Supplementary Table S1 The 627 inbred maize lines and the corresponding average kernel length (KL) used in regional association mapping

Geno_ID / Line_Name / KL (cm) / Geno_ID / Line_Name / KL (cm) / Geno_ID / Line_Name / KL (cm)
1 / 18 / 7.92 / 210 / Dan599 / 8.37 / 419 / MP704 / 8.83
2 / 32 / 10.05 / 211 / Dan717 / 8.68 / 420 / Ms71 / 8.62
3 / 107 / 9.84 / 212 / Dan9046 / 9.01 / 421 / Mu6 / 8.71
4 / 148 / 9.32 / 213 / Dan9064 / 9.79 / 422 / N68a / 10.58
5 / 196 / 9.35 / 214 / Dan988 / 9.18 / 423 / Nan21-3 / 9.91
6 / 248 / 9.76 / 215 / Dan99chang / 9.55 / 424 / NC268 / 10.08
7 / 273 / 9.79 / 216 / Danhuang02 / 9.42 / 425 / Ning24 / 9.45
8 / 288 / 9.34 / 217 / Danhuang34 / 9.90 / 426 / Ning36 / 8.93
9 / 327 / 8.23 / 218 / DanT138 / 10.12 / 427 / Ning37 / 7.79
10 / 444 / 10.05 / 219 / De811 / 9.81 / 428 / Ning45 / 10.25
11 / 488 / 9.12 / 220 / DH138 / 9.25 / 429 / Ning55 / 8.70
12 / 501 / 8.96 / 221 / DH40 / 9.17 / 430 / Niu2-1 / 8.70
13 / 599 / 8.53 / 222 / DH65232 / 10.15 / 431 / NN14B / 8.40
14 / 697 / 10.17 / 223 / Dhuang212 / 8.99 / 432 / P007 / 10.46
15 / 707 / 8.39 / 224 / DM07 / 9.23 / 433 / P136 / 8.64
16 / 757 / 9.55 / 225 / DM101B / 9.97 / 434 / P138 / 9.10
17 / 785 / 9.21 / 226 / Dong623O2 / 8.43 / 435 / P167 / 8.60
18 / 802 / 8.00 / 227 / DongD201 / 9.86 / 436 / P39_su / 7.90
19 / 897 / 10.26 / 228 / Duo229 / 7.10 / 437 / P51 / 8.53
20 / 930 / 9.04 / 229 / Duohangjin / 8.96 / 438 / Pa405 / 9.12
21 / 931 / 9.94 / 230 / Duohuang29 / 8.81 / 439 / Pa91 / 8.50
22 / 953 / 9.98 / 231 / E200 / 9.42 / 440 / PH4CV / 9.17
23 / 1029 / 9.29 / 232 / E28 / 8.75 / 441 / PH6WC / 10.16
24 / 1101 / 9.12 / 233 / E588 / 10.11 / 442 / PN2-8 / 8.75
25 / 1121 / 8.95 / 234 / E600 / 9.75 / 443 / Pop-1111 / 9.30
26 / 1127 / 8.86 / 235 / equn3 / 9.31 / 444 / Q1261 / 8.35
27 / 1610 / 9.10 / 236 / Ernan24 / 9.12 / 445 / Q3012 / 8.73
28 / 1614 / 10.01 / 237 / F516 / 8.74 / 446 / Q4401 / 9.66
29 / 2005 / 6.42 / 238 / F522 / 8.33 / 447 / Q4502 / 10.15
30 / 3189 / 9.50 / 239 / F7 / 8.56 / 448 / Qi205 / 8.97
31 / 3514 / 9.02 / 240 / F72 / 9.15 / 449 / Qi318 / 9.38
32 / 3732 / 9.54 / 241 / F7584 / 9.82 / 450 / Qi319 / 9.37
33 / 4003 / 9.50 / 242 / Fangyin / 9.53 / 451 / Qi35 / 9.23
34 / 4936 / 8.30 / 243 / Fanrong2 / 8.50 / 452 / Qi410 / 8.01
