Yue Ma
Supplementary Table 1. Overview of the selected genes, the corresponding T cell subsets and the AOD
Gene symbol / Alternative name / T cell subset / AOD-DetectorCCL5 / Th1 / Hs00174575_m1
CCR10 / Hs00706455_s1
CCR2 / Hs00356601_m1
CCR3 / Th2 / Hs00266213_s1
CCR4 / Th2/Treg / Hs99999919_m1
CCR5 / Th1 / Hs00152917_m1
CCR7 / Hs00171054_m1
CCR8 / Th2/Treg / Hs00174764_m1
CD25 / IL2RA / Treg / Hs00166229_m1
CD26 / DPP4 / Hs00175218_m1
CD69 / Th1 / Hs00156399_m1
CRTH2 / GPR44 / Th2 / Hs00173717_m1
CTLA4 / Treg / Hs00175480_m1
CXCR3 / Th1 / Hs00171041_m1
FOXP3 / Treg / Hs00203958_m1
GAPDH / Hs99999905_m1
GATA3 / Th2 / Hs00231122_m1
GITR / TNFRSF18 / Treg / Hs00188346_m1
ICOS / Treg / Hs00359999_m1
IFNγ / IFNG / Th1 / Hs00174143_m1
IL10 / Th2 / Hs00174086_m1
IL10RA / Hs00387004_m1
IL12A / Th1 / Hs00168405_m1
IL12B / Th1 / Hs00233688_m1
IL12RB2 / Th1 / Hs00155486_m1
IL13 / Th2 / Hs00174379_m1
IL13RA2 / Th2 / Hs00152924_m1
IL17 / Th17 / Hs00174383_m1
IL1R1 / Hs00168392_m1
IL21 / Th1 / Hs00222327_m1
IL2 / Th1 / Hs00174114_m1
IL4 / Th2 / Hs00174122_m1
IL4R / Th2 / Hs00166237_m1
IL5 / Th2 / Hs00174200_m1
IL5RA / Th2 / Hs00602482_m1
IL7R / Hs00233682_m1
IL8 / Hs00174103_m1
IL8RA / Hs00174146_m1
IL8RB / Hs00174304_m1
IL9R / Hs00602538_m1
MAF / Th2 / Hs00193519_m1
OX40 / TNFRSF4 / Th2/Treg / Hs00533968_m1
PDCD1 / Hs00169472_m1
RPII / POLR2A / Hs00172187_m1
T-bet / TBX21 / Th1 / Hs00203436_m1
TGFβ1 / TGFB1 / Th2/Treg / Hs00171257_m1
TGFBR1 / Hs00610318_m1
TNF / Th1 / Hs00174128_m1
Supplementary Table 2. Gene expression profiles in resting and stimulated CD4+CD26- T cell subsets from LN and cHL tissues.
LN1 / LN2 / LN3 / LN4 / LN5 / HL1 / HL3 / HL4 / HL5 / HL6 / LN1 / LN2 / LN4 / HL1 / HL2 / HL3 / HL4 / HL5
CCL5 / 2598 / 13798 / 28574 / 36879 / 19095 / 7060 / 3673 / 37397 / 1941 / 2566 / 1355 / 2512 / 3839 / 8823 / 2881 / 1127 / 4124 / 552
CCR10 / - / 2 / 3 / 4 / 19 / 2 / - / 11 / 4 / 33 / - / 2 / - / - / - / - / - / -
CCR2 / 9005 / 872 / 2720 / 4127 / 1427 / 1322 / 393 / 4799 / 126 / 961 / 33 / 204 / 49 / 318 / 607 / 123 / 776 / 34
CCR3 / 98 / 22 / 142 / 94 / 34 / 58 / 256 / 392 / 147 / 698 / 10 / 5 / - / 108 / 231 / 254 / 63 / 37
CCR4 / 8950 / 16970 / 17114 / 8163 / 4020 / 29377 / 12518 / 38918 / 150986 / 62014 / 13689 / 26392 / 8496 / 45200 / 4511 / 1027 / 28183 / 71469
CCR5 / 272 / 1375 / 1690 / 4143 / 2520 / 2141 / 573 / 15558 / 2807 / 5475 / 47 / 908 / 317 / 579 / 233 / 228 / 2604 / 1432
