Supplement S1 DNA and protein alignment of Williams 82, Bossier, PI 96354 and PI374170 for four candidate genes on chromosome 10.

ATCG: promoter

ATCG: 5’UTR

ATCG: exon/protein

ATCG: intron

ATCG: 3’UTR

1a. Glyma10g02090_extensin1_DNA alignment

Williams82 TCTTCCAGATCCGAGTCGATTCCTCTGCAAATAGTCACGACGTCACCGCACTCCGCGATC

Bossier TCTTCCAGATCCGAGTCGATTCCTCTGCAAATAGTCACGACGTCACCGCACTCCGCGATC

PI374170 TCTTCCAGATCCGAGTCGATTCCTCTGCAAATAGTCACGACGTCACCGCACTCCGCGATC

PI96354 TCTTCCAGATCCGAGTCGATACCTCTGCAAATAGTCACGACGTCACCGCACTCCGCGATC

Williams82 GCTCAAGACCAACACCATAGGGGGCGCTCTCCCTTCTTTCGAATTGCCCAACTTCACCTA

Bossier GCTCAAGACCAACACCATAGGGGGCGCTCTCCCTTCTTTCGAATTGCCCAACTTCACCTA

PI374170 GCTCAAGACCAACACCATAGGGGGCGCTCTCCCTTCTTTCGAATTGCCCAACTTCACCTA

PI96354 GCTCAAGACCAACACCATAGGGGGCGCTCTCCCTTCTTTCGAATTGCCCAACTTCACCTA

Williams82 TTTTCACACCTTGGTCCGCCAGACCTAGTTTCGTATTGTCCCTTTGTCACTTCTACCTAA

Bossier TTTTCACACCTTGGTCCGCCAGACCTAGTTTCGTATTGTCCCTTTGTCACTTCTACCTAA

PI374170 TTTTCACACCTTGGTCCGCCAGACCTAGTTTCGTATTGTCCCTTTGTCACTTCTACCTAA

PI96354 TTTTCACACCTTGGTCCGCCAGACCTAGTTTCGTATTGTCCCTTTGTCACTTCTACCTAA

Williams82 GGATTAACATGAATAAGTTGAAATGAATTATCTTTGTTAACTAAATCATCAATTTACTCC

Bossier GGATTAACATGAATAAGTTGAAATGAATTATCTTTGTTAACTAAATCATCAATTTACTCC

PI374170 GGATTAACATGAATAAGTTGAAATGAATTATCTTTGTTAACTAAATCATCAATTTACTCC

PI96354 GGATTAACATGAATAAGTTGAAATGAATTATCTTTGTTAACTAAATCATCAATTTACTCC

Williams82 CTGAATATTGTATCTCCATGTTATATTAGTTCCTATAACT-AAAAAAAAAAACTCAAATA

Bossier CTGAATATTGTATCTCCATGTTATATTAGTTCCTATAACT-AAAAAAAAAAACTCAAATA

PI374170 CTGAATATTGTATCTCCATGTTATATTAGTTCCTATAACT-AAAAAAAAAAACTCAAATA

PI96354 CTGAATATTGTATCTCCATGTTATATTAGTTCCTATAACTAAAAAAAAAAAACTCAAATA

Williams82 AGTCTTAAATGGACCAAATAAGCTCACATTGTGAACCAACATTTTATTAACTTTTCCTAA

Bossier AGTCTTAAATGGACCAAATAAGCTCACATTGTGAACCAACATTTTATTAACTTTTCCTAA

PI374170 AGTCTTAAATGGACCAAATAAGCTCACATTGTGAACCAACATTTTATTAACTTTTCCTAA

PI96354 AGTCTTAAATGGACCAAATAAGCTCACATTGTGAACCAACATTTTATTAACTTTTCCTAA

Williams82 CTTGCTTGATCCATGGGACCTGGACCCCATATATATCCCCCTCTAACTACTGGGTATTGA

Bossier CTTGCTTGATCCATGGGACCTGGACCCCATATATATCCCCCTCTAACTACTGGGTATTGA

PI374170 CTTGCTTGATCCATGGGACCTGGACCCCATATATATCCCCCTCTAACTACTGGGTATTGA

PI96354 CTTGCTTGATCCATGGGACCTGGACCCCATATATATCCCCCTCTAACTACGGGGTATTGA

Williams82 TCAAATCAAGTTAAGATTCAAATAAATGACTCTATCATAATTTCATATTAAGTAGAGACA

Bossier TCAAATCAAGTTAAGATTCAAATAAATGACTCTATCATAATTTCATATTAAGTAGAGACA

PI374170 TCAAATCAAGTTAAGATTCAAATAAATGACTCTATCATAATTTCATATTAAGTAGAGACA

PI96354 TCAAATCAAGTTAAGATTCAAATAAATGACTCTATCATAATTTCATATTAAGTAGAGACA

Williams82 AAGATAAGTAAATGGTACAATTTAGTCATTGAAATTGTATCACGCTGCTTATGACATTAG

Bossier AAGATAAGTAAATGGTACAATTTAGTCATTGAAATTGTATCACGCTGCTTATGACATTAG

PI374170 AAGATAAGTAAATGGTACAATTTAGTCATTGAAATTGTATCACGCTGCTTATGACATTAG

PI96354 AAGATAAGTAAATGGTACAATTTAGTCATTGAAATTGTATCACGCTGCTTATGACATTAG

Williams82 TTTCTGAAAAAATTTCGTGCTTTGTACTTGTACTCTACGTTCAAATGGCACTATTGCATG

Bossier TTTCTGAAAAAATTTCGTGCTTTGTACTTGTACTCTACGTTCAAATGGCACTATTGCATG

PI374170 TTTCTGAAAAAATTTCGTGCTTTGTACTTGTACTCTACGTTCAAATGGCACTATTGCATG

PI96354 TTTCTGAAAAAATTTCGTGCTTTGTACTTGTACTCTACGTTCAAATGGCACTATTGCATG

Williams82 ACTTTTAAACAGATACATTGTATTCGGCAAATAAGAAGTCGATGATCGGTCCTACGTTTT

Bossier ACTTTTAAACAGATACATTGTATTCGGCAAATAAGAAGTCGATGATCGGTCCTACGTTTT

PI374170 ACTTTTAAACAGATACATTGTATTCGGCAAATAAGAAGTCGATGATCGGTCCTACGTTTT

PI96354 ACTTTTAAACAGATACATTGTATTCGGCAAATAAGAAGTCGATGATCGGTCCTACGTTTT

Williams82 TTCAAAACATGCTTGCCTAAGAATTATCCATATGCAATCCAATGCGGTATGCAAAATCCC

Bossier TTCAAAACATGCTTGCCTAAGAATTATCCATATGCAATCCAATGCGGTATGCAAAATCCC

PI374170 TTCAAAACATGCTTGCCTAAGAATTATCCATATGCAATCCAATGCGGTATGCAAAATCCC

PI96354 TTCAAAACATGCTTGCCTAAGAATTATCCATATGCAATCCAATGCGGTATGCAAAATCCC

Williams82 AATCGTGCTAATTAACTTGTAATTTTGTAGGAAATTTCATATTTTTAAGTGTATATATAT

Bossier AATCGTGCTAATTAACTTGTAATTTTGTAGGAAATTTCATATTTTTAAGTGTATATATAT

PI374170 AATCGTGCTAATTAACTTGTAATTTTGTAGGAAATTTCATATTTTTAAGTGTATATATAT

PI96354 AATCGTGCTAATTAACTTGTAATTTTGTAGGAAATTTCATATTTTTAAGTGTATATATAT

Williams82 ATTTTCGGAGCAACGTGTTCTCCATTAAATAGGTGACGCAGTCATATATTTTGGTATTTA

Bossier ATTTTCGGAGCAACGTGTTCTCCATTAAATAGGTGACGCAGTCATATATTTTGGTATTTA

PI374170 ATTTTCGGAGCAACGTGTTCTCCATTAAATAGGTGACGCAGTCATATATTTTGGTATTTA

PI96354 ATTTTCGGATCAACGTGTTCTCCATTAAATAGGTGACGCAGTCATATATTTTGGTATTTA