35 / 5003 / 10.51 / 244 / Feng263 / 7.61 / 453 / Qiang113 / 10.54
36 / 5032 / 9.48 / 245 / Feng273 / 8.47 / 454 / Qin8-22-1 / 9.15
37 / 5237 / 9.55 / 246 / Fengke1 / 8.98 / 455 / Qiong51 / 9.67
38 / 5311 / 9.06 / 247 / FLQ2Bt / 9.39 / 456 / Qiu23 / 8.93
39 / 7146 / 8.98 / 248 / FR218 / 9.31 / 457 / R08 / 10.35
40 / 7236 / 9.28 / 249 / Fu130 / 8.86 / 458 / R15 / 8.69
41 / 7239 / 9.92 / 250 / Fu842 / 8.51 / 459 / R150 / 9.15
42 / 7331 / 10.24 / 251 / Fu844 / 7.70 / 460 / R1656 / 9.77
43 / 7884 / 9.02 / 252 / Fu85 / 8.24 / 461 / R31 / 9.10
44 / 7922 / 10.26 / 253 / Fu8521 / 8.99 / 462 / RC103Luo31B / 9.61
45 / 8723 / 9.83 / 254 / Fu8527 / 9.22 / 463 / RP125 / 9.79
46 / 9058 / 9.75 / 255 / Fu8529 / 9.09 / 464 / RW64A / 8.68
47 / 9706 / 10.52 / 256 / Fu8538 / 8.10 / 465 / S001 / 8.88
48 / 9711 / 9.36 / 257 / Fu8701 / 9.78 / 466 / S53 / 9.37
49 / 18599 / 7.99 / 258 / Fu8703 / 9.16 / 467 / S73 / 8.54
50 / 20564 / 8.85 / 259 / Fu8716 / 8.44 / 468 / SC30-1 / 10.18
51 / 20762 / 9.31 / 260 / Fu96 / 8.91 / 469 / Sg1533 / 7.23
52 / 68122 / 9.11 / 261 / FusheA / 7.52 / 470 / Shan89 / 7.81
53 / 68139 / 6.96 / 262 / Gan41 / 8.34 / 471 / Sheai16 / 7.86
54 / 68202 / 8.52 / 263 / GB / 6.09 / 472 / Shen125 / 9.87
55 / 78599 / 8.45 / 264 / GR29086-3 / 7.45 / 473 / Shen135 / 8.76
56 / 79028 / 9.33 / 265 / Guan17-1 / 9.16 / 474 / Shen137 / 8.81
57 / 79131 / 9.25 / 266 / Guangyou5 / 8.63 / 475 / Shen151 / 9.12
58 / 96201 / 9.36 / 267 / GY3 / 9.70 / 476 / Shen152 / 9.53
59 / 99122 / 10.37 / 268 / H114 / 9.63 / 477 / Shen3265 / 8.90
60 / 441950 / 9.34 / 269 / H1208 / 10.11 / 478 / Shen3336 / 10.05
61 / 6 / 9.22 / 270 / H153 / 9.04 / 479 / Shen5005 / 9.16
62 / 030_1 / 9.70 / 271 / H19 / 8.75 / 480 / Shen977 / 8.87
63 / 08-64 / 10.16 / 272 / H2 / 9.13 / 481 / Shuang105 / 9.46
64 / 08-641 / 10.24 / 273 / H205 / 8.11 / 482 / Shuang741 / 8.92
65 / 112_O2 / 8.46 / 274 / H21 / 9.12 / 483 / ShuangM9B-1 / 9.42
66 / 1134 / 8.38 / 275 / H66_6 / 8.60 / 484 / Shuangtaiwu / 9.33
67 / 1205A / 9.18 / 276 / H891 / 8.87 / 485 / Si-144 / 10.11
68 / 13A_O2 / 8.72 / 277 / H9442 / 9.69 / 486 / Song1145 / 8.36
69 / 150-4 / 8.90 / 278 / Hai1134 / 8.86 / 487 / SS99 / 9.07
70 / 200-24-13413 / 8.08 / 279 / Hai9-21 / 10.50 / 488 / Su75 / 9.71
