Appendix 1: Individual methylation levels for each population of Talorchestia capensis HPA+/MSP+ = no-methylated sites ; HPA+/MSP- = hemi-methylated sites; HPA-/MSP+ = internal cytosine methylation sites; HPA-/MSP+ = Uninformative sites. PN = Port Nolloth; GB = Gansbaai; PB = Plettenbergbay; PA = Port Alfred; MN = Mngazana
POPULATION / HPA+/MSP+ / HPA+/MSP- / HPA-/MSP+ / HPA-/MSP-PN1 / 0.09489 / 0.25547 / 0.13139 / 0.51825
PN2 / 0.08029 / 0.25547 / 0.10584 / 0.55839
PN3 / 0.09489 / 0.25547 / 0.18978 / 0.45985
PN4 / 0.07664 / 0.26642 / 0.15328 / 0.50365
PN5 / 0.1095 / 0.3066 / 0.1277 / 0.4562
PN6 / 0.08029 / 0.25182 / 0.16423 / 0.50365
PN7 / 0.05109 / 0.20803 / 0.11314 / 0.62774
PN8 / 0.06204 / 0.16788 / 0.21898 / 0.55109
PN9 / 0.05474 / 0.24453 / 0.08759 / 0.61314
PN10 / 0.04745 / 0.20803 / 0.14599 / 0.59854
PN11 / 0.09124 / 0.16788 / 0.13869 / 0.60219
PN12 / 0.06569 / 0.24453 / 0.09124 / 0.59854
PN13 / 0.08029 / 0.24453 / 0.14599 / 0.5292
PN14 / 0.07299 / 0.15693 / 0.13869 / 0.63139
PN15 / 0.07664 / 0.13869 / 0.16058 / 0.62409
PN16 / 0.09124 / 0.22628 / 0.11314 / 0.56934
PN17 / 0.07299 / 0.20803 / 0.10949 / 0.60949
PN18 / 0.08029 / 0.12409 / 0.13139 / 0.66423
PN19 / 0.06934 / 0.29562 / 0.12409 / 0.51095
PN20 / 0.06569 / 0.29562 / 0.15328 / 0.4854
PN21 / 0.07664 / 0.29927 / 0.14234 / 0.48175
PN22 / 0.08394 / 0.21898 / 0.15693 / 0.54015
PN23 / 0.07664 / 0.22263 / 0.14234 / 0.55839
PN24 / 0.07664 / 0.19343 / 0.11314 / 0.61679
PN25 / 0.07664 / 0.20803 / 0.16058 / 0.55474
PN26 / 0.09489 / 0.27372 / 0.12774 / 0.50365
PN27 / 0.07664 / 0.22628 / 0.15328 / 0.5438
PN28 / 0.08394 / 0.22993 / 0.14599 / 0.54015
PN29 / 0.09854 / 0.30292 / 0.15328 / 0.44526
GB1 / 0.06609 / 0.3046 / 0.17816 / 0.45115
GB2 / 0.1293 / 0.2787 / 0.1351 / 0.4569
GB3 / 0.1178 / 0.3103 / 0.1466 / 0.4253
GB4 / 0.08333 / 0.33046 / 0.1523 / 0.43391
GB5 / 0.1034 / 0.3017 / 0.1408 / 0.454
GB6 / 0.1121 / 0.2845 / 0.1466 / 0.4569
GB7 / 0.09483 / 0.28736 / 0.16092 / 0.4569
GB8 / 0.1264 / 0.2902 / 0.1466 / 0.4368
GB9 / 0.1178 / 0.3161 / 0.1293 / 0.4368
GB10 / 0.08621 / 0.3477 / 0.12356 / 0.44253
POPULATION / HPA+/MSP+ / HPA+/MSP- / HPA-/MSP+ / HPA-/MSP-
GB11 / 0.08046 / 0.29885 / 0.15805 / 0.46264
GB12 / 0.1092 / 0.2759 / 0.1466 / 0.4684
GB13 / 0.1006 / 0.2759 / 0.1351 / 0.4885