Williams82 AACTTTTCATGTAAGGAAACACTCTGCAAATGAAATCCGATGCCCTGTACAGTATCTATA

Bossier AACTTTTCATGTAAGGAAACACTCTGCAAATGAAATCCGATGCCCTGTACAGTATCTATA

PI374170 AACTTTTCATGTAAGGAAACACTCTGCAAATGAAATCCGATGCCCTGTACAGTATCTATA

PI96354 AACTTTTCATGTAAGGAAACACTCTGCAAATGAAATCTGATGCCCTGTACAGTATCTATA

Williams82 GATGTGAAAATCACGTTCTAGGCCACACAGGACATGTTATTGACCATGAACTTTGTGGCT

Bossier GATGTGAAAATCACGTTCTAGGCCACACAGGACATGTTATTGACCATGAACTTTGTGGCT

PI374170 GATGTGAAAATCACGTTCTAGGCCACACAGGACATGTTATTGACCATGAACTTTGTGGCT

PI96354 GATGTGAAAATCACGTTCTAGGCCACACAGGACATGTTATTGACCATGAACTATGTGGCT

Williams82 TCTAAGTCCTTAACGTGCTACCAACTATCTTGCTGAATCCAATCATTAATATATTCTTAC

Bossier TCTAAGTCCTTAACGTGCTACCAACTATCTTGCTGAATCCAATCATTAATATATTCTTAC

PI374170 TCTAAGTCCTTAACGTGCTACCAACTATCTTGCTGAATCCAATCATTAATATATTCTTAC

PI96354 TCTAAGTCCTTAACGTGCTACCAACTATCTTGCTGAATCCAATCATTAATATATTCTTAC

Williams82 AATTTCCTTAATGCATATGCTTGAGCTCGTTAGAAAATCATTAGGCTAGCTCTATCTATA

Bossier AATTTCCTTAATGCATATGCTTGAGCTCGTTAGAAAATCATTAGGCTAGCTCTATCTATA

PI374170 AATTTCCTTAATGCATATGCTTGAGCTCGTTAGAAAATCATTAGGCTAGCTCTATCTATA

PI96354 AATTTCCTTAATGCATATGCTTGAGCTCGTTAGAAAATCATTAGGCTAGCTCTATCTATA

Williams82 AATACCCAAGGGATTCATGGAATTGGTACCTCATCACTACTTCGAAGCATTTCTATATAC

Bossier AATACCCAAGGGATTCATGGAATTGGTACCTCATCACTACTTCGAAGCATTTCTATATAC

PI374170 AATACCCAAGGGATTCATGGAATTGGTACCTCATCACTACTTCGAAGCATTTCTATATAC

PI96354 AATACCCAAGGGATTCATGGAATTGGTACCTCATCACTACTTCGAAGCATTTCTATATAC

Williams82 TATTACTAAGAAATTTATCAATGGCTTTCCTTCGATCCACCTTGGCGACCTCAATGGTTC

Bossier TATTACTAAGAAATTTATCAATGGCTTTCCTTCGATCCACCTTGGCGACCTCAATGGTTC

PI374170 TATTACTAAGAAATTTATCAATGGCTTTCCTTCGATCCACCTTGGCGACCTCAATGGTTC

PI96354 TATTACTAAGAAATTTATCAATGGCTTTCCTTCGATCCACCTTGGCGACCTCAATGGTTC

Williams82 TTTTAGCAATGCTAGCCATTGTCTCCGCAACTGACTATTATGGATATGGTCCAACACCAA

Bossier TTTTAGCAATGCTAGCCATTGTCTCCGCAACTGACTATTATGGATATGGTCCAACACCAA

PI374170 TTTTAGCAATGCTAGCCATTGTCTCCGCAACTGACTATTATGGATATGGTCCAACACCAA

PI96354 TTTTAGCAATGCTAGCCATTGTCTCCGCAACTGACTATTATGGATATGGTCCAACACCAA

Williams82 AGCTTGAGAACCCCAAACCCAAAACAGATTACAAAGTTGACAAACCACACCCCAGAATAC

Bossier AGCTTGAGAACCCCAAACCCAAAACAGATTACAAAGTTGACAAACCACACCCCAGAATAC

PI374170 AGCTTGAGAACCCCAAACCCAAAACAGATTACAAAGTTGACAAACCACACCCCAGAATAC

PI96354 AGCTTGAGAACCCCAAACCCAAAACAGATTACAAAGTTGACAAACCACACCCCAGAATAC

Williams82 CAGATTACTATGCAGTGCCCAAACCAAAAGGAAACGATGAACTACATCTGCTTCCCACAA

Bossier CAGATTACTATGCAGTGCCCAAACCAAAAGGAAACGATGAACTACATCTGCTTCCCACAA

PI374170 CAGATTACTATGCAGTGCCCAAACCAAAAGGAAACGATGAACTACATCTGCTTCCCACAA

PI96354 CAGATTACTATGCAGTGCCCAAACCAAAAGGAAACGATGAACTACATCTGCTTCCCACAA

Williams82 TCATTGGTGTCCAAGGTGTTGTTTTATGTAAATCGGGTTCCAATTATTTCCCAATTCAAG

Bossier TCATTGGTGTCCAAGGTGTTGTTTTATGTAAATCGGGTTCCAATTATTTCCCAATTCAAG

PI374170 TCATTGGTGTCCAAGGTGTTGTTTTATGTAAATCGGGTTCCAATTATTTCCCAATTCAAG

PI96354 TCATTGGTGTCCAAGGTGTTGTTTTATGTAAATCGGGTTCCAATTATTTCCCAATTCAAG

Williams82 GTAATTTTTTCTTAGATGCAACTCCGACTATGTTTTATTTACAACATTTCTAATCTACGT

Bossier GTAATTTTTTCTTAGATGCAACTCCGACTATGTTTTATTTACAACATTTCTAATCTACGT

PI374170 GTAATTTTTTCTTAGATGCAACTCCGACTATGTTTTATTTACAACATTTCTAATCTACGT

PI96354 GTAATTTTTTCTTAGATGCAACTCCGACTATGTTTTATTTACAACATTTCTAATCTACGT

Williams82 TGTCAATAAATGTTTATTTTCATTTCTTGAAATTGAAATTAATTACTAAATACCAATAAT

Bossier TGTCAATAAATGTTTATTTTCATTTCTTGAAATTGAAATTAATTACTAAATACCAATAAT

PI374170 TGTCAATAAATGTTTATTTTCATTTCTTGAAATTGAAATTAATTACTAAATACCAATAAT

PI96354 TGTCAATAAATGTTTATTTTCATTTCTTGAAATTGAAATTAATTACTAAATACCAATAAT

Williams82 GATTGGCACATATGACTAACACAAGTGGTAATGACTTATATCATTTAACTAATAATTAAG

Bossier GATTGGCACATATGACTAACACAAGTGGTAATGACTTATATCATTTAACTAATAATTAAG

PI374170 GATTGGCACATATGACTAACACAAGTGGTAATGACTTATATCATTTAACTAATAATTAAG

PI96354 GATTGGCACATATGACTAACACAAGTGGTAATGACTTATATCATTTAACTAATAATTAAG

Williams82 TGATATAAAATTTGAATCTTGTAGATTTTAGTTATGAAATAAATAATATTGGAAAAAAAA

Bossier TGATATAAAATTTGAATCTTGTAGATTTTAGTTATGAAATAAATAATATTGGAAAAAAAA

PI374170 TGATATAAAATTTGAATCTTGTAGATTTTAGTTATGAAATAAATAATATTGGAAAAAAAA

PI96354 TGATATAAAATTTGAATCTTGTAGATTTTAGTTATGAAATAAATAATATTGGAAAAAAAA

Williams82 ATACCCACTTATATGGTACACTAGACGGGAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAAGAAACTAAC

Bossier ATACCCACTTATATGGTACACTAGACGGGAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAAGAAACTAAC

PI374170 ATACCCACTTATATGGTACACTAGACGGGAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAAGAAACTAAC

PI96354 ATACCCACTTATATGGTACACTAGACGGGAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAAGAAACTAAC

Williams82 TAATTAATTTATTTATGTAAGTTTTGGACTTTTTTGGGATGCATATTTGTTATTTAATTG

Bossier TAATTAATTTATTTATGTAAGTTTTGGACTTTTTTGGGATGCATATTTGTTATTTAATTG

PI374170 TAATTAATTTATTTATGTAAGTTTTGGACTTTTTTGGGATGCATATTTGTTATTTAATTG

PI96354 TAATTAATTTATTTATGTAAGTTTTGGACTTTTTTGGGATGCATATTTGTTATTTAATTG

Williams82 TATTTACTATGTGTGAGGGGTGCAGGAGCGGTTGCAAGAGTTACATGTGGATGGGAGAAT

Bossier TATTTACTATGTGTGAGGGGTGCAGGAGCGGTTGCAAGAGTTACATGTGGATGGGAGAAT

PI374170 TATTTACTATGTGTGAGGGGTGCAGGAGCGGTTGCAAGAGTTACATGTGGATGGGAGAAT

PI96354 TATTTACTATGTGTGAGGGGTGCAGGAGCGGTTGCAAGAGTTACATGTGGATGGGAGAAT

Williams82 GAGCTTGGGTACGAGACAGGTCCTATATCAGTGTTGAGTCATGTGACAGATAGTAAAGGC

Bossier GAGCTTGGGTACGAGACAGGTCCTATATCAGTGTTGAGTCATGTGACAGATAGTAAAGGC

PI374170 GAGCTTGGGTACGAGACAGGTCCTATATCAGTGTTGAGTCATGTGACAGATAGTAAAGGC

PI96354 GAGCTTGGGTACGAGACAGGTCCTATATCAGTGTTGAGTCATGTGACAGATAGTAAAGGC

Williams82 TATTTCTTTGCTACATTGTCACTTGGGGAGCTTGGATCGAAATTGAAGATCACTGAGTGC

Bossier TATTTCTTTGCTACATTGTCACTTGGGGAGCTTGGATCGAAATTGAAGATCACTGAGTGC

PI374170 TATTTCTTTGCTACATTGTCACTTGGGGAGCTTGGATCGAAATTGAAGATCACTGAGTGC

PI96354 TATTTCTTTGCTACATTGTCACTTGGGGAGCTTGGATCGAAATTGAAGATCACTGAGTGC

Williams82 AAGGCATACTTGGAGAGTTCTCCATTGGAGACATGTAAAGTTCCCACCGATGTCAACTAC

Bossier AAGGCATACTTGGAGAGTTCTCCATTGGAGACATGTAAAGTTCCCACCGATGTCAACTAC

PI374170 AAGGCATACTTGGAGAGTTCTCCATTGGAGACATGTAAAGTTCCCACCGATGTCAACTAC

PI96354 AAGGCATACTTGGAGAGTTCTCCATTGGAGACATGTAAAGTTCCCACCGATGTCAACTAC

Williams82 GGGATCAGTGGTGCTCGTCTTTCTTCTTATCGCCTCCTTGAGAATAAGATGAAGTTGTAC

Bossier GGGATCAGTGGTGCTCGTCTTTCTTCTTATCGCCTCCTTGAGAATAAGATGAAGTTGTAC

PI374170 GGGATCAGTGGTGCTCGTCTTTCTTCTTATCGCCTCCTTGAGAATAAGATGAAGTTGTAC

PI96354 GGGATCAGTGGTGCTCGTCTTTCTTCTTATCGCCTCCTTGAGAATAAGATGAAGTTGTAC

Williams82 ACTGTGGGACCTTTCTTCTGCACCTCCCAACCTGCTAAACCACTCCCTAACGGTTATTAA

Bossier ACTGTGGGACCTTTCTTCTGCACCTCCCAACCTGCTAAACCACTCCCTAACGGTTATTAA

PI374170 ACTGTGGGACCTTTCTTCTGCACCTCCCAACCTGCTAAACCACTCCCTAACGGTTATTAA

PI96354 ACTGTGGGACCTTTCTTCTGCACCTCCCAACCTGCTAAACCACTCCCTAACGGTTATTAA

Williams82 TTAATGAAGCCACCTTCTATATGACGTCCGTTGAAATGGCTGCAAAGTGGAAATCATCAT

Bossier TTAATGAAGCCACCTTCTATATGACGTCCGTTGAAATGGCTGCAAAGTGGAAATCATCAT

PI374170 TTAATGAAGCCACCTTCTATATGACGTCCGTTGAAATGGCTGCAAAGTGGAAATCATCAT

PI96354 TTAATGAAGCCACCTTCTATATGACGTCCGTTGAAATGGCTGCAAAGTGGAAATCATCAT

Williams82 TTTTTTTT--ATATTCAATTTCTATTTTTGTGTTTTTTTTTTTTGTCTGATGTTTTGTTAAG

Bossier TTTTTTTT—-ATATTCAATTTCTATTTTTGTG---TTTTTTTTTGTCTGATGTTTTGTTAAG

PI374170 TTTTTTTTTTATATTCAATTTCTATTTTTGTG--TTTTTTTTTTGTCTGATGTTTTGTTAAG

PI96354 TTTTTTTTT-ATATTCAATTTCTATTTTTGTG--TTTTTTTTTTGTCTGATGTTTTGTTAAG

Williams82 TGTTGGTTTCATATGTAATTCATTGGTAGGGGGAATTGATTAAGCCTCCTTGCCCTTTAA

Bossier TGTTGGTTTCATATGTAATTCATTGGTAGGGGGAATTGATTAAGCCTCCTTGCCCTTTAA

PI374170 TGTTGGTTTCATATGTAATTCATTGGTAGGGGGAATTGATTAAGCCTCCTTGCCCTTTAA

PI96354 TGTTGGTTTCATATGTAATTCATTGGTAGGGGGAATTGATTAAGCCTCCTTGCCCTTTAA

Williams82 GAGATTTATGTTAAGTTTTAATATGTTATGATATTGGTTCCTAAACC

Bossier GAGATTTATGTTAAGTTTTAATATGTTATGATATTGGTTCCTAAACC

PI374170 GAGATTTATGTTAAGTTTTAATATGTTATGATATTGGTTCCTAAACC

PI96354 GAGATTTATGTTAAGTTTTAATATGTTATGATATTGGTTCCTAAACC

1b.Glyma10g02090_extensin1_Protein alignment

Williams82 MRDSWNWYLITTSKHFYILLLRNLSMAFLRSTLATSMVLLAMLAIVSATDYYGYGPTPKL

PI96354 MRDSWNWYLITTSKHFYILLLRNLSMAFLRSTLATSMVLLAMLAIVSATDYYGYGPTPKL

Bossier MRDSWNWYLITTSKHFYILLLRNLSMAFLRSTLATSMVLLAMLAIVSATDYYGYGPTPKL

Williams82 ENPKPKTDYKVDKPHPRIPDYYAVPKPKGNDELHLLPTIIGVQGVVLCKSGSNYFPIQGA

PI96354 ENPKPKTDYKVDKPHPRIPDYYAVPKPKGNDELHLLPTIIGVQGVVLCKSGSNYFPIQGA

Bossier ENPKPKTDYKVDKPHPRIPDYYAVPKPKGNDELHLLPTIIGVQGVVLCKSGSNYFPIQGA

Williams82 VARVTCGWENELGYETGPISVLSHVTDSKGYFFATLSLGELGSKLKITECKAYLESSPLE

PI96354 VARVTCGWENELGYETGPISVLSHVTDSKGYFFATLSLGELGSKLKITECKAYLESSPLE

Bossier VARVTCGWENELGYETGPISVLSHVTDSKGYFFATLSLGELGSKLKITECKAYLESSPLE

Williams82 TCKVPTDVNYGISGARLSSYRLLENKMKLYTVGPFFCTSQPAKPLPNGY

PI96354 TCKVPTDVNYGISGARLSSYRLLENKMKLYTVGPFFCTSQPAKPLPNGY

Bossier TCKVPTDVNYGISGARLSSYRLLENKMKLYTVGPFFCTSQPAKPLPNGY

2a.Glyma10g02100_extensin2_DNA alignment

Williams82 TAAATGTAAGATAGAATTAGCTAGCAATGTTATAGATTAAAAAAAGGGAAAAATACAGCG

Bossier TAAATGTAAGATAGAATTAGCTAGCAATGTTATAGATTAAAAAAAGGGAAAAATACAGCG

PI374170 TAAATGTAAGATAGAATTAGCTAGCAATGTTATAGATTAAAAAAAGGGAAAAATACAGCG

PI96354 TAAATGTAAGATAGAATTAGCTAGCAATGTTATAGATTAAAAAAAGGGAAAAATACAGCG

Williams82 GTATTGTTTAAAATGCAAAATAGGGAGAGAAAAAAAAAACATTCTTCATCACTCTATAAC

Bossier GTATTGTTTAAAATGCAAAATAGGGAGAGAAAAAAAAAACATTCTTCATCACTCTATAAC

PI374170 GTATTGTTTAAAATGCAAAATAGGGAGAGAAAAAAAAAACATTCTTCATCACTCTATAAC

PI96354 GTATTTTTTAAAATGCAAAATAGGGAGAGAAAAAAAAAACATTCTTCATCACTCTATAAC

Williams82 CCATGTAGATATTAATTAAGTTGTCCGTGGACTAATAATAATGTAATCCAATAATATATG

Bossier CCATGTAGATATTAATTAAGTTGTCCGTGGACTAATAATAATGTAATCCAATAATATATG

PI374170 CCATGTAGATATTAATTAAGTTGTCCGTGGACTAATAATAATGTAATCCAATAATATATG

PI96354 CCATGCAGATATTAATTAAGTTGTCCGTGGACTAATAATAATGTAATCCAATAATATATG

Williams82 CATGTTTTATACATGCATTTTAGGTCGTGCATCCAAGTCACATCCTACTTCCTATATTAA

Bossier CATGTTTTATACATGCATTTTAGGTCGTGCATCCAAGTCACATCCTACTTCCTATATTAA

PI374170 CATGTTTTATACATGCATTTTAGGTCGTGCATCCAAGTCACATCCTACTTCCTATATTAA

PI96354 CATGTTTTATACATGCATTTTAGGTCGTGCATCCAAGTCACATCCTACTTCCTATATTAA

Williams82 TTGGGACAAAACGTTGAAAATTCCCGACATATGCCTACATGCTATATAAATATATTATAT

Bossier TTGGGACAAAACGTTGAAAATTCCCGACATATGCCTACATGCTATATAAATATATTATAT

PI374170 TTGGGACAAAACGTTGAAAATTCCCGACATATGCCTACATGCTATATAAATATATTATAT

PI96354 TTGGGACAAAACGTTGAAAATTCCCGACATATGCCTACATGCTATATAAATATATTATAT

Williams82 CACAGCACAGCACATGAAAAAACTCGATACGTGATGGCTAACGTGATAGGCAAATACTTA