CCR7 / 9311 / 4665 / 12622 / 6676 / 8708 / 7742 / 6151 / 13003 / 23891 / 11133 / 63849 / 9997 / 4913 / 8870 / 4493 / 1001 / 10005 / 13577
CCR8 / 494 / 837 / 1262 / 160 / 161 / 7635 / 54 / 2935 / 3353 / 1616 / 279 / 954 / 53 / 3172 / 137 / - / 692 / 490
CD69 / 2816 / 16476 / 21960 / 10216 / 7028 / 9411 / 4112 / 1594 / 12499 / 11862 / 9684 / 5847 / 16221 / 2880 / 533 / 689 / 388 / 482
CTLA4 / 2032 / 18258 / 29351 / 24122 / 23040 / 53238 / 27447 / 58743 / 65227 / 47305 / 11408 / 42203 / 140837 / 48984 / 10173 / 14681 / 17123 / 29227
CXCR3 / 205 / 643 / 2150 / 3194 / 4725 / 1832 / 1456 / 19346 / 2408 / 8803 / 141 / 34 / 554 / 48 / 53 / 196 / 287 / 309
DPP4 / 364 / 78 / 608 / 56 / 140 / 77 / 8 / 43 / 38 / 119 / 358 / 55 / 22 / 132 / - / - / 33 / 95
FOXP3 / 4591 / 5347 / 15515 / 2974 / 4500 / 56211 / 3296 / 51337 / 27804 / 9115 / 4536 / 6255 / 3523 / 44379 / 3740 / 3914 / 16726 / 30048
GATA3 / 6518 / 12418 / 23487 / 14282 / 10310 / 14738 / 9306 / 16683 / 10810 / 9446 / 3249 / 14851 / 2259 / 6086 / 5983 / 3301 / 2971 / 4698
GPR44 / 2327 / 5 / 94 / - / 16 / 2 / - / 8 / - / 4 / 24 / 2 / - / - / - / - / - / -
ICOS / 144 / 9137 / 19922 / 18863 / 15385 / 30653 / 2585 / 31385 / 28368 / 41587 / 1345 / 15254 / 33312 / 11316 / 14 / 2047 / 4906 / 11841
IFNG / 187 / 1443 / 4015 / 5126 / 2955 / 1139 / 448 / 997 / 102 / 131 / 39412 / 2125 / 409958 / 1912 / 140 / 372 / 1043 / 90
IL10 / 32 / 2034 / 1993 / 4353 / 1086 / 994 / 626 / 5530 / 1791 / 4316 / 1672 / 664 / 58384 / 380 / 54 / 96 / 198 / 341
IL10RA / 366 / 13022 / 55000 / 29764 / 15609 / 17312 / 8039 / 18293 / 10393 / 7905 / 8121 / 5544 / 4540 / 5888 / 3154 / 2168 / 4025 / 2697
IL12A / 30 / 32 / 47 / 29 / 13 / 58 / 67 / 37 / 37 / 65 / 773 / 60 / 19 / 21 / - / - / 38 / 72
IL12B / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
IL12RB2 / 148 / 508 / 325 / 682 / 6427 / 8734 / 3466 / 30811 / 15330 / 13183 / 2288 / 5537 / 2904 / 25618 / 6890 / 191 / 15897 / 18008
IL13 / 78 / 171 / - / 7 / 14 / 143 / - / 61 / 171 / 35 / 6238 / 2989 / 128 / 710 / - / - / 69 / 420
IL13RA2 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
IL17 / 5 / 4 / 186 / 5 / - / 917 / 233 / 132 / 609 / 325 / 9692 / 6 / 112 / 1230 / 24 / 83 / 43 / 683
IL1R1 / 576 / 75 / 292 / 70 / 54 / 2830 / 306 / 100 / 692 / 248 / 2412 / 268 / 1036 / 6070 / 93 / 223 / 275 / 1006
IL2 / 64 / 271 / 142 / 168 / 71 / 23 / 147 / 7 / 17 / 62 / 46332 / 2722 / 26200 / 938 / 36 / 74 / 180 / 339
