Supplementary Table 1.Identification by nano-LC-ESI-MS/MS of astrocyticmouse proteins regulated by PKCε overexpression.

Accession number / Name / MS/MS score / Match peptides / Sequence coverage, % / MS/MS peptides / Theoretical MW / Theoretical
pI
P62259 / 14-3-3 ε / 1845 / 33 / 80% / K.MDDREDLVYQAK.L (0.0030)
K.LAEQAER.Y (0.0354)
R.YDEMVESMK.K (-0.0405)
K.VAGMDVELTVEER.N (-0.0319)
R.NLLSVAYK.N (-0.0156)
R.IISSIEQK.E (-0.0811)
R.IISSIEQKEENK.G (-0.0641)
R.QMVETELK.L (0.0119)
V.ETELKLICCDILDVLDK.H (0.1873)
K.LICCDILDVLDK.H (0.1454)
I.CCDILDVLDK.H (-0.0540)
K.HLIPAANTGESK.V (-0.0244)
H.LIPAANTGESK.V (0.1341)
R.YLAEFATGNDR.K (0.0022)
R.YLAEFATGNDRK.E (-0.0164)
R.KEAAENSLVAYK.A (-0.0659)
K.EAAENSLVAY.K (0.0276)
K.EAAENSLVAYK.A (-0.0309)
E.AAENSLVAYK.A (-0.0863)
K.AASDIAMTELPPTHPIR.L (0.0157)
A.SDIAMTELPPTHPIR.L (0.0956)
F.SVFYYEILNSPDR.A (0.0329)
F.YYEILNSPDR.A (0.0418)
K.AAFDDAIAELDTL.S (0.0947)
E.LDTLSEESYK.D (0.0810)
L.SEESYKDSTLIMQ.L (0.0699)
K.DSTLIMQL.L (-0.0143)
K.DSTLIMQLLR.D (0.0554)
D.STLIMQLLR.D (0.1773(
R.DNLTLWTSDMQGDGEEQNK.E (-0.0637)
L.WTSDMQGDGEEQNK.E (-0.0002)
K.EALQDVEDENQ.- (-0.1128)
E.ALQDVEDENQ.- (0.0446) / 29326 / 4.63
P63038 / 60 kDa heat shock protein, mitochondrial / 1745 / 28 / 48% / R.TVIIEQSWGSPK.V ( 0.0333)
K.LVQDVANNTNEEAGDGTTTATVLAR.S ( -0.0595)
K.GANPVEIR.R ( -0.0556)
K.QSKPVTTPEEIAQVATISANGDK.D ( -0.1113)
K.DIGNIISDAMK.K ( 0.0962)
R.KGVITVK.D ( 0.1313)
K.TLNDELEIIEGMK.F ( 0.0779)
R.GYISPYFINTSK.G ( 0.0242)
K.CEFQDAYVLLSEK.K ( 0.0975)
K.KISSVQSIVPALEIANAHR.K ( 0.1617)
K.ISSVQSIVPALEIANAHR.K ( -0.1189)
K.VGLQVVAVK.A ( 0.0214)
K.APGFGDNR.K ( -0.0173)
K.APGFGDNRK.N ( 0.0877)
K.VGEVIVTK.D ( -0.0448)
K.DDAMLLK.G ( 0.0418)
K.LSDGVAVLK.V ( -0.0462)
K.VGGTSDVEVNEK.K ( 0.0213 )
K.VGGTSDVEVNEKK.D ( -0.0416)
R.VTDALNATR.A ( -0.0782)
R.AAVEEGIVLGGGCALLR.C ( -0.0123)
R.CIPALDSLKPANEDQK.I ( -0.0011 )
K.IGIEIIK.R ( 0.0360)
K.IGIEIIKR.A ( -0.0051)
R.ALKIPAMTIAK.N ( 0.0547)
K.IPAMTIAK.N ( 0.0781)
K.NAGVEGSLIVEK.I ( 0.0512)
K.GIIDPTK.V( -0.0607) / 61088 / 5.91
Q99KI0 / Aconitate hydratase, mitochondrial / 1223 / 33 / 41% / K.VAMSHFEPSEYIR.Y ( -0.0239)
