Supplement S1 DNA and protein alignment of Williams 82, Bossier, PI 96354 and PI374170 for four candidate genes on chromosome 10.
ATCG: promoter
ATCG: 5’UTR
ATCG: exon/protein
ATCG: intron
ATCG: 3’UTR
1a. Glyma10g02090_extensin1_DNA alignment
Williams82 TCTTCCAGATCCGAGTCGATTCCTCTGCAAATAGTCACGACGTCACCGCACTCCGCGATC
Bossier TCTTCCAGATCCGAGTCGATTCCTCTGCAAATAGTCACGACGTCACCGCACTCCGCGATC
PI374170 TCTTCCAGATCCGAGTCGATTCCTCTGCAAATAGTCACGACGTCACCGCACTCCGCGATC
PI96354 TCTTCCAGATCCGAGTCGATACCTCTGCAAATAGTCACGACGTCACCGCACTCCGCGATC
Williams82 GCTCAAGACCAACACCATAGGGGGCGCTCTCCCTTCTTTCGAATTGCCCAACTTCACCTA
Bossier GCTCAAGACCAACACCATAGGGGGCGCTCTCCCTTCTTTCGAATTGCCCAACTTCACCTA
PI374170 GCTCAAGACCAACACCATAGGGGGCGCTCTCCCTTCTTTCGAATTGCCCAACTTCACCTA
PI96354 GCTCAAGACCAACACCATAGGGGGCGCTCTCCCTTCTTTCGAATTGCCCAACTTCACCTA
Williams82 TTTTCACACCTTGGTCCGCCAGACCTAGTTTCGTATTGTCCCTTTGTCACTTCTACCTAA
Bossier TTTTCACACCTTGGTCCGCCAGACCTAGTTTCGTATTGTCCCTTTGTCACTTCTACCTAA
PI374170 TTTTCACACCTTGGTCCGCCAGACCTAGTTTCGTATTGTCCCTTTGTCACTTCTACCTAA
PI96354 TTTTCACACCTTGGTCCGCCAGACCTAGTTTCGTATTGTCCCTTTGTCACTTCTACCTAA
Williams82 GGATTAACATGAATAAGTTGAAATGAATTATCTTTGTTAACTAAATCATCAATTTACTCC
Bossier GGATTAACATGAATAAGTTGAAATGAATTATCTTTGTTAACTAAATCATCAATTTACTCC
PI374170 GGATTAACATGAATAAGTTGAAATGAATTATCTTTGTTAACTAAATCATCAATTTACTCC
PI96354 GGATTAACATGAATAAGTTGAAATGAATTATCTTTGTTAACTAAATCATCAATTTACTCC
Williams82 CTGAATATTGTATCTCCATGTTATATTAGTTCCTATAACT-AAAAAAAAAAACTCAAATA
Bossier CTGAATATTGTATCTCCATGTTATATTAGTTCCTATAACT-AAAAAAAAAAACTCAAATA
PI374170 CTGAATATTGTATCTCCATGTTATATTAGTTCCTATAACT-AAAAAAAAAAACTCAAATA
PI96354 CTGAATATTGTATCTCCATGTTATATTAGTTCCTATAACTAAAAAAAAAAAACTCAAATA
Williams82 AGTCTTAAATGGACCAAATAAGCTCACATTGTGAACCAACATTTTATTAACTTTTCCTAA
Bossier AGTCTTAAATGGACCAAATAAGCTCACATTGTGAACCAACATTTTATTAACTTTTCCTAA
PI374170 AGTCTTAAATGGACCAAATAAGCTCACATTGTGAACCAACATTTTATTAACTTTTCCTAA
PI96354 AGTCTTAAATGGACCAAATAAGCTCACATTGTGAACCAACATTTTATTAACTTTTCCTAA
Williams82 CTTGCTTGATCCATGGGACCTGGACCCCATATATATCCCCCTCTAACTACTGGGTATTGA
Bossier CTTGCTTGATCCATGGGACCTGGACCCCATATATATCCCCCTCTAACTACTGGGTATTGA
PI374170 CTTGCTTGATCCATGGGACCTGGACCCCATATATATCCCCCTCTAACTACTGGGTATTGA
PI96354 CTTGCTTGATCCATGGGACCTGGACCCCATATATATCCCCCTCTAACTACGGGGTATTGA
Williams82 TCAAATCAAGTTAAGATTCAAATAAATGACTCTATCATAATTTCATATTAAGTAGAGACA
Bossier TCAAATCAAGTTAAGATTCAAATAAATGACTCTATCATAATTTCATATTAAGTAGAGACA
PI374170 TCAAATCAAGTTAAGATTCAAATAAATGACTCTATCATAATTTCATATTAAGTAGAGACA
PI96354 TCAAATCAAGTTAAGATTCAAATAAATGACTCTATCATAATTTCATATTAAGTAGAGACA
Williams82 AAGATAAGTAAATGGTACAATTTAGTCATTGAAATTGTATCACGCTGCTTATGACATTAG
Bossier AAGATAAGTAAATGGTACAATTTAGTCATTGAAATTGTATCACGCTGCTTATGACATTAG
PI374170 AAGATAAGTAAATGGTACAATTTAGTCATTGAAATTGTATCACGCTGCTTATGACATTAG
PI96354 AAGATAAGTAAATGGTACAATTTAGTCATTGAAATTGTATCACGCTGCTTATGACATTAG
Williams82 TTTCTGAAAAAATTTCGTGCTTTGTACTTGTACTCTACGTTCAAATGGCACTATTGCATG
Bossier TTTCTGAAAAAATTTCGTGCTTTGTACTTGTACTCTACGTTCAAATGGCACTATTGCATG
PI374170 TTTCTGAAAAAATTTCGTGCTTTGTACTTGTACTCTACGTTCAAATGGCACTATTGCATG
PI96354 TTTCTGAAAAAATTTCGTGCTTTGTACTTGTACTCTACGTTCAAATGGCACTATTGCATG
Williams82 ACTTTTAAACAGATACATTGTATTCGGCAAATAAGAAGTCGATGATCGGTCCTACGTTTT
Bossier ACTTTTAAACAGATACATTGTATTCGGCAAATAAGAAGTCGATGATCGGTCCTACGTTTT
PI374170 ACTTTTAAACAGATACATTGTATTCGGCAAATAAGAAGTCGATGATCGGTCCTACGTTTT
PI96354 ACTTTTAAACAGATACATTGTATTCGGCAAATAAGAAGTCGATGATCGGTCCTACGTTTT
Williams82 TTCAAAACATGCTTGCCTAAGAATTATCCATATGCAATCCAATGCGGTATGCAAAATCCC
Bossier TTCAAAACATGCTTGCCTAAGAATTATCCATATGCAATCCAATGCGGTATGCAAAATCCC
PI374170 TTCAAAACATGCTTGCCTAAGAATTATCCATATGCAATCCAATGCGGTATGCAAAATCCC
PI96354 TTCAAAACATGCTTGCCTAAGAATTATCCATATGCAATCCAATGCGGTATGCAAAATCCC
Williams82 AATCGTGCTAATTAACTTGTAATTTTGTAGGAAATTTCATATTTTTAAGTGTATATATAT
Bossier AATCGTGCTAATTAACTTGTAATTTTGTAGGAAATTTCATATTTTTAAGTGTATATATAT
PI374170 AATCGTGCTAATTAACTTGTAATTTTGTAGGAAATTTCATATTTTTAAGTGTATATATAT
PI96354 AATCGTGCTAATTAACTTGTAATTTTGTAGGAAATTTCATATTTTTAAGTGTATATATAT
Williams82 ATTTTCGGAGCAACGTGTTCTCCATTAAATAGGTGACGCAGTCATATATTTTGGTATTTA
Bossier ATTTTCGGAGCAACGTGTTCTCCATTAAATAGGTGACGCAGTCATATATTTTGGTATTTA
PI374170 ATTTTCGGAGCAACGTGTTCTCCATTAAATAGGTGACGCAGTCATATATTTTGGTATTTA
PI96354 ATTTTCGGATCAACGTGTTCTCCATTAAATAGGTGACGCAGTCATATATTTTGGTATTTA
Williams82 AACTTTTCATGTAAGGAAACACTCTGCAAATGAAATCCGATGCCCTGTACAGTATCTATA
Bossier AACTTTTCATGTAAGGAAACACTCTGCAAATGAAATCCGATGCCCTGTACAGTATCTATA
PI374170 AACTTTTCATGTAAGGAAACACTCTGCAAATGAAATCCGATGCCCTGTACAGTATCTATA
PI96354 AACTTTTCATGTAAGGAAACACTCTGCAAATGAAATCTGATGCCCTGTACAGTATCTATA