IL21 / 85 / 8158 / 3361 / 21856 / 19506 / 2564 / 1185 / 1807 / 6015 / 13326 / 5768 / 8625 / 58915 / 5925 / 1076 / 2215 / 2038 / 8201
IL2RA / 3370 / 2614 / 4137 / 1822 / 2153 / 13065 / 6766 / 11579 / 7445 / 11593 / 44070 / 12663 / 21008 / 54107 / 16361 / 10002 / 12635 / 13574
IL4 / 1 / 54 / - / - / - / - / - / - / - / - / 66 / 124 / 13 / - / - / - / - / -
IL4R / 16366 / 12923 / 9746 / 8122 / 8096 / 10030 / 4021 / 4941 / 4823 / 3938 / 5642 / 7111 / 6926 / 5188 / 2019 / 1127 / 2227 / 2098
IL5 / 9 / 3 / - / 28 / 45 / - / 59747 / - / - / 43 / 312 / 116 / 246 / 34 / - / - / 8 / 15
IL5RA / - / 2 / 655 / 275 / 151190 / 16 / 538 / - / 6 / - / - / 2 / - / 61 / 287 / - / - / -
IL7R / 2601 / 5359 / 13378 / 11108 / 38589 / 5882 / 1688 / 4946 / 15946 / 13956 / 2213 / 3859 / 8214 / 1221 / 48 / 361 / 2134 / 6599
IL8 / 1152 / 284 / 1724 / 92 / 101 / 1132 / 15 / 36 / 26 / 11 / 118408 / 2145 / 3712 / 17388 / 263 / 320 / 432 / 1031
IL8RA / 13 / 4 / 8 / 4 / 12 / 5 / - / 6 / 3 / - / - / - / - / - / - / - / - / -
IL8RB / 226 / 7 / 29 / 11 / - / 5 / - / 4 / - / - / 9 / - / - / - / - / - / - / -
IL9R / 1 / 14 / 120 / 135 / 50 / 74 / 37 / 38 / 27 / 45 / - / 6 / 7 / - / - / - / 6 / -
MAF / 552 / 13421 / 7475 / 17615 / 21316 / 11120 / 4547 / 10823 / 13459 / 14772 / 786 / 17983 / 7204 / 4499 / 557 / 1599 / 3176 / 8998
PDCD1 / 1289 / 36676 / 10480 / 38100 / 27733 / 9120 / 3911 / 2543 / 1989 / 1424 / 2164 / 7435 / 6635 / 4772 / 3047 / 1071 / 1046 / 799
TBX21 / 499 / 674 / 494 / 1257 / 1404 / 694 / 1056 / 4269 / 685 / 923 / 10942 / 2007 / 553 / 2827 / 2272 / 723 / 1944 / 781
TGFB1 / 19080 / 9896 / 25989 / 10954 / 8627 / 10845 / 7982 / 14496 / 12161 / 11011 / 22551 / 11472 / 16003 / 13228 / 9548 / 6993 / 6312 / 7781
TGFBR1 / 425 / 2282 / 3692 / 5148 / 6191 / 1871 / 1091 / 2892 / 2271 / 3442 / 437 / 2631 / 1663 / 1188 / 306 / 345 / 1169 / 919
TNF / 1234 / 10334 / 13325 / 8908 / 6245 / 5657 / 3314 / 5535 / 5272 / 5419 / 7525 / 3418 / 10903 / 3713 / 80 / 1111 / 1284 / 1883
TNFRSF18 / 65 / 431 / 28 / 155 / 39 / 1012 / 412 / 418 / 773 / 98 / 177 / 393 / 91 / 347 / 68 / 115 / 74 / 186
TNFRSF4 / 2374 / 14449 / 5229 / 11096 / 11939 / 37767 / 15395 / 16955 / 19688 / 16333 / 14555 / 16672 / 45010 / 25026 / 3013 / 5998 / 1913 / 4583
*Relative mRNA values expressed as 2-ΔCt×104, normalized to RPII.
Supplementary Table 3. Gene expression profiles in resting and stimulated CD4+CD26+ T cell subsets from LN and cHL tissues.