K.IVYGHLDDPANQEIER.G ( -0.1174)
A.MQDATAQMAMLQ.F ( 0.0349)
K.DINQEVYNF.L ( 0.0203)
K.DINQEVYNFL.A ( 0.0563)
K.DINQEVYNFLATAGAK.Y ( 0.0936)
K.LTGSLSGWTSPK.D ( 0.0417)
K.VAGILTVK.G ( 0.0051)
R.TDIANLAEEFK.D ( 0.0828)
H.INGPFTPDLAHPVADVGTVAEK.E ( -0.1694)
K.EGWPLDIRV.G ( 0.0338)
R.VGLIGSCTNSSYEDMGR.S ( -0.1168)
V.GLIGSCTNSSYEDMGR.S ( -0.0440)
K.QALAHGLK.C ( 0.1950)
Q.ALAHGLK.C ( -0.0644)
S.QFTITPGSEQIR.A ( -0.0184)
R.DGYAQILR.D ( 0.0218)
R.DVGGIVLAN.A ( -0.0200)
R.DVGGIVLANACGPC.I (0.0674)
N.ACGPCIGQWDR.K ( -0.0056)
K.NTIVTSYNR.N ( 0.0047)
R.NDANPETHAF.V ( -0.0825)
N.DANPETHAFVTSPEIVTAL.A ( -0.0473)
K.FNPETDFLTGK.D ( 0.0534)
K.FKLEAPDADELPR.S ( -0.0002)
K.LEAPDADELPR.S ( 0.0068)
L.EAPDADELPR.S ( 0.0676)
R.LQLLEPFDK.W ( 0.0948)
K.CTTDHISAAGPWLK.F ( -0.0235)
R.NAVTQEFGPVPDTAR.Y ( -0.0155)
R.WVVIGDENYGEGSSR.E ( -0.0133)
R.EHAALEPR.H (-0.0213)
K.QGLLPLTFADPSDYNK.I ( -0.0468)
Q.GLLPLTFADPSDYNK.I ( -0.0462)
L.TFADPSDYNK.I ( 0.0582)
K.LTIQGLK.D ( -0.0236) / 86151 / 8.08
Q9JII6 / Alcohol dehydrogenase [NADP+] / 525 / 18 / 45% / M.TASSVLLHTGQK.M ( -0.0427)
K.HALSAGYR.H ( 0.0398)
Y.GNETEIGEALK.E ( -0.0702)
R.EELFVTSK.L ( 0.0505)
K.HHPEDVEPALR.K ( 0.0114)
K.ALEVLVAK.G ( 0.0345)
K.ALGLSNFNSR.Q ( 0.0088)
R.QIDDVLSVASVR.P (0.1068)
I.DDVLSVASVR.P ( 0.1569)
V.LSVASVRP.A ( 0.0433)
Y.LAQNELIAH.C ( -0.0109)
L.EVTAYSPLGSSDR.A ( 0.0653)
T.AYSPLGSSDR.A ( -0.0080) R.SPAQILLR.W ( -0.0353)
F.DFTFSPEEMK.Q ( 0.1144)
K.QLDALNK.N ( 0.1026)
R.YIVPMITVDGK.R ( 0.1187)
R.DAGHPLYPF.N ( 0.0691) / 36792 / 6.90
P23927 / α-crystallin B chain / 241 / 7 / 34% / R.APSWIDTGLSEMR.L (0.0583)
R.FSVNLDVK.H (0.1651)
K.HFSPEELK.V (0.0549)
K.VLGDVIEVHGK.H (-0.0685)
R.QDEHGFISR.E (-0.0192)
R.EEKPAVAAAPK.K (-0.0735)
E.EKPAVAAAPK.K (0.0784) / 20056 / 6.76
Q8K1M6 / Dynamin-1-like protein / 159 / 6 / 7% / K.DIELQIR.E (-0.0229)
Q.IRELIL.R (0.0993)
K.LGIIGVVNR.S (0.0789)
K.SATLLQLITK.F (0.1370)
K.FATEYCNTIEGTAK.Y (0.0230)
K.YIETSELCGGAR.I (-0.0133) / 83120 / 6.61
P26443 / Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial / 819 / 27 / 48% / Y.SEAAADREDDPNFFK.M (-0.0667)