Williams82 GATGTGAAAATCACGTTCTAGGCCACACAGGACATGTTATTGACCATGAACTTTGTGGCT
Bossier GATGTGAAAATCACGTTCTAGGCCACACAGGACATGTTATTGACCATGAACTTTGTGGCT
PI374170 GATGTGAAAATCACGTTCTAGGCCACACAGGACATGTTATTGACCATGAACTTTGTGGCT
PI96354 GATGTGAAAATCACGTTCTAGGCCACACAGGACATGTTATTGACCATGAACTATGTGGCT
Williams82 TCTAAGTCCTTAACGTGCTACCAACTATCTTGCTGAATCCAATCATTAATATATTCTTAC
Bossier TCTAAGTCCTTAACGTGCTACCAACTATCTTGCTGAATCCAATCATTAATATATTCTTAC
PI374170 TCTAAGTCCTTAACGTGCTACCAACTATCTTGCTGAATCCAATCATTAATATATTCTTAC
PI96354 TCTAAGTCCTTAACGTGCTACCAACTATCTTGCTGAATCCAATCATTAATATATTCTTAC
Williams82 AATTTCCTTAATGCATATGCTTGAGCTCGTTAGAAAATCATTAGGCTAGCTCTATCTATA
Bossier AATTTCCTTAATGCATATGCTTGAGCTCGTTAGAAAATCATTAGGCTAGCTCTATCTATA
PI374170 AATTTCCTTAATGCATATGCTTGAGCTCGTTAGAAAATCATTAGGCTAGCTCTATCTATA
PI96354 AATTTCCTTAATGCATATGCTTGAGCTCGTTAGAAAATCATTAGGCTAGCTCTATCTATA
Williams82 AATACCCAAGGGATTCATGGAATTGGTACCTCATCACTACTTCGAAGCATTTCTATATAC
Bossier AATACCCAAGGGATTCATGGAATTGGTACCTCATCACTACTTCGAAGCATTTCTATATAC
PI374170 AATACCCAAGGGATTCATGGAATTGGTACCTCATCACTACTTCGAAGCATTTCTATATAC
PI96354 AATACCCAAGGGATTCATGGAATTGGTACCTCATCACTACTTCGAAGCATTTCTATATAC
Williams82 TATTACTAAGAAATTTATCAATGGCTTTCCTTCGATCCACCTTGGCGACCTCAATGGTTC
Bossier TATTACTAAGAAATTTATCAATGGCTTTCCTTCGATCCACCTTGGCGACCTCAATGGTTC
PI374170 TATTACTAAGAAATTTATCAATGGCTTTCCTTCGATCCACCTTGGCGACCTCAATGGTTC
PI96354 TATTACTAAGAAATTTATCAATGGCTTTCCTTCGATCCACCTTGGCGACCTCAATGGTTC
Williams82 TTTTAGCAATGCTAGCCATTGTCTCCGCAACTGACTATTATGGATATGGTCCAACACCAA
Bossier TTTTAGCAATGCTAGCCATTGTCTCCGCAACTGACTATTATGGATATGGTCCAACACCAA
PI374170 TTTTAGCAATGCTAGCCATTGTCTCCGCAACTGACTATTATGGATATGGTCCAACACCAA
PI96354 TTTTAGCAATGCTAGCCATTGTCTCCGCAACTGACTATTATGGATATGGTCCAACACCAA
Williams82 AGCTTGAGAACCCCAAACCCAAAACAGATTACAAAGTTGACAAACCACACCCCAGAATAC
Bossier AGCTTGAGAACCCCAAACCCAAAACAGATTACAAAGTTGACAAACCACACCCCAGAATAC
PI374170 AGCTTGAGAACCCCAAACCCAAAACAGATTACAAAGTTGACAAACCACACCCCAGAATAC
PI96354 AGCTTGAGAACCCCAAACCCAAAACAGATTACAAAGTTGACAAACCACACCCCAGAATAC
Williams82 CAGATTACTATGCAGTGCCCAAACCAAAAGGAAACGATGAACTACATCTGCTTCCCACAA
Bossier CAGATTACTATGCAGTGCCCAAACCAAAAGGAAACGATGAACTACATCTGCTTCCCACAA
PI374170 CAGATTACTATGCAGTGCCCAAACCAAAAGGAAACGATGAACTACATCTGCTTCCCACAA
PI96354 CAGATTACTATGCAGTGCCCAAACCAAAAGGAAACGATGAACTACATCTGCTTCCCACAA
Williams82 TCATTGGTGTCCAAGGTGTTGTTTTATGTAAATCGGGTTCCAATTATTTCCCAATTCAAG
Bossier TCATTGGTGTCCAAGGTGTTGTTTTATGTAAATCGGGTTCCAATTATTTCCCAATTCAAG
PI374170 TCATTGGTGTCCAAGGTGTTGTTTTATGTAAATCGGGTTCCAATTATTTCCCAATTCAAG
PI96354 TCATTGGTGTCCAAGGTGTTGTTTTATGTAAATCGGGTTCCAATTATTTCCCAATTCAAG
Williams82 GTAATTTTTTCTTAGATGCAACTCCGACTATGTTTTATTTACAACATTTCTAATCTACGT
Bossier GTAATTTTTTCTTAGATGCAACTCCGACTATGTTTTATTTACAACATTTCTAATCTACGT
PI374170 GTAATTTTTTCTTAGATGCAACTCCGACTATGTTTTATTTACAACATTTCTAATCTACGT
PI96354 GTAATTTTTTCTTAGATGCAACTCCGACTATGTTTTATTTACAACATTTCTAATCTACGT
Williams82 TGTCAATAAATGTTTATTTTCATTTCTTGAAATTGAAATTAATTACTAAATACCAATAAT
Bossier TGTCAATAAATGTTTATTTTCATTTCTTGAAATTGAAATTAATTACTAAATACCAATAAT
PI374170 TGTCAATAAATGTTTATTTTCATTTCTTGAAATTGAAATTAATTACTAAATACCAATAAT
PI96354 TGTCAATAAATGTTTATTTTCATTTCTTGAAATTGAAATTAATTACTAAATACCAATAAT
Williams82 GATTGGCACATATGACTAACACAAGTGGTAATGACTTATATCATTTAACTAATAATTAAG
Bossier GATTGGCACATATGACTAACACAAGTGGTAATGACTTATATCATTTAACTAATAATTAAG
PI374170 GATTGGCACATATGACTAACACAAGTGGTAATGACTTATATCATTTAACTAATAATTAAG
PI96354 GATTGGCACATATGACTAACACAAGTGGTAATGACTTATATCATTTAACTAATAATTAAG
Williams82 TGATATAAAATTTGAATCTTGTAGATTTTAGTTATGAAATAAATAATATTGGAAAAAAAA
Bossier TGATATAAAATTTGAATCTTGTAGATTTTAGTTATGAAATAAATAATATTGGAAAAAAAA
PI374170 TGATATAAAATTTGAATCTTGTAGATTTTAGTTATGAAATAAATAATATTGGAAAAAAAA
PI96354 TGATATAAAATTTGAATCTTGTAGATTTTAGTTATGAAATAAATAATATTGGAAAAAAAA
Williams82 ATACCCACTTATATGGTACACTAGACGGGAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAAGAAACTAAC
Bossier ATACCCACTTATATGGTACACTAGACGGGAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAAGAAACTAAC
PI374170 ATACCCACTTATATGGTACACTAGACGGGAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAAGAAACTAAC
PI96354 ATACCCACTTATATGGTACACTAGACGGGAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAAGAAACTAAC
Williams82 TAATTAATTTATTTATGTAAGTTTTGGACTTTTTTGGGATGCATATTTGTTATTTAATTG
Bossier TAATTAATTTATTTATGTAAGTTTTGGACTTTTTTGGGATGCATATTTGTTATTTAATTG
PI374170 TAATTAATTTATTTATGTAAGTTTTGGACTTTTTTGGGATGCATATTTGTTATTTAATTG
PI96354 TAATTAATTTATTTATGTAAGTTTTGGACTTTTTTGGGATGCATATTTGTTATTTAATTG
Williams82 TATTTACTATGTGTGAGGGGTGCAGGAGCGGTTGCAAGAGTTACATGTGGATGGGAGAAT
Bossier TATTTACTATGTGTGAGGGGTGCAGGAGCGGTTGCAAGAGTTACATGTGGATGGGAGAAT