LN1 / LN2 / LN3 / LN4 / LN5 / HL1 / HL2 / HL4 / HL5 / HL6 / HL7 / LN1 / LN2 / LN4 / HL1 / HL2 / HL4
CCL5 / 3160 / 15285 / 11466 / 14789 / 12855 / 22512 / 13616 / 14244 / 3856 / 5971 / 30514 / 2911 / 5598 / 3444 / 37113 / 12086 / 1912
CCR10 / - / 2 / 5 / 4 / 12 / 11 / - / 3 / - / - / 13 / - / - / - / - / - / -
CCR2 / 1842 / 4255 / 3828 / 6320 / 4236 / 3792 / 2664 / 2365 / 2329 / 4012 / 9722 / - / 146 / 104 / 261 / 665 / 52
CCR3 / 45 / 30 / 22 / 65 / 48 / 96 / 140 / 40 / 82 / 250 / 225 / - / 3 / 5 / 27 / 68 / 13
CCR4 / 6400 / 18950 / 10406 / 15472 / 11612 / 18289 / 17023 / 13766 / 37551 / 59422 / 8447 / 27920 / 29366 / 24567 / 21330 / 24101 / 10804
CCR5 / 228 / 1351 / 346 / 2431 / 1544 / 954 / 447 / 1681 / 625 / 2998 / 2546 / 66 / 344 / 244 / 257 / 451 / 216
CCR7 / 7639 / 16855 / 9505 / 13154 / 30669 / 25352 / 28993 / 73400 / 40027 / 12704 / 52881 / 21237 / 21522 / 7591 / 32305 / 12984 / 25764
CCR8 / 279 / 1440 / 170 / 463 / 309 / 867 / 456 / 412 / 1348 / 1120 / 472 / 208 / 1167 / 369 / 504 / 326 / 120
CD69 / 4336 / 27849 / 35449 / 12485 / 17394 / 11861 / 10340 / 3071 / 6901 / 3939 / 4764 / 16455 / 34233 / 46785 / 12914 / 22507 / 2477
CTLA4 / 5806 / 15928 / 9752 / 11315 / 14468 / 9456 / 20734 / 5535 / 12597 / 40700 / 7702 / 31298 / 37182 / 106925 / 34809 / 71346 / 9458
CXCR3 / 132 / 1246 / 1192 / 2620 / 3927 / 2297 / 1579 / 2221 / 642 / 6239 / 3811 / 154 / 142 / 846 / 83 / 194 / 33
DPP4 / 6 / 5748 / 6798 / 4161 / 7253 / 4030 / 3404 / 6898 / 1774 / 3660 / 7575 / - / 4647 / 962 / 11841 / 4329 / 5311
FOXP3 / 4053 / 15271 / 3904 / 7652 / 16201 / 13587 / 9469 / 5139 / 7046 / 17411 / 7008 / 7866 / 11450 / 5537 / 9757 / 10994 / 6596
GATA3 / 7251 / 8452 / 17574 / 15181 / 10099 / 20437 / 17979 / 11389 / 7830 / 11409 / 8136 / 6829 / 7028 / 2312 / 12131 / 16381 / 4249
GPR44 / 158 / 205 / 680 / 732 / 403 / 99 / 110 / 271 / 104 / 103 / 61 / - / 10 / 29 / - / - / -
ICOS / 498 / 5449 / 8505 / 11547 / 11716 / 9416 / 10678 / 7848 / 4728 / 37752 / 2672 / 3975 / 12771 / 67241 / 11981 / 18326 / 13054
IFNG / 495 / 932 / 1148 / 1896 / 1068 / 827 / 1743 / 328 / 180 / 491 / 271 / 45967 / 10790 / 519943 / 8814 / 62741 / 2711
IL10 / 210 / 1836 / 210 / 1563 / 478 / 522 / 726 / 309 / 265 / 1441 / 1280 / 2409 / 771 / 102351 / 507 / 7680 / 194
IL10RA / 11672 / 24288 / 35938 / 31459 / 27294 / 47216 / 27726 / 18745 / 17401 / 10205 / 30989 / 4188 / 9594 / 7657 / 28829 / 15260 / 4454
IL12A / 26 / 29 / 8 / 24 / 50 / 46 / 22 / 17 / 34 / 44 / 94 / - / 303 / 57 / 134 / 26 / 35
IL12B / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
IL12RB2 / 222 / 874 / 185 / 639 / 2389 / 1182 / 2801 / 2161 / 3336 / 10946 / 1652 / 3476 / 9624 / 3280 / 7245 / 11418 / 3052
