Supplemental Table 2:Results of the in silico sequence analyses of the HvS40 promoter.
Database:PLACE_HvS40 upstream sequence 840 bases
Sequence of the HvS40-sP-I fragment and cis elements found in this promoter region are labeled with red letters.
5´
CCGCGGGCCTAACCAGAATAAGTCCCAATAAGCTCCTATTAAAGAGTCTT
ATTTGATAAGTCCCAAATAACCATAATAAGTCCCAATAAGTCCCTTGTGT
TTGATTTAGGTGGGACTTATAGGAACTTTTTTAAGTCTTAAAACCAATAA
GTCCCTAGAAACAAACACCCTCTAGGTCGTCCTATGTTTGGGGTTACTAT
TTCAATTTGTATGTCAGAAAATGGTCAAATGAGTTTGAACCGGTCCGTAC
GTGGCATCAATCTAGTGAGTTGGTACGTGCATGATTCCTTCCTCCAAATT
AAGCTTACATGTGCGTTATCAATGAATATGTTACTGTATGAAAGTGCCTA
AAAAAACTTGTTGCTATCAATGGGATTGGCTAGCACTAAGTTCCGAGCCA
ACCTATCTTGCCGTGTGAGAACTCTGTCAAATATTGGTCAAACGAAGCAA
GTTTACACAGGACAGAAATTCCGCCATTGGTAAGTAGGACGATACGCGTG
CAAATACGTACGTACATACGTGCACACCTGTACCAGGCGCACGTCCACGT
GGCAGCCGAGGATAGGGTGTACCGCACTCCACATCAACCCCTTCCTTCCT
TCCATCCCAGGCGCAGGCAGAGACACCCACAGCTAGCAAAGTTTGTCCAA
ACGCGCCACTACTCCTCCTCCAGTTGCCAACTCCCCAAGGAAGTCTGCTT
GCTCACCAAGACACGCCATCGTCTCCTTCTCCAATCTCCATCCCCTTCCT
TCCACAGCACACCTACCTTCGCTCGCTATATATGCCCCTCGCCATGGCAG
CCCCAGCTCTTGCCTTCCCGGACACACGGCCGGGGAGGCC 3´
Factor or Site Name Loc.(Strand)Signal Sequence SITE #
______
CGCGBOXAT site 1 (+) VCGCGB S000501
CGCGBOXAT site 1 (-) VCGCGB S000501
SORLIP2AT site 5 (+) GGGCC S000483
MYBATRD22 site 9 (+) CTAACCA S000175
MYB1AT site 10 (+) WAACCA S000408
-10PEHVPSBD site 15 (-) TATTCT S000392
CCAATBOX1 site 25 (+) CCAAT S000030
CAATBOX1 site 26 (+) CAAT S000028
TAAAGSTKST1 site 40 (+) TAAAG S000387
DOFCOREZM site 41 (+) AAAG S000265
NODCON2GM site 42 (-) CTCTT S000462
OSE2ROOTNODULE site 42 (-) CTCTT S000468
TATABOX5 site 49 (+) TTATTT S000203
GATABOX site 55 (+) GATA S000039
IBOX site 55 (+) GATAAG S000124
IBOXCORE site 55 (+) GATAA S000199
TATABOX5 site 65 (-) TTATTT S000203
MYB1AT site 68 (+) WAACCA S000408
CCAATBOX1 site 83 (+) CCAAT S000030
CAATBOX1 site 84 (+) CAAT S000028
DPBFCOREDCDC3 site 94 (-) ACACNNG S000292
2SSEEDPROTBANAPA site 97 (-) CAAACAC S000143
CANBNNAPA site 97 (-) CNAACAC S000148
ARR1AT site 102 (+) NGATT S000454
CARGCW8GAT site 126 (+) CWWWWWWWWG S000431
CARGCW8GAT site 126 (-) CWWWWWWWWG S000431
DOFCOREZM site 126 (-) AAAG S000265
MYB1AT site 141 (+) WAACCA S000408
REALPHALGLHCB21 site 142 (+) AACCAA S000362
CCAATBOX1 site 144 (+) CCAAT S000030
CAATBOX1 site 145 (+) CAAT S000028
POLLEN1LELAT52 site 157 (+) AGAAA S000245
ANAERO1CONSENSUS site 159 (+) AAACAAA S000477