PI374170 TATTTACTATGTGTGAGGGGTGCAGGAGCGGTTGCAAGAGTTACATGTGGATGGGAGAAT
PI96354 TATTTACTATGTGTGAGGGGTGCAGGAGCGGTTGCAAGAGTTACATGTGGATGGGAGAAT
Williams82 GAGCTTGGGTACGAGACAGGTCCTATATCAGTGTTGAGTCATGTGACAGATAGTAAAGGC
Bossier GAGCTTGGGTACGAGACAGGTCCTATATCAGTGTTGAGTCATGTGACAGATAGTAAAGGC
PI374170 GAGCTTGGGTACGAGACAGGTCCTATATCAGTGTTGAGTCATGTGACAGATAGTAAAGGC
PI96354 GAGCTTGGGTACGAGACAGGTCCTATATCAGTGTTGAGTCATGTGACAGATAGTAAAGGC
Williams82 TATTTCTTTGCTACATTGTCACTTGGGGAGCTTGGATCGAAATTGAAGATCACTGAGTGC
Bossier TATTTCTTTGCTACATTGTCACTTGGGGAGCTTGGATCGAAATTGAAGATCACTGAGTGC
PI374170 TATTTCTTTGCTACATTGTCACTTGGGGAGCTTGGATCGAAATTGAAGATCACTGAGTGC
PI96354 TATTTCTTTGCTACATTGTCACTTGGGGAGCTTGGATCGAAATTGAAGATCACTGAGTGC
Williams82 AAGGCATACTTGGAGAGTTCTCCATTGGAGACATGTAAAGTTCCCACCGATGTCAACTAC
Bossier AAGGCATACTTGGAGAGTTCTCCATTGGAGACATGTAAAGTTCCCACCGATGTCAACTAC
PI374170 AAGGCATACTTGGAGAGTTCTCCATTGGAGACATGTAAAGTTCCCACCGATGTCAACTAC
PI96354 AAGGCATACTTGGAGAGTTCTCCATTGGAGACATGTAAAGTTCCCACCGATGTCAACTAC
Williams82 GGGATCAGTGGTGCTCGTCTTTCTTCTTATCGCCTCCTTGAGAATAAGATGAAGTTGTAC
Bossier GGGATCAGTGGTGCTCGTCTTTCTTCTTATCGCCTCCTTGAGAATAAGATGAAGTTGTAC
PI374170 GGGATCAGTGGTGCTCGTCTTTCTTCTTATCGCCTCCTTGAGAATAAGATGAAGTTGTAC
PI96354 GGGATCAGTGGTGCTCGTCTTTCTTCTTATCGCCTCCTTGAGAATAAGATGAAGTTGTAC
Williams82 ACTGTGGGACCTTTCTTCTGCACCTCCCAACCTGCTAAACCACTCCCTAACGGTTATTAA
Bossier ACTGTGGGACCTTTCTTCTGCACCTCCCAACCTGCTAAACCACTCCCTAACGGTTATTAA
PI374170 ACTGTGGGACCTTTCTTCTGCACCTCCCAACCTGCTAAACCACTCCCTAACGGTTATTAA
PI96354 ACTGTGGGACCTTTCTTCTGCACCTCCCAACCTGCTAAACCACTCCCTAACGGTTATTAA
Williams82 TTAATGAAGCCACCTTCTATATGACGTCCGTTGAAATGGCTGCAAAGTGGAAATCATCAT
Bossier TTAATGAAGCCACCTTCTATATGACGTCCGTTGAAATGGCTGCAAAGTGGAAATCATCAT
PI374170 TTAATGAAGCCACCTTCTATATGACGTCCGTTGAAATGGCTGCAAAGTGGAAATCATCAT
PI96354 TTAATGAAGCCACCTTCTATATGACGTCCGTTGAAATGGCTGCAAAGTGGAAATCATCAT
Williams82 TTTTTTTT--ATATTCAATTTCTATTTTTGTGTTTTTTTTTTTTGTCTGATGTTTTGTTAAG
Bossier TTTTTTTT—-ATATTCAATTTCTATTTTTGTG---TTTTTTTTTGTCTGATGTTTTGTTAAG
PI374170 TTTTTTTTTTATATTCAATTTCTATTTTTGTG--TTTTTTTTTTGTCTGATGTTTTGTTAAG
PI96354 TTTTTTTTT-ATATTCAATTTCTATTTTTGTG--TTTTTTTTTTGTCTGATGTTTTGTTAAG
Williams82 TGTTGGTTTCATATGTAATTCATTGGTAGGGGGAATTGATTAAGCCTCCTTGCCCTTTAA
Bossier TGTTGGTTTCATATGTAATTCATTGGTAGGGGGAATTGATTAAGCCTCCTTGCCCTTTAA
PI374170 TGTTGGTTTCATATGTAATTCATTGGTAGGGGGAATTGATTAAGCCTCCTTGCCCTTTAA
PI96354 TGTTGGTTTCATATGTAATTCATTGGTAGGGGGAATTGATTAAGCCTCCTTGCCCTTTAA
Williams82 GAGATTTATGTTAAGTTTTAATATGTTATGATATTGGTTCCTAAACC
Bossier GAGATTTATGTTAAGTTTTAATATGTTATGATATTGGTTCCTAAACC
PI374170 GAGATTTATGTTAAGTTTTAATATGTTATGATATTGGTTCCTAAACC
PI96354 GAGATTTATGTTAAGTTTTAATATGTTATGATATTGGTTCCTAAACC
1b.Glyma10g02090_extensin1_Protein alignment
Williams82 MRDSWNWYLITTSKHFYILLLRNLSMAFLRSTLATSMVLLAMLAIVSATDYYGYGPTPKL
PI96354 MRDSWNWYLITTSKHFYILLLRNLSMAFLRSTLATSMVLLAMLAIVSATDYYGYGPTPKL
Bossier MRDSWNWYLITTSKHFYILLLRNLSMAFLRSTLATSMVLLAMLAIVSATDYYGYGPTPKL
Williams82 ENPKPKTDYKVDKPHPRIPDYYAVPKPKGNDELHLLPTIIGVQGVVLCKSGSNYFPIQGA
PI96354 ENPKPKTDYKVDKPHPRIPDYYAVPKPKGNDELHLLPTIIGVQGVVLCKSGSNYFPIQGA
Bossier ENPKPKTDYKVDKPHPRIPDYYAVPKPKGNDELHLLPTIIGVQGVVLCKSGSNYFPIQGA
Williams82 VARVTCGWENELGYETGPISVLSHVTDSKGYFFATLSLGELGSKLKITECKAYLESSPLE
PI96354 VARVTCGWENELGYETGPISVLSHVTDSKGYFFATLSLGELGSKLKITECKAYLESSPLE
Bossier VARVTCGWENELGYETGPISVLSHVTDSKGYFFATLSLGELGSKLKITECKAYLESSPLE
Williams82 TCKVPTDVNYGISGARLSSYRLLENKMKLYTVGPFFCTSQPAKPLPNGY
PI96354 TCKVPTDVNYGISGARLSSYRLLENKMKLYTVGPFFCTSQPAKPLPNGY
Bossier TCKVPTDVNYGISGARLSSYRLLENKMKLYTVGPFFCTSQPAKPLPNGY
2a.Glyma10g02100_extensin2_DNA alignment
Williams82 TAAATGTAAGATAGAATTAGCTAGCAATGTTATAGATTAAAAAAAGGGAAAAATACAGCG
Bossier TAAATGTAAGATAGAATTAGCTAGCAATGTTATAGATTAAAAAAAGGGAAAAATACAGCG
PI374170 TAAATGTAAGATAGAATTAGCTAGCAATGTTATAGATTAAAAAAAGGGAAAAATACAGCG
PI96354 TAAATGTAAGATAGAATTAGCTAGCAATGTTATAGATTAAAAAAAGGGAAAAATACAGCG
Williams82 GTATTGTTTAAAATGCAAAATAGGGAGAGAAAAAAAAAACATTCTTCATCACTCTATAAC
Bossier GTATTGTTTAAAATGCAAAATAGGGAGAGAAAAAAAAAACATTCTTCATCACTCTATAAC
PI374170 GTATTGTTTAAAATGCAAAATAGGGAGAGAAAAAAAAAACATTCTTCATCACTCTATAAC
PI96354 GTATTTTTTAAAATGCAAAATAGGGAGAGAAAAAAAAAACATTCTTCATCACTCTATAAC
Williams82 CCATGTAGATATTAATTAAGTTGTCCGTGGACTAATAATAATGTAATCCAATAATATATG
Bossier CCATGTAGATATTAATTAAGTTGTCCGTGGACTAATAATAATGTAATCCAATAATATATG
PI374170 CCATGTAGATATTAATTAAGTTGTCCGTGGACTAATAATAATGTAATCCAATAATATATG
PI96354 CCATGCAGATATTAATTAAGTTGTCCGTGGACTAATAATAATGTAATCCAATAATATATG
Williams82 CATGTTTTATACATGCATTTTAGGTCGTGCATCCAAGTCACATCCTACTTCCTATATTAA
Bossier CATGTTTTATACATGCATTTTAGGTCGTGCATCCAAGTCACATCCTACTTCCTATATTAA
