•357•484•11•96•236•109•15•438•402•432•6•249•12•78
FO203526 / 93•89•19•14•229•165•111•193•69•14•142•82•73•237•366•324•159•153•150•18•156•183•4•17•564•160•227•18 / 550•111•426•156•24•492•252•954•27•48•120•177•261•111•285•18•17 / 86•37•540•36•30•294•278•411•229•605•430•128•39•90•99•48•67•536•46 / 369•18•158•493•66•357•81•414•96•236•109•15•840•96•336•6•249•12•78
CP009354 / 93•58•31•19•14•229•165•111•108•133•6•171•82•73•237•366•187•137•159•4•122•27•22•128•18•156•73•68•33•9•21•351•4•173•36•160•227•18 / 304•333•318•9•57•321•60•357•252•84•285•213•345•27•27•48•84•36•177•75•186•156•75•165•18•17 / 86•37•441•92•43•30•194•94•54•114•261•266•510•222•45•487•128•16•23•90•99•48•132•27•490 / 369•176•493•66•357•81•403•11•96•254•91•15•840•432•6•249•12•78
HpyCH4V / RsaI / TaqI / Tru9I
AE003852 / 204•243•169•18•177•273•90•420•141•7•313•568•230•168•414•291•132•168 / 48•288•66•18•115•48•4•284•535•234•9•101•353•163•79•269•145•19•14•141•119•85•153•18•199•181•212•71•55 / 85•10•9•12•354•81•12•56•55•15•69•6•428•85•23•34•300•48•302•127•132•32•160•8•343•57•132•99•483•78•372•19 / 245•105•2799•726•150
BA000031 / 204•243•187•255•195•57•279•174•228•66•105•42•20•91•707•873•303 / 48•288•66•18•163•277•11•778•101•131•73•149•122•534•19•359•153•18•195•4•181•60•152•10•119 / 85•10•9•12•354•87•36•26•27•28•15•75•5•85•38•166•96•38•85•57•300•7•41•144•285•132•192•8•343•57•231•12•921•22 / 245•105•63•519•282•210•81•696•93•336•108•120•66•225•18•126•102•480•15•139
BA000037 / 204•127•303•300•150•156•180•174•141•171•26•34•89•328•327•143•168•22•392•291•303 / 48•91•263•18•94•69•4•138•135•11•535•243•101•131•222•656•19•274•85•153•18•36•163•181•60•152•10•119 / 85•10•9•12•334•20•123•81•15•75•90•204•96•38•85•57•300•7•41•144•417•192•8•343•288•933•22 / 245•105•63•1794•531•186•225•144•582•15•139
CP000020 / 280•45•122•187•117•282•24•192•207•45•234•114•206•499•299•118•156•287•312•121•182 / 313•89•18•167•417•645•101•86•45•188•34•122•87•447•19•14•136•124•85•171•199•138•43•212•129 / 85•31•354•87•117•324•156•38•106•27•9•300•48•144•417•192•639•933•22 / 245•96•9•359•12•108•676•210•152•210•124•6•50•373•108•120•102•102•87•18•228•116•4•66•11•283•154
FM954972 / 204•121•122•187•450•57•315•45•228•6•87•66•147•20•277•501•20•561•312•121•182 / 48•288•66•18•167•273•11•383•386•131•110•188•34•122•41•46•447•19•14•141•357•18•36•163•138•43•212•10•61•58 / 85•19•12•202•152•93•30•26•27•28•15•69•6•90•300•72•51•57•300•48•429•132•32•160•8•343•57•231•483•450•22 / 245•105•63•1011•81•210•486•6•87•336•108•120•57•9•216•9•18•69•57•102•198•33•249•15•139
CP002284 / 204•243•169•18•786•174•141•153•147•20•117•538•143•691•21•90•71•121•182 / 48•288•66•18•305•52•83•11•194•189•386•9•122•110•222•656•19•155•375•199•138•43•60•152•129 / 85•10•9•12•354•149•27•28•114•66•204•219•57•348•429•132•32•160•8•343•189•99•12•573•348•22 / 245•105•63•1022•70•210•486•6•87•336•108•411•143•103•197•283•15•139
FO203526 / 204•243•187•177•330•357•96•338•34•69•20•70•728•274•287•67•245•303 / 48•288•66•18•163•4•819•234•9•101•21•332•163•46•447•19•512•18•36•101•70•130•43•212•129 / 85•10•9•12•354•93•30•81•15•69•96•12•26•166•96•72•51•57•300•48•429•132•543•57•132•99•207•276•450•22 / 245•105•63•1011•81•789•444•411•18•126•736
CP009354 / 204•243•73•291•78•48•147•372•138•372•27•42•20•277•501•20•873•303 / 48•288•66•18•167•273•11•535•234•9•101•90•263•656•19•274•85•153•18•36•163•181•60•152•10•61•58 / 85•10•9•12•354•87•132•69•96•12•26•166•96•38•34•108•300•48•429•132•192•8•343•189•99•933•22 / 245•48•57•362•712•81•573•123•537•120•66•225•18•708•15•139
Symbol (•) indicates RE site in the gene sequences

