Additional file 6: FigureS5. Alignment of the R. ferrugenieusOBPs contigs. Highly conserved cysteine are shown with dark arrowhead above. Conserved residues are shown in hollow arrowheads.
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100
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RPW1_contig_23 ------DEMKELAAQ------LHNAC------V--AE
RPW1_contig_23127 ------NVLAI------SDEEKAAIKESVLK------YVQEC------G--QE
RPW1_contig_77 ------MKTFIVLSAFVL------AVVLGATTKSSWNS------VHQAC------QAKPG
RPW1_contig_107 ------KFD------DSIISEDIRKLLKG------LHDVC------V--SK
RPW1_contig_382 ------LTMKVLCLAIFVFA------TVVMADHVQVRYDN------VHKNC------QKDPA
RPW1_contig_446 ------CQEFTEEQKKKILE------NRKQC------I--EE
RPW1_contig_1768 ------MTPEQRTRFFN------FQNEC------M--QE
RPW1_contig_3937 ------MKYLIVLVLSLSAIT------AKPLTDEQKQNFRN------FYDGC------V--SE
RPW1_contig_3997 ------MKQVLALVLCV------SVVMGQSVLEKWEK------LHDVC------QSDPA
RPW1_contig_4661 ------KEVINTCQDEIKIVILSEAL-EA
RPW1_contig_11442 ------ET------TR
RPW1_contig_12010 ------VASSKKHQKNNEVT---PKKAFKEC------QKNAA
RPW1_contig_14025 ------ALVLCTWLLDYVQPAP------PPAFQLPSEEERNR------IALKC------I--DE
RPW1_contig_23691 ------MFKINLFTLLFISIT------TADLVANRKDATLK------PLSAC------CDIPE
RPW1_contig_28119 ------ESQEKLKQ------AHQKC------QSDPA
RPW1_contig_29381 ------RYFQ------AHEQC------QSNPE
RPW1_contig_33721 ------
RPW1_contig_10788 ------YT------MADLSDEQKQKVVG------YGREC------I--AE
RPW1_contig_12481 ------
RPW1_contig_12511 ------LTPEQQEAKLE------SQRHC------L--KE
RPW1_contig_14511 ------MNTLLALCVILASACVVTTAYDFEDAEFNQILADDLEDGLDTLDSTFVHHRVRRAEDTNPSPQNSDEKCKKKRRKPSLCCADDIFEQE
RPW1_contig_16551 ------FHNEC------L--NE
RPW1_contig_1689 ------MTPEQRQRFLT------FQGEC------M--ME
RPW1_contig_17793 ------MQATFTLLVIIGYNAIS------ALTLLPEEKQFGDE------VVKQC------I--TE
RPW1_contig_19755 ------MHNFTIIVILACTFVSALA------VGDLTPEQRQRFFN------FQNEC------M--QE
RPW1_contig_2374 ------YV------SAELSEEQKQKVVS------YGKEC------I--SD
RPW1_contig_257 ------LIFSVCLLVSLLQ------VKCQTDKQKELLAQ------HYKHC------V--EE
RPW1_contig_29 ------MTVILVSIFLVFVANTIA------KVTLPPELQEYVDE------IHSVC------L--SK
RPW1_contig_3199 ------NGLSESLIDEMKEKVQT------FGLEC------A--QQ
RPW1_contig_3213 ------VKAMSDEMKELAQM------LHNTC------V--GE
RPW1_contig_7073 ------MKQFLLIITVIGISSTV------FAELSEAQKQKVDS------YENEC------M--VK
RPW1_contig_8586 ------C------QGIGD
RPW1_contig_9136 ------AETSDERKQKIAA------FTNHC------I--VE
RPW1_contig_981 ------MKSFLLVTVVISLVLYV------SAELSEEQKQKVVS------YGKDC------I--AD
RPW1_contig_9915 ------KMYIFTLIVIFGIGSIAANQQK------LVHLTADKLYQILP------HIMKC------A--DE
RPW_OBP_Unigene_1 ------FLVLVGSVIKL------TDAQRDPQRQKIID------FHAEC------L--DA
RPW_OBP_Unigene_2 ------ADLSDEQKQKVVA------FGKEC------I--AE
RPW_OBP_Unigene_3 ------MKSFLVISSVLCMSIYV------LADLSDEQKQKIIS------YGKEC------I--AE
110 120 130 140 150 160 170 180 190 200
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RPW1_contig_23 TGATEDA----ITN---AR------AGTF--AD--DD---NFKCYFK-CLFDQMA------IMDDEG-IIDVEAMIAVLPDEYQD
RPW1_contig_23127 YDISEEK----LKE---AH------EKKS--SDGIEP------CAIG-CIFKKAS------FINGQG-LFDAEKAKQIGTKYIKG
RPW1_contig_77 VFVDDAI----FEK---LK------RGEK--VQ--LP--ANFGVHAH-CMLEGFG------IQNSQG-AIQQSGVKKAVQESVSD