Bossier CACAGCACAGCACATGAAAAAACTCGATACGTGATGGCTAACGTGATAGGCAAATACTTA

PI374170 CACAGCACAGCACATGAAAAAACTCGATACGTGATGGCTAACGTGATAGGCAAATACTTA

PI96354 CACAGCACAGCACATGAAAAAACTCGATACGTGATGGCTAACGTGATAGGCAAATACTTA

Williams82 AGAAAGGAATAAAAAAATGAAGGAATTAATTAAAAGAAAGATGCAAAAAACCTAAAGTTG

Bossier AGAAAGGAATAAAAAAATGAAGGAATTAATTAAAAGAAAGATGCAAAAAACCTAAAGTTG

PI374170 AGAAAGGAATAAAAAAATGAAGGAATTAATTAAAAGAAAGATGCAAAAAACCTAAAGTTG

PI96354 AGAAAGGAATAAAAAAATGAAGGAATTAATTAAAAGAAAGATGCAAAAAACCTAAAGTTG

Williams82 CATGCTATATATAAGGTCATCTGTTCTCTTCTCTTTATTTTGTAAACTTAATCTGTTTTC

Bossier CATGCTATATATAAGGTCATCTGTTCTCTTCTCTTTATTTTGTAAACTTAATCTGTTTTC

PI374170 CATGCTATATATAAGGTCATCTGTTCTCTTCTCTTTATTTTGTAAACTTAATCTGTTTTC

PI96354 CATGCTATATATAAGGTCATCTGTTCTCTTCTCTTTATTTTGTAAACTTAATCTGTTTTC

Williams82 AACAATAGAAGGACATATGAAAATGGCCTATTTCCATAGTACCTGCTTTCTGGTTTTTAT

Bossier AACAATAGAAGGACATATGAAAATGGCCTATTTCCATAGTACCTGCTTTCTGGTTTTTAT

PI374170 AACAATAGAAGGACATATGAAAATGGCCTATTTCCATAGTACCTGCTTTCTGGTTTTTAT

PI96354 AACAATAGAAGGACATATGAAAATGGCCTATTTCCATAGTACCTGCTTTCTGGTTTTTAT

Williams82 GCTTATCGCATCACTGTTGGTCCCCGGCAGAGGCGGTGACTACGGTCCCGAAGAAGAAAA

Bossier GCTTATCGCATCACTGTTGGTCCCCGGCAGAGGCGGTGACTACGGTCCCGAAGAAGAAAA

PI374170 GCTTATCGCATCACTGTTGGTCCCCGGCAGAGGCGGTGACTACGGTCCCGAAGAAGAAAA

PI96354 GCTTATCGTATCACTGTTGGTCCCCGGCAGAGGCGGTGACTACGGTCCCGAAGAAGAAAA

Williams82 ACTTCTATCAAAAACTATAGGCATTCAAGGCATTGTCTATTGCAAATCTGCCTCTAAACT

Bossier ACTTCTATCAAAAACTATAGGCATTCAAGGCATTGTCTATTGCAAATCTGCCTCTAAACT

PI374170 ACTTCTATCAAAAACTATAGGCATTCAAGGCATTGTCTATTGCAAATCTGCCTCTAAACT

PI96354 ACTTCTATCAAAAACTATAGGCATTCAAGGCATTGTCTATTGCAAATCTGCCTCTAAACT

Williams82 CACCCCACTTGAAGGTAATTAATTAATTTTAAAACTAAATTAATATAGTGTGCTATGCTA

Bossier CACCCCACTTGAAGGTAATTAATTAATTTTAAAACTAAATTAATATAGTGTGCTATGCTA

PI374170 CACCCCACTTGAAGGTAATTAATTAATTTTAAAACTAAATTAATATAGTGTGCTATGCTA

PI96354 CACCCCACTTGAAGGTAATTAATTAATTTTAAAACTAAATTAATATAGTGTGCTATGCTA

Williams82 TATAAACATGCTAAACTAACAATATATGCATTATTGAATATGTTACTTGTTACATATATG

Bossier TATAAACATGCTAAACTAACAATATATGCATTATTGAATATGTTACTTGTTACATATATG

PI374170 TATAAACATGCTAAACTAACAATATATGCATTATTGAATATGTTACTTGTTACATATATG

PI96354 TATAAACATGCTAAACTAACAATATATGCATTATTGAATATGTTACTTGTTACATATATG

Williams82 TTTATAGGGGCCTTGACAAGGATAGCATGCGAGGCTGTTGATGAATATGGGTTTGAAACG

Bossier TTTATAGGGGCCTTGACAAGGATAGCATGCGAGGCTGTTGATGAATATGGGTTTGAAACG

PI374170 TTTATAGGGGCCTTGACAAGGATAGCATGCGAGGCTGTTGATGAATATGGGTTTGAAACG

PI96354 TTTATAGGGGCCTTGACAAGGATATCATGCGAGGCTGTTGATGAATATGGGTTTGAAACG

Williams82 ACACCGTTTTCTTTCTTAAGTGAGGCAACCGACTCGAAAGGCTACTTCCTTGCAACTTTG

Bossier ACACCGTTTTCTTTCTTAAGTGAGGCAACCGACTCGAAAGGCTACTTCCTTGCAACTTTG

PI374170 ACACCGTTTTCTTTCTTAAGTGAGGCAACCGACTCGAAAGGCTACTTCCTTGCAACTTTG

PI96354 ACACCGTTTTCTTTCTTAAGTGAGGCAACCGACTCGAAAGGCTACTTCCTTGCAACTTTG

Williams82 AGTCCACAAGAGGTCGAAGGAAAAGGGGTGCTCAAGGAGTGTAGGGCTTTTCTTGACGCC

Bossier AGTCCACAAGAGGTCGAAGGAAAAGGGGTGCTCAAGGAGTGTAGGGCTTTTCTTGACGCC

PI374170 AGTCCACAAGAGGTCGAAGGAAAAGGGGTGCTCAAGGAGTGTAGGGCTTTTCTTGACGCC

PI96354 AGTCCACAAGAGGTCGAAGGAAAAGGGGTGCTCAAGGAGTGTAGGGCTTTTCTTGACGCC

Williams82 TCTCCTTTGAACAATTGCAGTTATCCCACAGATGTTAACAAAGGGATTAGTGGTGCTGTG

Bossier TCTCCTTTGAACAATTGCAGTTATCCCACAGATGTTAACAAAGGGATTAGTGGTGCTGTG

PI374170 TCTCCTTTGAACAATTGCAGTTATCCCACAGATGTTAACAAAGGGATTAGTGGTGCTGTG

PI96354 TCTCCTTTGAACAATTGCAGTTATCCCACAGATGTTAACAAAGGGATTAGTGGTGCTGTG

Williams82 CTTCGTTTTCATCGCTTCCTCCATGACAAGAAGATGAAATTATACACCGTGGGGCCTTTT

Bossier CTTCGTTTTCATCGCTTCCTCCATGACAAGAAGATGAAATTATACACCGTGGGGCCTTTT

PI374170 CTTCGTTTTCATCGCTTCCTCCATGACAAGAAGATGAAATTATACACCGTGGGGCCTTTT

PI96354 CTTCGTTTTCATCGCTTCCTCCATGACAAGAAGATGAAATTATACACCGTGGGGCCTTTT

Williams82 CAATTCACCGCATCACCGACACCAATCTCTGATGGATATTAATTTTTT--TTTTTTCCAT

Bossier CAATTCACCGCATCACCGACACCAATCTCTGATGGATATTAATTTTTT--TTTTTTCCAT

PI374170 CTATTCACCGCATCACCGACACCAATCTCTGATGGATATTAATTTTTT--TTTTTTCCAT

PI96354 CTATTCACCGCATCACCGACACCAATCTCTGATGGATATTAATTTATTTATTTTTTCCAT

Williams82 ATAAAACCTTATCATGACTCTTTAAGGGGGAGTTGATCAAGTTGCAAGATTAGTATGAAA

Bossier ATAAAACCTTATCATGACTCTTTAAGGGGGAGTTGATCAAGTTGCAAGATTAGTATGAAA

PI374170 ATAAAACCTTATCATGACTCTTTAAGGGGGAGTTGATCAAGTTGCAAGATTAGTATGAAA

PI96354 ATAAAACCTTATCATGACTCTTTAAGGGGGAGTTGATCAAGTTGCAAGATTAGTATGAAA

Williams82 TTTCATGGACGAAAAAGAAGTATCAAAAAGAGTGTATTGGTATTCAAATCTTTTGGTTTA

Bossier TTTCATGGACGAAAAAGAAGTATCAAAAAGAGTGTATTGGTATTCAAATCTTTTGGTTTA

PI374170 TTTCATGGACGAAAAAGAAGTATCAAAAAGAGTGTATTGGTATTCAAATCTTTTGGTTTA

PI96354 TTTCATGGACGAAAAAGAAGTATCAAAAAGAGTGTATTGGTATTCAAATCTTTTGGTTTA

Williams82 TCTTGTATATGAAACCAACAATCTCCCAAAATTAAATTGACTTGTCTTGCAATCAAGGTT

Bossier TCTTGTATATGAAACCAACAATCTCCCAAAATTAAATTGACTTGTCTTGCAATCAAGGTT

PI374170 TCTTGTATATGAAATCAACAATCTCCCAAAATTAAATTGACTTGTCTTGCAATCAAGGTT

PI96354 TCTTGTATATGAAATCAACAATCTCCCAAAATTAAATTGACTTGTCTTG-AATCAAGATT

Williams82 ATC

Bossier ATC

PI374170 ATC

PI96354 ATC

2b.Glyma10g02100_extensin2_Protein alignment

Williams82 MKMAYFHSTCFLVFMLIASLLVPGRGGDYGPEEEKLLSKTIGIQGIVYCKSASKLTPLEG

Bossier MKMAYFHSTCFLVFMLIASLLVPGRGGDYGPEEEKLLSKTIGIQGIVYCKSASKLTPLEG

PI96354 MKMAYFHSTCFLVFMLIVSLLVPGRGGDYGPEEEKLLSKTIGIQGIVYCKSASKLTPLEG

Williams82 ALTRIACEAVDEYGFETTPFSFLSEATDSKGYFLATLSPQEVEGKGVLKECRAFLDASPL

Bossier ALTRIACEAVDEYGFETTPFSFLSEATDSKGYFLATLSPQEVEGKGVLKECRAFLDASPL

PI96354 ALTRISCEAVDEYGFETTPFSFLSEATDSKGYFLATLSPQEVEGKGVLKECRAFLDASPL

Williams82 NNCSYPTDVNKGISGAVLRFHRFLHDKKMKLYTVGPFQFTASPTPISDGY

Bossier NNCSYPTDVNKGISGAVLRFHRFLHDKKMKLYTVGPFQFTASPTPISDGY

PI96354 NNCSYPTDVNKGISGAVLRFHRFLHDKKMKLYTVGPFLFTASPTPISDGY

3a.Glyma10g02140_Pectinesterase1_DNA alignment (in this gene, sequence of Bossier is 100% similar to that of Williams 82, therefore, only sequence of Bossier is presented)