AACACOREOSGLUB1 site 160 (+) AACAAAC S000353
2SSEEDPROTBANAPA site 162 (+) CAAACAC S000143
CANBNNAPA site 162 (+) CNAACAC S000148
PROXBBNNAPA site 162 (+) CAAACACC S000263
CACTFTPPCA1 site 195 (+) YACT S000449
SP8BFIBSP8BIB site 195 (+) TACTATT S000184
INRNTPSADB site 201 (+) YTCANTYY S000395
CAATBOX1 site 203 (+) CAAT S000028
BIHD1OS site 212 (+) TGTCA S000498
WRKY71OS site 213 (-) TGAC S000447
POLLEN1LELAT52 site 216 (+) AGAAA S000245
GT1CONSENSUS site 217 (+) GRWAAW S000198
ELRECOREPCRP1 site 223 (-) TTGACC S000142
WBBOXPCWRKY1 site 223 (-) TTTGACY S000310
WBOXNTERF3 site 223 (-) TGACY S000457
WBOXATNPR1 site 224 (-) TTGAC S000390
WRKY71OS site 224 (-) TGAC S000447
EBOXBNNAPA site 226 (+) CANNTG S000144
MYCCONSENSUSAT site 226 (+) CANNTG S000407
EBOXBNNAPA site 226 (-) CANNTG S000144
MYCCONSENSUSAT site 226 (-) CANNTG S000407
PREATPRODH site 229 (-) ACTCAT S000450
ABADESI1 site 247 (+) RTACGTGGCR S000007
ABREATRD22 site 247 (+) RYACGTGGYR S000013
ACGTOSGLUB1 site 247 (+) GTACGTG S000278
CURECORECR site 247 (+) GTAC S000493
CURECORECR site 247 (-) GTAC S000493
ABREATCONSENSUS site 248 (+) YACGTGGC S000406
ABRELATERD1 site 249 (+) ACGTG S000414
ACGTABREMOTIFA2OSEM site 249 (+) ACGTGKC S000394
ACGTATERD1 site 249 (+) ACGT S000415
BOXIIPCCHS site 249 (+) ACGTGGC S000229
LRENPCABE site 249 (+) ACGTGGCA S000231
ACGTATERD1 site 249 (-) ACGT S000415
SORLIP1AT site 251 (-) GCCAC S000482
CAATBOX1 site 258 (+) CAAT S000028
ARR1AT site 259 (-) NGATT S000454
CACTFTPPCA1 site 264 (-) YACT S000449
GTGANTG10 site 265 (+) GTGA S000378
CAREOSREP1 site 267 (-) CAACTC S000421
ACGTOSGLUB1 site 273 (+) GTACGTG S000278
CURECORECR site 273 (+) GTAC S000493
CURECORECR site 273 (-) GTAC S000493
ABRELATERD1 site 275 (+) ACGTG S000414
ACGTATERD1 site 275 (+) ACGT S000415
ACGTATERD1 site 275 (-) ACGT S000415
RHERPATEXPA7 site 275 (-) KCACGW S000512
RYREPEATLEGUMINBOX site 277 (-) CATGCAY S000100
RYREPEATBNNAPA site 278 (-) CATGCA S000264
ARR1AT site 282 (+) NGATT S000454
EBOXBNNAPA site 308 (+) CANNTG S000144
MYCATERD1 site 308 (+) CATGTG S000413
MYCCONSENSUSAT site 308 (+) CANNTG S000407
EBOXBNNAPA site 308 (-) CANNTG S000144
MYCATRD22 site 308 (-) CACATG S000174
MYCCONSENSUSAT site 308 (-) CANNTG S000407
IBOXCORE site 316 (-) GATAA S000199
GATABOX site 317 (-) GATA S000039
CAATBOX1 site 320 (+) CAAT S000028
-10PEHVPSBD site 323 (-) TATTCT S000392