71 / 200B / 9.70 / 280 / Hai9818 / 9.44 / 489 / Suixi601 / 9.12
72 / 3335 / 11.16 / 281 / Han102 / 7.59 / 490 / Suixi606 / 8.69
73 / 3489a / 9.29 / 282 / Han21 / 10.57 / 491 / Suixi704 / 8.42
74 / 412 / 9.06 / 283 / Hda-5 / 8.34 / 492 / Suwan1611 / 7.65
75 / 433-7 / 9.49 / 284 / Hengbai522 / 7.92 / 493 / SW153 / 7.78
76 / 48_2 / 8.79 / 285 / HP301 / 6.93 / 494 / SZ3 / 8.90
77 / 4F1 / 9.00 / 286 / HR210 / 9.63 / 495 / T24 / 8.59
78 / 502 / 8.40 / 287 / HR3 / 8.97 / 496 / Tai1-Lg / 9.23
79 / 55113-3-3-5 / 8.93 / 288 / HR962 / 8.60 / 497 / Tai183 / 9.38
80 / 698-3 / 8.95 / 289 / HRA65B / 8.56 / 498 / Tai184 / 9.48
81 / 7026B / 8.42 / 290 / Hua160 / 9.33 / 499 / Tangsipingtou / 8.53
82 / 72-105 / 9.61 / 291 / HuangC / 11.03 / 500 / THB242 / 8.22
83 / 72-125 / 9.34 / 292 / Huangchanga / 8.67 / 501 / Tian77 / 9.99
84 / 7381 / 8.74 / 293 / Huangjin63 / 7.43 / 502 / Tianya4 / 8.44
85 / 75-14gao / 9.06 / 294 / Huanglu12 / 9.82 / 503 / Tie222 / 8.87
86 / 75-24 / 8.41 / 295 / Huangyesi / 8.37 / 504 / Tie7922 / 9.63
87 / 75-322 / 8.31 / 296 / Huangyesi3 / 8.53 / 505 / Tie9010 / 9.28
88 / 75-364 / 9.41 / 297 / Huangzaosi / 8.59 / 506 / Tie98033-1 / 10.06
89 / 7903E / 9.36 / 298 / Huobai / 8.95 / 507 / TieC9324 / 10.05
90 / 806A / 9.67 / 299 / Huotanghuang17 / 9.87 / 508 / Timpunia-1 / 10.13
91 / 807D / 9.20 / 300 / HZ120 / 8.94 / 509 / Va26 / 9.46
92 / 811A / 8.56 / 301 / HZ121 / 8.83 / 510 / Va35 / 9.15
93 / 82huangzaosi / 9.75 / 302 / HZ124C / 9.48 / 511 / VG85-5 / 8.64
94 / 84-126-15-1 / 10.71 / 303 / HZ139 / 8.55 / 512 / W136-87 / 9.77
95 / 85bai41 / 7.71 / 304 / j0045 / 9.29 / 513 / W172 / 9.82
96 / 85bai64 / 9.26 / 305 / Ji15-22 / 9.20 / 514 / W182bn / 8.43
97 / 85huang14 / 10.28 / 306 / Ji35 / 9.20 / 515 / W222 / 9.99
98 / 87_20 / 8.47 / 307 / Ji4112 / 9.44 / 516 / W238 / 11.18
99 / 8902 / 9.04 / 308 / Ji432 / 8.70 / 517 / W2H03 / 8.84
100 / 90Ha502 / 9.62 / 309 / Ji444 / 9.17 / 518 / W344 / 8.38
101 / 91af361 / 9.30 / 310 / Ji53 / 10.37 / 519 / W499 / 9.36
102 / 91huang10 / 8.93 / 311 / Ji533 / 10.21 / 520 / W5543_su / 8.30
103 / 91huang15 / 8.48 / 312 / Ji63 / 8.77 / 521 / W64a / 8.38
104 / 91huang5 / 8.71 / 313 / Ji69 / 6.74 / 522 / W6786_su / 8.76
105 / 92_8 / 10.14 / 314 / Ji818 / 9.44 / 523 / W9706 / 10.01
106 / 92huang40 / 9.02 / 315 / Ji830 / 9.63 / 524 / Wang94 / 7.60