IL13 / 51 / 158 / 6 / 21 / - / 78 / 17 / 38 / 207 / 45 / 73 / 2097 / 2112 / 4344 / 605 / 1927 / 426
IL13RA2 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
IL17 / 1 / 5 / 80 / 7 / - / 631 / 53 / 22 / 287 / 3249 / 139 / 1839 / 750 / 17850 / 4323 / 3199 / 292
IL1R1 / 374 / 857 / 321 / 415 / 784 / 565 / 96 / 88 / 293 / 338 / 1898 / 2816 / 1298 / 5057 / 2128 / 1613 / 238
IL2 / 126 / 41 / 167 / 352 / 61 / 31 / 36 / 9 / 58 / 48 / 57 / 46356 / 2165 / 303494 / 1922 / 14323 / 745
IL21 / 1837 / 1211 / 243 / 3186 / 1200 / 773 / 3388 / 131 / 1228 / 10451 / 1098 / 5651 / 3189 / 78605 / 10315 / 13771 / 1453
IL2RA / 2179 / 7490 / 3295 / 3510 / 6885 / 6008 / 8664 / 2047 / 2170 / 14140 / 2700 / 27005 / 37756 / 32391 / 39228 / 65171 / 6353
IL4 / 8 / 8 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / 59 / 55 / 48 / - / 20 / 4
IL4R / 8120 / 38676 / 12098 / 9142 / 13150 / 15838 / 11976 / 14298 / 9957 / 6105 / 8509 / 8140 / 25030 / 7449 / 7459 / 14359 / 12673
IL5 / 34 / 22 / 4069 / 147 / 187 / 3127 / 13 / - / 62 / - / 178 / 328 / 1126 / 781 / 774 / 1896 / 203
IL5RA / - / 5 / - / 3 / - / 29 / 134 / - / 5 / 162 / 38 / - / 5 / 763 / 153 / 179 / 21
IL7R / 684 / 18399 / 44466 / 28394 / 70002 / 41726 / 19543 / 41640 / 22104 / 28045 / 32111 / 1179 / 8772 / 13491 / 5836 / 10597 / 20777
IL8 / 1127 / 848 / 270 / 2417 / 264 / 1090 / 15 / 31 / 150 / 26 / 901 / 51105 / 19714 / 47525 / 62442 / 7477 / 11637
IL8RA / 5 / 12 / 7 / 5 / 31 / 12 / - / 10 / - / 17 / 169 / - / - / - / - / - / -
IL8RB / 74 / 126 / 23 / 84 / 43 / 44 / 22 / 33 / 13 / 29 / 551 / - / - / 9 / - / - / -
IL9R / 2 / 53 / 99 / 51 / 43 / 77 / 11 / 40 / 21 / 21 / 75 / - / 1 / 6 / - / - / 5
MAF / 2627 / 5596 / 3001 / 8665 / 7461 / 4095 / 4422 / 1696 / 2143 / 6129 / 955 / 1789 / 6908 / 6347 / 6290 / 5206 / 1432
PDCD1 / 19892 / 3578 / 572 / 7867 / 3478 / 2840 / 2343 / 485 / 1041 / 1241 / 1391 / 13018 / 1573 / 10515 / 4143 / 3628 / 245
TBX21 / 483 / 460 / 192 / 845 / 565 / 949 / 1407 / 644 / 393 / 685 / 354 / 3881 / 5798 / 4108 / 7405 / 11213 / 1960
TGFB1 / 10589 / 22236 / 35172 / 27789 / 30312 / 36724 / 24007 / 39077 / 15211 / 18899 / 23796 / 15499 / 18050 / 40918 / 38734 / 32553 / 9962
TGFBR1 / 528 / 2838 / 5212 / 4272 / 9851 / 2668 / 1641 / 3738 / 2063 / 3192 / 2789 / 282 / 1893 / 2620 / 1606 / 956 / 1183
TNF / 1168 / 5666 / 13179 / 13186 / 7430 / 21814 / 5745 / 3073 / 2950 / 4790 / 4927 / 4014 / 7981 / 70314 / 13504 / 19953 / 2803
TNFRSF18 / 199 / 164 / 2 / 89 / 43 / 73 / 70 / 33 / 199 / 74 / 53 / 1176 / 298 / 174 / 132 / 159 / 24
TNFRSF4 / 3377 / 8212 / 2111 / 7972 / 6416 / 8428 / 7637 / 2188 / 6091 / 17720 / 5217 / 35467 / 23358 / 76397 / 26549 / 45473 / 1149
*Relative mRNA values expressed as 2-ΔCt×104, normalized to RPII.
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