PI374170 CATGTTTTATACATGCATTTTAGGTCGTGCATCCAAGTCACATCCTACTTCCTATATTAA
PI96354 CATGTTTTATACATGCATTTTAGGTCGTGCATCCAAGTCACATCCTACTTCCTATATTAA
Williams82 TTGGGACAAAACGTTGAAAATTCCCGACATATGCCTACATGCTATATAAATATATTATAT
Bossier TTGGGACAAAACGTTGAAAATTCCCGACATATGCCTACATGCTATATAAATATATTATAT
PI374170 TTGGGACAAAACGTTGAAAATTCCCGACATATGCCTACATGCTATATAAATATATTATAT
PI96354 TTGGGACAAAACGTTGAAAATTCCCGACATATGCCTACATGCTATATAAATATATTATAT
Williams82 CACAGCACAGCACATGAAAAAACTCGATACGTGATGGCTAACGTGATAGGCAAATACTTA
Bossier CACAGCACAGCACATGAAAAAACTCGATACGTGATGGCTAACGTGATAGGCAAATACTTA
PI374170 CACAGCACAGCACATGAAAAAACTCGATACGTGATGGCTAACGTGATAGGCAAATACTTA
PI96354 CACAGCACAGCACATGAAAAAACTCGATACGTGATGGCTAACGTGATAGGCAAATACTTA
Williams82 AGAAAGGAATAAAAAAATGAAGGAATTAATTAAAAGAAAGATGCAAAAAACCTAAAGTTG
Bossier AGAAAGGAATAAAAAAATGAAGGAATTAATTAAAAGAAAGATGCAAAAAACCTAAAGTTG
PI374170 AGAAAGGAATAAAAAAATGAAGGAATTAATTAAAAGAAAGATGCAAAAAACCTAAAGTTG
PI96354 AGAAAGGAATAAAAAAATGAAGGAATTAATTAAAAGAAAGATGCAAAAAACCTAAAGTTG
Williams82 CATGCTATATATAAGGTCATCTGTTCTCTTCTCTTTATTTTGTAAACTTAATCTGTTTTC
Bossier CATGCTATATATAAGGTCATCTGTTCTCTTCTCTTTATTTTGTAAACTTAATCTGTTTTC
PI374170 CATGCTATATATAAGGTCATCTGTTCTCTTCTCTTTATTTTGTAAACTTAATCTGTTTTC
PI96354 CATGCTATATATAAGGTCATCTGTTCTCTTCTCTTTATTTTGTAAACTTAATCTGTTTTC
Williams82 AACAATAGAAGGACATATGAAAATGGCCTATTTCCATAGTACCTGCTTTCTGGTTTTTAT
Bossier AACAATAGAAGGACATATGAAAATGGCCTATTTCCATAGTACCTGCTTTCTGGTTTTTAT
PI374170 AACAATAGAAGGACATATGAAAATGGCCTATTTCCATAGTACCTGCTTTCTGGTTTTTAT
PI96354 AACAATAGAAGGACATATGAAAATGGCCTATTTCCATAGTACCTGCTTTCTGGTTTTTAT
Williams82 GCTTATCGCATCACTGTTGGTCCCCGGCAGAGGCGGTGACTACGGTCCCGAAGAAGAAAA
Bossier GCTTATCGCATCACTGTTGGTCCCCGGCAGAGGCGGTGACTACGGTCCCGAAGAAGAAAA
PI374170 GCTTATCGCATCACTGTTGGTCCCCGGCAGAGGCGGTGACTACGGTCCCGAAGAAGAAAA
PI96354 GCTTATCGTATCACTGTTGGTCCCCGGCAGAGGCGGTGACTACGGTCCCGAAGAAGAAAA
Williams82 ACTTCTATCAAAAACTATAGGCATTCAAGGCATTGTCTATTGCAAATCTGCCTCTAAACT
Bossier ACTTCTATCAAAAACTATAGGCATTCAAGGCATTGTCTATTGCAAATCTGCCTCTAAACT
PI374170 ACTTCTATCAAAAACTATAGGCATTCAAGGCATTGTCTATTGCAAATCTGCCTCTAAACT
PI96354 ACTTCTATCAAAAACTATAGGCATTCAAGGCATTGTCTATTGCAAATCTGCCTCTAAACT
Williams82 CACCCCACTTGAAGGTAATTAATTAATTTTAAAACTAAATTAATATAGTGTGCTATGCTA
Bossier CACCCCACTTGAAGGTAATTAATTAATTTTAAAACTAAATTAATATAGTGTGCTATGCTA
PI374170 CACCCCACTTGAAGGTAATTAATTAATTTTAAAACTAAATTAATATAGTGTGCTATGCTA
PI96354 CACCCCACTTGAAGGTAATTAATTAATTTTAAAACTAAATTAATATAGTGTGCTATGCTA
Williams82 TATAAACATGCTAAACTAACAATATATGCATTATTGAATATGTTACTTGTTACATATATG
Bossier TATAAACATGCTAAACTAACAATATATGCATTATTGAATATGTTACTTGTTACATATATG
PI374170 TATAAACATGCTAAACTAACAATATATGCATTATTGAATATGTTACTTGTTACATATATG
PI96354 TATAAACATGCTAAACTAACAATATATGCATTATTGAATATGTTACTTGTTACATATATG
Williams82 TTTATAGGGGCCTTGACAAGGATAGCATGCGAGGCTGTTGATGAATATGGGTTTGAAACG
Bossier TTTATAGGGGCCTTGACAAGGATAGCATGCGAGGCTGTTGATGAATATGGGTTTGAAACG
PI374170 TTTATAGGGGCCTTGACAAGGATAGCATGCGAGGCTGTTGATGAATATGGGTTTGAAACG
PI96354 TTTATAGGGGCCTTGACAAGGATATCATGCGAGGCTGTTGATGAATATGGGTTTGAAACG
Williams82 ACACCGTTTTCTTTCTTAAGTGAGGCAACCGACTCGAAAGGCTACTTCCTTGCAACTTTG
Bossier ACACCGTTTTCTTTCTTAAGTGAGGCAACCGACTCGAAAGGCTACTTCCTTGCAACTTTG
PI374170 ACACCGTTTTCTTTCTTAAGTGAGGCAACCGACTCGAAAGGCTACTTCCTTGCAACTTTG
PI96354 ACACCGTTTTCTTTCTTAAGTGAGGCAACCGACTCGAAAGGCTACTTCCTTGCAACTTTG
Williams82 AGTCCACAAGAGGTCGAAGGAAAAGGGGTGCTCAAGGAGTGTAGGGCTTTTCTTGACGCC
Bossier AGTCCACAAGAGGTCGAAGGAAAAGGGGTGCTCAAGGAGTGTAGGGCTTTTCTTGACGCC
PI374170 AGTCCACAAGAGGTCGAAGGAAAAGGGGTGCTCAAGGAGTGTAGGGCTTTTCTTGACGCC
PI96354 AGTCCACAAGAGGTCGAAGGAAAAGGGGTGCTCAAGGAGTGTAGGGCTTTTCTTGACGCC
Williams82 TCTCCTTTGAACAATTGCAGTTATCCCACAGATGTTAACAAAGGGATTAGTGGTGCTGTG
Bossier TCTCCTTTGAACAATTGCAGTTATCCCACAGATGTTAACAAAGGGATTAGTGGTGCTGTG
PI374170 TCTCCTTTGAACAATTGCAGTTATCCCACAGATGTTAACAAAGGGATTAGTGGTGCTGTG
PI96354 TCTCCTTTGAACAATTGCAGTTATCCCACAGATGTTAACAAAGGGATTAGTGGTGCTGTG
Williams82 CTTCGTTTTCATCGCTTCCTCCATGACAAGAAGATGAAATTATACACCGTGGGGCCTTTT
Bossier CTTCGTTTTCATCGCTTCCTCCATGACAAGAAGATGAAATTATACACCGTGGGGCCTTTT
PI374170 CTTCGTTTTCATCGCTTCCTCCATGACAAGAAGATGAAATTATACACCGTGGGGCCTTTT
PI96354 CTTCGTTTTCATCGCTTCCTCCATGACAAGAAGATGAAATTATACACCGTGGGGCCTTTT
Williams82 CAATTCACCGCATCACCGACACCAATCTCTGATGGATATTAATTTTTT--TTTTTTCCAT
Bossier CAATTCACCGCATCACCGACACCAATCTCTGATGGATATTAATTTTTT--TTTTTTCCAT
PI374170 CTATTCACCGCATCACCGACACCAATCTCTGATGGATATTAATTTTTT--TTTTTTCCAT
PI96354 CTATTCACCGCATCACCGACACCAATCTCTGATGGATATTAATTTATTTATTTTTTCCAT
Williams82 ATAAAACCTTATCATGACTCTTTAAGGGGGAGTTGATCAAGTTGCAAGATTAGTATGAAA
Bossier ATAAAACCTTATCATGACTCTTTAAGGGGGAGTTGATCAAGTTGCAAGATTAGTATGAAA