107 / 92huang7 / 8.89 / 316 / Ji833 / 8.66 / 525 / Wanxi23 / 8.44
108 / 96Hong-768 / 8.69 / 317 / Ji8415 / 8.57 / 526 / Wei3322 / 8.93
109 / 9782 / 9.66 / 318 / Ji842 / 9.24 / 527 / Weifeng322 / 8.05
110 / 98F1 / 9.48 / 319 / Ji846 / 9.48 / 528 / Wenhuang31413 / 8.27
111 / A495 / 9.05 / 320 / Ji853 / 8.75 / 529 / wk12 / 9.75
112 / A509 / 7.38 / 321 / Ji854 / 8.95 / 530 / WN11H / 8.42
113 / A554 / 7.81 / 322 / Ji856 / 9.30 / 531 / Wu109 / 8.71
114 / A619 / 9.61 / 323 / Ji866 / 9.98 / 532 / Wu125 / 9.46
115 / A632 / 9.04 / 324 / Ji870 / 8.15 / 533 / Wu202 / 10.28
116 / A679 / 9.38 / 325 / Ji876 / 9.29 / 534 / Wu302 / 7.27
117 / A801 / 8.98 / 326 / Ji880 / 8.40 / 535 / Wu306 / 8.55
118 / Ai154 / 6.73 / 327 / Jia13 / 8.79 / 536 / Wu308 / 8.60
119 / Aijin525 / 9.06 / 328 / Jia6 / 9.29 / 537 / Wu312 / 8.85
120 / AR226-2Lida / 7.64 / 329 / Jiao05 / 9.97 / 538 / Wu314 / 9.26
121 / Ay3566 / 9.16 / 330 / Jiao306_02 / 9.44 / 539 / Wutang448 / 9.07
122 / B12 / 8.49 / 331 / Jiao51 / 7.28 / 540 / Wuxi205 / 8.80
123 / B317 / 8.02 / 332 / Jing24 / 10.21 / 541 / X_L9010-3_O2 / 8.36
124 / B37 / 8.86 / 333 / Jing404 / 9.75 / 542 / X178 / 8.70
125 / B394 / 8.74 / 334 / Jing54 / 8.43 / 543 / x48B / 8.94
126 / B68 / 9.34 / 335 / Jing7 / 9.46 / 544 / XF223 / 9.65
127 / B73 / 9.44 / 336 / Jing7huang / 8.07 / 545 / XF27 / 9.38
128 / B8 / 8.01 / 337 / Jing89 / 9.74 / 546 / Xi502 / 10.13
129 / B97 / 9.33 / 338 / Jingnuo2 / 7.79 / 547 / Xiangai3 / 9.56
130 / B98 / 9.82 / 339 / Jingnuo6 / 8.07 / 548 / Xinaiguang10 / 8.32
131 / Bai197 / 8.91 / 340 / Jinhuang59 / 9.11 / 549 / Xing230 / 10.13
132 / Baihe43 / 10.59 / 341 / Jinnuo / 9.44 / 550 / Xing26 / 8.91
133 / Bainuo6 / 10.22 / 342 / Jinsui54 / 8.91 / 551 / Xing83 / 8.33
134 / BaiU8112 / 9.68 / 343 / Jitian15 / 7.58 / 552 / Xinglun5-9 / 9.47
135 / Baiyesi / 8.30 / 344 / Jiu03 / 8.17 / 553 / Xuan6 / 8.31
136 / BC19 / 8.80 / 345 / Jiu138-5 / 10.05 / 554 / Xun928 / 10.03
137 / BC4B / 10.11 / 346 / Jiu22 / 8.68 / 555 / XZ19 / 8.99
138 / Beck / 10.60 / 347 / JiuC546 / 9.21 / 556 / Y223 / 9.16
139 / Bei11 / 8.27 / 348 / JiV993 / 8.85 / 557 / y9961 / 8.37
140 / BM / 9.31 / 349 / JN15 / 8.97 / 558 / Yan103 / 8.50
141 / BS16-6211 / 8.98 / 350 / K10 / 9.16 / 559 / Yan11 / 8.17