GB14 / 0.06897 / 0.3477 / 0.1408 / 0.44253
GB15 / 0.1063 / 0.25 / 0.1006 / 0.5431
GB16 / 0.08908 / 0.29023 / 0.12069 / 0.5
GB17 / 0.1092 / 0.204 / 0.1379 / 0.5489
GB18 / 0.0977 / 0.2615 / 0.1466 / 0.4943
GB19 / 0.0977 / 0.204 / 0.1724 / 0.5259
GB20 / 0.09483 / 0.18391 / 0.1408 / 0.58046
GB21 / 0.1006 / 0.2098 / 0.1897 / 0.5
GB22 / 0.07471 / 0.27011 / 0.18678 / 0.46839
GB23 / 0.1006 / 0.2356 / 0.1408 / 0.523
GB24 / 0.1264 / 0.2586 / 0.158 / 0.4569
GB25 / 0.08333 / 0.23276 / 0.14368 / 0.54023
GB26 / 0.1121 / 0.2241 / 0.158 / 0.5057
GB27 / 0.1322 / 0.227 / 0.1954 / 0.4454
GB28 / 0.09483 / 0.18103 / 0.18966 / 0.53448
GB29 / 0.09195 / 0.23276 / 0.17529 / 0.5
PB1 / 0.08023 / 0.28653 / 0.14327 / 0.48997
PB2 / 0.08883 / 0.24928 / 0.17765 / 0.48424
PB3 / 0.06304 / 0.25215 / 0.16332 / 0.52149
PB4 / 0.07163 / 0.17479 / 0.10029 / 0.6533
PB5 / 0.06304 / 0.24069 / 0.12321 / 0.57307
PB6 / 0.04871 / 0.19198 / 0.15759 / 0.60172
PB7 / 0.08309 / 0.22063 / 0.14327 / 0.55301
PB8 / 0.08596 / 0.18052 / 0.12894 / 0.60458
PB9 / 0.07163 / 0.19198 / 0.14327 / 0.59312
PB10 / 0.04871 / 0.26648 / 0.12894 / 0.55587
PB11 / 0.05731 / 0.21777 / 0.10602 / 0.61891
PB12 / 0.08309 / 0.17192 / 0.14613 / 0.59885
PB13 / 0.06017 / 0.24069 / 0.13467 / 0.56447
PB14 / 0.07163 / 0.23209 / 0.12034 / 0.57593
PB15 / 0.06877 / 0.18911 / 0.149 / 0.59312
PB16 / 0.05444 / 0.21203 / 0.11748 / 0.61605
PB17 / 0.04298 / 0.26934 / 0.12321 / 0.56447
PB18 / 0.06304 / 0.2808 / 0.12607 / 0.53009
PB19 / 0.0659 / 0.2378 / 0.1318 / 0.5645
PB20 / 0.06877 / 0.26361 / 0.12607 / 0.54155
PB21 / 0.08596 / 0.29226 / 0.13181 / 0.48997
PB22 / 0.08883 / 0.24355 / 0.16619 / 0.50143
PB23 / 0.08596 / 0.29513 / 0.15186 / 0.46705
PB24 / 0.06304 / 0.2808 / 0.12607 / 0.53009
PB25 / 0.06877 / 0.27794 / 0.16046 / 0.49284
PB26 / 0.08023 / 0.2894 / 0.09169 / 0.53868
PB27 / 0.08883 / 0.27221 / 0.14327 / 0.4957
PB28 / 0.0745 / 0.2693 / 0.1175 / 0.5387
POPULATION / HPA+/MSP+ / HPA+/MSP- / HPA-/MSP+ / HPA-/MSP-
PB29 / 0.1003 / 0.255 / 0.1146 / 0.5301
PA1 / 0.05346 / 0.2673 / 0.1195 / 0.55975
PA2 / 0.04088 / 0.22327 / 0.11006 / 0.62579
PA3 / 0.05346 / 0.21698 / 0.10377 / 0.62579
PA4 / 0.06604 / 0.25786 / 0.12893 / 0.54717
PA5 / 0.04717 / 0.26101 / 0.09748 / 0.59434
PA6 / 0.05031 / 0.21384 / 0.11635 / 0.6195
PA7 / 0.06918 / 0.23585 / 0.17296 / 0.52201