PI96354 TAAAGCTAGCTCATTTTTTTTTCAAAAAA------

Bossier TAAAGCTAGCTCATTTTTTTTTCAAAAAATAAAAATAAAAATAAAAAAATAAAAAATAAA

PI96354 ------ATATATATATATATATATATATATATATATATATAGTTTCACAGTGTCAA

Bossier ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGTTTCACAGTGTCAA

PI96354 CGTGAAACACCCCACTCCATGTTACAATCCAACCACTCTATTTATCCACAGCACGTACCC

Bossier CGTGAAACACCCCACTCCATGTTACAATCCAACCACTCTATTTATCCACAGCACGTACCC

PI96354 TGCTAGCTAGTTACACATACACAGTAATCCTAACCCACCTCCTAAGTCCTATCACATCAT

Bossier TGCTAGCTAGTTACACATACACAGTAATCCTAACCCACCTCCTAAGTCCTATCACATCAT

PI96354 GAACAACCTCACACTTGCATCCATTCTGACCGTGATTTCTTCTCTACTATTCTTTGGAAC

Bossier GAACAACCTCACACTTGCATCCATTCTGACCGTGATTTCTTCTCTACTATTCTTTGGAAC

PI96354 AACTCATTTAACCAACACCCAAACAACAAGAGTCCCAGATCAAAAACATAAACACCTCCA

Bossier AACTCATTTAACCAACACCCAAACAACAAGAGTCCCAGATCAAAAACATAAACACCTCCA

PI96354 TTTCCAAAAGCATATACAAGTAGTAGCCCAATCCACATGCGAAGGAACACTCTACCCAGA

Bossier TTTCCAAAAGCACATACAAGTAGTAGCCCAATCCACATGCGAAGGAACACTCTACCCAGA

PI96354 CCTATGTGTCTTAACACTAGCCACATTCCCAGATCTCACAACAAAATCTGTCCCACAAGT

Bossier CCTATGTGTCTTAACACTAGCCACATTCCCAGATCTCACAACAAAATCTGTCCCACAAGT

PI96354 GATATCCTCAGTGGTCAACCATACCATGTACGAGATAAGATCAACGTCCTACAACTGCAG

Bossier GATATCCTCAGTGGTCAACCATACCATGTACGAGGTAAGATCAACGTCCTACAACTGCAG

PI96354 CGGCCTCAAAAAGATGCTCAAAAACCTCAACCCACTCGACCAGAGAGCCCTCGACTACTG

Bossier CGGCCTCAAAAAGATGCTCAAAAACCTCAACCCACTCGACCAGAGAGCCCTCGACGACTG

PI96354 TCTCAAACTGTTTGAAGACACCAGCGTCGAGCTCAAAGCCACCATCGACGATCTCTCCAT

Bossier TCTCAAACTGTTTGAAGACACCAGCGTCGAGCTCAAAGCCACCATCGACGATCTCTCCAT

PI96354 CAAGAGCACCATAGGGTCGAAACGGCATCATGACTTGCAGACTCTGCTGAGTGGAGCAAT

Bossier CAAGAGCACCATAGGGTCTAAACTGCACCATGACTTGCAGACTCTGCTGAGTGGAGCAAT

PI96354 GACCAACTTGTACACGTACCTCGATGGCTTTGCGTACAGCAAAGGGCGCGTGGGGGACAG

Bossier GACCAACTTGTACACGTGCCTCGATGGCTTTGCGTACAGCAAAGGGCGCGTGGGGGACAG

PI96354 AATCGAGAAGAAGCTGCTTCAAATATCGCATCACGTGAGCAACTCGTTGGCCATGCTGAA

Bossier AATCGAGAAGAAGCTGCTTCAAATATCGCATCACGTGAGCAACTCGTTGGCCATGCTGAA

PI96354 CAAAGTGCCTGGAGTTGAGAAATTAACAACTTCTTCGGATTCTGATGAGGTGTTTCCAGA

Bossier CAAAGTGCCTGGAGTTGAGAAATTAACAACTTCTTCGGAATCTGATGAGGTGTTTCCAGA

PI96354 ATATGGAAAGATGCAAAAGGGGTTCCCTTCGTGGGTGTCCTCCAAAGACCGAAAGCTTCT

Bossier ATATGGAAAGATGCAAAAGGGGTTCCCTTCGTGGGTGTCCTCTAAAGACCGAAAGCTTCT

PI96354 TTAAGCTAAAGTGAATGAGACCAAGTTCAATCTTGTTGTTGCCAAAGATGGCACTGGCAA

Bossier TCAAGCTAAAGTGAATGAGACCAAGTTCAATCTTGTTGTTGCCAAAGATGGCACTGGCAA

PI96354 CTTCACCACTATAGGGGAAGCACTGTCTGTGGCTCCCAACTCAAGCACAACTAGGTACAT

Bossier CTTCACCACTATAGGGGAAGCACTGTCTGTGGCTCCCAACTCAAGCACAACTAGGTACAT

PI96354 AACAAAATACTTTATTTCAGACCAATGTGATTGATTATAATTTACTCTAGTATAAATGAA

Bossier AACAAAATACTTTATTTCAGACCAATGTGATTGATTATAATTTACACTAGTATAAATGAA

PI96354 TTACATAGTAAAAACGTAGTACCAATGGGATACAAATTAAGAGAAAAGAGAAAGGTGTTA

Bossier TTACATAGTAAAAACGTAGTACCAATGGGATACAAATTAAGAGAAAAGAGAAAGGTGTTA

PI96354 GTAGAGTGTCAATTTTTTTTTTAAAGATTTTTAATAATGCCATGTATTCAATTGGAAATG

Bossier GTAGAGTGTCAATTTTTTTTT-AAAGATTTTTAATAATGCCATGTATTCAATTGGAAATG

PI96354 TATACACTATATACAGTGTTTTTTTTTTTTTTTTATGTATAAGTGAAAAGAATAAATATT

Bossier TATACACTATATACAGTGAGCTTTTTTTTTTTTTATGTATAAGTGAAAAGAATAAATATT

PI96354 AAGCATTAGTCAAAATAAAATACAGAAGTCATATGAGTTATTTAAAAATCACGTTAAGAA

Bossier AAGCATTAGTCAAAATAAAATACAGAAGTCATATGAGTTATTTAAAAATCACGTTAAGAA

PI96354 ACTCATTCTCACATTATATCTATGTATAATTATATATGACTTAGATGTACTGTTTTCAAT

Bossier ACTCATTCTCACATTATATCTATGTATAATTATATATGACTTAGATGTACTGTTTTCAAT

PI96354 CCGATGTAAGAAACTCATTCTTACATTATACCTCTCCTATTTGATTGTAAGAAATATTTC

Bossier CTGATGTAAGAAACTCATTCTTACATTATACCTCTCCTATTTGATTGTAAGAAATATTTC

PI96354 TTCATTGGGTTGTAAAATTAAATGAGTGTAAGTGATAACAGGTTTGTGATACACGTAACG

Bossier TTCATTGGGTTGTAAAATTAAATGAGTGTAAGTGATAACAGGTTTGTGATACACGTAACG

PI96354 GCGGGGGCATACTTCGAGAATGTGGAAGTGATAAGGAAGAAGACGAATCTAATGTTTGTT

Bossier GCGGGGGCATACTTCGAGAATGTGGAAGTGATAAGGAAGAAGACGAATCTAATGTTTGTT

PI96354 GGAGACGGTATTGGAAAGACAGTAGTGAAAGGCAGTAGGAATGTTGAGGACGGGTGGACA

Bossier GGAGACGGTATTGGAAAGACAGTAGTGAAAGGCAGTAGGAATGTTGAGGACGGGTGGACC

PI96354 ATTTTTCAATCTGCTACTGTTGGTAAG------

Bossier ATTTTTCAATCTGCTACTGTTGGTAAGTATTAAATTTAGAGTGCAGCAATGCATTCGGAA

PI96354 ------

Bossier GGTCCCCTTAAAAATCGGTTCGTCAGCATTCATCGGGCAGAATATGGCTCTGATACCATA

PI96354 ------

Bossier TTAAATTTATAGTGTAGCAAAGACATTCGAAAAATTCCCTTAAAAACCGGTTTATAAGGG

PI96354 ------

Bossier GTGGCCTACCGAACTATATAAGTACTTATCAAAATTTGCTAAACATCCAATGTAGGACTA

PI96354 ------TATGTCTTTCTTCTTCCCACCTTCTGCTACTATTTTTAATTAGTTA

Bossier TTTTCAACAGTAAATATGTCTTTCTTCTTCCCACCTTCTGCTACTATTTTTAATTAGTTA

PI96354 TGTTTTTTTCTTGGTTTGATATTCCAACTTTGAAAAATAAAAATAGGTATGATATATAGA

Bossier TGTTTTTTTCTTGGTTTGATATTCCAACTTTGAAAAATAAAAATAGGTATGATATATAGA

PI96354 ATGGTCATAAGTGAGATTTGATTAGTAGCTCGGTCACTTAATAAAGTTTTATAAATGCTC

Bossier ATGGTCATAAGTGAGATTTGATTAGTAGCTCGGTCACTTAATAAAGTTTTATAAATGCTC

PI96354 TACTTTGAGGCTGGCGTTGTGATTGTTAAGTCAAAGAC--AGAAAAAAAATCATTAGAAA

Bossier TACTTTGAGGCTGGCGTTGTGATTGTTAAGTCAAAGACAGAGAAAAAAAATCATTAGAAA

PI96354 AAGTTAGAACAAGACAACGAAAATGGCAACTTGATGCACAGCCCACATGTTGGTTTAAAA

Bossier AAGTTAGAACAAGACAACGAAAATGGCAACTTGATGCACAGCCCACATGTTGGTTTAAAA

PI96354 ATTATTAATAAACTAATTTTGCTAGGTGATTTTGTAGTTAAAATACATAATGTAGATGTG

Bossier ATTATTAATAAACTAATTTTGCTAGGTGATTTTGTAGTTAAAATACATAAAGTAGATGTG

PI96354 GGAAGATCATTTTAAATGGTTTGGACAGACACGGACT-CTTGGGTTTGTCAAGACATCGT

Bossier GGAAGATCATTTTAAATGGTTTGGACAGACATGGACTACTTGGGTTTGTCAAGACATCGT

PI96354 GCAGTTCCTGCATTGCATTGAAAAATAGTGTTGTAGAGGTTGATGCATGTAATTAT-TTT

Bossier GCAGTTCCTGCATTGCATTGAAAAATAGCGTTGTAGAGGTTGATGCATGTAATTATCTTT

PI96354 TTTTTTGTTTTGTGTGTGTACACTAGTAAAATCCTACCTCTGGTGAGAATAAGCACAACT

Bossier TGTTTTGTTTTGTGTGTGTACACTAGTAAAATCCTACCTCTTGTGAGAATAAGCACAACT

PI96354 TAGTTTTGAATGTTTGGAATAAAACCAAGGAAAGTTCAAAAGATAAAAGGCTTTGCCATT

Bossier TAGTTTTGAATGTTTGGAATAAAACCAAGGAAAGTTCAAAAGATAAAAGGCTTTGTCATT

PI96354 TT------AAGATAGGTG

Bossier TTAAAATTTTTGAGGATTCTGCTTTCCGTGATTGAACATAATGCTGAAAAAAGATAGGTG

PI96354 ATGAGTGCATGTATATATGTTTAAAGACTATTTTCAAAGGCATCACTGCAAATTTAAACT

Bossier ATGAGTGCATGTATATATGTTTAAAGACTATTTTCAAAGGCATCACTGCAAATTTAAACT

PI96354 ACCCCAGCTATCAATGACGTATGCATGAAATATAAATAGTGTCAAAGTGATGCTAGTATT

