Table S1List of Zanthoxylumaccessions used in the present study

Code / Sl. No. / Cultivar/common name / Germplasm types / Species / Population/province
1 / SX-1 / Fengxiandahongpao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim. / Fengxian, Shaanxi
2 / SX-2 / Zhuyehuajiao / Wild type / Z.armatum DC.
3 / SX-3 / Wucihuajiao / Grafted seedlings / Z. bungeanumMaxim.
4 / SX-4 / Fengxiandahongpao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
5 / SX-5 / Yehuajiao / Wild type / Z.simulansHance
6 / SX-6 / Shizitou / Cultivar / Z. bungeanumMaxim. / Hancheng, Shaanxi
7 / SX-7 / Hanchengchenjiagelaowuci / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
8 / SX-8 / Hanchengdahongpao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
9 / SX-9 / Hanchengwuci / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
10 / SX-10 / Hanchengdangcunwuci / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
11 / SX-11 / Fuguhuajiao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim. / Fugu, Shaanxi
12 / SX-12 / Huajiao1 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim. / Xunyang, Shaanxi
13 / SX-13 / Huajiao2 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
14 / SX-14 / Goujiao1 / Wild type / Z.armatum DC.
15 / SX-15 / Goujiao2 / Wild type / Z.armatum DC.
16 / SX-16 / Goujiao3 / Wild type / Z.armatum DC.
17 / SX-17 / Dahongpao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
18 / SX-18 / Dahongpao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
19 / SX-19 / Huajiao1 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
20 / SX-20 / Huajiao2 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
21 / SX-21 / Huajiao3 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
22 / SX-22 / Huajiao4 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
23 / SX-23 / Huajiao5 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
24 / HN-1 / Shiyuejiao / Landraces / Z. bungeanumMaxim. / Lingbao, Henan
25 / HN-2 / Dahongpao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
26 / HN-3 / Dashizitou1 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
27 / HN-4 / Dashizitou2 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
28 / HN-5 / Xiaoshizitou / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
29 / HN-6 / Lingbaohuajiao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
30 / HN-7 / Huajiao / Landraces / Z. bungeanumMaxim. / Gaomiao, Henan
31 / HN-8 / Huajiao / Landraces / Z. bungeanumMaxim.
32 / HN-9 / Dahongpao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
33 / HN-10 / Qinghuajiao / Landraces / Z. bungeanumMaxim.
34 / HN-11 / Dahongpao1 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
35 / HN-12 / Dahongpao2 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
36 / HN-13 / Dahongpao3 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
37 / HN-14 / Huajiao1 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim. / Zhengzhou, Henan
38 / HN-15 / Huajiao2 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
39 / HN-16 / Xiaohongpao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim. / Linzhou, Henan
40 / HN-17 / Dahongpao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
41 / HN-18 / Dahongpao1 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim. / Mianchi, Henan
42 / HN-19 / Dahongpao2 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
43 / HN-20 / Dahongpao3 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
44 / HN-21 / Huajiao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim. / Mengzhou, Henan
45 / HN-22 / Henandahongpao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim. / Xishan, Henan
46 / SD-1 / Xiaohuajiao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim. / Mengyin, Shandong
47 / SD-2 / Muzhujiao / Landraces / Z. bungeanumMaxim.
48 / SD-3 / Dahongpao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
49 / SD-4 / Yehuajiao / Wild type / Z. bungeanumMaxim.
50 / SD-5 / Xiaohongjiao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim. / Zaozhuang, Shandong
51 / SD-6 / Xiaohongpao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
52 / SD-7 / Dahongpao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
53 / SD-8 / Xiaohongjiao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
54 / SD-9 / Daqingke / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
55 / SD-10 / Yehuajiao / Wild type / Z.simulansHance
56 / SD-11 / Zhuyejiao / Wild type / Z.armatum DC.