PA8 / 0.05346 / 0.2044 / 0.15094 / 0.59119
PA9 / 0.06918 / 0.20126 / 0.15409 / 0.57547
PA10 / 0.05031 / 0.25786 / 0.1478 / 0.54403
PA11 / 0.05346 / 0.26101 / 0.12579 / 0.55975
PA12 / 0.0566 / 0.2579 / 0.1069 / 0.5786
PA13 / 0.07233 / 0.18553 / 0.12893 / 0.61321
PA14 / 0.05031 / 0.19182 / 0.18239 / 0.57547
PA15 / 0.0566 / 0.2201 / 0.1226 / 0.6006
PA16 / 0.05975 / 0.22642 / 0.08176 / 0.63208
PA17 / 0.05346 / 0.1761 / 0.12893 / 0.64151
PA18 / 0.06918 / 0.17296 / 0.10063 / 0.65723
PA19 / 0.07233 / 0.18868 / 0.10692 / 0.63208
PA20 / 0.05975 / 0.2044 / 0.1195 / 0.61635
PA21 / 0.05031 / 0.18239 / 0.1195 / 0.6478
PA22 / 0.06604 / 0.21698 / 0.14465 / 0.57233
PA23 / 0.08805 / 0.23585 / 0.18239 / 0.49371
PA24 / 0.09119 / 0.20126 / 0.16038 / 0.54717
PA25 / 0.1289 / 0.2138 / 0.1258 / 0.5314
PA26 / 0.1289 / 0.3145 / 0.1478 / 0.4088
PA27 / 0.1069 / 0.2516 / 0.1604 / 0.4811
PA28 / 0.06918 / 0.28616 / 0.16352 / 0.48113
PA29 / 0.06289 / 0.27044 / 0.18239 / 0.48428
MN1 / 0.08651 / 0.29758 / 0.19031 / 0.42561
MN2 / 0.04844 / 0.21453 / 0.11419 / 0.62284
MN3 / 0.05536 / 0.23875 / 0.14187 / 0.56401
MN4 / 0.0519 / 0.2042 / 0.1142 / 0.6298
MN5 / 0.05882 / 0.24913 / 0.14533 / 0.54671
MN6 / 0.04844 / 0.22145 / 0.14879 / 0.58131
MN7 / 0.0519 / 0.2734 / 0.128 / 0.5467
MN8 / 0.08304 / 0.28374 / 0.13841 / 0.49481
MN9 / 0.04844 / 0.20761 / 0.15571 / 0.58824
MN10 / 0.05536 / 0.23875 / 0.13495 / 0.57093
MN11 / 0.0519 / 0.263 / 0.1557 / 0.5294
MN12 / 0.07958 / 0.24567 / 0.15917 / 0.51557
MN13 / 0.08304 / 0.26298 / 0.16609 / 0.48789
MN14 / 0.07266 / 0.27336 / 0.19031 / 0.46367
MN15 / 0.0692 / 0.2457 / 0.1592 / 0.526
MN16 / 0.07266 / 0.22491 / 0.11765 / 0.58478
MN17 / 0.06228 / 0.20069 / 0.11419 / 0.62284
POPULATION / HPA+/MSP+ / HPA+/MSP- / HPA-/MSP+ / HPA-/MSP-
MN18 / 0.05882 / 0.27336 / 0.14533 / 0.52249
MN19 / 0.07612 / 0.22145 / 0.16955 / 0.53287
MN20 / 0.06574 / 0.22491 / 0.18339 / 0.52595
MN21 / 0.06228 / 0.23529 / 0.14533 / 0.55709
MN22 / 0.07266 / 0.22145 / 0.17301 / 0.53287
MN23 / 0.06574 / 0.2526 / 0.15571 / 0.52595
MN24 / 0.08304 / 0.21453 / 0.16263 / 0.53979
MN25 / 0.09689 / 0.21799 / 0.18339 / 0.50173
MN26 / 0.09343 / 0.22837 / 0.16609 / 0.51211
MN27 / 0.09689 / 0.3045 / 0.14879 / 0.44983
MN28 / 0.07612 / 0.20415 / 0.21453 / 0.50519
MN29 / 0.1107 / 0.3114 / 0.1453 / 0.4325