Bossier ACCCCAGCTATCAATGACGTATGCATGAAATATAAATAGTGTCAAAGTGATGCTAGTATT

PI96354 ATTGGTTACAATGCTGACTAGCTAGATTCCAAAATGCTTGTTTTTTTTTTTT-ATCATTG

Bossier ATTGGTTACAATGCTGACTAGCTAGATTCCAAAATGCTTGTTTTTTTTTTGTGATCATTG

PI96354 CCCGTTGTCAACTATTCCTGTTATGGGAATAAATTTTGAGGACTCTAATTTTGTGTTTTC

Bossier CCCGTCGTCAACTATTCCTGTTATGGGAATAAATTTTGAAGACTCTAATTTTGTGTTTTC

PI96354 AGTGTTCTGTTTGGTTTTTCCAGTTATATTGCAATCCAGTAATATCAATTGGACTTCTCC

Bossier AGTGTTCTGTTTGGTTTTTCCAGTTATATTGCAATCCAGTAATATCAATTGGACTTCTCC

PI96354 ATCAGACAACGGGTCTCAATCACAATGACATTAGCAAATATGTATTGTAAATAAATCAAA

Bossier ATCAGACAACGGGTCTCAATCACAATGACATTAGCAAATATGTATTGTAAATAAATCAAA

PI96354 TTTCTTATTTCTTGTTAAAGGTAGCAGTAATAAACCTAGATTTGGGATCTCCTGCCCGAA

Bossier TTTCTTATTTCTTGTTAAAGGTAGCAGTAATAAACCTAGATTTGGGATCTCCTGCCCGAA

PI96354 AGCATGTTTTCTTTATTAATATTTTCCGAGCTATGAGTGGTGACACCATTTTTTGGAAAG

Bossier AGCATGTTTTCTTTATTAATATTTTCCGAGCTATGAGTGGTGACACCATTTTTTGGAAAG

PI96354 AAAATGACGTGAGTAATCTTGGTGAAAGATAGAAAAAGAACAGAGAAAAAAAACATAACC

Bossier AAAATGACGTGAGTAATCTTGGTGAAAGATAGAAAAAGAACAGAGAAAAAAAACATAACC

PI96354 GGTGTGGTCTAATGAGAAGAAATAAAAATAGAATTGGAAACTCTTTTATAAGACAAAAAA

Bossier GGTGTGGTCTAATGAGAAGAAATAAAAATAGAATTGGAAACTCTTTTATAAGACAAAAAA

PI96354 AAAAAAAAATACATGCAGGCAGGCAGAGGAGGTAGGACTATCTCTGGCCTTAGATACATG

Bossier AAAAAAAAATACATGCAGGCAG------AGGTAGGACTATCTTTGGCCTTAGATACATG

PI96354 ATAATTTTATTTATATTTTCGCGAAAAGTAGAGTTACCTCTATGGTTGGTCAAAGTAAAG

Bossier ATAATTTTATTTATATTTTCGCGAAAAGTAGAGTTACCTCTATGGTTGGTCAAAGTAAAG

PI96354 GGTCCACATGCCTATCCACGCCCACCTAAAGATCTGCATAATTCTCATCACAACCAAACT

Bossier GGTCCACATGCCTATCCACGCCCACCTAAAGATCTGCATAATTCTCATCACAACCAAACT

PI96354 ACTTTTTCAGTGCCATTAGGTCCACTTTGCTTGTTTTTTCTTCTATGCTTCCCCTTTTAC

Bossier ACTTTTTCAGTGCCATTAGGTCCACTTTGCTTGTTTTTTCTTCTATGCTTCCCCTTTTAC

PI96354 TTTTCTGCTTTTGCTTTTAACAAATAAAAATGCTTTAATTTCCTCTTTTGGGATAACATG

Bossier TTTTCTGCTTTTGCTCTTAACAAATAAAAATGCTTTAATTTCCTCTTTTGGGATAACATG

PI96354 GATAAAAGAAAGTGAATTTTATGATCT---TTATTATTCATGTGACAAATAATGTGCAGT

Bossier GATAAAAGAAAGTGAATTTTATGATCTTTATTATTATTCATGTGACAAATAATGTGCAGT

PI96354 ACAAAGTTAACAGACTTTTAGTTTTCTTTCTTCGTTTCAATGATACCTTTATGTTGAGTT

Bossier ACAAAGTTAACAGACTTTTAGTTCTCTTTCTTCGTTTCAATGATACCTTTATGTTGAGTT

PI96354 TGTGTCTCTCAGCAAAGTTTGCTCTTTATTGTTCATTTATGAATAATGATCCAAAATCTA

Bossier TGTGTCTCCCAGCAAAGTTTGCTCTTTATTGTTCATTTATGAATAATGATCCAAAATCTA

PI96354 ATCCTAACAGCGTTGACAATAATGGTATGTTGCAACTATTCAGTTGTAACTCAGTTGGCA

Bossier ATCCTAACAGCGTTGACAATAATGGTATGTTGCAACTATTCAGTTGTAACTCAGTTGGCA

PI96354 ACAGATCTTAAGTTTATGGAAAAAAAATCTGTGTTCAATCCTTACAAGAAAAAGGATGAA

Bossier ACACATCTTAAGTTTATGAAAAAAAGATCTGTGTTCAATCCTTACAAGAAAAAGGATGAA

PI96354 TAATTTAAAATGTAATTAAGTCTCGAACAGAATGATTATGATTGTTGTTAATAAAAGAAA

Bossier TAATTTTAAATGTAATTAAGTCTCGAACAGAATGATTATGATTGTTGTTAATAAAGGAAA

PI96354 ATGGTATGTTGCAGCTGTTGTAGGAGCAGGATTCATAGCAAAGGGTATAACATTTGAGAA

Bossier ATGGTATGTTGCAGCTGTTGTAGGAGCAGGATTCATAGCAAAGGGTATAACATTTGAGAA

PI96354 GTCAGCAGGACCCGACAAACACCAAGCTGTGGCACTGAGAAGTGGTGTGCTGACTTCTCA

Bossier GTCAGCAGGACCCGACAAACACCAAGCTGTGGCACTGAGAAGTGGTGTGCTGACTTCTCA

PI96354 GCTTTCTACCAATGCAGTTTCGTTGGCTACCAGGACACTCTCTACGTCCATTCCCTGCGT

Bossier GCTTTCTACCAATGCAGTTTCGTTGGCTACCAGGACACTCTCTACGTCCATTCCCTGCGC

PI96354 TAATTCTACCGTGAACGTGACATTTATGGCACTGTAGACTTCATTTTCGGCAATGCAGCT

Bossier CAATTCTACCGTGAACGTGACATTTATGGCACTGTAGACTTCATTTTCGGCAATGCAGCT

PI96354 GTGGTATTCCAAAACTGCAACTTATACGCACGCAAGCCAAACGAAAATCAGAAGAACTTG

Bossier GTGGTATTCCAAAACTGCAACTTATACGCACGCAAGCCAAACGAAAATCAGAAGAACTTG

PI96354 TTCATGGCACAAGGCAGAGAGGACCCTAACCAAAACACTGGCATATCCATCTTGAACTGC

Bossier TTCATGGCACAAGGCAGAGAGGACCCTAACCAAAACACTGGCATATCCATCTTGAACTGC

PI96354 AAGATTGCAGCTGCTGCAGATTTGATCCCTGTGAAATCCTCGTTCAAGAGCTACCTAGGA

Bossier AAGATTGCAGCTGCTGCAGATTTGATCCCTGTGAAATCCTCGTTCAAGAGCTACCTAGGA

PI96354 CGTCCTTGGAAAATGTACTCTATGACTGTTGTGTTAAAATCTTACGTGGATATAGACCCA

Bossier CGTCCTTGGAAAATGTACTCTATGACTGTTGTGTTAAAATCTTACGTGGATATAGACCCA

PI96354 GCAGGGTGGTTGGAATGGAATGAAACATTTGCATTGGATACGTTGTATTATGGGGAGTAC

Bossier GCAGGGTGGTTGGAATGGAATGAAACATTTGCATTGGATACGTTGTATTATGGGGAGTAC

PI96354 ATGAATAGGGGTCCATGTTCAAACACAAGTGGTAGGGTTACGTGGCCAGGTTATAGGGTC

Bossier ATGAATAGGGGTCCATGTTCAAACACAAGTGGTAGGGTTACGTGGCCAGGTTATAGGGTC

PI96354 ATTAACAGCTCCATTGAGGCAAGCCAATTCACAGTTGGACAGTTTATTCAAGACAATGAT

Bossier ATTAACAGCTCCATTGAGGCAAGCCAATTCACAGTTGGACAGTTTATTCAAGACAATGAT

PI96354 TGGTTGAACAACACTGGCATCCCATTCTTCTCTGGT

Bossier TGGTTGAACAACACTGGCATCCCATTCTTCTCTGGT

3b.Glyma10g02140_Pectinesterase1_Protein alignment

Williams82 MNNLTLASILTVISSLLFFGTTHLTNTQTTRVPDQKHKHLHFQKHIQVVAQSTCEGTLYP

Bossier MNNLTLASILTVISSLLFFGTTHLTNTQTTRVPDQKHKHLHFQKHIQVVAQSTCEGTLYP

PI96354 MNNLTLASILTVISSLLFFGTTHLTNTQTTRVPDQKHKHLHFQKHIQVVAQSTCEGTLYP

Williams82 DLCVLTLATFPDLTTKSVPQVISSVVNHTMYEVRSTSYNCSGLKKMLKNLNPLDQRALDD

Bossier DLCVLTLATFPDLTTKSVPQVISSVVNHTMYEVRSTSYNCSGLKKMLKNLNPLDQRALDD

PI96354 DLCVLTLATFPDLTTKSVPQVISSVVNHTMYEIRSTSYNCSGLKKMLKNLNPLDQRALDY

Williams82 CLKLFEDTSVELKATIDDLSIKSTIGSKLHHDLQTLLSGAMTNLYTCLDGFAYSKGRVGD

Bossier CLKLFEDTSVELKATIDDLSIKSTIGSKLHHDLQTLLSGAMTNLYTCLDGFAYSKGRVGD

PI96354 CLKLFEDTSVELKATIDDLSIKSTIGSKRHHDLQTLLSGAMTNLYTYLDGFAYSKGRVGD

Williams82 RIEKKLLQISHHVSNSLAMLNKVPGVEKLTTSSESDEVFPEYGKMQKGFPSWVSSKDRKL

Bossier RIEKKLLQISHHVSNSLAMLNKVPGVEKLTTSSESDEVFPEYGKMQKGFPSWVSSKDRKL

PI96354 RIEKKLLQISHHVSNSLAMLNKVPGVEKLTTSSDSDEVFPEYGKMQKGFPSWVSSKDRKL

Williams82 LQAKVNETKFNLVVAKDGTGNFTTIGEALSVAPNSSTTRFVIHVTAGAYFENVEVIRKKT

Bossier LQAKVNETKFNLVVAKDGTGNFTTIGEALSVAPNSSTTRFVIHVTAGAYFENVEVIRKKT

PI96354 L------

Williams82 NLMFVGDGIGKTVVKGSRNVEDGWTIFQSATVAVVGAGFIAKGITFEKSAGPDKHQAVAL

Bossier NLMFVGDGIGKTVVKGSRNVEDGWTIFQSATVAVVGAGFIAKGITFEKSAGPDKHQAVAL

PI96354 ------

Williams82 RSGVLTSQLSTNAVSLATRTLSTSIPCANSTVNVTFMAL

Bossier RSGVLTSQLSTNAVSLATRTLSTSIPCANSTVNVTFMAL

PI374170 RSGVLTSQLSTNAVSLATRTLSTSIPCANSTVNVTFMAL

PI96354 ------

4a. Glyma10g02160_Pectinesterase2_DNA alignment (in this gene, sequence of Bossier is 100% similar to that of Williams 82, therefore, only sequence of Bossier is presented)