K.MVEGFFDR.G (-0.0179)
G.ASIVEDK.L (-0.0327)
R.DDGSWEVIEGYR.A (0.0246)
R.YSTDVSVDEVK.A (-0.0205)
K.ALASLMTYK.C (0.0705)
K.CAVVDVPFGGAK.A (-0.0347)
R.RFTMELAK.K (-0.0051)
R.FTMELAK.K (0.0410)
K.GFIGPGIDVPAPDMSTGER.E (-0.0491)
G.FIGPGIDVPAPDMSTGER.E (-0.0040)
K.PISQGGIHGR.I (-0.0574)
M.SILGMTPGFGDK.T (0.0405)
G.FGNVGLH.S (-0.0922)
K.CVGVGESDGSIWNPDGIDPK.E ( -0.0604 )
K.LQHGSILGFPK.A ( 0.0305 ) L.EADCDILIPAASEK.Q ( -0.0417)
K.IIAEGANGPTTPEADK.I ( -0.0820)
K.NLNHVSYGR.L ( 0.0797)
R.DSNYHLL.M ( -0.0174)
R.DSNYHLLM.S ( -0.0779)
M.SVQESLER.K ( -0.0429)
K.HGGTIPVVPTAEFQDR.I ( -0.0999)
K.DIVHSGLAYTMER.S ( -0.0333)
K.YNLGLDLR.T ( -0.0131)
R.TAAYVNAIEK.V ( -0.0844)
K.VYNEAGVTFT.- ( -0.0132) / 61640 / 8.05
Q64345 / Interferon-induced protein with tetratrico
peptide repeats 3 / 957 / 24 / 55% / R.ESLEAILPQLK.C ( 0.1344)
R.EGSMSSHMEDR.V ( 0.0242)
R.VCNQVEHLNSEEK.A ( -0.0104)
K.ATMYDLLAYIK.H ( 0.1932)
K.AALECLGQAEDLR.K ( -0.0489)
R.LSEAQAYVDK.V ( -0.0139)
Y.SMECPELECEEGWTR.L (-0.0583)
K.DPECSSGMAIAMFR.L ( 0.0276)
K.QFSVDALK.Q ( 0.0309)
K.QAMELNPQNQYLK.V (-0.0053)
R.MGEEAEGER.L ( 0.0229)
K.APNQTDVLQK.A ( -0.0008)
K.AAQFYK.K ( 0.0718)
R.AIELLGK.A ( -0.0170)
R.STVNNSPLYSLVM.C ( 0.1688)
S.TVNNSPLYSLVM.C ( 0.1415)
S.TVNNSPLYSLVMCR.Y ( 0.0784)
R.EILEQLQNK.G (0.0589 )
R.LTMEFMQK.T ( 0.0842)
Y.SDLIDFPEVER.C ( 0.0250)
R.CYQMVISK.E ( -0.0412)
R.CYQMVISK.E ( 0.0838)
K.ESPDVEEEDLYER.Y ( -0.0336)
L.ECLLQFPR.N ( 0.0563) / 47934 / 5.51
Q9CQ19 / Myosin regulatory light polypeptide 9 / 201 / 7 / 35% / M.FDQSQIQEFK.E ( 0.0781)
K.EAFNMIDQNR.D ( -0.0416)
N.EAPGPINFT.M ( 0.0251)
K.LNGTDPEDVIR.N ( 0.0719 )
L.NGTDPEDVIR.N ( 0.1965)
R.FTDEEVDEMYR.E ( 0.0238)
K.GNFNYVEFTR.I ( 0.0676)
. / 19898 / 4.80
O08709 / Peroxiredoxin-6 / 1046 / 26 / 76% / M.PGGLLLGDEAPNFEAN.T ( 0.0365)
M.PGGLLLGDEAPNFEANTTIG.R ( 0.0771)
G.LLLGDEAPNFEAN.T ( 0.1813)
G.DEAPNFEANTTIGR.I ( -0.0219)
R.DFTPVCTTELG.R ( 0.1624)
R.DFTPVCTTELGR.A ( 0.0554)
R.AAKLAPEFAK.R ( 0.0229)
L.SIDSVEDHLAWSK.D ( 0.1319 ) K.DINAYNGETPTEK.L ( -0.0878)
K.DINAYNGETPTEK.L ( -0.0878)
I.NAYNGETPTEK.L ( -0.1947)
K.LPFPIIDDK.G ( 0.0363)