57 / SD-12 / Dahongpao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
58 / SD-13 / Xiaohongpao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim. / Laiwu, Shandong
59 / SD-14 / DahongpaoⅠ / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
60 / SD-15 / DahongpaoⅡ / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
61 / SD-16 / DahongpaoⅢ / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
62 / SD-17 / Shandonghuajiao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim. / Yishui, Shandong
63 / S-1 / Huajiao1 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim. / Xinzhou, Shanxi
64 / S-2 / Huajiao2 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
65 / S-3 / Huajiao3 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
66 / S-4 / Dahongpao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim. / Wutai, Shanxi
67 / S-5 / Huajiao1 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
68 / S-6 / Huajiao2 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
69 / S-7 / Huajiao1 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
70 / S-8 / Huajiao2 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
71 / S-9 / Huangjinjiao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
72 / S-10 / Huajiao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
73 / S-11 / Yongjihuajiao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim. / Yongji, Shanxi
74 / S-12 / Yucihuajiao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim. / Yuci, Shanxi
75 / GS-1 / Huajiao1 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim. / Wudu, Gansu
76 / GS-2 / Huajiao2 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
77 / GS-3 / Huajiao3 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
78 / GS-4 / Huajiao4 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
79 / GS-5 / Huajiao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
80 / GS-6 / Wududahongpao1 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
81 / GS-7 / Wududahongpao2 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
82 / GS-8 / Wududahongpao3 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
83 / GS-9 / Wududahongpao4 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
84 / GS-10 / Changbajiao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
85 / GS-11 / Wududahongpao1 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
86 / GS-12 / Wududahongpao2 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
87 / GS-13 / Bayuejiao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
88 / GS-14 / Erhongjiao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
89 / GS-15 / Wudubayuejiao1 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
90 / GS-16 / Wudubayuejiao2 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
91 / GS-17 / Wudubayuejiao3 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
92 / GS-18 / Wudubayuejiao4 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
93 / GS-19 / Wududahongpao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
94 / GS-20 / Wududahongpao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
95 / GS-21 / Changbajiao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
96 / GS-22 / Qin'anyihao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim. / Qin'an, Gansu
97 / SC-1 / Zhaocanghuajiao♂ / Introduction, from Japan / Z. piperitumDC.var.inerme Makino / Neijiang, Sichuan
98 / SC-2 / Zhaocanghuajiao♀ / Introduction, from Japan / Z. piperitumDC.var.inerme Makino
99 / SC-3 / Putaojiao / Introduction, from Japan / Z. piperitumDC.var.inerme Makino
100 / SC-4 / Zhuyejiao / Wild type / Z.armatum DC.
101 / SC-5 / Jiuyeqing / Cultivar / Z.armatum DC.
102 / SC-6 / Zhuyejiao1 / Wild type / Z.armatum DC.
103 / SC-7 / Zhuyejiao2 / Wild type / Z.armatum DC.
104 / SC-8 / Zhuyejiao / Wild type / Z.armatum DC.
105 / SC-9 / Zhuyejiao / Wild type / Z.armatum DC.
106 / SC-10 / Zhuyejiao / Wild type / Z.armatum DC.
107 / SC-11 / Huajiao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
108 / SC-12 / Zhuyejiao / Wild type / Z.armatum DC.
109 / SC-13 / Gongjiao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim. / Hanyuan, Sichuan
110 / SC-14 / Gongjiao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
111 / SC-15 / Hanyuanhuajiao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
112 / SC-16 / Tengjiao / Cultivar / Z.armatum DC. / Emei, Sichuan
113 / SC-17 / Zhenglujiao1 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim. / Jiulong, Sichuan
114 / SC-18 / Zhenglujiao2 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
115 / SC-19 / Huajiao / Wild type / Z. bungeanumMaxim.
116 / SC-20 / Gaojiaohuangjiao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
117 / SC-21 / Yehuajiao / Wild type / Z.simulansHance
118 / SC-22 / Lijiao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim. / Luding, Sichuan
119 / SC-23 / Dahongpao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim. / Kangding, Sichuan
120 / SC-24 / Maoxiandahongpao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim. / Maoxian, Sichuan
122 / GZ-1 / Zhuyejiao / Wild type / Z.armatum DC. / Liupanshui, Guizhou
123 / GZ-2 / Huajiaojin1 / Wild type / Z.scandens Bl.
124 / GZ-3 / Huajiaojin2 / Wild type / Z.scandens Bl.
125 / GZ-4 / Huajiao1 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
126 / GZ-5 / Huajiao2 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
127 / GZ-6 / Huajiao3 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
128 / GZ-7 / Xiaohuahuajiao1 / Wild type / Z. micranthumHemsl.
129 / GZ-8 / Xiaohuahuajiao2 / Wild type / Z. micranthumHemsl.
130 / GZ-9 / Xiaohuahuajiao3 / Wild type / Z. micranthumHemsl.
131 / GZ-10 / Xiaohuahuajiao4 / Wild type / Z. micranthumHemsl.
132 / GZ-11 / Xiaohuahuajiao5 / Wild type / Z. micranthumHemsl.
133 / GZ-12 / Xiaohuahuajiao6 / Wild type / Z. micranthumHemsl.