ROOTMOTIFTAPOX1 site 325 (-) ATATT S000098
CACTFTPPCA1 site 332 (+) YACT S000449
DOFCOREZM site 341 (+) AAAG S000265
CACTFTPPCA1 site 343 (-) YACT S000449
RAV1AAT site 359 (-) CAACA S000314
GATABOX site 365 (-) GATA S000039
CAATBOX1 site 368 (+) CAAT S000028
ARR1AT site 373 (+) NGATT S000454
CAATBOX1 site 375 (-) CAAT S000028
CCAATBOX1 site 375 (-) CCAAT S000030
CACTFTPPCA1 site 384 (+) YACT S000449
MYBPZM site 398 (+) CCWACC S000179
GATABOX site 404 (-) GATA S000039
GTGANTG10 site 415 (+) GTGA S000378
BIHD1OS site 425 (+) TGTCA S000498
WBOXATNPR1 site 426 (-) TTGAC S000390
WRKY71OS site 426 (-) TGAC S000447
ROOTMOTIFTAPOX1 site 430 (-) ATATT S000098
ROOTMOTIFTAPOX1 site 431 (+) ATATT S000098
CAATBOX1 site 433 (-) CAAT S000028
CCAATBOX1 site 433 (-) CCAAT S000030
ELRECOREPCRP1 site 436 (-) TTGACC S000142
WBBOXPCWRKY1 site 436 (-) TTTGACY S000310
WBOXNTERF3 site 436 (-) TGACY S000457
WBOXATNPR1 site 437 (-) TTGAC S000390
WRKY71OS site 437 (-) TGAC S000447
DPBFCOREDCDC3 site 455 (+) ACACNNG S000292
POLLEN1LELAT52 site 464 (+) AGAAA S000245
EECCRCAH1 site 465 (-) GANTTNC S000494
CAATBOX1 site 476 (-) CAAT S000028
CCAATBOX1 site 476 (-) CCAAT S000030
CACTFTPPCA1 site 483 (-) YACT S000449
GATABOX site 491 (+) GATA S000039
CGCGBOXAT site 494 (+) VCGCGB S000501
ABRERATCAL site 494 (-) MACGYGB S000507
CGCGBOXAT site 494 (-) VCGCGB S000501
ACGTABOX site 505 (+) TACGTA S000130
ACGTABOX site 505 (-) TACGTA S000130
ACGTATERD1 site 506 (+) ACGT S000415
ACGTATERD1 site 506 (-) ACGT S000415
CURECORECR site 508 (+) GTAC S000493
CURECORECR site 508 (-) GTAC S000493
ACGTABOX site 509 (+) TACGTA S000130
ACGTABOX site 509 (-) TACGTA S000130
ACGTATERD1 site 510 (+) ACGT S000415
ACGTATERD1 site 510 (-) ACGT S000415
CURECORECR site 512 (+) GTAC S000493
CURECORECR site 512 (-) GTAC S000493
ABRELATERD1 site 518 (+) ACGTG S000414
ACGTATERD1 site 518 (+) ACGT S000415
ACGTATERD1 site 518 (-) ACGT S000415
RHERPATEXPA7 site 518 (-) KCACGW S000512
DPBFCOREDCDC3 site 524 (+) ACACNNG S000292
EBOXBNNAPA site 525 (+) CANNTG S000144
MYCCONSENSUSAT site 525 (+) CANNTG S000407
RAV1BAT site 525 (+) CACCTG S000315
EBOXBNNAPA site 525 (-) CANNTG S000144
MYCCONSENSUSAT site 525 (-) CANNTG S000407
CURECORECR site 530 (+) GTAC S000493
CURECORECR site 530 (-) GTAC S000493
ABREOSRAB21 site 537 (-) ACGTSSSC S000012
RHERPATEXPA7 site 539 (+) KCACGW S000512
ABRELATERD1 site 540 (-) ACGTG S000414