K.LPFPIIDDKGR.D ( 0.1337)
R.DLAILLGMLDPVEK.D ( 0.1444)
L.LGMLDPVEK.D ( 0.1406 )
K.DDNNMPVTAR.V ( 0.0225)
R.VVFIFGPDK.K ( 0.0974)
R.VVFIFGPDKK.L ( 0.0024)
K.LKLSILYPATTG.R (0.0275)
K.LSILYPATTGR.N ( 0.0195)
R.NFDEILR.V ( -0.0552)
R.VVDSLQLTGTK.P ( 0.1170)
R.VVDSLQLTGTKPVATPVDWK.K ( -0.0114)
K.KGESVMVVPTLSEEEAK.Q ( 0.0381)
K.GESVMVVPTLSEEEAK.Q ( 0.0382)
G.ESVMVVPTLSEEEAK.Q ( 0.0367) / 24969 / 5.71
Q61206 / Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit beta / 216 / 9 / 30% / M.SQGDSNPAAIPH.A ( -0.0524)
H.AAEDIQGDDR.W ( -0.0244)
K.DKEPDVLFVGDSM.V ( 0.0768)
K.DKEPDVLFVGDSMVQ.L ( 0.0134)
K.NGELENIKPK.V ( 0.0076)
K.VNQLLK.V ( 0.0983)
K.LANVQLL.D ( -0.0207)
Q.LLEETPEEK.Q ( 0.0974)
L.LEETPEEK.Q ( 0.0815) / 25736 / 5.57
Q9JJV2 / Profilin-2 / 161 / 8 / 41% / T.PVEIDMI.V ( 0.0257)
D.MIVGKDRE.G ( 0.0632)
R.DSLYVDGDCTMDI.R ( 0.0119)
R.DSLYVDGDCTMDIR.T ( 0.0589)
K.SQGGEPTYNVAVGR.A ( -0.0201) S.QGGEPTYNVAVGR.A ( -0.0067)
R.VLVFVMGK.E ( 0.0817)
E.GVHGGGLNK.K ( 0.0581) / 15364 / 6.55
P08207 / Protein S100-A10 / 245 / 36 / 42% / -.MPSQMEHAMETM.M ( -0.0588)
M.PSQMEHAMETM.M ( 0.0314)
M.PSQMEHAMETMML.T ( -0.1332)
R.FAGDKDHLTK.E ( 0.0098)
R.EFPGFLENQK.D ( 0.0825)
R.EFPGFLENQKDPLAVDK.I ( -0.0367)
K.DPLAVDK.I ( 0.0001) / 11293 / 6.27
P52480 / Pyruvate kinase isozymes M1/M2 / 1052 / 30 / 47% / P.KPHSEAGTAFIQ.T (-0.0172)
R.LDIDSAPITAR.N (0.0010)
R.NTGIICTIGPASR.S (0.0278)
R.LNFSHGTHEYHAETIK.N (0.0984)
R.EATESFASDPILYR.P (0.0031)
A.TESFASDPI.L (0.0192)
R.PVAVALDTK.G (0.0738)
K.GSGTAEVELKK.G (0.0439)
G.SGTAEVELK.K (0.0625)
K.ITLDNAYMEK.C (0.0671)
K.IYVDDGLISL.Q (-0.0005)
K.IYVDDGLISLQVK.E (0.1539)
K.GADFLVTEVENGGSLGSK.K (0.0328)
T.EVENGGSLGSK.K (0.0673)
K.KGVNLPGAAVDLPAVSEK.D (0.0064)
K.GVNLPGAAVDLPAVSEK.D (0.0586)
R.GDLGIEIPAEK.V (0.0792)
G.DLGIEIPAEK.V (-0.0172)
R.AGKPVICAT.Q (0.0770)
R.AGKPVICATQMLESMIK.K (0.0927)
G.DYPLEAVR.M (-0.0429)
R.MQHLIAR.E (0.0506)
R.EAEAAIYHL.Q (0.0680)
R.EAEAAIYHLQ.L (-0.0269)
L.QLFEELR.R (0.0171)
A.PITSDPTEAAAV.G (0.1856)
K.CCSGAIIVLTK.S (0.1063)
R.GIFPVLCK.D (0.0665)
N.AWAEDVDLR.V (0.0513)
R.VNLAMDVGK.A (-0.0284) / 58378 / 7.18