134 / GZ-13 / Liangmianzhen / Wild type / Z.nitidum (Roxb.) DC. var.nitidum
135 / GZ-14 / Liangmianzhen / Wild type / Z.nitidum (Roxb.) DC. var.nitidum
136 / GZ-15 / Liangmianzhen / Wild type / Z.nitidum (Roxb.) DC. var.nitidum
137 / GZ-16 / Chunyehuajiao / Wild type / Z.ailanthoidesSieb. etZucc. var. ailanthoides
138 / GZ-17 / Zhuyejiao1 / Wild type / Z.armatum DC.
139 / GZ-18 / Zhuyejiao2 / Wild type / Z.armatum DC.
140 / GZ-19 / Zhuyejiao1 / Wild type / Z.armatum DC.
141 / GZ-20 / Zhuyejiao2 / Wild type / Z.armatum DC.
142 / GZ-21 / Zhuyejiao3 / Wild type / Z.armatum DC.
143 / GZ-22 / Huajiao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
144 / GZ-23 / Huajiao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
145 / GZ-24 / Huajiao1 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
146 / GZ-25 / Huajiao2 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
147 / GZ-26 / Huajiao3 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
148 / GZ-27 / Youhuajiao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
149 / GZ-28 / Suhuajiao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
150 / GZ-29 / Gouhuajiao / Wild type / Z. bungeanumMaxim.
151 / GZ-30 / Dingtanhuajiao1 / Cultivar / Z.armatum DC. / Guanling, Guizhou
152 / GZ-31 / Dingtanhuajiao2 / Cultivar / Z.armatum DC.
153 / GZ-32 / Dingtanhuajiao3 / Cultivar / Z.armatum DC.
154 / GZ-33 / Dingtanhuajiao4 / Cultivar / Z.armatum DC.
155 / GZ-34 / Dahongjiao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim. / Bijie, Guizhou
156 / GZ-35 / Daqingpi / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
157 / YN-1 / Dahongpao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim. / Kunming, Yunnan
158 / YN-2 / Qinghuajiao / Cultivar / Z.armatum DC.
159 / YN-3 / Qinghuajiao / Cultivar / Z.armatum DC.
160 / YN-4 / Mahuajiao / Wild type / Z.molleRehd.
161 / YN-5 / Zhuyejiao1 / Wild type / Z.armatum DC.
162 / YN-6 / Zhuyejiao2 / Wild type / Z.armatum DC.
163 / YN-7 / Huajiao1 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
164 / YN-8 / Huajiao2 / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
165 / YN-9 / Donghuajiao / Cultivar / Z.armatum DC.
166 / YN-10 / Huajiao / Cultivar / Z.armatum DC.
167 / YN-11 / Qiyeqinghuajiao1 / Cultivar / Z.armatum DC.
168 / YN-12 / Qiyeqinghuajiao2 / Grafted seedlings / Z.armatum DC.
169 / YN-13 / Jiuyeqinghuajiao / Cultivar / Z.armatum DC.
170 / YN-14 / Qiyeqinghuajiao3 / Grafted seedlings / Z.armatum DC.
171 / YN-15 / Qinghuajiao / Cultivar / Z.armatum DC.
172 / YN-16 / Yunnandahongpao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim. / Zhaotong, Yunnan
173 / YN-17 / Xueyujiao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
174 / YN-18 / Yunnandahongpao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim.
175 / YN-19 / Damajiao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim. / Baoshan, Yunnan
176 / YN-20 / Dalihuajiao / Cultivar / Z. bungeanumMaxim. / Dali, Yunnan

Table S2SRAP profiles detected by 16 SRAP primer combinations in 175Zanthoxylumaccessions

Primer combination / Total no. of bands / No. of polymorphic bands / Polymorphic fragments/%
ME1/EM2 / 7 / 7 / 100%
ME1/OD8 / 8 / 8 / 100%
ME1/SA8 / 10 / 10 / 100%
ME2/EM7 / 5 / 5 / 100%
ME2/EM14 / 5 / 5 / 100%
ME2/SA8 / 10 / 10 / 100%
ME3/OD3 / 8 / 8 / 100%
ME4/OD3 / 7 / 7 / 100%
ME9/OD8 / 8 / 8 / 100%
ME10/EM6 / 12 / 12 / 100%
ME10/OD8 / 14 / 14 / 100%
ME11/EM4 / 10 / 10 / 100%
ME11/EM7 / 9 / 9 / 100%
ME11/SA17 / 7 / 7 / 100%
DC1/SA4 / 13 / 13 / 100%
PM8/GA18 / 12 / 12 / 100%
Total / 145 / 145 / 100%