PI374170 ATAAAACCTTATCATGACTCTTTAAGGGGGAGTTGATCAAGTTGCAAGATTAGTATGAAA
PI96354 ATAAAACCTTATCATGACTCTTTAAGGGGGAGTTGATCAAGTTGCAAGATTAGTATGAAA
Williams82 TTTCATGGACGAAAAAGAAGTATCAAAAAGAGTGTATTGGTATTCAAATCTTTTGGTTTA
Bossier TTTCATGGACGAAAAAGAAGTATCAAAAAGAGTGTATTGGTATTCAAATCTTTTGGTTTA
PI374170 TTTCATGGACGAAAAAGAAGTATCAAAAAGAGTGTATTGGTATTCAAATCTTTTGGTTTA
PI96354 TTTCATGGACGAAAAAGAAGTATCAAAAAGAGTGTATTGGTATTCAAATCTTTTGGTTTA
Williams82 TCTTGTATATGAAACCAACAATCTCCCAAAATTAAATTGACTTGTCTTGCAATCAAGGTT
Bossier TCTTGTATATGAAACCAACAATCTCCCAAAATTAAATTGACTTGTCTTGCAATCAAGGTT
PI374170 TCTTGTATATGAAATCAACAATCTCCCAAAATTAAATTGACTTGTCTTGCAATCAAGGTT
PI96354 TCTTGTATATGAAATCAACAATCTCCCAAAATTAAATTGACTTGTCTTG-AATCAAGATT
Williams82 ATC
Bossier ATC
PI374170 ATC
PI96354 ATC
2b.Glyma10g02100_extensin2_Protein alignment
Williams82 MKMAYFHSTCFLVFMLIASLLVPGRGGDYGPEEEKLLSKTIGIQGIVYCKSASKLTPLEG
Bossier MKMAYFHSTCFLVFMLIASLLVPGRGGDYGPEEEKLLSKTIGIQGIVYCKSASKLTPLEG
PI96354 MKMAYFHSTCFLVFMLIVSLLVPGRGGDYGPEEEKLLSKTIGIQGIVYCKSASKLTPLEG
Williams82 ALTRIACEAVDEYGFETTPFSFLSEATDSKGYFLATLSPQEVEGKGVLKECRAFLDASPL
Bossier ALTRIACEAVDEYGFETTPFSFLSEATDSKGYFLATLSPQEVEGKGVLKECRAFLDASPL
PI96354 ALTRISCEAVDEYGFETTPFSFLSEATDSKGYFLATLSPQEVEGKGVLKECRAFLDASPL
Williams82 NNCSYPTDVNKGISGAVLRFHRFLHDKKMKLYTVGPFQFTASPTPISDGY
Bossier NNCSYPTDVNKGISGAVLRFHRFLHDKKMKLYTVGPFQFTASPTPISDGY
PI96354 NNCSYPTDVNKGISGAVLRFHRFLHDKKMKLYTVGPFLFTASPTPISDGY
3a.Glyma10g02140_Pectinesterase1_DNA alignment (in this gene, sequence of Bossier is 100% similar to that of Williams 82, therefore, only sequence of Bossier is presented)
PI96354 TAAAGCTAGCTCATTTTTTTTTCAAAAAA------
Bossier TAAAGCTAGCTCATTTTTTTTTCAAAAAATAAAAATAAAAATAAAAAAATAAAAAATAAA
PI96354 ------ATATATATATATATATATATATATATATATATATAGTTTCACAGTGTCAA
Bossier ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGTTTCACAGTGTCAA
PI96354 CGTGAAACACCCCACTCCATGTTACAATCCAACCACTCTATTTATCCACAGCACGTACCC
Bossier CGTGAAACACCCCACTCCATGTTACAATCCAACCACTCTATTTATCCACAGCACGTACCC
PI96354 TGCTAGCTAGTTACACATACACAGTAATCCTAACCCACCTCCTAAGTCCTATCACATCAT
Bossier TGCTAGCTAGTTACACATACACAGTAATCCTAACCCACCTCCTAAGTCCTATCACATCAT
PI96354 GAACAACCTCACACTTGCATCCATTCTGACCGTGATTTCTTCTCTACTATTCTTTGGAAC
Bossier GAACAACCTCACACTTGCATCCATTCTGACCGTGATTTCTTCTCTACTATTCTTTGGAAC
PI96354 AACTCATTTAACCAACACCCAAACAACAAGAGTCCCAGATCAAAAACATAAACACCTCCA
Bossier AACTCATTTAACCAACACCCAAACAACAAGAGTCCCAGATCAAAAACATAAACACCTCCA
PI96354 TTTCCAAAAGCATATACAAGTAGTAGCCCAATCCACATGCGAAGGAACACTCTACCCAGA
Bossier TTTCCAAAAGCACATACAAGTAGTAGCCCAATCCACATGCGAAGGAACACTCTACCCAGA
PI96354 CCTATGTGTCTTAACACTAGCCACATTCCCAGATCTCACAACAAAATCTGTCCCACAAGT
Bossier CCTATGTGTCTTAACACTAGCCACATTCCCAGATCTCACAACAAAATCTGTCCCACAAGT
PI96354 GATATCCTCAGTGGTCAACCATACCATGTACGAGATAAGATCAACGTCCTACAACTGCAG
Bossier GATATCCTCAGTGGTCAACCATACCATGTACGAGGTAAGATCAACGTCCTACAACTGCAG
PI96354 CGGCCTCAAAAAGATGCTCAAAAACCTCAACCCACTCGACCAGAGAGCCCTCGACTACTG
Bossier CGGCCTCAAAAAGATGCTCAAAAACCTCAACCCACTCGACCAGAGAGCCCTCGACGACTG
PI96354 TCTCAAACTGTTTGAAGACACCAGCGTCGAGCTCAAAGCCACCATCGACGATCTCTCCAT
Bossier TCTCAAACTGTTTGAAGACACCAGCGTCGAGCTCAAAGCCACCATCGACGATCTCTCCAT
PI96354 CAAGAGCACCATAGGGTCGAAACGGCATCATGACTTGCAGACTCTGCTGAGTGGAGCAAT
Bossier CAAGAGCACCATAGGGTCTAAACTGCACCATGACTTGCAGACTCTGCTGAGTGGAGCAAT
PI96354 GACCAACTTGTACACGTACCTCGATGGCTTTGCGTACAGCAAAGGGCGCGTGGGGGACAG
Bossier GACCAACTTGTACACGTGCCTCGATGGCTTTGCGTACAGCAAAGGGCGCGTGGGGGACAG
PI96354 AATCGAGAAGAAGCTGCTTCAAATATCGCATCACGTGAGCAACTCGTTGGCCATGCTGAA
Bossier AATCGAGAAGAAGCTGCTTCAAATATCGCATCACGTGAGCAACTCGTTGGCCATGCTGAA
PI96354 CAAAGTGCCTGGAGTTGAGAAATTAACAACTTCTTCGGATTCTGATGAGGTGTTTCCAGA
Bossier CAAAGTGCCTGGAGTTGAGAAATTAACAACTTCTTCGGAATCTGATGAGGTGTTTCCAGA
PI96354 ATATGGAAAGATGCAAAAGGGGTTCCCTTCGTGGGTGTCCTCCAAAGACCGAAAGCTTCT
Bossier ATATGGAAAGATGCAAAAGGGGTTCCCTTCGTGGGTGTCCTCTAAAGACCGAAAGCTTCT
PI96354 TTAAGCTAAAGTGAATGAGACCAAGTTCAATCTTGTTGTTGCCAAAGATGGCACTGGCAA
Bossier TCAAGCTAAAGTGAATGAGACCAAGTTCAATCTTGTTGTTGCCAAAGATGGCACTGGCAA
PI96354 CTTCACCACTATAGGGGAAGCACTGTCTGTGGCTCCCAACTCAAGCACAACTAGGTACAT
Bossier CTTCACCACTATAGGGGAAGCACTGTCTGTGGCTCCCAACTCAAGCACAACTAGGTACAT
PI96354 AACAAAATACTTTATTTCAGACCAATGTGATTGATTATAATTTACTCTAGTATAAATGAA
Bossier AACAAAATACTTTATTTCAGACCAATGTGATTGATTATAATTTACACTAGTATAAATGAA
PI96354 TTACATAGTAAAAACGTAGTACCAATGGGATACAAATTAAGAGAAAAGAGAAAGGTGTTA
Bossier TTACATAGTAAAAACGTAGTACCAATGGGATACAAATTAAGAGAAAAGAGAAAGGTGTTA
PI96354 GTAGAGTGTCAATTTTTTTTTTAAAGATTTTTAATAATGCCATGTATTCAATTGGAAATG
Bossier GTAGAGTGTCAATTTTTTTTT-AAAGATTTTTAATAATGCCATGTATTCAATTGGAAATG