142 / C103 / 8.91 / 351 / K12 / 8.74 / 560 / Yan156 / 8.84
143 / C107 / 8.59 / 352 / K14 / 8.96 / 561 / Yan172 / 7.62
144 / C168 / 8.76 / 353 / K21 / 8.88 / 562 / Yan38 / 9.91
145 / C39 / 9.37 / 354 / K22 / 9.15 / 563 / Yan812 / 8.77
146 / C416 / 9.64 / 355 / K305 / 10.44 / 564 / Yan85 / 9.33
147 / C521 / 8.94 / 356 / K36 / 9.44 / 565 / Yanlai3 / 8.92
148 / C8605-2 / 10.30 / 357 / K514 / 9.09 / 566 / Yanlai2 / 8.30
149 / Cai11-8 / 8.56 / 358 / KL2 / 9.03 / 567 / Yd6 / 9.08
150 / Cai48-1111 / 10.02 / 359 / KL3 / 9.15 / 568 / Ye107 / 9.65
151 / CB0443-2 / 8.49 / 360 / KL4 / 9.18 / 569 / Ye478 / 9.49
152 / CG10 / 8.66 / 361 / KL6 / 8.74 / 570 / Ye488 / 9.98
153 / Chang3 / 8.82 / 362 / KP3130 / 9.97 / 571 / Ye515 / 9.69
154 / Chang72 / 8.06 / 363 / L005 / 8.93 / 572 / Ye52106 / 9.18
155 / Chang7-2 / 9.19 / 364 / L069 / 8.32 / 573 / Ye8001 / 9.21
156 / Chang7daxian1 / 8.08 / 365 / L105 / 7.07 / 574 / Ye8112 / 9.62
157 / ChangD / 9.36 / 366 / L473 / 10.02 / 575 / Ye832 / 10.19
158 / ChangK / 8.88 / 367 / La2-4 / 8.68 / 576 / Yi113 / 9.42
159 / Chaoxianbai / 8.94 / 368 / Lan766-4-2 / 9.56 / 577 / Yi12 / 9.36
160 / Chen322 / 9.74 / 369 / LD175-1 / 9.58 / 578 / Yi36 / 8.68
161 / Cheng18 / 8.23 / 370 / LD61 / 10.37 / 579 / Yi49 / 9.14
162 / Cheng2 / 10.60 / 371 / Lian1538 / 9.65 / 580 / Yi67 / 8.30
163 / Cheng435 / 8.65 / 372 / Lian87 / 8.98 / 581 / ys06 / 9.77
164 / Cheng687 / 9.60 / 373 / Liao138 / 8.82 / 582 / Yu374 / 9.08
165 / Chengbei711 / 8.47 / 374 / Liao2202 / 8.42 / 583 / Yuanwu02 / 8.55
166 / Chengzi108 / 9.67 / 375 / Liao2204 / 8.09 / 584 / Yue20-3 / 8.84
167 / Chengzi205-1-1 / 9.79 / 376 / Liao3053 / 9.19 / 585 / Yue267-1-1 / 8.47
168 / Chi545 / 8.94 / 377 / Liao3162 / 10.25 / 586 / Yue267-3-1 / 9.41
169 / Chihuang14 / 9.45 / 378 / Liao3180 / 9.11 / 587 / Yue39-4 / 9.01
170 / Chihuang32 / 8.25 / 379 / Liao4271 / 9.01 / 588 / Yue89A12-1 / 9.64
171 / Chong72 / 11.39 / 380 / Liao5110 / 9.56 / 589 / Yue89E4-2 / 8.56
172 / CM105 / 9.21 / 381 / Liao5114 / 11.17 / 590 / Yunnan9-6 / 8.55
173 / CML125-2pianma / 9.09 / 382 / Liao6082 / 11.38 / 591 / YX46 / 8.24
174 / CML58 / 9.34 / 383 / Liao7794 / 9.95 / 592 / Z31B / 10.00
175 / CML61 / 8.98 / 384 / Lo1067 / 9.57 / 593 / Za5125_su / 7.83
176 / CML67 / 8.65 / 385 / Lo1125 / 9.65 / 594 / Zao48 / 9.49