Table S32 Unique in silico Restriction Endonuclease digestion pattern (5ʹ-3ʹ) of sodB gene of Vibrio genomes

Vibrio genome / Restriction Endonucleases
AluI / BfaI / HpyCH4V
AE003852 / - / - / -
BA000031 / 19•95•274•177•20 / 43•27•87•219•24•174•11 / -
BA000037 / - / - / -
CP000020 / 19•225•42•39•260 / 43•114•243•174•11 / 31•9•258•234•53
FM954972 / 114•274•189•8 / 43•27•87•243•144•30•11 / 280•18•234•53
CP002284 / 19•95•202•269 / 43•27•504•11 / 244•9•27•144•141•20
FO203526 / - / - / 61•213•153•158
CP009354 / 19•42•53•166•305 / 43•27•87•84•159•144•30•11 / 205•69•24•234•33•20
RsaI / TaqI / Tru9I
AE003852 / 135•355•22•73 / - / -
BA000031 / 135•315•40•22•73 / 143•168•186•88 / 110•6•264•30•175
BA000037 / 77•384•44•104 / 56•429•78•46 / -
CP000020 / - / - / 110•60•150•90•175
FM954972 / - / - / 110•60•210•30•175
CP002284 / - / 8•150•339•88 / 116•78•126•228•37
FO203526 / - / - / 110•84•96•295
CP009354 / - / - / 110•270•30•138•37
Symbol (•) indicates RE site in the gene sequences (-): No digestion
Additional unique patterns:
(i)BfuCI- 125•39•240•181 (AE003852); 164•180•60•67•114(CP002284)
(ii)CviAII- 69•180•131•119•110 (BA000037)
(iii)Hin1I - 72•180•131•119•107(BA000037)

Table S33Unique in silico Restriction Endonuclease digestion pattern (5ʹ-3ʹ) of flaE gene of Vibrio genomes

Genome / AluI / BfaI / BfuCI / CviAII
AE003852 / 261•147•66•50•58•11•328•216 / 541•381•63•152 / 146•72•275•136•324•184 / 6•216•51•703•161
BA000031 / 927•288•69•30 / - / 279•240•111•192•42•357•5•88 / -
BA000037 / 34•884•288•69•30 / - / 42•477•24•35•52•180•45•357•93 / -
CP000020 / - / 25•306•261•225•482 / 279•158•7•75•24•306•362•88 / -
FM954972 / 131•47•267•285•575 / 179•744•71•33•42•105•84•47 / 296•94•120•33•87•180•45•450 / 202•146•321•67•14•313•242
CP002284 / 331•124•69•58•144•6•50•352 / - / 222•318•48•150•238•158
FO203526 / 843•264•99•99 / - / 519•356•246•184 / 202•146•388•257•312
CP009354 / 62•37•597•575•34 / 129•11•94•693•164•214 / 144•36•426•65•111•9•231•237•46 / 109•444•605•147
HpyCH4V / RsaI / TaqI / Tru9I
AE003852 / 144•81•21•21•24•25•81•536•42•87•75 / - / 108•109•155•530•63•29•143 / 53•302•652•39•88•3
BA000031 / 172•150•492•15•33•440•12 / 85•170•364•152•237•87•69•110•40 / 574•15•334•15•376 / 16•30•46•518•87•184•433
BA000037 / - / 173•117•371•110•228•47•40•69•150 / 472•67•35•355•45•209•7•115 / 16•76•399•24•95•142•131•419•3
CP000020 / 106•42•24•150•312•171•96•36•129•153•53•27 / 512•259•309•84•95•40 / 58•942•184•109•6 / 16•30•46•215•127•192•132•27•47•6•27•434
FM954972 / 34•234•54•99•144•288•452 / 255•406•110•98•183•213•40 / 274•115•45•140•340•54•6•209•7•115 / 16•76•399•24•95•175•87•86•202•142•3
CP002284 / 136•89•16•5•45•180•327•96•39•201 / 194•704•76•100•60 / 151•814•37•132 / 14•99•254•114•292•171•63•127
FO203526 / 268•585•372•53•15•12 / 255•364•152•211•64•6•34•84•135 / 127•231•216•60•144•405•122 / 92•215•207•244•27•520
CP009354 / 39•323•837•93•13 / 135•15•156•228•167•604 / 113•7•609•9•567 / 384•134•294•159•25•215•94
Symbol (•) indicates RE site in the gene sequences(-): No digestion

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