PI96354 TATACACTATATACAGTGTTTTTTTTTTTTTTTTATGTATAAGTGAAAAGAATAAATATT
Bossier TATACACTATATACAGTGAGCTTTTTTTTTTTTTATGTATAAGTGAAAAGAATAAATATT
PI96354 AAGCATTAGTCAAAATAAAATACAGAAGTCATATGAGTTATTTAAAAATCACGTTAAGAA
Bossier AAGCATTAGTCAAAATAAAATACAGAAGTCATATGAGTTATTTAAAAATCACGTTAAGAA
PI96354 ACTCATTCTCACATTATATCTATGTATAATTATATATGACTTAGATGTACTGTTTTCAAT
Bossier ACTCATTCTCACATTATATCTATGTATAATTATATATGACTTAGATGTACTGTTTTCAAT
PI96354 CCGATGTAAGAAACTCATTCTTACATTATACCTCTCCTATTTGATTGTAAGAAATATTTC
Bossier CTGATGTAAGAAACTCATTCTTACATTATACCTCTCCTATTTGATTGTAAGAAATATTTC
PI96354 TTCATTGGGTTGTAAAATTAAATGAGTGTAAGTGATAACAGGTTTGTGATACACGTAACG
Bossier TTCATTGGGTTGTAAAATTAAATGAGTGTAAGTGATAACAGGTTTGTGATACACGTAACG
PI96354 GCGGGGGCATACTTCGAGAATGTGGAAGTGATAAGGAAGAAGACGAATCTAATGTTTGTT
Bossier GCGGGGGCATACTTCGAGAATGTGGAAGTGATAAGGAAGAAGACGAATCTAATGTTTGTT
PI96354 GGAGACGGTATTGGAAAGACAGTAGTGAAAGGCAGTAGGAATGTTGAGGACGGGTGGACA
Bossier GGAGACGGTATTGGAAAGACAGTAGTGAAAGGCAGTAGGAATGTTGAGGACGGGTGGACC
PI96354 ATTTTTCAATCTGCTACTGTTGGTAAG------
Bossier ATTTTTCAATCTGCTACTGTTGGTAAGTATTAAATTTAGAGTGCAGCAATGCATTCGGAA
PI96354 ------
Bossier GGTCCCCTTAAAAATCGGTTCGTCAGCATTCATCGGGCAGAATATGGCTCTGATACCATA
PI96354 ------
Bossier TTAAATTTATAGTGTAGCAAAGACATTCGAAAAATTCCCTTAAAAACCGGTTTATAAGGG
PI96354 ------
Bossier GTGGCCTACCGAACTATATAAGTACTTATCAAAATTTGCTAAACATCCAATGTAGGACTA
PI96354 ------TATGTCTTTCTTCTTCCCACCTTCTGCTACTATTTTTAATTAGTTA
Bossier TTTTCAACAGTAAATATGTCTTTCTTCTTCCCACCTTCTGCTACTATTTTTAATTAGTTA
PI96354 TGTTTTTTTCTTGGTTTGATATTCCAACTTTGAAAAATAAAAATAGGTATGATATATAGA
Bossier TGTTTTTTTCTTGGTTTGATATTCCAACTTTGAAAAATAAAAATAGGTATGATATATAGA
PI96354 ATGGTCATAAGTGAGATTTGATTAGTAGCTCGGTCACTTAATAAAGTTTTATAAATGCTC
Bossier ATGGTCATAAGTGAGATTTGATTAGTAGCTCGGTCACTTAATAAAGTTTTATAAATGCTC
PI96354 TACTTTGAGGCTGGCGTTGTGATTGTTAAGTCAAAGAC--AGAAAAAAAATCATTAGAAA
Bossier TACTTTGAGGCTGGCGTTGTGATTGTTAAGTCAAAGACAGAGAAAAAAAATCATTAGAAA
PI96354 AAGTTAGAACAAGACAACGAAAATGGCAACTTGATGCACAGCCCACATGTTGGTTTAAAA
Bossier AAGTTAGAACAAGACAACGAAAATGGCAACTTGATGCACAGCCCACATGTTGGTTTAAAA
PI96354 ATTATTAATAAACTAATTTTGCTAGGTGATTTTGTAGTTAAAATACATAATGTAGATGTG
Bossier ATTATTAATAAACTAATTTTGCTAGGTGATTTTGTAGTTAAAATACATAAAGTAGATGTG
PI96354 GGAAGATCATTTTAAATGGTTTGGACAGACACGGACT-CTTGGGTTTGTCAAGACATCGT
Bossier GGAAGATCATTTTAAATGGTTTGGACAGACATGGACTACTTGGGTTTGTCAAGACATCGT
PI96354 GCAGTTCCTGCATTGCATTGAAAAATAGTGTTGTAGAGGTTGATGCATGTAATTAT-TTT
Bossier GCAGTTCCTGCATTGCATTGAAAAATAGCGTTGTAGAGGTTGATGCATGTAATTATCTTT
PI96354 TTTTTTGTTTTGTGTGTGTACACTAGTAAAATCCTACCTCTGGTGAGAATAAGCACAACT
Bossier TGTTTTGTTTTGTGTGTGTACACTAGTAAAATCCTACCTCTTGTGAGAATAAGCACAACT
PI96354 TAGTTTTGAATGTTTGGAATAAAACCAAGGAAAGTTCAAAAGATAAAAGGCTTTGCCATT
Bossier TAGTTTTGAATGTTTGGAATAAAACCAAGGAAAGTTCAAAAGATAAAAGGCTTTGTCATT
PI96354 TT------AAGATAGGTG
Bossier TTAAAATTTTTGAGGATTCTGCTTTCCGTGATTGAACATAATGCTGAAAAAAGATAGGTG
PI96354 ATGAGTGCATGTATATATGTTTAAAGACTATTTTCAAAGGCATCACTGCAAATTTAAACT
Bossier ATGAGTGCATGTATATATGTTTAAAGACTATTTTCAAAGGCATCACTGCAAATTTAAACT
PI96354 ACCCCAGCTATCAATGACGTATGCATGAAATATAAATAGTGTCAAAGTGATGCTAGTATT
Bossier ACCCCAGCTATCAATGACGTATGCATGAAATATAAATAGTGTCAAAGTGATGCTAGTATT
PI96354 ATTGGTTACAATGCTGACTAGCTAGATTCCAAAATGCTTGTTTTTTTTTTTT-ATCATTG
Bossier ATTGGTTACAATGCTGACTAGCTAGATTCCAAAATGCTTGTTTTTTTTTTGTGATCATTG
PI96354 CCCGTTGTCAACTATTCCTGTTATGGGAATAAATTTTGAGGACTCTAATTTTGTGTTTTC
Bossier CCCGTCGTCAACTATTCCTGTTATGGGAATAAATTTTGAAGACTCTAATTTTGTGTTTTC
PI96354 AGTGTTCTGTTTGGTTTTTCCAGTTATATTGCAATCCAGTAATATCAATTGGACTTCTCC
Bossier AGTGTTCTGTTTGGTTTTTCCAGTTATATTGCAATCCAGTAATATCAATTGGACTTCTCC
PI96354 ATCAGACAACGGGTCTCAATCACAATGACATTAGCAAATATGTATTGTAAATAAATCAAA
Bossier ATCAGACAACGGGTCTCAATCACAATGACATTAGCAAATATGTATTGTAAATAAATCAAA
PI96354 TTTCTTATTTCTTGTTAAAGGTAGCAGTAATAAACCTAGATTTGGGATCTCCTGCCCGAA
Bossier TTTCTTATTTCTTGTTAAAGGTAGCAGTAATAAACCTAGATTTGGGATCTCCTGCCCGAA
PI96354 AGCATGTTTTCTTTATTAATATTTTCCGAGCTATGAGTGGTGACACCATTTTTTGGAAAG
Bossier AGCATGTTTTCTTTATTAATATTTTCCGAGCTATGAGTGGTGACACCATTTTTTGGAAAG
PI96354 AAAATGACGTGAGTAATCTTGGTGAAAGATAGAAAAAGAACAGAGAAAAAAAACATAACC
Bossier AAAATGACGTGAGTAATCTTGGTGAAAGATAGAAAAAGAACAGAGAAAAAAAACATAACC
PI96354 GGTGTGGTCTAATGAGAAGAAATAAAAATAGAATTGGAAACTCTTTTATAAGACAAAAAA
Bossier GGTGTGGTCTAATGAGAAGAAATAAAAATAGAATTGGAAACTCTTTTATAAGACAAAAAA
PI96354 AAAAAAAAATACATGCAGGCAGGCAGAGGAGGTAGGACTATCTCTGGCCTTAGATACATG
Bossier AAAAAAAAATACATGCAGGCAG------AGGTAGGACTATCTTTGGCCTTAGATACATG
PI96354 ATAATTTTATTTATATTTTCGCGAAAAGTAGAGTTACCTCTATGGTTGGTCAAAGTAAAG
Bossier ATAATTTTATTTATATTTTCGCGAAAAGTAGAGTTACCTCTATGGTTGGTCAAAGTAAAG
PI96354 GGTCCACATGCCTATCCACGCCCACCTAAAGATCTGCATAATTCTCATCACAACCAAACT