PI96354 TACTAAAAAA-TATATATATAT------TTATTATATTAAAATAAATATTTTTTAACAAA

Bossier TACTAAAAAAATATATATATATATATATTTATTATATTAAAATAAATATTTTTTAACAAA

PI96354 TAAGCAAATCGACTCAATATTGTTAAAAAGAATGTAAATTTCCGATGATTAATTTATAAA

Bossier TAAGCAAATCGACTCAATATTGTTAAAAAGAATGTAAATTTCCGATGATTAATTTATAAA

PI96354 GTGTGCGTTCCATCGAATCATCCATTGACTTTGTCAAATGTCACATATAAAAGTCAACAT

Bossier GTGTGCGTTCCATCGAATCATCCATTGACTTTGTCAAATGTCACATATAAAAGTCAACAT

PI96354 TATTTTTGTATAACATGCTAGACTCCTTCTGTATTTGGCAAAAACTAATTGGATTTGTGG

Bossier TATTTTTGTATAACATGCTAGACTCCTTCTGTATTTGGCAAAAACTAATTGGATTTGTGG

PI96354 GAGATTAGGTTGAAGACAACTCCGCTTGAGAAAGGAAAAAGTTTTTTTTATTAAAGAATA

Bossier GAGATTAGGTTGAAGACAACTCCGCTTGAGAAAGGAAAAAGTTTTTTTTATTAAAGAATA

PI96354 GATAAGTGAGTGAAGATGGAAACATAGAAATGGTATATCACAAATATATTCATAATTGTG

Bossier GATAAGTGAGTGAAGATGGAAACATAGAAATGGTATATCACAAATATATTCATAATTGTG

PI96354 CAAATGCATAATCCTTTTCTCATTACAATTTGCAAAGACTGGTCCATGGTTTGCATTGCA

Bossier CAAATGCATAATCCTTTTCTCATTACAATTTGCAAAGACTGGTCCATGGTTTGCATTGCA

PI96354 GTTTCACGTAGCAGCCACTACTACGCCAACAATATACTACTACACATGTAAAACGTAAAC

Bossier GTTTCACGTAGCAGCCACTACTACGCCAACAATATACTACTACACATGTAAAACGTAAAC

PI96354 GCATTACAGAATATTTTTCAATTAAAAGAACCTCTCCATTTCCACTATAAATTGCAAGTG

Bossier GCATTACAGAATATTTTTCAATTAAAAGAACCTCTCCATTTCCACTATAAATTGCAAGTG

PI96354 ATGAAACCCAATTTCCATCACACTCATAAGCTCTTCCAATCTAATAGTAATAAACTCTTG

Bossier ATGAAACCCAATTTCCATCACACTCATAAGCTCTTCCAATCTAATAGTAATAAACTCTTG

PI96354 CTATATATCAATCAGTACCAATGGCCAACAACAAGTTAACCTTTGTCATCATCCTCATCT

Bossier CTATATATCAATCAGTACCAATGGCCAACAACAAGTTAACCTTTGTCATCATCCTCATCT

PI96354 TCCTACCCTCATTGTTAGCTTTGGCTGACATCACTCCCAACACTTCCGTTTCTCCCGGAA

Bossier TCCTACCCTCATTGTTAGCTTTGGCTGACATCACTCCCAACACTTCCGTTTCTCCCGGAA

PI96354 CCATTTGCAAATCCACTCCAGACCCTTCTTATTGCAACTCCGTGCTACCTCCCCAAAACG

Bossier CCATATGCAAATCCACTCCAGACCCTTCTTATTGCAACTCCGTGCTACCTCCCCAAAACG

PI96354 GCAACGTTTACGAATATGGCAGGTTCTCGGTAAGAAAGTCCCTTTCACAGGCCACCAATT

Bossier GCAACGTTTACGAATATGGCAGGTTCTCGGTAAGAAAGTCCCTTTCACAGGCCACCAATT

PI96354 TCTTGAACTTAGTTAACAGATACCTCCAACTCCAACGCCGTTCTTCTCTTTCCACCCCCG

Bossier TCTTGAACTTAGTTAACAGATACCTCCAACTCCAACGCCGTTCTTCTCTTTCCACCCCCG

PI96354 CAATCCACGCGCTCGAAGATTGCCAAAGCCTCGCCGAACTCAACATAGACTTTCTCTCCA

Bossier CAATCCACGCGCTCGAAGATTGCCAAAGCCTCGCCGAACTCAACATAGACTTTCTCTCCA

PI96354 GTTCCTTAGAAACGGTGAACAGAACAACCAAATTTTTACCCACTTCACAGGCTGACGACA

Bossier GTTCCTTAGAAACGGTGAACAGAACAACCAAATTTTTACCCACTTCACAGGCTGATGACA

PI96354 TTCAAACTCTTTTAAGTGCCATTCTAACCAACCAACAAACATGCTTGGAAGGCCTTCAAG

Bossier TTCAAACTCTTTTAAGTGCCATTCTAACAAACCAACAAACATGCTTGGAAGGCCTTCAAG

PI96354 CCACCGCCTCCGCTTGGCGCCTCAAGAACGGACTCTCCGTTCCGCTCTCCAACGACACTA

Bossier CCACCGCCTCCGCTTGGCGCCTCAAGAACGGACTCTCCGTTCCGCTCTCCAACGACACTA

PI96354 AGCTATACAGTGTCTCTCTGGCACTCTTCACAAAGGGGTGGGTCCCAGAAAATGCTAATG

Bossier AGCTATACAGTGTCTCTCTGGCACTCTTCACAAAGGGGTGGGTCCCAGAAAATGCTAATG

PI96354 TCACCGCGTTTCAGCCAAGCGCCAAACATCGCGGGTTTCGAAACGGGCGTTTGCCGCTCA

Bossier TCACCGCGTTTCAGCCAAGCGCCAAACATCGCGGGTTTCGAAACGGGCGTTTGCCGCTCA

PI96354 AGATGTCGAGCACAACGCGCGCGATCTACGAGTCGGTGAGTCGGAGAAAGCTCCTGCAGG

Bossier AGATGTCGAGCAGAACGCGCGCGATCTACGAGTCGGTGAGTCGGAGAAAGCTCCTGCAGG

PI96354 CGACGGTGGGTGACGAGGTTAAGGTGAAAGACATTGTGACGGTGAGCAAAGATGGAAACG

Bossier CGACGGTGGGTGACGAGGTTAAGGTGAAAGACATTGTGACGGTGAGCAAAGATGGAAACG

PI96354 GGAACTTCACCACCATCAGCGACGCCGTGGCCGCGGCGCCGAACAAGACTTCATCCACGG

Bossier GGAACTTCACCACCATCAGCGACGCCGTGGCCGCGGCGCCGAACAAGACTTCATCCACGG

PI96354 CGGGGTACTTCCTGATCTATGTGACCGCCGGTGTTTACGAGGAAAATGTTTCTATTGATA

Bossier CGGGGTACTTCCTGATCTATGTGACCGCCGGTGTTTACGAGGAAAATGTTTCTATTGATA

PI96354 AGAAAAAGACGTACCTGATGATGGTGGGAGATGGCATCAACAAGACAATTATTACTGGAA

Bossier AGAAAAAGACGTACCTGATGATGGTGGGAGATGGCATCAACAAGACAATTATTACTGGAA

PI96354 ATCGCAGTGTTGTTGATGGCTGGACAACCTTTAAGTCAGCGACATTTGGTACGTACTACT

Bossier ATCGCAGTGTTGTTGATGGCTGGACAACCTTTAAGTCAGCGACATTTGGTACGTACTACT

PI96354 ACTACTCCATAATCAGCATAAAAAGTGGTGTATTATTAGTAGAACTAGTACATCTCTTTA

Bossier ACTACTCCATAATCAGCATAAAAAGTGGTGTATTATTAGTAGAACTAGTACATCTCTTTA

PI96354 CCAAAAAATCATATAAAAACAAGTTAAAAAGAAGAAAAATTATAGATGAAAGCCAATACA

Bossier CCAAAAAATCATATAAAAACAAGTTAAAAAGAAGAAAAATTATAGATGAAAGCCAATACA

PI96354 TGAATAGACCCTTAGAGATAGAAAAAGATAAAAGGAAAATTTTAAGTTTTAACAGGTAGA

Bossier TGAATAGACCCTTAGACATAGAAAAAGATAAAAGGAAAATTTTAAGTTTTAACAGGTAGA

PI96354 AAAGCGAATAATAAATACACCATCAATT--TTTTTTTCCAATTATTTCGTAAACTCTATT

Bossier AAAGCGAATAATAAATACACCATCAATTATTTTTTTTCCAATTATTTCATAAACTCTATT

PI96354 ATATCTATTTTTATGATATTTTAGGTGTTAGATAACATGTTATGTCCATTAAACATTTTC

Bossier ATATCTATTTTTATGATATTTTAGGTGTTAGATAACATGTTATGTCCATTAAACATTTTC

PI96354 ATTTATAGGTAATATGATTGTTATTTTAGATTATAAATAACATGATTTGATATAAGAAAT

Bossier ATTTATAGGTAATATGATTGTTATTTTAGATTATAAATAACATGATTTGATATAAAAAAT

PI96354 AAAAAAAATAAAAGATGTATAAAAAATGATTGTTGAACAACAACTATTATACTTGCATTA

Bossier AAAAAAATAAAA-GATGTATAAAAAATGATTGTTGAACAACAACTATTATTCTTGCATTA

PI96354 TTTTTAATAATAAA------TACTATTATATTTTTAAAATGATAATATTGTCTCT

Bossier TTTTTAATAATAAAATTAAAATAAATACTATTATATTTTAAAAATGATAATATTGTCTCT

PI96354 GCTGAATGCTAATATTATGAATATAAAACTATATATTTGTTTACTCTTTATAGCTTAAAA

Bossier GCTGAATGCTAATATTATGAATATAAAACTATATATTTGTTTACTCTTTATAGCTTAAAA

PI96354 AGTTAAAGTGAATGTCTATTTTCATTCGTGTTTTGGTATTGAAAATAAATTTAAAAATGT

Bossier AGTTAAAGTGAATGTCTATTTTCATTCGTGTTTTGGTATTGAAAATAAATTTAAAAATGT

PI96354 AATAAATAAAAGTGGTTTCATAATAACGTTACTGTTGCTGTAACTTTTTTCACATCACTT

Bossier AATAAATAAAAGTGGCTTCATAATAACGTTACTGTTGCTGTAACTTTTTTCGCTTCACTT

PI96354 TTTACAAAATACAGATTGAAAATAAATTATAAAAATGTATATAGTAACTTATAGTTTACG

Bossier TTTACAAAATACAGATTGAAAATAAATTATAAAAATGTATATAGTAACTTATAGTTTACG

PI96354 AAAAAACATTATGATCAACAATCTTTTAGTTGGAAAAAAA-CATTATGATTGGCCATTAT

Bossier AAAAAACATTATGATCAACAATCTTTTAGTTGGAAAAAAAACATTATGATTGACCATTAT

PI96354 GAATTTATGACTGACTAGTATGATGTTATGATATCATGCATGTTGCAGCGGTGGTTGGAG