177 / CN104 / 10.62 / 386 / Lo415 / 9.63 / 595 / Zao49 / 8.85
178 / CN165 / 8.95 / 387 / Lo5-6 / 9.10 / 596 / Zezi23 / 9.49
179 / CT109 / 8.95 / 388 / Longkang1 / 9.08 / 597 / Zhang21 / 9.17
180 / CT52C / 9.46 / 389 / Longkang11 / 8.84 / 598 / Zhangjin6 / 8.11
181 / Cwu215B / 9.77 / 390 / Longkang15 / 9.10 / 599 / Zhangxi913 / 8.65
182 / D1049 / 9.90 / 391 / Longkang279 / 8.74 / 600 / Zhebai1 / 8.05
183 / D1051 / 8.34 / 392 / Longxi65 / 9.17 / 601 / Zheng22 / 9.60
184 / D1139 / 9.04 / 393 / Los-6 / 10.67 / 602 / Zheng32 / 9.53
185 / d140 / 10.24 / 394 / Lu28 / 9.53 / 603 / Zheng58 / 9.57
186 / D15 / 9.57 / 395 / Lu45 / 7.41 / 604 / Zheng653 / 9.24
187 / D183 / 9.51 / 396 / Lu65 / 9.12 / 605 / Zhengbai11 / 9.26
188 / D185 / 9.14 / 397 / Luyuan133 / 9.20 / 606 / Zhong101 / 7.93
189 / D23 / 9.06 / 398 / Luyuan92 / 8.77 / 607 / Zhong106 / 9.45
190 / D619 / 9.09 / 399 / LX00-1 / 9.13 / 608 / Zhong128 / 9.96
191 / D729 / 9.16 / 400 / LX006a / 10.24 / 609 / Zhong451 / 8.42
192 / D801 / 9.90 / 401 / LX03-2 / 10.17 / 610 / Zhong5493 / 9.17
193 / D857 / 8.54 / 402 / LX1124 / 10.48 / 611 / Zhong741 / 8.55
194 / D869 / 8.96 / 403 / LX3999 / 8.90 / 612 / Zhonger_O2 / 9.29
195 / D88 / 9.44 / 404 / LX9223 / 8.22 / 613 / Zhonghuang64 / 9.47
196 / D883 / 8.76 / 405 / Lx9801 / 9.71 / 614 / Zhongxi042 / 8.17
197 / D886 / 7.35 / 406 / M101 / 9.09 / 615 / Zhongyin10 / 9.03
198 / D892 / 9.00 / 407 / M14 / 10.27 / 616 / Zhongyin15 / 9.18
199 / Da255 / 8.91 / 408 / M256 / 4.70 / 617 / Zhongzi03 / 7.62
200 / Dai6 / 9.70 / 409 / M3736 / 7.36 / 618 / Zi330 / 9.14
201 / DaMO / 8.69 / 410 / M7 / 9.90 / 619 / Ziduosui / 7.41
202 / Dan299 / 9.67 / 411 / M9 / 9.70 / 620 / Ziyu3 / 9.14
203 / Dan3101 / 9.05 / 412 / Mei22 / 9.09 / 621 / Zong3 / 10.21
204 / Dan3115 / 8.22 / 413 / Mei68113 / 8.92 / 622 / Zong31 / 9.11
205 / Dan3116 / 9.31 / 414 / Meibao / 8.72 / 623 / Zong548-1521 / 8.97
206 / Dan3130 / 8.39 / 415 / Ming2325 / 10.25 / 624 / Zongtong3 / 9.06
207 / Dan340 / 9.41 / 416 / MO113 / 7.75 / 625 / Zongxi241 / 10.49
208 / Dan341 / 9.14 / 417 / Mo17 / 9.82 / 626 / ZPON7 / 8.96
209 / Dan598 / 9.30 / 418 / Mo17Ht / 9.80 / 627 / Zun90110 / 8.70

Supplementary Table S2 Primers for the simple sequence repeat (SSR)/InDel markers used in this study