Bossier GGTCCACATGCCTATCCACGCCCACCTAAAGATCTGCATAATTCTCATCACAACCAAACT
PI96354 ACTTTTTCAGTGCCATTAGGTCCACTTTGCTTGTTTTTTCTTCTATGCTTCCCCTTTTAC
Bossier ACTTTTTCAGTGCCATTAGGTCCACTTTGCTTGTTTTTTCTTCTATGCTTCCCCTTTTAC
PI96354 TTTTCTGCTTTTGCTTTTAACAAATAAAAATGCTTTAATTTCCTCTTTTGGGATAACATG
Bossier TTTTCTGCTTTTGCTCTTAACAAATAAAAATGCTTTAATTTCCTCTTTTGGGATAACATG
PI96354 GATAAAAGAAAGTGAATTTTATGATCT---TTATTATTCATGTGACAAATAATGTGCAGT
Bossier GATAAAAGAAAGTGAATTTTATGATCTTTATTATTATTCATGTGACAAATAATGTGCAGT
PI96354 ACAAAGTTAACAGACTTTTAGTTTTCTTTCTTCGTTTCAATGATACCTTTATGTTGAGTT
Bossier ACAAAGTTAACAGACTTTTAGTTCTCTTTCTTCGTTTCAATGATACCTTTATGTTGAGTT
PI96354 TGTGTCTCTCAGCAAAGTTTGCTCTTTATTGTTCATTTATGAATAATGATCCAAAATCTA
Bossier TGTGTCTCCCAGCAAAGTTTGCTCTTTATTGTTCATTTATGAATAATGATCCAAAATCTA
PI96354 ATCCTAACAGCGTTGACAATAATGGTATGTTGCAACTATTCAGTTGTAACTCAGTTGGCA
Bossier ATCCTAACAGCGTTGACAATAATGGTATGTTGCAACTATTCAGTTGTAACTCAGTTGGCA
PI96354 ACAGATCTTAAGTTTATGGAAAAAAAATCTGTGTTCAATCCTTACAAGAAAAAGGATGAA
Bossier ACACATCTTAAGTTTATGAAAAAAAGATCTGTGTTCAATCCTTACAAGAAAAAGGATGAA
PI96354 TAATTTAAAATGTAATTAAGTCTCGAACAGAATGATTATGATTGTTGTTAATAAAAGAAA
Bossier TAATTTTAAATGTAATTAAGTCTCGAACAGAATGATTATGATTGTTGTTAATAAAGGAAA
PI96354 ATGGTATGTTGCAGCTGTTGTAGGAGCAGGATTCATAGCAAAGGGTATAACATTTGAGAA
Bossier ATGGTATGTTGCAGCTGTTGTAGGAGCAGGATTCATAGCAAAGGGTATAACATTTGAGAA
PI96354 GTCAGCAGGACCCGACAAACACCAAGCTGTGGCACTGAGAAGTGGTGTGCTGACTTCTCA
Bossier GTCAGCAGGACCCGACAAACACCAAGCTGTGGCACTGAGAAGTGGTGTGCTGACTTCTCA
PI96354 GCTTTCTACCAATGCAGTTTCGTTGGCTACCAGGACACTCTCTACGTCCATTCCCTGCGT
Bossier GCTTTCTACCAATGCAGTTTCGTTGGCTACCAGGACACTCTCTACGTCCATTCCCTGCGC
PI96354 TAATTCTACCGTGAACGTGACATTTATGGCACTGTAGACTTCATTTTCGGCAATGCAGCT
Bossier CAATTCTACCGTGAACGTGACATTTATGGCACTGTAGACTTCATTTTCGGCAATGCAGCT
PI96354 GTGGTATTCCAAAACTGCAACTTATACGCACGCAAGCCAAACGAAAATCAGAAGAACTTG
Bossier GTGGTATTCCAAAACTGCAACTTATACGCACGCAAGCCAAACGAAAATCAGAAGAACTTG
PI96354 TTCATGGCACAAGGCAGAGAGGACCCTAACCAAAACACTGGCATATCCATCTTGAACTGC
Bossier TTCATGGCACAAGGCAGAGAGGACCCTAACCAAAACACTGGCATATCCATCTTGAACTGC
PI96354 AAGATTGCAGCTGCTGCAGATTTGATCCCTGTGAAATCCTCGTTCAAGAGCTACCTAGGA
Bossier AAGATTGCAGCTGCTGCAGATTTGATCCCTGTGAAATCCTCGTTCAAGAGCTACCTAGGA
PI96354 CGTCCTTGGAAAATGTACTCTATGACTGTTGTGTTAAAATCTTACGTGGATATAGACCCA
Bossier CGTCCTTGGAAAATGTACTCTATGACTGTTGTGTTAAAATCTTACGTGGATATAGACCCA
PI96354 GCAGGGTGGTTGGAATGGAATGAAACATTTGCATTGGATACGTTGTATTATGGGGAGTAC
Bossier GCAGGGTGGTTGGAATGGAATGAAACATTTGCATTGGATACGTTGTATTATGGGGAGTAC
PI96354 ATGAATAGGGGTCCATGTTCAAACACAAGTGGTAGGGTTACGTGGCCAGGTTATAGGGTC
Bossier ATGAATAGGGGTCCATGTTCAAACACAAGTGGTAGGGTTACGTGGCCAGGTTATAGGGTC
PI96354 ATTAACAGCTCCATTGAGGCAAGCCAATTCACAGTTGGACAGTTTATTCAAGACAATGAT
Bossier ATTAACAGCTCCATTGAGGCAAGCCAATTCACAGTTGGACAGTTTATTCAAGACAATGAT
PI96354 TGGTTGAACAACACTGGCATCCCATTCTTCTCTGGT
Bossier TGGTTGAACAACACTGGCATCCCATTCTTCTCTGGT
3b.Glyma10g02140_Pectinesterase1_Protein alignment
Williams82 MNNLTLASILTVISSLLFFGTTHLTNTQTTRVPDQKHKHLHFQKHIQVVAQSTCEGTLYP
Bossier MNNLTLASILTVISSLLFFGTTHLTNTQTTRVPDQKHKHLHFQKHIQVVAQSTCEGTLYP
PI96354 MNNLTLASILTVISSLLFFGTTHLTNTQTTRVPDQKHKHLHFQKHIQVVAQSTCEGTLYP
Williams82 DLCVLTLATFPDLTTKSVPQVISSVVNHTMYEVRSTSYNCSGLKKMLKNLNPLDQRALDD
Bossier DLCVLTLATFPDLTTKSVPQVISSVVNHTMYEVRSTSYNCSGLKKMLKNLNPLDQRALDD
PI96354 DLCVLTLATFPDLTTKSVPQVISSVVNHTMYEIRSTSYNCSGLKKMLKNLNPLDQRALDY
Williams82 CLKLFEDTSVELKATIDDLSIKSTIGSKLHHDLQTLLSGAMTNLYTCLDGFAYSKGRVGD
Bossier CLKLFEDTSVELKATIDDLSIKSTIGSKLHHDLQTLLSGAMTNLYTCLDGFAYSKGRVGD
PI96354 CLKLFEDTSVELKATIDDLSIKSTIGSKRHHDLQTLLSGAMTNLYTYLDGFAYSKGRVGD
Williams82 RIEKKLLQISHHVSNSLAMLNKVPGVEKLTTSSESDEVFPEYGKMQKGFPSWVSSKDRKL
Bossier RIEKKLLQISHHVSNSLAMLNKVPGVEKLTTSSESDEVFPEYGKMQKGFPSWVSSKDRKL
PI96354 RIEKKLLQISHHVSNSLAMLNKVPGVEKLTTSSDSDEVFPEYGKMQKGFPSWVSSKDRKL
Williams82 LQAKVNETKFNLVVAKDGTGNFTTIGEALSVAPNSSTTRFVIHVTAGAYFENVEVIRKKT
Bossier LQAKVNETKFNLVVAKDGTGNFTTIGEALSVAPNSSTTRFVIHVTAGAYFENVEVIRKKT
PI96354 L------
Williams82 NLMFVGDGIGKTVVKGSRNVEDGWTIFQSATVAVVGAGFIAKGITFEKSAGPDKHQAVAL
Bossier NLMFVGDGIGKTVVKGSRNVEDGWTIFQSATVAVVGAGFIAKGITFEKSAGPDKHQAVAL
PI96354 ------
Williams82 RSGVLTSQLSTNAVSLATRTLSTSIPCANSTVNVTFMAL
Bossier RSGVLTSQLSTNAVSLATRTLSTSIPCANSTVNVTFMAL
PI374170 RSGVLTSQLSTNAVSLATRTLSTSIPCANSTVNVTFMAL
PI96354 ------
4a. Glyma10g02160_Pectinesterase2_DNA alignment (in this gene, sequence of Bossier is 100% similar to that of Williams 82, therefore, only sequence of Bossier is presented)
PI96354 TACTAAAAAA-TATATATATAT------TTATTATATTAAAATAAATATTTTTTAACAAA
Bossier TACTAAAAAAATATATATATATATATATTTATTATATTAAAATAAATATTTTTTAACAAA