P42932 / T-complex protein 1 subunit theta / 1112 / 33 / 57% / M.ALHVPK.A (-0.0283)
K.APGFAQMLK.D (-0.0386)
K.HFSGLEEAVYR.N (0.0749)
K.LFVTNDAATILR.E (0.0653)
R.ELEVQHPAAK.M (0.0542)
K.AHEILPELVCCSAK.N (0.0513)
R.DVDEVSSLLR.T (0.0483)
K.QYGSETFLAK.L (0.1010)
K.KETEGDVTSVK.D (0.1635)
K.ETEGDVTSVK.D (0.0385)
K.IAVYSCPFDGMITETK.G (0.0337)
K.TAEELMNFSK.G (0.0584)
K.GEENLMDAQVK.A (-0.0489)
G.EENLMDAQVK.A (0.0199)
K.AIAGTGANVIVTGGK.V (0.0559)
K.VADIALHYANK.Y (0.0963)
K.YNIMLVR.L (0.1156)
K.TVGATALPK.L (0.0600)
K.EDGAISTIVLR.G (0.0654)
E.DGAISTIVLR.G (0.0263)
R.GSTDNLMDDIER.A (-0.0773)
R.AVDDGVNTFK.V (0.0480)
R.LVPGGGATEIELAK.Q (-0.0249)
K.QITSYGETCPGLEQY.A (-0.0524)
K.FAEAFEAIPR.A (0.0836)
R.ALAENSGVK.A (0.0706)
K.ANEVISK.L (0.1492)
K.LYSVHQEGNK.N (0.0640)
K.NVGLDIEAEVPAVK.D (0.0031)
K.LATNAAVTVLR.V (0.0552)
K.LATNAAVTVLRV.D (0.0704)
R.VDQIIMAK.P (0.0217)
K.PAGGPKPPSGK.K (0.1968) / 60088 / 5.44
P17751 / Triosephosphate isomerase / 207 / 6 / 25% / K.IAVAAQNCYK.V ( -0.0030)
K.VTNGAFTGEISPGMIK.D ( -0.0316)
V.TNGAFTGEISPGMIK.D ( -0.0603)
R.HVFGESDELIGQK.V ( -0.0132)
S.NVNDGVAQSTR.I ( 0.0730)
R.IIYGGSVTGATCK.E ( 0.0369)
. / 27038 / 6.90
P58771 / Tropomyosin α-1 chain / 726 / 26 / 55% / K.LDKENALDR.A ( 0.0306)
R.SKQLEDELVSL.Q ( 0.1410)
R.SKQLEDELVSLQK.K ( 0.0274)
S.KQLEDELVSL.Q ( -0.0318)
K.QLEDELVSL.Q ( 0.0781)
K.QLEDELVSLQK.K ( 0.0544)
L.EDELVSLQK.K ( -0.0518)
K.GTEDELDKYSEALK.D ( 0.0100)
K.KATDAEADVA.S ( 0.0553)
K.KATDAEADVASL.N ( 0.0792)
K.KATDAEADVASLNR.R ( -0.0448)
K.ATDAEADVASL.N ( -0.0222)
K.ATDAEADVASLNR.R ( -0.0263)
R.IQLVEEELDR.A ( -0.0201)
R.LATALQK.L ( 0.0277)
K.LEEAEKAADESER.G ( -0.0521)
K.DEEKMEIQ.E ( 0.0585)
K.DEEKMEIQEIQLK.E ( -0.0207)
K.MEIQEIQLK.E ( 0.0413)
K.HIAEDADR.K ( 0.0801)
R.KLVIIESDLER.A ( 0.0464)
K.LVIIESDLER.A ( 0.0250)
K.CAELEEELK.T ( 0.0002)
K.SLEAQAEK.Y ( 0.0623)
K.SIDDLEDELYAQK.L ( 0.0871)
K.AISEELDHALNDMTI.- ( -0.0436) / 32718 / 4.69
Q9CPT4 / UPF0556 protein C19orf10 homolog / 229 / 5 / 28% / V.SEPTTVPFDVR.P ( 0.0788)
K.SYLYFTQFK.A ( 0.1305)
G.AEIEYAMAYSK.A ( -0.0562)
F.ERESDVPLK.S ( -0.0757)
R.ESDVPLKSEEFEVTK.T ( 0.0302) / 18085 / 6.30