ACGTATERD1 site 541 (+) ACGT S000415
ACGTATERD1 site 541 (-) ACGT S000415
LREBOXIIPCCHS1 site 544 (+) TCCACGTGGC S000303
ABREZMRAB28 site 545 (+) CCACGTGG S000133
GBOXLERBCS site 545 (+) MCACGTGGC S000041
ABRERATCAL site 545 (-) MACGYGB S000507
ABREZMRAB28 site 545 (-) CCACGTGG S000133
IRO2OS site 545 (-) CACGTGG S000505
ABREATCONSENSUS site 546 (+) YACGTGGC S000406
ABRERATCAL site 546 (+) MACGYGB S000507
CACGTGMOTIF site 546 (+) CACGTG S000042
EBOXBNNAPA site 546 (+) CANNTG S000144
EMBP1TAEM site 546 (+) CACGTGGC S000119
IRO2OS site 546 (+) CACGTGG S000505
MYCCONSENSUSAT site 546 (+) CANNTG S000407
ABRELATERD1 site 546 (-) ACGTG S000414
CACGTGMOTIF site 546 (-) CACGTG S000042
EBOXBNNAPA site 546 (-) CANNTG S000144
MYCCONSENSUSAT site 546 (-) CANNTG S000407
ABRELATERD1 site 547 (+) ACGTG S000414
ACGTABREMOTIFA2OSEM site 547 (+) ACGTGKC S000394
ACGTATERD1 site 547 (+) ACGT S000415
BOXIIPCCHS site 547 (+) ACGTGGC S000229
LRENPCABE site 547 (+) ACGTGGCA S000231
ACGTATERD1 site 547 (-) ACGT S000415
UPRMOTIFIIAT site 548 (-) CCNNNNNNNNNNNNCCACG S000426
SORLIP1AT site 549 (-) GCCAC S000482
MYBST1 site 560 (+) GGATA S000180
GATABOX site 561 (+) GATA S000039
CURECORECR site 569 (+) GTAC S000493
CURECORECR site 569 (-) GTAC S000493
CACTFTPPCA1 site 575 (+) YACT S000449
SURECOREATSULTR11 site 620 (+) GAGAC S000499
ARFAT site 620 (-) TGTCTC S000270
TBOXATGAPB site 637 (-) ACTTTG S000383
DOFCOREZM site 638 (+) AAAG S000265
ABRERATCAL site 650 (+) MACGYGB S000507
CGCGBOXAT site 651 (+) VCGCGB S000501
CGCGBOXAT site 651 (-) VCGCGB S000501
SORLIP1AT site 655 (+) GCCAC S000482
CACTFTPPCA1 site 657 (+) YACT S000449
CACTFTPPCA1 site 660 (+) YACT S000449
EBOXBNNAPA site 671 (+) CANNTG S000144
MYBCORE site 671 (+) CNGTTR S000176
MYCCONSENSUSAT site 671 (+) CANNTG S000407
EBOXBNNAPA site 671 (-) CANNTG S000144
MYB2CONSENSUSAT site 671 (-) YAACKG S000409
MYCCONSENSUSAT site 671 (-) CANNTG S000407
CAREOSREP1 site 678 (+) CAACTC S000421
EECCRCAH1 site 689 (-) GANTTNC S000494
GTGANTG10 site 703 (-) GTGA S000378
SURECOREATSULTR11 site 721 (-) GAGAC S000499
CCAATBOX1 site 731 (+) CCAAT S000030
CAATBOX1 site 732 (+) CAAT S000028
ARR1AT site 733 (-) NGATT S000454
MYBPLANT site 760 (+) MACCWAMC S000167
BOXLCOREDCPAL site 761 (+) ACCWWCC S000492
MYBPZM site 762 (+) CCWACC S000179
NODCON2GM site 807 (+) CTCTT S000462
OSE2ROOTNODULE site 807 (+) CTCTT S000468
DPBFCOREDCDC3 site 822 (+) ACACNNG S000292