PI96354 TAAGCAAATCGACTCAATATTGTTAAAAAGAATGTAAATTTCCGATGATTAATTTATAAA
Bossier TAAGCAAATCGACTCAATATTGTTAAAAAGAATGTAAATTTCCGATGATTAATTTATAAA
PI96354 GTGTGCGTTCCATCGAATCATCCATTGACTTTGTCAAATGTCACATATAAAAGTCAACAT
Bossier GTGTGCGTTCCATCGAATCATCCATTGACTTTGTCAAATGTCACATATAAAAGTCAACAT
PI96354 TATTTTTGTATAACATGCTAGACTCCTTCTGTATTTGGCAAAAACTAATTGGATTTGTGG
Bossier TATTTTTGTATAACATGCTAGACTCCTTCTGTATTTGGCAAAAACTAATTGGATTTGTGG
PI96354 GAGATTAGGTTGAAGACAACTCCGCTTGAGAAAGGAAAAAGTTTTTTTTATTAAAGAATA
Bossier GAGATTAGGTTGAAGACAACTCCGCTTGAGAAAGGAAAAAGTTTTTTTTATTAAAGAATA
PI96354 GATAAGTGAGTGAAGATGGAAACATAGAAATGGTATATCACAAATATATTCATAATTGTG
Bossier GATAAGTGAGTGAAGATGGAAACATAGAAATGGTATATCACAAATATATTCATAATTGTG
PI96354 CAAATGCATAATCCTTTTCTCATTACAATTTGCAAAGACTGGTCCATGGTTTGCATTGCA
Bossier CAAATGCATAATCCTTTTCTCATTACAATTTGCAAAGACTGGTCCATGGTTTGCATTGCA
PI96354 GTTTCACGTAGCAGCCACTACTACGCCAACAATATACTACTACACATGTAAAACGTAAAC
Bossier GTTTCACGTAGCAGCCACTACTACGCCAACAATATACTACTACACATGTAAAACGTAAAC
PI96354 GCATTACAGAATATTTTTCAATTAAAAGAACCTCTCCATTTCCACTATAAATTGCAAGTG
Bossier GCATTACAGAATATTTTTCAATTAAAAGAACCTCTCCATTTCCACTATAAATTGCAAGTG
PI96354 ATGAAACCCAATTTCCATCACACTCATAAGCTCTTCCAATCTAATAGTAATAAACTCTTG
Bossier ATGAAACCCAATTTCCATCACACTCATAAGCTCTTCCAATCTAATAGTAATAAACTCTTG
PI96354 CTATATATCAATCAGTACCAATGGCCAACAACAAGTTAACCTTTGTCATCATCCTCATCT
Bossier CTATATATCAATCAGTACCAATGGCCAACAACAAGTTAACCTTTGTCATCATCCTCATCT
PI96354 TCCTACCCTCATTGTTAGCTTTGGCTGACATCACTCCCAACACTTCCGTTTCTCCCGGAA
Bossier TCCTACCCTCATTGTTAGCTTTGGCTGACATCACTCCCAACACTTCCGTTTCTCCCGGAA
PI96354 CCATTTGCAAATCCACTCCAGACCCTTCTTATTGCAACTCCGTGCTACCTCCCCAAAACG
Bossier CCATATGCAAATCCACTCCAGACCCTTCTTATTGCAACTCCGTGCTACCTCCCCAAAACG
PI96354 GCAACGTTTACGAATATGGCAGGTTCTCGGTAAGAAAGTCCCTTTCACAGGCCACCAATT
Bossier GCAACGTTTACGAATATGGCAGGTTCTCGGTAAGAAAGTCCCTTTCACAGGCCACCAATT
PI96354 TCTTGAACTTAGTTAACAGATACCTCCAACTCCAACGCCGTTCTTCTCTTTCCACCCCCG
Bossier TCTTGAACTTAGTTAACAGATACCTCCAACTCCAACGCCGTTCTTCTCTTTCCACCCCCG
PI96354 CAATCCACGCGCTCGAAGATTGCCAAAGCCTCGCCGAACTCAACATAGACTTTCTCTCCA
Bossier CAATCCACGCGCTCGAAGATTGCCAAAGCCTCGCCGAACTCAACATAGACTTTCTCTCCA
PI96354 GTTCCTTAGAAACGGTGAACAGAACAACCAAATTTTTACCCACTTCACAGGCTGACGACA
Bossier GTTCCTTAGAAACGGTGAACAGAACAACCAAATTTTTACCCACTTCACAGGCTGATGACA
PI96354 TTCAAACTCTTTTAAGTGCCATTCTAACCAACCAACAAACATGCTTGGAAGGCCTTCAAG
Bossier TTCAAACTCTTTTAAGTGCCATTCTAACAAACCAACAAACATGCTTGGAAGGCCTTCAAG
PI96354 CCACCGCCTCCGCTTGGCGCCTCAAGAACGGACTCTCCGTTCCGCTCTCCAACGACACTA
Bossier CCACCGCCTCCGCTTGGCGCCTCAAGAACGGACTCTCCGTTCCGCTCTCCAACGACACTA
PI96354 AGCTATACAGTGTCTCTCTGGCACTCTTCACAAAGGGGTGGGTCCCAGAAAATGCTAATG
Bossier AGCTATACAGTGTCTCTCTGGCACTCTTCACAAAGGGGTGGGTCCCAGAAAATGCTAATG
PI96354 TCACCGCGTTTCAGCCAAGCGCCAAACATCGCGGGTTTCGAAACGGGCGTTTGCCGCTCA
Bossier TCACCGCGTTTCAGCCAAGCGCCAAACATCGCGGGTTTCGAAACGGGCGTTTGCCGCTCA
PI96354 AGATGTCGAGCACAACGCGCGCGATCTACGAGTCGGTGAGTCGGAGAAAGCTCCTGCAGG
Bossier AGATGTCGAGCAGAACGCGCGCGATCTACGAGTCGGTGAGTCGGAGAAAGCTCCTGCAGG
PI96354 CGACGGTGGGTGACGAGGTTAAGGTGAAAGACATTGTGACGGTGAGCAAAGATGGAAACG
Bossier CGACGGTGGGTGACGAGGTTAAGGTGAAAGACATTGTGACGGTGAGCAAAGATGGAAACG
PI96354 GGAACTTCACCACCATCAGCGACGCCGTGGCCGCGGCGCCGAACAAGACTTCATCCACGG
Bossier GGAACTTCACCACCATCAGCGACGCCGTGGCCGCGGCGCCGAACAAGACTTCATCCACGG
PI96354 CGGGGTACTTCCTGATCTATGTGACCGCCGGTGTTTACGAGGAAAATGTTTCTATTGATA
Bossier CGGGGTACTTCCTGATCTATGTGACCGCCGGTGTTTACGAGGAAAATGTTTCTATTGATA
PI96354 AGAAAAAGACGTACCTGATGATGGTGGGAGATGGCATCAACAAGACAATTATTACTGGAA
Bossier AGAAAAAGACGTACCTGATGATGGTGGGAGATGGCATCAACAAGACAATTATTACTGGAA
PI96354 ATCGCAGTGTTGTTGATGGCTGGACAACCTTTAAGTCAGCGACATTTGGTACGTACTACT
Bossier ATCGCAGTGTTGTTGATGGCTGGACAACCTTTAAGTCAGCGACATTTGGTACGTACTACT
PI96354 ACTACTCCATAATCAGCATAAAAAGTGGTGTATTATTAGTAGAACTAGTACATCTCTTTA
Bossier ACTACTCCATAATCAGCATAAAAAGTGGTGTATTATTAGTAGAACTAGTACATCTCTTTA
PI96354 CCAAAAAATCATATAAAAACAAGTTAAAAAGAAGAAAAATTATAGATGAAAGCCAATACA
Bossier CCAAAAAATCATATAAAAACAAGTTAAAAAGAAGAAAAATTATAGATGAAAGCCAATACA
PI96354 TGAATAGACCCTTAGAGATAGAAAAAGATAAAAGGAAAATTTTAAGTTTTAACAGGTAGA
Bossier TGAATAGACCCTTAGACATAGAAAAAGATAAAAGGAAAATTTTAAGTTTTAACAGGTAGA
PI96354 AAAGCGAATAATAAATACACCATCAATT--TTTTTTTCCAATTATTTCGTAAACTCTATT
Bossier AAAGCGAATAATAAATACACCATCAATTATTTTTTTTCCAATTATTTCATAAACTCTATT
PI96354 ATATCTATTTTTATGATATTTTAGGTGTTAGATAACATGTTATGTCCATTAAACATTTTC
Bossier ATATCTATTTTTATGATATTTTAGGTGTTAGATAACATGTTATGTCCATTAAACATTTTC
PI96354 ATTTATAGGTAATATGATTGTTATTTTAGATTATAAATAACATGATTTGATATAAGAAAT
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Bossier AAGAAATCTTCAT
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