Bossier GAATTTATGACTGACTAGTATGATGTTATGATATCATGCATGTTGCAGCGGTGGTTGGAG

PI96354 CGAGATTCGTGGGTGTGAATATGACCATCCGCAACACTGCCGGAGCAGAGAAGCACCAAG

Bossier CGAGATTCGTGGGTGTGAATATGACCATCCGCAACACTGCCGGAGCAGAGAAGCACCAAG

PI96354 CTGTAGCACTCCGCAACGGCGCAGACTTGTCCACGTTTTACAGCTGCAGCTTCGAAGGGT

Bossier CTGTAGCACTCCGCAACGGCGCAGACTTGTCCACGTTTTACAGCTGCAGCTTCGAAGGGT

PI96354 ACCAAGACACACTGTACACTCATTCGCTGCGACAATTCTACAGAGAATGCGACATCTACG

Bossier ACCAAGACACACTGTACACTCATTCGCTGCGACAATTCTACAGAGAATGCGACATCTACG

PI96354 GAACCGTCGATTTCATATTCGGAAACGCCGCGGTTGTGTTCCAAAACTGCAACCTCTATC

Bossier GAACCGTCGATTTCATATTCGGAAACGCCGCGGTTGTGTTCCAAAACTGCAACCTCTATC

PI96354 CTCGTCTCCCAATGAGTGGCCAATTCAACTCCATCACCGCACAAGGCCGAACCGACCCTA

Bossier CTCGTCTCCCAATGAGTGGCCAATTCAACTCCATCACCGCACAAGGCCGAACCGACCCTA

PI96354 ACCAAAACACCGGCACTTCAATCCACAACTGCACGATTCGACCAGCCGATGATTTGGCAG

Bossier ACCAAAACACCGGCACTTCAATCCACAACTGCACGATTCGACCAGCCGATGATTTGGCAG

PI96354 CGAACATCGATGCCGCTGAAACTTATCTGGGAAGGCCTTGGAAAAATTACTCCAGGACAG

Bossier CGAACATCGATGCCGCTGAAACTTATCTGGGAAGGCCTTGGAAAAATTACTCCAGGACAG

PI96354 TTTACATGCAGAGCTTTATGGACACTGTCATCAATTCTGCTGGGTGGCGCGAATGGGACG

Bossier TTTACATGCAGAGCTTTATGGACACTGTCATCAATTCTGCTGGGTGGCGCGAATGGGACG

PI96354 GTGATTTTGCTCTGAGCACTCTTTACTATGCAGAGTTTAACAACACTGGACCTGGATCTA

Bossier GTGATTTTGCTCTGAGCACTCTTTACTATGCAGAGTTTAACAACACTGGACCTGGATCTA

PI96354 CCACTGCCAATAGAGTCACGTGGCCGGGTTACCACGTCATTAATGCCACTGTTGCTGCTA

Bossier CCACTGCCAATAGAGTCACGTGGCCGGGTTACCACGTCATTAATGCCACTGTTGCTGCTA

PI96354 ATTTTACCGTCGCTAATTTCTTGCTTGGAGATAACTGGCTGCCCCAGACCGGAGTGCCTT

Bossier ATTTTACCGTCGCTAATTTCTTGCTTGGAGATAACTGGCTGCCCCAGACCGGAGTGCCTT

PI96354 ACGCCAGTAACTTGATATAG

Bossier ACGCCAGTAACTTGATATAG

4b. Glyma10g02160_Pectinesterase2_Protein alignment

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Bossier MANNKLTFVIILIFLPSLLALADITPNTSVSPGTICKSTPDPSYCNSVLPPQNGNVYEYG

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Williams82 RFSVRKSLSQATNFLNLVNRYLQLQRRSSLSTPAIHALEDCQSLAELNIDFLSSSLETVN

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Bossier RTTKFLPTSQADDIQTLLSAILTNQQTCLEGLQATASAWRLKNGLSVPLSNDTKLYSVSL

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Bossier ALFTKGWVPENANVTAFQPSAKHRGFRNGRLPLKMSSRTRAIYESVSRRKLLQATVGDEV

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Bossier KVKDIVTVSKDGNGNFTTISDAVAAAPNKTSSTAGYFLIYVTAGVYEENVSIDKKKTYLM

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Bossier ADLSTFYSCSFEGYQDTLYTHSLRQFYRECDIYGTVDFIFGNAAVVFQNCNLYPRLPMSG

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Williams82 QFNSITAQGRTDPNQNTGTSIHNCTIRPADDLAANIDAAETYLGRPWKNYSRTVYMQSFM

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Williams82 DTVINSAGWREWDGDFALSTLYYAEFNNTGPGSTTANRVTWPGYHVINATVAANFTVANF

Bossier DTVINSAGWREWDGDFALSTLYYAEFNNTGPGSTTANRVTWPGYHVINATVAANFTVANF

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Williams82 LLGDNWLPQTGVPYASNLI

Bossier LLGDNWLPQTGVPYASNLI

PI96354 LLGDNWLPQTGVPYASNLI

5a. Glyma18g48730_ EREBP transcriptional factor_DNA alignment

Bossier AGTTCAAGGCACACACACATTGGTGTTTCCACCAAATACAGTGAGCAAAGTTAGCTGAAA

PI96354 AGTTCAAGGCACACACACATTGGTGTTTCCACCAAATACAGTGAGCAAAGTTAGCTGAAA

Bossier ATTAAAACATGGTTTCCGCCACCGTGGATTCCGATTTTGCATTCTTGGAATCTGTTCAAC

PI96354 ATTAAAACATGGTTTCCGCCACCGTGGATTCCGATTTTGCATTCTTGGAATCTGTTCAAC

Bossier AATACCTACTTGGACATGATTCCATCAATCTCATGTCTGAAACCCACCAAGCTGCATCTC

PI96354 AATACCTACTTGGACATGATTCCATCAATCTCATGTCTGAAACCCACCAAGCTGCATCTC

Bossier ATGATCCATTTTCAGACCCTAATAAATGTGATGGTGATTCAGGGAACATTGCTTTCCGAA

PI96354 ATGATCCATTTTCAGACCCTAATAAATGTGATGGTGATTCAGGGAACATTGCTTTCCGAA

Bossier GTGAGGATGCAACGGCTGTGGTAGCGCGTGATCATGCGCCACCAACATGGAAGCATTACA

PI96354 GTGAGGATGCAACGGCTGTGGTGGCTCGTGATCATGCGCCACAAACATGGAAGCATTACA

Bossier GAGGGGTGAGGCGTAGACCGTGGGGAAAGTTTGCGGCCGAGATTAGGGATCCAAAGAAGA

PI96354 GAGGGGTGAGACGTAGACCGTGGGGAAAGTTTGCGGCCGAGATTAGGGATCCAAAGAAGA

Bossier ACGGAGCTAGGGTTTGGCTTGGCACGTATGATACCGAAGAGAAGGCCGCTTTGGCATATG

PI96354 ACGGAGCTAGGGTTTGGCTTGGCACGTATGATACCGAAGAGAAGGCGGCTTTGGCATATG

Bossier ACAAAGCCGCTTTCAAAATGCGAGGCCAAAAGGCCAAGCTGAATTTTCCTCATCTTATTG

PI96354 ACAAAGCCGCTTTCAAAATGCGAGGCCAAAAGGCCAAGCTGAATTTTCCTCATCTTATTG

Bossier ATTCCGACAATTCCGATGAATTGTCGGAGCCAGTAATGATGACAACTTCCAAGCGAAGTT

PI96354 ATTCCGACAATTCCGATGAATTGTCGGAGCCAGTAATGATGACAACTTCCAAGCGAAGTT

Bossier TGTTAGAAATTTCATCACCGTCGTCCTCGTGTTCAGATGATAGCTCAGAATCACAAGGGA

PI96354 TGTTAGAAATTTCATCACCGTCGTCCTCGTATTCAGATGATAGCTCAGAATCACAAGGGA

Bossier CAAAGAGGAGGAAGAGCCTGGCTGAACTACTGAATAAATTAGCCAAGAATAGAAGCCAAG

PI96354 CAAAGAGGAGGAAGAGCCTTGCTGAACTACTGAATAAATTAGCCAAGAATAGAAGCCAAG

Bossier TCAAGGTGGAATGTTGAAGTGGCTAGAGGAATATGCATGTTGTACAATTTGATCAATCAT

PI96354 TCAAGGTGGAATGTTGAAGTGGCTAGATGAATATGCATGTTGTACAATTTGATCAATCAT

Bossier TAATATGAGACTTCAACGATTGTAATGTAATCTGGTGTTCATAGAATTAATGCAATTTTG

PI96354 TAATATGAGACTTCAACGATTGTAATGTAATCTGGTGTTCATAGAATTAATGCAATTTTG

Bossier TTCACCATAATATTGTGCACTTTTCAAGTTTGATGAAATTATTTGCATACTATTGGTGAA

PI96354 TTCACCATAATATTGTGCACTTTTCAAGTTTGATGAAATTATTTGCATACTATTGGTGAA

Bossier GTTCAAGTTGTGATGTTTTACAATATGGGTGATAATCAATCCTGAAACATCAATAAAACC

PI96354 GTTCAAGTTGTGATGTTTTACAATATGGGTGATAATCAATCCTGAAACATCAATAAAACC

Bossier AAGAAATCTTCAT

PI96354 AAGAAATCTTCAT

5b. Glyma18g48730_ EREBP transcriptional factor_protein alignment

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Bossier MVSATVDSDFAFLESVQQYLLGHDSINLMSETHQAASHDPFSDPNKCDGDSGNIAFRSED

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Bossier ATAVVARDHAPQTWKHYRGVRRRPWGKFAAEIRDPKKNGARVWLGTYDTEEKAALAYDKA

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Bossier AFKMRGQKAKLNFPHLIDSDNSDELSEPVMMTTSKRSLLEISSPSSSYSDDSSESQGTKR

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Bossier RKSLAELLNKLAKNRSQVKVEC

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