RPW1_contig_107 TAVDEVL----IEK---LK------DAEF--TE--DQ---KLKCYVQ-CLLVQTG------SMDLAG-HIDIEAAVELIPEQIRN
RPW1_contig_382 LYVDDAI----FAK---LK------KGEK--VDNLPA---NFGAHAF-CMLKNLD------LQDGQG-KIQGAGVQKAVEKSITD
RPW1_contig_446 TKVNPEL----IEK---AD------QGNF--VD--DN---SLKCFTK-CFYQKAG------FVNDEG-EVQLDVVKAKLPPQADK
RPW1_contig_1768 TGATDEM----VLK---AF------AGEL--TD--SP---VFKDHLV-CVGMKDGTESVRWRTHRLTCVQRSSGLCWYEXXX-XXXXXXXXKGIMLFVDD
RPW1_contig_3937 TNVDKAV----VEK---AH------HGEF--EN--DD---KLPFFFL-CMSKKIG------FRDANN-VFQPSSIKEK------
RPW1_contig_3997 TFVDESI----FEK---VK------NNET--VEL-PP---NFGAHVF-CMTVNLN------IQDPNG-KFNKEVTAKLIGEVVKD
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RPW1_contig_29381 TCMDEKE----FRC---IK---RRENGVL------TA---NFTRHAA-CMFKRLG------FLSDEG-QLQKDTMGQVIAWNYKD
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RPW1_contig_10788 TGVEKEL----VSK---AR------QGSF--SD--DP---KLKAFAF-CLSKKIG------LQNASG-DVQADVIKQKLASIVNN
RPW1_contig_12481 ------P---EFKKHLL-CVKKAAG------IVDDRG-NYNKDALRDTISTYVDD
RPW1_contig_12511 TGATEEM----VRN---AF------KGEI--SD--AP---EFKKHLF-CVKKSAG------IVDDSG-NYNKDVLRETVSKYVDD
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RPW1_contig_16551 SNLTTDE----LQE---QK------TQL--SE--RK-----LCYIK-CMALKVG------FLLRDG-TVLINKAREMLPRKIFT
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RPW1_contig_17793 TSISKSI----LEM---HE------IN--DENREKAGSFAL-CISKKVG------YQDDKG-NLQTDDIRKVLTSIIGN
RPW1_contig_19755 TGATDDM----ILK---AF------RGEL--TD--SP---LFKDHLV-CLGLKSG------VVDKEG-NYHKEVLKKEIMMFTDD
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RPW1_contig_7073 TGVARDV----VEK---AQ------QGTL--ID--DP---KLKAFAF-CISKKIG------LQNEKG-EVQIEALKEQLPSLVEN
RPW1_contig_8586 SKIDEEV----FQK---LD------QNEP--VDL-PP---NFGKHML-CMMQGIG------AVTSDG-HISQDGVKTHIRHVVSD
RPW1_contig_9136 TGIDGNI----VQN---AL------QGNI--VE--DP---KLKTFAF-CMTKKAG------LQNANG-DVQIEELKKQLPNLVDN
RPW1_contig_981 TGVDKEI----VQK---AH------QGSF--SD--DP---KLKAFAF-CMSKKIG------LQSESG-DVQTDVLKQKLSSVVDD
RPW1_contig_9915 TNVNFEE----LRY---LG------TDKGD-RG--DR---NVGGFIS-CSFKRTG------YADEMG-NVKVGKFLQLFPIEYQE
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RPW_OBP_Unigene_3 TGVDKEL----VDK---AR------QGSF--SD--DP---KLKAFAF-CLSKKIG------LQNADG-DVQAEVLKEKLSSVVDN
210 220 230 240 250 260 270 280 290 300
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RPW1_contig_23 ------TLPPVIRKCDTKK------GAN--PCENA------WL-THK-CYY------QENPAHYFLI------
RPW1_contig_23127 EEDR---KKYDEIADEC------
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RPW1_contig_3937 ------
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RPW1_contig_3213 EAD------PIIRSCGTKV------GKT--ACENA------WL-THK-CYA------ENFAEYMLI------
RPW1_contig_7073 PEQD------KDLIASCLGD------SKD--PEEIA------FH-TYI-CYY------KANP------
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RPW1_contig_981 PDTV------HNLISACVQK------KDT--PEETA------YQ-TFV-CYH------EKNPKHSPIF------
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RPW_OBP_Unigene_1 ----HNMENIHNIVKKCLIQ------KED--VLSTL------RA-AVQ-CFV------NESHNL------
RPW_OBP_Unigene_2 PDAV------NSLISTCVQS------KGS--PEETA------FH-TFV-CYY------EKTPTHVSIF------
RPW_OBP_Unigene_3 AETV------NSLISACVQN------KGS--PEETA------YQ-TFM-CYY------EKTPTHASIF------